dr hab., prof. uw jacek bielecki – kierownik (+22) 554 13 04 e-mail: [email protected]

Dr hab., prof. UW Jacek Bielecki – kierownikDr hab., prof. UW Jacek Bielecki – kierownik (+22) 554 13 04 e-mail: (+22) 554 13 04 e-mail: [email protected]@biol.uw.edu.pl

Dr hab. Katarzyna BrzostekDr hab. Katarzyna Brzostek (+22) 554 13 10 e-mail: (+22) 554 13 10 e-mail: [email protected]@biol.uw.edu.pl

Dr Adrianna RaczkowskaDr Adrianna Raczkowska (+22) 554 13 10 e-mail: (+22) 554 13 10 e-mail: [email protected]@biol.uw.edu.pl

Dr Radosław StachowiakDr Radosław Stachowiak (+22) 554 13 12 e-mail: (+22) 554 13 12 e-mail: [email protected]@biol.uw.edu.pl

Mgr Jarosław WiśniewskiMgr Jarosław Wiśniewski (+22) 554 13 12 e-mail: (+22) 554 13 12 e-mail: [email protected]@biol.uw.edu.pl

Doktoranci:Doktoranci:

Mgr Olga Anna OsińskaMgr Olga Anna Osińska [email protected]@biol.uw.edu.pl

Mgr Marta BrzóstkowskaMgr Marta Brzóstkowska [email protected]@biol.uw.edu.pl

Skład osobowySkład osobowy

Zakład Mikrobiologii StosowanejInstytutu Mikrobiologii UW

uzyskanie zaliczeń z przedmiotów:uzyskanie zaliczeń z przedmiotów: Mikrobiologia Mikrobiologia BiotechnologiaBiotechnologia Genetyka z inż. genetycznąGenetyka z inż. genetyczną Mikrobiologia Przemysłowa*Mikrobiologia Przemysłowa*

przyjęte zostaną przyjęte zostaną 3 osoby do zespołu K. Brzostek 3 osoby do zespołu K. Brzostek 3 osoby do pracowni J. Bieleckiego 3 osoby do pracowni J. Bieleckiego

**w przypadku nadmiaru kandydatów brane będą pod uwagę średnie z przedmiotóww przypadku nadmiaru kandydatów brane będą pod uwagę średnie z przedmiotów

Warunki przyjęcia na studia licencjackieWarunki przyjęcia na studia licencjackie


Przyjmujemy do 6 osób, warunkiem jest uzyskanie zaliczeń z:Przyjmujemy do 6 osób, warunkiem jest uzyskanie zaliczeń z: 1. Genetyki molekularnej lub Genetyki bakterii 1. Genetyki molekularnej lub Genetyki bakterii 2. Biologii molekularnej lub Ruchomych elementów genet....2. Biologii molekularnej lub Ruchomych elementów genet.... 3. Fizjologii bakterii lub Mol. pod. bak. patogenezy*3. Fizjologii bakterii lub Mol. pod. bak. patogenezy*

* przypadku nadmiaru kandydatów będą brane pod uwagę oceny * przypadku nadmiaru kandydatów będą brane pod uwagę oceny

Warunki przyjęcia na studia magisterskie


Czynniki zjadliwości Czynniki zjadliwości Yersinia enterocoliticaYersinia enterocolitica – badanie roli – badanie roli białek Inv, Yop, YadA, poryn, sideroforów oraz funkcji białek Inv, Yop, YadA, poryn, sideroforów oraz funkcji dwuskładnikowego systemu regulacji EnvZ/OmpR i regulonu dwuskładnikowego systemu regulacji EnvZ/OmpR i regulonu maltozy w procesie patogenezy. maltozy w procesie patogenezy.

Badanie mechanizmów patogenezy Badanie mechanizmów patogenezy Listeria monocytogenesListeria monocytogenes; ; ocena współzależności determinantów patogenezy w ocena współzależności determinantów patogenezy w środowisku wewnątrzkomórkowym. środowisku wewnątrzkomórkowym. Sekrecja dowolnych białek w komórkach ssaków przez szczep Sekrecja dowolnych białek w komórkach ssaków przez szczep Bacillus subtilisBacillus subtilis zawierający determinanty patogenezy zawierający determinanty patogenezy L. L. monocytogenes.monocytogenes.Wykorzystanie toksyn bakteryjnychWykorzystanie toksyn bakteryjnych w biotechnologii w biotechnologii medycznej.medycznej.

