deuxième année · - lui permettre ainsi d'acquérir des connaissances fondamentales et...

34
Licence Sciences de la Vie Deuxième année Livret de l’étudiant 2015-2016 mise à jour le 6 octobre 2015

Upload: vukhue

Post on 16-Sep-2018

220 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Page 1: Deuxième année · - lui permettre ainsi d'acquérir des connaissances fondamentales et pratiques de niveau Bac+3 ... en biochimie structurale, en génétique, ... Travaux pratiques

Licence Sciences de la VieDeuxième année

Livret de l’étudiant

2015-2016

mise à jour le 6 octobre 2015

Page 2: Deuxième année · - lui permettre ainsi d'acquérir des connaissances fondamentales et pratiques de niveau Bac+3 ... en biochimie structurale, en génétique, ... Travaux pratiques

Licence Sciences de la Vie

Informations générales

Martine [email protected]

(Secrétariat)+33238417097

Directrice des étudesDans le cadre de l'harmonisation européenne des cur-

sus universitaires (réforme LMD Licence-Master-Doctorat), les

mentions de Licence sont constituées de 6 semestres.

Parcours et objectifs

La licence mention � Sciences de la Vie � a pour objectifs de :

- former un public étudiant à toutes les disciplines de la biologie : biologie générale animale et

végétale, biologie cellulaire et moléculaire, génétique formelle et des populations, physiologie animale

et physiologie végétale, biotechnologies, écologie, biologie des organismes et des populations.

- lui permettre ainsi d'acquérir des connaissances fondamentales et pratiques de niveau Bac+3

dans tous les secteurs techniques et scienti�ques des Sciences de la Vie, ces connaissances étant

indispensables à une poursuite d'études vers les Masters Recherches et Professionnels ou à l'inté-

gration dans le monde professionnel dans ce domaine.

- préparer au concours du CAPES Sciences de la Vie et de la Terre, via une insertion dans un

Master de préparation au concours du CAPES (exemple le Master MEEF-SVT d'Orléans)

- préparer au concours pour le Professorat des écoles, via une insertion dans un Master de

préparation au concours (exemple le Master MEEFA ESPE d'Orléans) mettre à disposition les sa-

voirs et les connaissances existants à l'Université d'Orléans dans le domaine des Sciences biologiques.

La première année de la licence mention � Sciences de la Vie � est organisée en deux semestres.

Le premier est un semestre d'enseignement pluridisciplinaire, commun à tous les étudiants. Au second

semestre, deux options peuvent être choisies par les étudiants :

� L'option Biologie-Biochimie, qui permet d'acquérir les bases d'une formation généraliste

en sciences biologiques. Ce parcours permet par la suite d'accéder aux di�érents parcours

de la licence Sciences de la Vie :

Le parcours � Biologie des Organismes, des Populations et des Ecosystèmes �

(BOPE) s'intègre dans le contexte actuel de l'essor des disciplines de l'écologie de la bio-

diversité et de l'étude de l'environnement. Ce parcours permet aux étudiants d'approfondir

leurs connaissances sur les inter-relations des êtres vivants, animaux ou végétaux, ainsi que

les liens avec leur environnement. Les mécanismes adaptatifs, évolutifs, physiologiques et

génétiques seront abordés au niveau des organismes et des populations. Pour ce faire, au-

delà des connaissances théoriques, des études sur le terrain et en laboratoire, intégrant les

2

Page 3: Deuxième année · - lui permettre ainsi d'acquérir des connaissances fondamentales et pratiques de niveau Bac+3 ... en biochimie structurale, en génétique, ... Travaux pratiques

outils modernes de la biologie moléculaire sont proposées.

Le parcours � Biologie Moléculaire et Cellulaire � (BMC) est destiné aux étudiants

voulant aborder le monde vivant, par ses aspects physiologiques, cellulaires et moléculaires.

Ce parcours permettra aux étudiants d'acquérir des connaissances en biologie moléculaire,

en biochimie structurale, en génétique, en biochimie, en biophysique en physiologie humaine

et animale et en immunologie. Les aspects pratiques permettront aux étudiants d'acquérir

une initiation au travail en laboratoire dans ces di�érents domaines. Un choix d'option

de chimie en semestre 6 peut aussi permettre à l'étudiant d'acquérir des connaissances

spéci�ques à la chimie bioorganique.

� L'option SVT, contenant des enseignements adaptés aux étudiants désireux de poursuivre

une formation pour préparer les concours du CAPES Sciences de la vie et de la terre

(Parcours � Biologie et Sciences de la Terre � (BST)).

� Le parcours " Pluridisciplinaire " (PLURI) s'adresse aux étudiants souhaitant obtenir

une niveau Bac+3 a�n de postuler aux concours de la fonction publique d'une part, mais

surtout d'intégrer les Masters préparant au concours de professorat des écoles (comme celui

proposé par l'ESPE d'Orléans-Tours). Pour ce faire, des enseignements scienti�ques seront

complétés en troisième année par des unités de mathématiques, de français et d'anglais

proposé par l'ESPE. Les étudiants en première année souhaitant s'orienter vers ce parcours

peuvent choisir l'une ou l'autres des options proposées par la licence Sciences de la Vie.

Conditions d'admission

Semestre 3 : Pour les étudiants inscrits dans le cursus, avoir obtenu au moins un des semestres

de première année de licence.

Pour les étudiants provenant d'autres cursus (Prépa, classes BTS, IUT. . . .) : Après examen des

dossiers par la commission d'équivalence.

