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DPCデータ分析環境をSQL SERVER® 2012 EXPRESS & Access®で構築する
産業医科大学 公衆衛生学教室 産業医科大学病院 医療情報部
村松圭司
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セミナー受講時の注意 • 当日は実習形式ではありません • 時間の都合上一部省略して紹介します
– 講演時間;約45分 – 後日作業するための資料として活用ください – 当日はつまづきやすい箇所を集中的に紹介します
• PCを持参して作業しながら聴講されても構いませんが、個別の対応はできません
• スライド以外は産業医科大学公衆衛生学教室ウェブサイトからダウンロードしてください – http://bit.ly/17xowAt
2015/2/28 2
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本日の内容 • なぜ2つのアプリケーションを使うのか • SQL SERVER®2012 Express インストール • Access®へのDPCデータのインポート • SQL SERVER®での新規DB・テーブル作成 • Access®からのエクスポート • SQL SERVER®でのデータ集約 • Access®でSQL SERVER®のDBを用いて
分析を行う 2015/2/28 3
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SQL SERVER® 2012 EXPRESS vs Access® 2010
SQL SERVER® 2012 EXPRESS • 最大サイズ; 10GB/DB • クエリデザインのGUIが
無い • 付属のインポートツール
の使い勝手が悪い – コマンドプロンプト使用は
ハードルが高い • 無償
Access® 2010 • 最大サイズ; 約2GB • 慣れたUI・Reporting • インポート機能の保存が
可能 • 有償 • 一般的に普及している
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大きなデータを慣れたUIで 定型処理することができる
組み合わせる メリット
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想定する作業環境・人的要件 • ディスク領域が十分に確保されている
– SSD搭載マシンは外部ストレージ使用が無難 • メモリサイズが大きい(8GB以上)
– 例)1年分のFファイル検索で8GB超 • Accessが既にインストールされている • Accessでクエリデザインができる
– 本資料ではAccessの詳細な解説は省略
2015/2/28 5
DPCデータの分析を行いたいが、大規模なハード導入が困難 自前解析のメリットを理解し実践する(ための技術を習得する)熱意がある
本実習の TARGET
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SQL SERVER ® 2012 Express • Microsoft社が開発しているリレーショナル
データベース管理システム (RDBMS)の無料版 – 基本的な技術は製品版と同一 – デスクトップアプリケーション(もしくは小規模
システム)での使用を想定 • インストール方法
– 以下のサイトからインストーラをダウンロード • http://www.microsoft.com/ja-
jp/download/details.aspx?id=29062
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SQL SERVER® 2012 Express
2015/2/28 7
クリック
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SQL SERVER® 2012 Express 64bit OSの場合 32bit OSの場合
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いずれの場合も「SQLEXPRADV」の文字列が含まれるインストーラをダウンロード 理由→後々便利な機能を使いたくなった時に追加インストール作業が煩雑
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SQL SERVER® 2012 Express
2015/2/28 9
チェック
クリック
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SQL SERVER® 2012 Express
2015/2/28 10
クリック
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SQL SERVER® 2012 Express
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ダブルクリック
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SQL SERVER® 2012 Express
2015/2/28 12
インストーラーを開くのに時間がかかる場合もありますが 気長に待ちましょう
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SQL SERVER® 2012 Express
2015/2/28 13
クリック
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SQL SERVER® 2012 Express
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ライセンス事項を読み 同意できればチェック
クリック
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SQL SERVER® 2012 Express
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クリック
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SQL SERVER® 2012 Express
2015/2/28 16
クリック
LocalDB以外 すべてにチェック
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SQL SERVER® 2012 Express
2015/2/28 17
このまま
クリック
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SQL SERVER® 2012 Express
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混合モード
次頁へ
パスワードを決定 (忘れない!)