Problematyka badawczaProblematyka badawcza


a) podstawowe techniki inżynierii genetycznej w ramacha) podstawowe techniki inżynierii genetycznej w ramach

- klonowania DNA,- klonowania DNA, - konstrukcji wektorów genetycznych,- konstrukcji wektorów genetycznych, - syntezy DNA (PCR),- syntezy DNA (PCR), - sekwencjonowania,- sekwencjonowania, - izolacji białek z metryczką histydynową,- izolacji białek z metryczką histydynową, - elektroforezy DNA i białek- elektroforezy DNA i białek

b) badanie uzyskanych konstrukcji w hodowlach tkankowychb) badanie uzyskanych konstrukcji w hodowlach tkankowych przy użyciu mikroskopii wszystkich typów i technik przy użyciu mikroskopii wszystkich typów i technik fluorescencyjnychfluorescencyjnych

Stosowana metodykaStosowana metodyka


Raczkowska A., Brzostek K. 2004. Identification of OmpR protein and its role in the invasion Raczkowska A., Brzostek K. 2004. Identification of OmpR protein and its role in the invasion properties of properties of Yersinia enterocoliticaYersinia enterocolitica. . Pol. J. MicrobiolPol. J. Microbiol. . 5353:11-16.:11-16.

Brzostek K., Raczkowska A. 2007: The YompC protein of Brzostek K., Raczkowska A. 2007: The YompC protein of Yersinia enterocoliticaYersinia enterocolitica: molecular : molecular and physiological characterization. and physiological characterization. Folia Microbiol. 52, 73-80.Folia Microbiol. 52, 73-80.

Brzostek K., Brzóstkowska M., Bukowska I., Karwicka E., Raczkowska A. 2007. Brzostek K., Brzóstkowska M., Bukowska I., Karwicka E., Raczkowska A. 2007. OmpR OmpR negatively regulates expression of invasin in negatively regulates expression of invasin in Yersinia enterocoliticaYersinia enterocolitica . . MicrobiologyMicrobiology SGM 153, SGM 153, 2416-2425.2416-2425.

Wiśniewski, Jarosław M., Bielecki J. 2004. Polymerizer-mediated intracellular movement. Wiśniewski, Jarosław M., Bielecki J. 2004. Polymerizer-mediated intracellular movement. Pol. Pol. J. Microbiol.J. Microbiol., , 5353, 35-38. , 35-38.

Krawczyk-Balska A, Bielecki J., 2005. Krawczyk-Balska A, Bielecki J., 2005. Listeria monocytogenesListeria monocytogenes listeriolysin O and listeriolysin O and phosphatidylinositol - specific phospholipase C affect adherence to epithelial cells. phosphatidylinositol - specific phospholipase C affect adherence to epithelial cells. Can. J. Can. J. MicrobiolMicrobiol., ., 5151((99), 745-751.), 745-751.

Wiśniewski J., Krawczyk-Balska A. & Bielecki J., 2006. Associated roles of hemolysin and p60 Wiśniewski J., Krawczyk-Balska A. & Bielecki J., 2006. Associated roles of hemolysin and p60 protein for the intracellular growth of protein for the intracellular growth of Bacillus subtilisBacillus subtilis. . FEMS Immunology & Medical FEMS Immunology & Medical MicrobiologyMicrobiology , , 46(3), 330 – 339.46(3), 330 – 339.

Wybrane publikacjeWybrane publikacje


BiotechnologiaBiotechnologia

Mikrobiologia przemysłowaMikrobiologia przemysłowa

Zajęcia dydaktyczne Zajęcia dydaktyczne


Marta Brzóstkowska (2005) „Udział białka MalT w regulacji ekspresji i sekrecji Marta Brzóstkowska (2005) „Udział białka MalT w regulacji ekspresji i sekrecji czynników wirulencji czynników wirulencji Yersinia enterocoliticaYersinia enterocolitica serotyp O:9”. serotyp O:9”.

Magdalena Kieliszek(2005) „Wpływ mutacji w genie ompR na poziom ekspresji Magdalena Kieliszek(2005) „Wpływ mutacji w genie ompR na poziom ekspresji genów wirulencji genów wirulencji Yersinia enterocoliticaYersinia enterocolitica O:9. Udział białek porynowych w O:9. Udział białek porynowych w antybiotykooporności szczepu.”antybiotykooporności szczepu.”