Orientation et réorientation

Le choix du parcours de licence (général ou enseignement) s'est e�ectué à l'issue du premier

semestre de L1. Au-delà du premier semestre, le suivi de l'étudiant dans ses choix d'orientation

sera assuré par une commission composée des responsables pédagogiques des semestres et des

représentants des disciplines concernées.

Le choix du parcours en L2 se fera lors de la réunion de pré rentrée ou dans les jours qui

suivent cette réunion. L'étudiant pourra être aidé dans son choix par les directeurs des études. Un

changement de parcours reste possible entre les semestres 3 et 4.

3

Page 4: Deuxième année · - lui permettre ainsi d'acquérir des connaissances fondamentales et pratiques de niveau Bac+3 ... en biochimie structurale, en génétique, ... Travaux pratiques

Glossaire

Unités d'enseignement :

Ensemble d'enseignements comprenant des cours, TD, TP ou autres travaux personnels. Chaque

unité est a�ectée d'ECTS et fait l'objet d'un contrôle de connaissances.

Unités d'ossature : unités d'enseignement obligatoires correspondant à la formation de l'étu-

diant dans la licence pour le parcours choisi.

Unités de di�érenciation : unités à choisir dans une sélection d'unités proposées pour person-

naliser son parcours.

Unités libres : UE permettant à l'étudiant de compléter sa formation (culture générale, mé-

thodologie universitaire, éléments de professionnalisation, stages, compléments de langue,

utilisation des ressources documentaires. . . ). Unités à choisir dans le livret des UE libres de

l'ensemble des composantes de l'Université.

Crédits ECTS (European Credits Transfer System = Système Européen de

Crédits de Transfert)

� A chaque unité d'enseignement (UE) est a�ectée une valeur en crédits qui correspond au

volume du horaire de l'unité. Les crédits sont attribués quand l'unité est validée (note >

ou = à 10/20).

� Chaque semestre validé correspond à 30 crédits. Une licence correspond donc à 180 crédits

(6 semestres).

� Ces crédits représentent une monnaie d'échange et sont :

� Transférables dans toute autre université européenne ;

� Capitalisables c'est-à-dire dé�nitivement acquis quelle que soit la durée du parcours de

l'étudiant.

Grade :

Les grades universitaires sanctionnent les divers niveaux de l'enseignement supérieur. Depuis le

décret du 8 avril 2002 ce sont : le baccalauréat, la licence, le master et le doctorat.

Diplôme :

A chaque grade correspond un titre ou un diplôme. Sont conservées les possibilités de délivrer

deux diplômes intermédiaires, ne correspondant pas à un des grades précédents :

4

Page 5: Deuxième année · - lui permettre ainsi d'acquérir des connaissances fondamentales et pratiques de niveau Bac+3 ... en biochimie structurale, en génétique, ... Travaux pratiques

� celui de maîtrise (correspondant aux 60 crédits ECTS des semestres 1 et 2 de master) �

(article 9 de l'arrêté du 25 avril 2002 relatif au diplôme de master),

� celui de DEUG (correspondant aux 120 crédits ECTS des semestres 1, 2, 3 et 4 de licence)

� (article 2 de l'arrêté du 23 avril 2002 relatif aux études universitaires conduisant au grade

de licence).

Ces deux derniers diplômes sont délivrés dans la mention retenue sans indication de

parcours ou de spécialité, mais accompagnés d'un � supplément au diplôme �.

Supplément au diplôme

(décret du 8 avril 2002 portant application au système français d'enseignement supérieur de la

construction de l'Espace européen de l'enseignement supérieur. Art. 2). C'est une annexe descriptive

au diplôme, destinée à assurer la lisibilité des connaissances et aptitudes acquises dans le cadre de

la mobilité internationale.

Equipe de formation :

Chaque mention de licence ou master est pilotée par une équipe de formation qui veille à

l'adéquation de l'organisation des études avec les objectifs �xés, organise l'évaluation générale des

formations et élabore un bilan annuel de la formation.

Conseil de Perfectionnement :

Equipe de formation élargie à des représentants étudiants élus et des personnalités du monde de

la recherche académique, du monde de l'entreprise et des enseignants en lycée (classes du secondaire

et de BTS). Réuni une fois par an, ce conseil, à la lecture des évaluations de la formation, fait évoluer

la licence pour l'adapter au monde socio-économique, de la recherche et aux formations antérieures.

Directeur des études :

En contact direct avec les étudiants et la scolarité du collegium ST, il anime l'équipe pédago-

gique.

Jury :

Constitué pour chaque semestre et présidé par le Directeur des études, il a en charge le recueil

des notes, l'établissement des moyennes et la validation du semestre. Un jury d'année réuni après

chaque session a en charge la délivrance de l'année et pour la L3 la délivrance �nale du diplôme.

5

Page 6: Deuxième année · - lui permettre ainsi d'acquérir des connaissances fondamentales et pratiques de niveau Bac+3 ... en biochimie structurale, en génétique, ... Travaux pratiques

Compensations :

� Pour chaque semestre, si la note globale moyenne est supérieure ou égale à 10/20, le

semestre est validé et lui sont associés 30 ECTS.

� La compensation annuelle s'organise dès la première session entre les deux semestres consé-

cutifs d'une même année universitaire : soit le semestre 5 avec le semestre 6.

