ejercicios pruebas diagnósticas i
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7/21/2019 Ejercicios Pruebas Diagnósticas I
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Cómo se describe la utilidad de una prueba diagnóstica?
Sensibilidad = Probabilidad de una prueba positiva en laspersonas con la enfermedad
= Pr(P+|E+)
O qué tan buena es la prueba para identificar las personascon la enfermedad?
Especificidad= Probabilidad de una prueba negativa en laspersonas sin la enfermedad
= Pr(P-|E-)
O que tan buena es la prueba para identificar a las personassin la enfermedad?
Estado de la enfermedad
Resultado () ()
() VP FP P+
() FN VN P-
Total E+ E- N
VP VPSensibilidad = -------------- = -----------
VP + FN E+
VN VNEspecificidad = -------------- = -----------
VN + FP E-
La evaluación de una prueba diagnóstica siempre requiere un goldStandard (prueba de oro). El gold Standard es la prueba con lamejor ses y sps hast ahora existente.
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Los siguientes datos fueron obtenidos de un estudio que estabaevaluando una nueva prueba (Prueba A):
Estado de la enfermedad
(gold standard)Resultadopruebanueva (A)
() ()
() 160 30 190
() 40 170 210
Total 200 200 400
Cuál es la sensibilidad y especificidad de la prueba A?
VP 160Sensibilidad = -------------- = -------------------- = 0.80
VP + FN 160 + 40
VN 170Especificidad = -------------- = ----------------- = 0.85
VN + FP 170 + 30
Cuál es la prevalencia de la enfermedad en la población a estudio?
200/400=50%
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Es la sensibilidad y la especificidad dependiente de la prevalencia?
Se repite la evaluación de la prueba A:
Estado de la enfermedad(gold standard)
Resultado(prueba A)
() ()
() 160 270 430
() 40 1530 1570
Total 200 1800 2000
Cuál es la prevalencia?
200/2000=10%
Cuál es la sensibilidad y la especificidad?
VP 160Sensibilidad = -------------- = ----------------- = 0.80
VP + FN 160 + 40
VN 1530Especificidad = -------------- = -------------------- = 0.85VN + FP 1530 + 270
Sensibilidad y especificidad son en teoría independientes de laprevalencia
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Muchas veces la pregunta que estamos interesados en contestares:
Si obtengo un resultado positivo cuál es la probabilidad de que la
persona realmente tenga la enfermedad?
Si obtengo un resultado negativo cuál es la probabilidad de quela persona realmente no-tenga la enfermedad?
Ustedes creen que la sensibilidad y especificidad responden estaspreguntas?
Estado de la enfermedad(gold standard)
Resultado(prueba A)
() ()
() VP FP P+
() FN VN P-
Total E+ E- N
Valor predictivo positivo (VPP) = es la probabilidad de que unapersona tenga la enfermedad dado que laprueba es positiva
Valor predictivo negativo (VPN) = es la probabilidad de que unapersona no-tenga la enfermedad dado que laprueba es negativa
VP VPVPP = -------------- = ----------------
VP + FP P+
VN VNVPN = -------------- = --------------
VN + FN P-
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Estado de la enfermedad(gold standard)
Resultado
(prueba A)
() ()
() 160 30 190
() 40 170 210
Total 200 200 400
Cuál es el VPP y VPN de la prueba?
VP 160VPP = -------------- = ----------------- = 0.84
VP + FP 160 + 30
VN 170VPN = -------------- = ----------------- = 0.81
VN + FN 170 + 40
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Segunda evaluación de la prueba A
Estado de la enfermedad
(gold standard)Resultado(prueba A)
() ()
() 160 270 430
() 40 1530 1570
Total 200 1800 2000
Cuál es el VPP y VPN de la prueba?
TP 160PPV = -------------- = ------------------ = 0.37
TP + FP 160 + 270
TN 1530NPV = -------------- = ------------------ = 0.97
TN + FN 1530 + 40
VPP y VPN dependen de la prevalencia.
Baja prevalencia favorece VPN y alta prevalencia favorece VPP.
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Teorema de Bayes
1. P(X and Y) = P(Y) * P(X|Y)
2. P(X and not Y) = P(not Y) * P(X|not Y)
3. P(X) = P(X and Y) + P(X and not Y)
P(Y and X)P(Y|X) = -----------------------
P(X)
P(X and Y)P(Y|X) = -------------------------------------------------
P(X and Y) + P(X and not Y)
P(Y) * P(X|Y)P(Y|X) = ------------------------------------------------
P(Y) * P(X|Y) + P(not Y) * P(X|notY)
O equivalente:
P(E+) * P(P+|E+)P(E|P+) = ---------------------------------------------------------------
[P(E+) * P(P+|E+)] + [P(E-) * P(P+|E-)]
O equivalente
Sens * PrevVPP = ------------------------------------------------------
(Sens * Prev) + ((1-espec) * (1-Prev))
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Estado de la enfermedad(gold standard)
Resultado(prueba A)
() (-)
() 450 25 475
() 50 475 525
Total 500 500 1000
Sens = 0.90; Espec = 0.95
Dado una prevalencia del 0.025:
(Sens * Prev)VPP= ----------------------------------------------------
(Sens * Prev) + [(1- espec)*(1 - Prev)]
0.9 * 0.025VPP = --------------------------------------------------(0.9 * 0.025) + [(1 - 0.95) * (1 - 0.025)]
0.0225VPP = ------------------------ = 0.32
0.0225 + 0.04875
1. If the patient has a negative test, what is the probability that the patient has
disease Z (answer to 4 decimal places)? Use your knowledge of probability,
Bayes' theorem and diagnostic tests to derive a formula for the Pr(D+|T-)
comparable to PPV.
(1-sens)*prev
Pr(D|T-) = ------------------------------------------- = 1 – NPV = 0.0070
(1-sens)*prev + (spec)*(1-prev)
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Considere una muy buena prueba con una sensibilidad del 95% yespecificidad del 99%. Si usted hace tamizaje en una poblacióndonde la prevalencia es del 0.1%, cual es el VPP?
(Sens * Prev)PPV = ----------------------------------------------------
(Sens * Prev) + [(1- espec)*(1 - Prev)]
0.95 * 0.001 0.00095PPV = --------------------------------------------- = ------------------- = 0.09
(0.95 * 0.001) + [(1 - 0.99) * (1 - 0.001)] 0.00095 + 0.00999
A muy baja prevalencia inclusive pruebas excelentes tienenbajos VPP
En otras palabras van a resultar muchos falsos positivos aunque laprueba tenga una especificidad del 99%
Qué se puede hacer para aumentar la exactitud de la prueba?