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SQL SERVER® 2012 Express
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デフォルトの保存場所を変更したい場合 (常に同一の外部ストレージを使用するなど)の場合は この時点で変更をしておくと便利
ユーザデータベースディレクトリ ユーザデータベースログディレクトリ
クリック (次へ)
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SQL SERVER® 2012 Express
2015/2/28 20
クリック
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SQL SERVER® 2012 Express
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SQL SERVER® 2012 Express
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SQL SERVER® 2012 Express
2015/2/28 23
クリック
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SQL SERVER® 2012 Express
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クリックして起動 (SQL Server
Management Studio)
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SQL SERVER® 2012 Express
2015/2/28 25
入力
クリック
SQL Server 認証を選択
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SQL SERVER® 2012 Express
2015/2/28 26
起動後の画面
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Access®へのデータのインポート
• DPCデータのインポートを毎月もしくは3か月に1回実施する
2015/2/28 27
FF1,D,E,F Access® SQL SERVER®
FF1,D,E,F Access®
201501
201502
保存用
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Access®へのデータのインポート
クリック
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Access®へのデータのインポート
クリック
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Access®へのデータのインポート それぞれ適切なデータ型とフィールド名を選択・入力
クリック
参考用Accessファイル同梱しています
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Access®へのデータのインポート
クリック
クリック
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Access®へのデータのインポート
クリック
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Access®へのデータのインポート
入力
クリック
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次回以降のインポート • 先月のファイルをコピー
– インポート操作が保存されている • テーブルの削除クエリを実行
– データを空にする • 保存されたインポート操作を実行
– 読み込むフォルダ・ファイル名を同じに
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次回以降のインポート
クリック
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次回以降のインポート
必ずこのパスのファイルを 読み込もうとします。 最も簡単なのは ・読み込み用フォルダを作る ・その中に毎度同じ名前で ファイルを入れる ・インポート の流れです。
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新規Databaseの作成 • 10GBの制限を超えないように構築する
– 改定年・ファイル別に分けるのが無難 • 1か月分の作業用容量を残しておく必要あり • Cf; 産業医科大学病院(年間退院数;約18,000)
– Fファイル 約3.5GB/yr
– 以下のデータベース⇔テーブルを作成
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DB Table 様式1 様式1・その他 Dファイル Dファイル Eファイル Eファイル Fファイル Fファイル
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新規Databaseの作成
2015/2/28 38
クリック
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新規Databaseの作成
2015/2/28 39
データベース名 (IMU_FF1_FYH26)などわかりやすいものが良いでしょう
DBのファイルの保存場所を指定できます デフォルト以外の場所にしたい場合はこの時点で変更
DB名とファイルパスを指定したらOKをクリックすると DBが作成されます
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テーブルの作成
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• SQL SERVER®でクエリを実行し、テーブルを作成する
• 各DBに格納するデータは以下の通り
DB Table 様式1 様式1・その他 Dファイル Dファイル Eファイル Eファイル Fファイル Fファイル
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テーブルの作成
2015/2/28 41
クリック
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テーブルの作成
2015/2/28 42
• クエリを書くウインドウが現れます – 「参考」フォルダ内のテーブル作成クエリ参照 – 実行時の注意点
• テーブルを作成するDBに変更されているか確認 • SQL SERVERではハイライトしたクエリのみ実行
– 何も選択していないときは全クエリが実行される
クリックして変更もしくは 各クエリの最上部に記載の USE [database_name] go で変更
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Access®からのエクスポート
2015/2/28 43
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Access®からのエクスポート
2015/2/28 44
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入力
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Access®からのエクスポート
2015/2/28 45
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Access®からのエクスポート
2015/2/28 46
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Access®からのエクスポート
2015/2/28 47
クリック
SQL Sever Native liantを選択
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Access®からのエクスポート
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2015/2/28 54
「テストは無事に完了しました」と出ればOK
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2015/2/28 55
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2015/2/28 56
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前頁までで作成したもの
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2015/2/28 57
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データの追加 • 各月のデータを、先ほど作成した
テーブルにまとめます – Access®からエクスポートしたデータを
まとめ用テーブルに追加(insert) – エクスポートデータを削除(drop)
• この作業を各月のデータに対し行うことで 1つのDBとして管理できます
2015/2/28 58
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データの追加
2015/2/28 59
この状態になっていればOK (様式1,D,E,Fそれぞれにここまでの作業を行う)
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データの追加
2015/2/28 60
クリック
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データの追加
2015/2/28 61
SELECTの上に INSERT INTO [dbo].[table_name] を追加
無事終了すると (○○件処理されました) と表示される
不要になったテーブルは DROP [dbo].[table_name] で削除できる
追加先のテーブル名
インポートしたテーブル
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Access®へのインポート • SQL SERVER®からAccess®へインポート
– リンクを作成 – Access自体はデータを持たない
• ファイルサイズの限界を考慮せずに済む – 複数のDBに1つのAccess®ファイルから
接続可能
2015/2/28 62
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Access®へのインポート
2015/2/28 63
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2015/2/28 64
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2015/2/28 65
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2015/2/28 66
様式1の固有レコード識別子の例
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2015/2/28 67
Dファイルの固有レコード識別子の例 (算定開始日も追加すると安全)
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2015/2/28 68
Eファイルの固有レコード識別子の例
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2015/2/28 69
Fファイルの固有レコード識別子の例
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Access®へのインポート
2015/2/28 70
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Accessでの活用例 • DPCコードの
リストを作成
2015/2/28 71
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Accessでの活用例 • 副傷病に糖尿病(ICD-10; E11$-E14$)の
入力がある症例の抽出
2015/2/28 72
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QlikView®へのデータ読み込み • SQL Server®からQlikView®へ直接データ
を読み込むことが出来る – ODBC接続をする – ロードスクリプトにSQLを記述する
2015/2/28 73
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QlikView®へのデータ読み込み
2015/2/28 74
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入力 クリック
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QlikView®へのデータ読み込み
2015/2/28 75
User,Passは暗号化されるので安心
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QlikView®へのデータ読み込み
2015/2/28 76
SQL ServerからSelect文をコピー
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セミコロン(;)を追加
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まとめ • SQL Serverで構築したDBをAccessやQV
で活用する方法について紹介した • 公開データの分析だけでは自院の姿は
みえてこない • 当事者自身が手を動かすことではじめて
明らかになる事実がある • DPCデータの本質
– 医療の「標準化」と「透明化」
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