Notes éliminatoires :

Pas de note éliminatoire en licence

6

Page 7: Deuxième année · - lui permettre ainsi d'acquérir des connaissances fondamentales et pratiques de niveau Bac+3 ... en biochimie structurale, en génétique, ... Travaux pratiques

Le semestre 3

Maquette des enseignements

Option Biologie-Biochimie :

Intitulé ECTS Coe�. CM TD TP

Ossature

-16ECTS

Bases fondamentales de biologie molécu-

laire5 5 26 22

Métabolisme général 3 3 20 10

Photosynthèse-nutrition 2 2 18 2 4

Enzymologie 3 3 12 6 12

Anglais 3 3 3 24

Stage facultatif 0 0

Choix

110ECTS Bases d'embryologie 5 5 24 8 16

Physiologie des cellules excitables 3 3 12 10 14

Chimie Organique 5 5 18 18 12

Choix

24ECTS

-surOrléans-

Travaux pratiques photosynthèse 1 1 8

Ecologie : relations population-

environnement3 3 16 4 4

Maths prépa concours 1 3 3 24

Physique pour les biosciences 4 4 13 14 9

UE Libre 3 3 20

Choix

24ECTS

-surChartres-

Ecologie : relations population-

environnement3 3 16 4 4

Travaux pratiques photosynthèse 1 1 8

Histoire des sciences naturelles 3 3 20

7

Page 8: Deuxième année · - lui permettre ainsi d'acquérir des connaissances fondamentales et pratiques de niveau Bac+3 ... en biochimie structurale, en génétique, ... Travaux pratiques

Option SVT (sur Orléans uniquement) :

Intitulé ECTS Coe�. CM TD TP

Ossature

-30ECTS

Bases fondamentales de biologie moléculaire 5 5 26 22

Métabolisme général 3 3 20 10

Photosynthèse-nutrition 2 2 18 2 4

Enzymologie 3 3 12 6 12

Anglais 3 3 3 24

Ecologie : relations population-environnement 3 3 16 4 4

Tectonique et géophysique 4 4 26 10 24

Sédimentologie et pétrologie sédimentaire 3 3 20 4 24

Système terre 4 4 30 16 9

Détail des enseignements

8

Page 9: Deuxième année · - lui permettre ainsi d'acquérir des connaissances fondamentales et pratiques de niveau Bac+3 ... en biochimie structurale, en génétique, ... Travaux pratiques

SOL3BH01SSL3BH01

Bases fondamentales de biologie moléculaire

Durée�i1 48 h

Cours à 26 hTD à 22 h

Semestre 3Objectifs+ Acquérir les

connaissances debase sur lesmécanismesfondamentaux dela transmissiondel’informationgénétique.

Langue(s)

Français

Options Biologie-Biochimie et SVT

Responsable Alain Legrand å [email protected]

Contenu

— Biologie moléculaire et dogme central de la biologie. Transmission de l’informationgénétique : du gène à la protéine.

— Structure des acides nucléiques (ADN / ARN), supports de l’information génétique.— Conservation de l’information génétique : réplication et notions de réparation de

l’ADN.— Expression des gènes : production d’ARN (transcription).— Finalisation du message génétique chez les organismes eucaryotes : maturation des

ARN messagers (modifications post-transcriptionnelles).— Décryptage du code génétique : traduction des ARNm ; acteurs de la traduction et

mécanismes.— Modifications des protéines (modifications post traductionnelles).— Notions de technologies en biologie moléculaire.

Évaluation5Coefficient 5ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CC 1h + CT 2hà Session de rattrapage : RNE et RSE : CT 2h

Calcul de la note finale :à Première session : CC 30% + CT 70%à Session de rattrapage : CT 100%

9

Page 10: Deuxième année · - lui permettre ainsi d'acquérir des connaissances fondamentales et pratiques de niveau Bac+3 ... en biochimie structurale, en génétique, ... Travaux pratiques

SOL3AG23SSL3AG23

Anglais 3

Durée�i1 24 h

TD à 24 hSemestre 3

Objectifs+ Découvrir les

bases de l’anglaisscientifique et lesutiliser à l’écrit età l’oral.

Langue(s)

FrançaisAnglais

Options Biologie-Biochimie et SVT

Responsable Elise Vinauger-Tela å [email protected]

ContenuTravail de compréhension et d’expression à partir de documents authentiques simpleset/ou courts portant sur des innovations technologiques, des découvertes.Évaluation

3Coefficient 3ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit et oral

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE : CC 2h30 ; RSE : CT 1h30à Session de rattrapage : RNE et RSE : CT 1h

Calcul de la note finale :à Première session : Ecrit/oral 100%à Session de rattrapage : Ecrit 100%

SOL3BH11SSL3BH11

Métabolisme général

Durée�i1 30 h

Cours à 20 hTD à 10 h

Semestre 3Objectifs+ Connaissance des

métabolismesglucidique etlipidique humainde base.

Langue(s)

Français

Options Biologie-Biochimie et SVT

Responsable Eric Hébert å [email protected]

Pré-requis Biochimie générale.

ContenuPrésentation dans l’espèce humaine des voies métaboliques de base des glucides (cata-bolisme et anabolisme) : glycolyse, cycle de Krebs et oxydations phosphorylantes, néo-glucogenèse, voies des pentoses, glycogène), des lipides (acides gras et triglycérides :biosynthèse et dégradation) et des corps cétoniques ; intégration métabolique tissulaire.Différents modes de contrôle hormonal de ces voies (insuline, glucagon, adrénaline) etpathologies associées.Évaluation

3Coefficient 3ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CT 2hà Session de rattrapage : RNE et RSE : CT 2h

Calcul de la note finale :à Première session : Ecrit 100%à Session de rattrapage : Ecrit 100%

10

Page 11: Deuxième année · - lui permettre ainsi d'acquérir des connaissances fondamentales et pratiques de niveau Bac+3 ... en biochimie structurale, en génétique, ... Travaux pratiques

SOL3BH12SSL3BH12

Photosynthèse et nutrition carbonée

Durée�i1 24 h

Cours à 18 hTD à 2 hTP à 4 h

Semestre 3Objectifs+ Acquisition des

basesfondamentales dela physiologie etde la biochimievégétales.