Ewa Karwicka (2006) „Wpływ warunków środowiska na ekspresję inwazyny Ewa Karwicka (2006) „Wpływ warunków środowiska na ekspresję inwazyny Yersinia Yersinia enterocoliticaenterocolitica O:9 – rola białka OmpR w osmoregulacji” O:9 – rola białka OmpR w osmoregulacji”

Paulina Nojek (2006) „Białka YOP Paulina Nojek (2006) „Białka YOP Yersinia enterocolitica Yersinia enterocolitica i ich rola w procesie i ich rola w procesie patogenezy – właściwości biologiczne cytotoksyny YopEpatogenezy – właściwości biologiczne cytotoksyny YopE

Karol Szawaryn (2006). „Wewnątrzkomórkowa lokalizacja Karol Szawaryn (2006). „Wewnątrzkomórkowa lokalizacja Bacillus subtilisBacillus subtilis wyrażającego hemolizynę wyrażającego hemolizynę Listeria monocytogenesListeria monocytogenes”.”.

Maria Karwowska (2007). „Maria Karwowska (2007). „Konstrukcja nowego wektora umożliwiającego Konstrukcja nowego wektora umożliwiającego klonowanie dowolnych genów w klonowanie dowolnych genów w Bacillus subtilisBacillus subtilis””..

Gabriela Szmyd (2008) „Gabriela Szmyd (2008) „Listeria monocytogenesListeria monocytogenes jako narzędzie w biotechnologii jako narzędzie w biotechnologii medycznej”medycznej”

Sebastian Mielnicki (2008) „Strategie klonowania oraz wektory bekspresyjne dla Sebastian Mielnicki (2008) „Strategie klonowania oraz wektory bekspresyjne dla Bacillus subtilisBacillus subtilis””

Przykładowe prace licencjackiePrzykładowe prace licencjackie


Marta Brzóstkowska (2005) „Udział białka MalT w regulacji ekspresji i sekrecji Marta Brzóstkowska (2005) „Udział białka MalT w regulacji ekspresji i sekrecji czynników wirulencji czynników wirulencji Yersinia enterocoliticaYersinia enterocolitica serotyp O:9”. serotyp O:9”.

Magdalena Kieliszek(2005) „Wpływ mutacji w genie ompR na poziom ekspresji Magdalena Kieliszek(2005) „Wpływ mutacji w genie ompR na poziom ekspresji genów wirulencji genów wirulencji Yersinia enterocoliticaYersinia enterocolitica O:9. Udział białek porynowych w O:9. Udział białek porynowych w antybiotykooporności szczepu.”antybiotykooporności szczepu.”

Ewa Karwicka (2006) „Wpływ warunków środowiska na ekspresę inwazyny Yersinia Ewa Karwicka (2006) „Wpływ warunków środowiska na ekspresę inwazyny Yersinia enterocolitica O:9 – rola białka OmpR w osmoregulacji”enterocolitica O:9 – rola białka OmpR w osmoregulacji”

Olga Anna Osińska (2005) „Domena TN białka p60 Olga Anna Osińska (2005) „Domena TN białka p60 Listeria monocytogenesListeria monocytogenes: rola w : rola w procesie adhezji do powierzchni komórek nabłonka oraz znaczenie dla aktywności procesie adhezji do powierzchni komórek nabłonka oraz znaczenie dla aktywności murolitycznej”.murolitycznej”.

Anna Piasecka (2006) „Właściwości fragmentu 296-299 hemolizyny Anna Piasecka (2006) „Właściwości fragmentu 296-299 hemolizyny Escherichia coliEscherichia coli””Paulina Godzik (2007) „Rola białka Lmo0409 we wczesnych etapach patogenezy Paulina Godzik (2007) „Rola białka Lmo0409 we wczesnych etapach patogenezy Listeria monocytogenes”.Listeria monocytogenes”.