Langue(s)

Français

Options Biologie-Biochimie et SVT

Responsables Daniel Hagège å [email protected] Lainé å [email protected]

ContenuLes bases de la photosynthèse ; photosynthèse des plantes en C3 : acte photochimique etfixation du CO2 atmosphérique (Cycle de Calvin), biosynthèse de l’amidon et du saccha-rose. Photorespiration, photosynthèse des plantes en C4 et CAM.Évaluation

2Coefficient 2ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit et oral

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CT (E) 2h / CC (TP)à Session de rattrapage : RNE et RSE : CT (E) 2h / TP (oral) 15 min

Calcul de la note finale :à Première session : Ecrit 67 % ; TP 33 %à Session de rattrapage : Ecrit 67 % ; TP 33 %

SOL3BH13SSL3BH13

Enzymologie

Durée�i1 30 h

Cours à 12 hTD à 6 hTP à 12 h

Semestre 3Objectifs+ Connaissance des

bases del’enzymologie.

Langue(s)

Français

Options Biologie-Biochimie et SVT

Responsable Richard Daniellou å [email protected]

Pré-requis Biochimie générale.

ContenuDéfinitions, origine de la catalyse, Cinétique michaelienne, Modèles d’inhibition, applica-tion des enzymes en sciences, en santé, en agroalimentaire et en environnement.Évaluation

3Coefficient 3ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit et oral

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CT (E) 2h / CC (TP) (écrit)à Session de rattrapage : RNE et RSE : CT (E+TP) 2h15 (écrit/oral)

Calcul de la note finale :à Première session : Ecrit 75% ; TP 25 %à Session de rattrapage : Ecrit 75% ; TP 25 %

11

Page 12: Deuxième année · - lui permettre ainsi d'acquérir des connaissances fondamentales et pratiques de niveau Bac+3 ... en biochimie structurale, en génétique, ... Travaux pratiques

SOL3BO01SSL3BO01

Physiologie des cellules excitables

Durée�i1 48 h

Cours à 24 hTD à 10 hTP à 14 h

Semestre 3Objectifs+ Connaissance du

fonctionnementdes biomembranes,de la signalisationnerveuse et de laphysiologie descellules excitables,introduction auxtechniques d’élec-trophysiologie etl’étude des canauxioniques et descourants trans-membranaires.Connaissance enneuro-antomie etdu fonctionnementdu systèmenerveux central.

Langue(s)

Français

Option Biologie-Biochimie

Responsable William Même å [email protected]

Pré-requis Connaissances de biologie cellulaire.

ContenuPhysiologie cellulaire : fonctionnement des cellules excitables (cellules nerveuses, mus-culaires striées et lisses). Rôle de la membrane plasmique et des échanges membranairespassifs et actifs dans le fonctionnement de la cellule excitable (gradients de concentra-tion, de flux ioniques à travers les membranes semi-perméables, les canaux ioniques etles transporteurs). Potentiel d’action neuronal et propagation de l’information nerveuseet neuro-musculaire. Couplage excitation-contraction des muscles striés et lisses. Pre-mière approche de la neurotransmission (neurotransmetteurs, récepteurs membranaires,synapse). Physiologie cardiaque : organisation générale du tissu cardiaque au niveau ma-croscopique et microscopique (cardiomyocytes). Etude de l’activité électrique au niveaucellulaire (tissu pacemaker, tissu conducteur, potentiels d’action) et global (électrocar-diogramme). L’activité mécanique cardiaque (le couplage excitation-contraction, la révo-lution cardiaque). Sensibilité et traitements sensoriels : étude de la transduction, l’enco-dage, transmission et de la perception des stimuli de l’environnement. Fonctionnement dela chaîne d’événements de l’activation des récepteurs périphériques à l’intégration céré-brale (somesthésie, olfaction et gustation). Les travaux pratiques illustreront les contenusdu cours par des expérimentations sur tissu vivant (nerf isolé, préparation nerf-muscle),observation de coupes histologiques et modélisation informatique (le potentiel d’actionneuronal, les canaux ioniques).Évaluation

5Coefficient 5ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CT (E 2h + TP 1h) + CC (TP)à Session de rattrapage : RNE et RSE : CT (E 2h + TP 1h)

Calcul de la note finale :à Première session : Ecrit 67% + TP 33%à Session de rattrapage : Ecrit 67% + TP 33%

12

Page 13: Deuxième année · - lui permettre ainsi d'acquérir des connaissances fondamentales et pratiques de niveau Bac+3 ... en biochimie structurale, en génétique, ... Travaux pratiques

SOL3CH02SSL3CH02

Chimie organique

Durée�i1 48 h

Cours à 18 hTD à 18 hTP à 12 h

Semestre 3Objectifs+ Pouvoir identifier,

nommerdifférentesfonctions etcomposéschimiques.Connaître etcomprendre destransformationschimiques.Approche de lastratégie desynthèse. Initiationà la synthèsemultiétapes.

Langue(s)

Français

Parcours Biologie-Biochimie

Responsable Frederic Buron å [email protected]

Pré-requis Introduction à la chimie organique.

ContenuEtude des grandes réactivités (substitution, élimination, addition) associées aux fonc-tions essentielles du monde du vivant, les insaturations (alcènes et alcynes), les fonctionsalcool et carbonyles, pour une meilleure compréhension des phénomènes biochimiques.Présentation des réactivités, des mécanismes et des intermédiaires réactionnels.Évaluation

5Coefficient 5ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE : CC (E(2)+TP) 3h + CR TP ; RSE : CT (E+TP) 2hà Session de rattrapage : RNE et RSE : CT(E) 2h + CT(TP) 1h

Calcul de la note finale :à Première session : RNE : E 67% + TP 33% ; RSE CT 100%à Session de rattrapage : CT 100%

13

Page 14: Deuxième année · - lui permettre ainsi d'acquérir des connaissances fondamentales et pratiques de niveau Bac+3 ... en biochimie structurale, en génétique, ... Travaux pratiques

SOL3BO02SSL3BO02

Bases d’embryologie

Durée�i1 48 h

Cours à 22 hTD à 14 hTP à 10 hNP à 2 h

Semestre 3Objectifs+ Connaissance des

grandes lignes dudéveloppementanimal. Acquérirun espritsynthétique afin degénéraliser lamajorité desphénomènesétudiés.

Langue(s)

Français

Options Biologie-Biochimie

Responsables Stéphane Pallu å [email protected]éline

Montécot-Dubourgå [email protected]

Pré-requis Connaître les principaux groupes du règne animal.

ContenuCe cours aborde la description des premières étapes de développement de quelques espèceschoisies, la mise en place des plans d’organisation, l’acquisition de polarité, ... Le cours surle développement embryonnaire humain décrira le déroulement de l’embryogénèse précocedu premier mois de gestation. Les TD-TP illustreront le cours sous différents aspects :observation de lames histologiques et d’échantillons, expérimentation in vivo, analysesde résultats d’embryologie expérimentale. L’étudiant approfondira ses connaissances eneffectuant un exposé sur un thème d’embryologie de son choix (la recherche actuelle enembryologie, aspect médical ou écologique de l’embryologie, ...).Évaluation

5Coefficient 5ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CT 2h (CM, TD, TP) + CCà Session de rattrapage : RNE et RSE : CT 2h (CM, TD, TP)

Calcul de la note finale :à Première session : CT 67% + CC 33%à Session de rattrapage : Ecrit 100%

14

Page 15: Deuxième année · - lui permettre ainsi d'acquérir des connaissances fondamentales et pratiques de niveau Bac+3 ... en biochimie structurale, en génétique, ... Travaux pratiques

SOL3PY06SSL3PY06

Physique pour les biosciences

Durée�i1 36 h

Cours à 13 hTD à 14 hTP à 9 h

Semestre 3Objectifs+ Ce module

s’attache à donneraux étudiants lesoutils physiquesnécessaires enSciences de la Vie.Le but essentielest de mettre enévidence certaineslois decomportementpouvant êtredécrites par lesmêmesformalismes, touten reliant ces lois àdes exemples prisdans le domainede la biologie.

Langue(s)

Français

Option Biologie-Biochimie

Responsable Régis Guégan å [email protected]

Pré-requis Toutes les notions de physique et de mathématiques acquises dansl’enseignement secondaire.

ContenuCours et TD :— Rappels de mathématiques.— Lois de comportement : Croissance et décroissance exponentielles / Equilibre dyna-

mique / Régulation /Applications : Élimination d’une substance (notion de clairance)- Phénomènes de régulation biologique (respiration, glycémie, équilibre hormonal)

— Eléments de mécanique des fluides : Hydrostatique /Écoulement des fluides parfaits/ Viscosité

Travaux pratiques : Loi exponentielle (absorption d’un rayonnement par une substance)/ Lentille minces (application à l’œil)Évaluation

4Coefficient 4ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE : CC (CM(3) : 1h/1h/2h + TP(3)) ; RSE : CT (CM +

TP) 2h30à Session de rattrapage : RNE et RSE : CT (CM + TP) 1h

Calcul de la note finale :à Première session : CC1 25 % / CC2 25% / CC3 50%à Session de rattrapage : Ecrit 100%

SOL3BO03SSL3BO03

Travaux pratiques photosynthèse

Durée�i1 8 h

TP à 8 hSemestre 3

Objectifs+ Acquisition des

basesfondamentales dephysiologie etbiochimievégétales

Langue(s)

Français

Option Biologie-Biochimie

Responsable Domenico Morabito å [email protected]

ContenuTravaux pratiques mettant en évidence les bases de la photosynthèse.Évaluation

1Coefficient 1ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit et oral

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CC(2)à Session de rattrapage : RNE et RSE : CT 15min

Calcul de la note finale :à Première session : Ecrit 100 %à Session de rattrapage : Oral 100%

15

Page 16: Deuxième année · - lui permettre ainsi d'acquérir des connaissances fondamentales et pratiques de niveau Bac+3 ... en biochimie structurale, en génétique, ... Travaux pratiques

SOL3BO04SSL3BO04

Ecologie : les relations populations-environnement

Durée�i1 24 h

Cours à 16 hTD à 4 hTP à 4 h

Semestre 3Objectifs+ Les populations

sont les piècesélémentaires dessystèmesécologiques.Etudier lesrelations despopulations avecleurenvironnementabiotique etbiotique, c’est sedonner les notionsde base pour lacompréhension dufonctionnementdes écosystèmes.