Paweł Wawrzyniak (2009) „Paweł Wawrzyniak (2009) „Modyfikacja wektora ekspresyjnego pSW12 Modyfikacja wektora ekspresyjnego pSW12 umożliwiającego produkcję listeriolizyny O w Bacillus subtilisumożliwiającego produkcję listeriolizyny O w Bacillus subtilis””

Przykładowe prace magisterskiePrzykładowe prace magisterskie


ZESPÓŁ I• prof. dr hab. Zdzisław Markiewicz

(emeritus)• dr Magdalena Popowska (p. 320)• dr Agata Krawczyk-Balska (p. 325)• dr Dorota Korsak (p. 325)

GRUPA BADAWCZA (poprzednio ZMO)GRUPA BADAWCZA (poprzednio ZMO)w Zakładzie Mikrobiologii Stosowanejw Zakładzie Mikrobiologii Stosowanej

ZESPÓŁ II

•prof. dr hab. Roman Mycielski (emeritus)

•dr Hanka Boszczyk-Maleszak (p. 427)

•dr Marzena Rzeczycka (p. 414)

•dr Antoni Miernik (p. 421)

•mgr Agnieszka Suszek

•mgr Adam Kopera

TEMATYKA BADAWCZA – I TEMATYKA BADAWCZA – I ZespółZespół

I. Struktura i funkcje osłon bakteryjnych oraz związanych i nimi białek:

• badanie fizjologicznej funkcji enzymów o charakterze hydrolaz mureiny oraz wybranych białek powierzchniowych w komórkach L. monocytogenes • Poszukiwanie przedstawicieli nowej grupy hydrolazy mureiny Listeria monocytogenes – adhezyny/autolizyny• poszukiwanie nowych celów dla leków - białka powierzchniowe; kwasy tejchojowe i lipotejchojowe(Grant realizowany)

II. Mechanizmy oporności na antybiotyki stosowane w medycynie: • badanie występowania oporności izolatów środowiskowych i klinicznych Listeria monocytogenes na antybiotyki/chemioterapeutyki oraz poszukiwanie molekularnych mechanizmów tej oporności (Grant realizowany) • Rola wybranych genów Listeria monocytogenes, których ekspresja jest indukowana przez antybiotyki -laktamowe, w determinowaniu oporności i/lub tolerancji na -laktamy – poszukiwanie nowych celów działania dla chemioterapeutyków w terapii listeriozy. (Realizacja tematu z poprzedniego grantu - Grant złożony)

TEMATYKA BADAWCZA – II TEMATYKA BADAWCZA – II ZespółZespół

I. Analiza oporności na wybrane antybiotyki (erytromycynę, oksyteteracyklinę) naturalnych zespołów bakterii izolowanych z osadów dennych stawów hodowlanych i innych zbiorników wodnych

II. Biodegradacja nitrozwiązków, charakterystyka fizjologiczna oraz molekularna szczepów bakterii wyizolowanych z rejonów skażonych (poligony wojskowe), zdolnych do rozkładu nitrozwiązków (materiały wybuchowe) (Grant złożony)

III. Mikrobiologiczne usuwanie wysokich stężeń fenolu ze ścieków• metodą osadu czynnego• z zastosowaniem błony biologicznej na złożu.

Badania bioróżnorodności i aktywności mikroorganizmów środowiskowych z wykorzystaniem min. metod biologii molekularnej (amplifikacja PCR, klonowanie, sekwencjonowanie)

PrProponowaneoponowane tematy tematy pracprac licenlicenccjackijackichch

• Nanobakterie - fakty i mity• Oporność drobnoustrojów: strategia przetrwania • Bioteroryzmy - charakterystyka wybranych aspektów• Mikroflora organizmu ludzkiego – wybrane aspekty• praca praktyczna polegająca na określeniu zmian

wrażliwości na antybiotyki już uzyskanych szczepów mutantów L. monocytogenes

• Stosowanie antybiotyków w stawach hodowlanych, bilans zysków i strat

• Produkcja wodoru przez mikroorganizmy, wybrane aspekty

• Bakterie żelaziste, charakterystyka i znaczenie

ZESPÓŁ I – molekularny

Kontakt: dr M.Popowska (III piętro, p. 320)

kierunek biotechnologia

Ilość osób na licencjat: 4-6; na pracownię magisterską: 4-6

ZESPÓŁ II – środowiskowyKontakt: dr H.Boszczyk-Maleszak (IV pietro, p. 427)

kierunek biologia; ochrona środowiska

Ilość osób na licencjat: 3; na pracownię magisterską: 3

Spotkanie informacyjne dla zainteresowanych, odbędzie się 17 marca br. o godz. 12,00, sala 301A, III piętro

Dziękuję za uwagę

dr hab., prof. uw jacek bielecki – kierownik (+22) 554 13 04 e-mail: [email protected]

Documents