Langue(s)

Français

Options Biologie-Biochimie et SVT

Responsable Mathilde Baudé å [email protected]

Pré-requis Ecologie générale

ContenuLes facteurs abiotiques et leur influence sur les êtres vivants (facteurs limitants et adapta-tion des organismes, facteurs climatiques, hydrologiques et édaphiques) ; les populationset leurs interactions (paramètres démographiques, croissance et fluctuations des popu-lations, stratégies démographiques, facteurs de régulation, densité-dépendance, compéti-tions, prédation, parasitisme, interactions positives) ; notions de base sur la structure etl’organisation des peuplements (paramètres fondamentaux : richesse spécifique, diversité,niche écologique).Évaluation

3Coefficient 3ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CT(CM+TD) 1h30 / CC(TP)à Session de rattrapage : RNE et RSE : CT(CM+TD+TP) 2h

Calcul de la note finale :à Première session : CT 67 % ; CC 33 %à Session de rattrapage : CM 33 % ; TD 33 % ; TP 33 %

SOL3MT16 Maths prépa concours 1Durée�i1 20 h

TD à 24 hSemestre 3

Objectifs+ Permettre à des

étudiantsd’acquérir desconnaissancesutiles pour passerles concoursd’accès aux écolesnationalesvétérinaires(concours ENV-voie B), lesconcoursd’ingénieurs agro(concours ENSAvoie B) maiségalement certainsconcoursadministratifs.

Langue(s)

Français

Option Biologie-Biochimie, sur Orléans uniquement

Responsable Athanassios Batakis å [email protected]

Pré-requis Maths niveau BAC S, forte motivation.

ContenuAnalyse : étude des suites et fonctions. Intégration et fonctions différentielles.Évaluation

3Coefficient 3ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CT 2hà Session de rattrapage : RNE et RSE : CT 2h

Calcul de la note finale :à Première session : CT 100%à Session de rattrapage : CT 100%

16

Page 17: Deuxième année · - lui permettre ainsi d'acquérir des connaissances fondamentales et pratiques de niveau Bac+3 ... en biochimie structurale, en génétique, ... Travaux pratiques

SSL3BO07 Histoire des Sciences NaturellesDurée�i1 20 h

TD à 20 hSemestre 3

Objectifs+ Donner une idée

de la démarchescientifique etprésenter, parquelques exemplesbiologiques,l’évolution desconnaissancesscientifiques aucours du temps.

Langue(s)

Français

Option Biologie-Biochimie, sur Chartres uniquement

Responsable Géraldine Roux å [email protected]

ContenuA quoi sert l’histoire des sciences. Du savoir à la science. Histoire des classifications oucomment ordonner la nature. Débat création-évolution. Histoire des neurosciences : com-ment l’Homme essaie de comprendre le fonctionnement de son cerveau : de la préhistoireà nos jours. Histoire de la microbiologie.Évaluation

3Coefficient 3ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CT 2hà Session de rattrapage : RNE et RSE : CT 2h

Calcul de la note finale :à Première session : Ecrit 100%à Session de rattrapage : Ecrit 100%

SOL3GO03 Tectonique et géophysiqueDurée�i1 60 h

Cours à 26 hTD à 10 hTP à 24 h

Semestre 3Objectifs+ Connaissances

générales engéophysique et entectonique.Notions d’analysede la déformationet sur lecomportementmécanique dessolides.Techniques deconstruction decoupes et delecture de cartesgéologiques.

Langue(s)

Français

Option SVT

Responsable Charles Gumiaux å [email protected]

ContenuCours : Géophysique interne et dynamique lithosphérique. Tectonique : cinématique etdéformations aux limites des plaques, régimes tectoniques. Rappels sur les contrainteset la rhéologie. Quantification de la déformation finie. Objets structuraux : failles, plis,schistosité/foliation et linéations, boudinage. Exemples de structures régionales : rifts, do-maines transformants, grandes structures des marges actives (prismes d’accrétion, chaînesde subduction, obduction, bassins arrière-arc), chaînes intracontinentales, chaînes de col-lision. TD : Géophysique : gravimétrie, magnétisme et paléomagnétisme, mécanisme aufoyer des séismes. TP : Analyse de cartes géologiques, construction de coupes, élémentsde dessin cartographique, notions de construction des cartes géologiques.Évaluation

4Coefficient 4ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit et oral

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE : CC(6)/CT 6h ; RSE : CT 5hà Session de rattrapage : RNE et RSE : CT (oral/TP) 3h20

Calcul de la note finale :à Première session : Ecrit 67% ; TP 33%à Session de rattrapage : Oral 67% ; TP 33%

17

Page 18: Deuxième année · - lui permettre ainsi d'acquérir des connaissances fondamentales et pratiques de niveau Bac+3 ... en biochimie structurale, en génétique, ... Travaux pratiques

SOL3GO04 Sédimentologie et pétrologie sédimentaireDurée�i1 48 h

Cours à 20 hTD à 4 hTP à 24 h

Semestre 3Objectifs+ Acquisition des

bases desédimentologie etde diagenèse.Identificationmacroscopique etmicroscopique desminéraux et desrochessédimentaires.Acquisition desoutils dediagnostique desenvironnementssédimentaires.

Langue(s)

Français

Option SVT

Responsable Mohammed Boussafir å [email protected]

Pré-requis Minéralogie et système terre.

ContenuCours : Dynamique et environnement sédimentaires, paléogéograhie, sédimentation conti-nentale (glaciaire, fluviatile, lacustre, éolienne), sédimentation marine (plateforme, talus,profonde), sédimentation organique, diagenèses minérale et organique. TD : Figures etstructures sédimentaires ; Minéralogie sédimentaire, classification TP : Minéralogie etclassification des roches sédimentaires ; Granulométrie, exoscopie des sables et morpho-métrie des galets pour les sédiments et macrofaciès des roches consolidées (détritiquessilicoclastiques, carbonatées, siliceuses non-détritiques, résiduelles, évaporitiques et car-bonées), figures et structures sédimentaires et microfaciès.Évaluation

3Coefficient 3ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit et oral

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CC(7) 8h30à Session de rattrapage : RNE et RSE : CT 3h30

Calcul de la note finale :à Première session : Ecrit 67% ; TP 33%à Session de rattrapage : Oral 67% ; TP 33%

18

Page 19: Deuxième année · - lui permettre ainsi d'acquérir des connaissances fondamentales et pratiques de niveau Bac+3 ... en biochimie structurale, en génétique, ... Travaux pratiques

SOL3GO05 Système TerreDurée�i1 55 h

Cours à 30 hTD à 16 hTP à 9 h

Semestre 3ObjectifsPremière vision dusystème Terre :originalité de laTerrepar rapport aux autresplanètes, etconnaissances desenveloppes terrestres.

Langue(s)

Français

Option SVT

Responsables Christian Di Giovanni å [email protected] Jolivet å [email protected]

Contenup1- La Terre dans le système solaire.2- Terre interne : Les grands séismes et la dynamique du globe (présentation séismes,

rebond élastique, rhéologie et séismes, séismes et cinématique), Le Volcanisme et lesrisques (magmatisme, dynamique volcanisme)

3- Terre externe : le système climatique (physico-chimie de l’atmosphère, climats futurs),les interactions entre enveloppes externes (altération et pédogenèse).

Évaluation4Coefficient 4ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CC(3) 1h/1h/2hà Session de rattrapage : RNE et RSE : Ecrit CT 2h

Calcul de la note finale :à Première session : Ecrit 100%à Session de rattrapage : Ecrit 100%

19

Page 20: Deuxième année · - lui permettre ainsi d'acquérir des connaissances fondamentales et pratiques de niveau Bac+3 ... en biochimie structurale, en génétique, ... Travaux pratiques

Le semestre 4

Maquette des enseignements

Option Biologie-Biochimie :

20

Page 21: Deuxième année · - lui permettre ainsi d'acquérir des connaissances fondamentales et pratiques de niveau Bac+3 ... en biochimie structurale, en génétique, ... Travaux pratiques

Intitulé ECTS Coe�. CM TD TP

Ossature

8ECTS

Anglais 4 3 3 24

Techniques en biologie moléculaire 5 5 18 18 12

Stage facultatif 0 0

Choix

19/10ECTS

Microbiologie générale 4 4 26 6 18

Morphologie et reproduction des plantes 5 5 23 4 21

Puri�cation et analyse des molécules biologiques 5 5 26 6 18

Choix

212/13ECTS

Ecologie des peuplements 4 4 16 4 16

Communication cellulaire et pharmacologie 4 4 24 7 9

L'eau, les minéraux et la plante 4 14 8 14 16

Génétique fonctionnelle 3 3 10 8 6

Chimie organique expérimentale 3 4 24

Chimie pour les biosciences 3 3 8 4 12

Initiation à la valorisation des ressources végé-

tales2 2 8 46

Maths prépa concours 2 (sur Orléans) 3 3 24

UE Libre ou Stage (sur Orléans) 3 3 24

Histoire des sciences naturelles ou Stage

(sur Chartres)3 3 20

21

Page 22: Deuxième année · - lui permettre ainsi d'acquérir des connaissances fondamentales et pratiques de niveau Bac+3 ... en biochimie structurale, en génétique, ... Travaux pratiques

Option SVT (sur Orléans uniquement) :

Intitulé ECTS Coe�. CM TD TP

Ossature

-30ECTS

Techniques en biologie moléculaire 5 5 18 18 12

Anglais 4 3 3 24

Morphologie et reproduction des plantes 5 5 23 4 21

Bassins et stratigraphie séquentielle 3 3 10 2 12

Les algues et les champignons 2 2 10 4 10

L'eau, les minéraux et la plante 4 4 14 8 16

Pétrologie endogène 1 5 5 18 6 24

Ecologie des peuplements 3 3 16 4 16

Détail des enseignements

22

Page 23: Deuxième année · - lui permettre ainsi d'acquérir des connaissances fondamentales et pratiques de niveau Bac+3 ... en biochimie structurale, en génétique, ... Travaux pratiques

SOL4AG24SSL4AG24

Anglais 4

Durée�i1 24 h

TD à 24 hSemestre 3

Objectifs+ Analyser dans une

langue simple etcohérente lesrapports entrescience et sociétéà l’écrit et à l’oral(niveau européen :B1+).

Langue(s)

FrançaisAnglais

Option Biologie-Biochimie et SVT

Responsable Elise Vinauger-Tela å [email protected]

Pré-requis Avoir suivi Anglais 3 ou environ 450 heures de formation équivalente.

ContenuTravail de compréhension et d’expression à partir de documents authentiques simpleset/ou courts portant sur des innovations technologiques, des découvertes et avancéesscientifiques.Évaluation

3Coefficient 3ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit/Oral

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE : CC 2h30 ; RSE : CT 1hà Session de rattrapage : RNE et RSE : CT 30min

Calcul de la note finale :à Première session : Ecrit 100%à Session de rattrapage : Ecrit 100%

SOL4BH01SSL4BH01

Techniques en biologie moléculaire

Durée�i1 48 h

Cours à 18 hTD à 18 hTP à 12 h

Semestre 4Objectifs+ Acquérir les bases

nécessaires à lacompréhension età la réalisation destechniques debiologiemoléculaireutilisées enrecherchefondamentale,médicale etbiotechnologique.

Langue(s)

Français

Option Biologie-Biochimie et SVT

Responsable Alain Legrand å [email protected]

Pré-requis Bases fondamentales de biologie moléculaire.

ContenuTechniques de bases de la manipulation des acides nucléiques (Extraction, purification,dosage, électrophorèse, enzymes de restriction et de modification, mutagénèse dirigée,transformation de E.coli. Notions de vecteurs (plasmides, cosmides, phages, YAC). Clo-nage, construction et utilisation de banques d’ADN. Détection, caractérisation et identi-fication des acides nucléiques : Marquages radioactifs et marquages froids. Hybridationmoléculaire. Techniques de Southern et Northern, hybridation in situ. Amplification (PCR)et séquençage. Applications : expression de protéines recombinantes, analyse de l’activitéet de la structure des gènes, polymorphisme, études cliniques.Évaluation

5Coefficient 5ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CM/TD : CT 2h ; TP : CC(3-4)à Session de rattrapage : RNE et RSE : CT(E/TP) 3h

Calcul de la note finale :à Première session : CT 75 % ; CC 25 %à Session de rattrapage : Ecrit 100%

23

Page 24: Deuxième année · - lui permettre ainsi d'acquérir des connaissances fondamentales et pratiques de niveau Bac+3 ... en biochimie structurale, en génétique, ... Travaux pratiques

SOL4BO01SSL4BO01

Morphologie et reproduction des plantes

Durée�i1 48 h

Cours à 23 hTD à 4 hTP à 21 h

Semestre 4Objectifs+ Connaissance sur

l’anatomie et lareproduction desEmbryophytes.

Langue(s)

Français

Option Biologie-Biochimie et SVT

Responsable Christiane Depierreux å [email protected]

Pré-requis Notions d’organisation des végétaux.

ContenuOrganisation anatomique des appareils végétatif et reproducteur des Plantes, des mousses(Bryophytes) aux plantes à fleurs (Angiospermes).Évaluation

5Coefficient 5ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CT : E 1h30 / TP 2hà Session de rattrapage : RNE et RSE : CT E/TP 2h

Calcul de la note finale :à Première session : Ecrit 67% + TP 33%à Session de rattrapage : Ecrit 67% + TP 33%

24

Page 25: Deuxième année · - lui permettre ainsi d'acquérir des connaissances fondamentales et pratiques de niveau Bac+3 ... en biochimie structurale, en génétique, ... Travaux pratiques

SOL4BH04SSL4BH04

Microbiologie générale

Durée�i1 48 h

Cours à 26 hTD à 6 hTP à 18 h

Semestre 4Objectifs+ Faire découvrir la

microbiologie enfournissant lesconnaissancesindispensables surlesmicroorganismes(structure, modede division,taxinomie...) puisen préciser lesméthodes d’étudeet d’analyse.Apprentissage desbases nécessairesau contrôle et à lamaîtrise dudéveloppement desmicroorganismesnécessaire dansdifférentsdomaines(industrie,recherche, milieumédical, agroali-mentaire...).

Langue(s)

Français

Option Biologie-Biochimie

Responsable Fabienne Brulé å [email protected]

ContenuMicroorganismes : Structure et organisation cellulaire (bactéries, fungi, bactériophages).Les transferts naturels de matériel génétique chez les microorganismes : aspects physio-logiques (conjugaison, transformation, transduction et reproduction des bactériophages).Croissance microbienne : Cinétique, types trophiques, nutriments, métabolisme. Systéma-tique bactérienne : Méthodes de la taxinomie, les grands groupes bactériens, techniquesd’identification. Notions de virologie : Principaux types de virus animaux et végétaux.Maîtrise des populations bactériennes : Procédés de décontamination. Notions d’épidé-miologie, virulence, pouvoir pathogène, toxines.Évaluation

4Coefficient 4ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CT 2h + CC(TP)à Session de rattrapage : RNE et RSE : CT 3h

Calcul de la note finale :à Première session : Ecrit 75 % ; TP 25 %à Session de rattrapage : Ecrit 100%

25

Page 26: Deuxième année · - lui permettre ainsi d'acquérir des connaissances fondamentales et pratiques de niveau Bac+3 ... en biochimie structurale, en génétique, ... Travaux pratiques

SOL4BH03SSL4BH03

Purification et analyse des molécules biologiques

Durée�i1 48 h

Cours à 18 hTP à 30 h

Semestre 4Objectifs

Langue(s)

Français

Option Biologie-Biochimie

Responsable Sylvain Bourgerie å [email protected]

ContenuProtéines : extraction. Centrifugation. précipitations. Ultrafiltration. Dialyse. Méthodeschromatographiques : échangeurs d’ions, chromatofocalisation, tamisage moléculaire, af-finité. Méthodes électrophorétiques : électrophorèse zonale, électrofocalisation, isotacho-phorèse, électrophorèse capillaire, SDS/bmercaptoéthanol. Transfert Western. Acides nu-cléiques. Oses et lipides : chromatographie sur couches minces, chromatographie en phasegazeuse (CPG), chromatographie liquide haute performance (HPLC.).Évaluation

5Coefficient 5ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : Ecrit : CT 2h / TP : CC(2)à Session de rattrapage : RNE et RSE : CT(E+TP) 2h30

Calcul de la note finale :à Première session : Ecrit 75 % ; TP 25 %à Session de rattrapage : Ecrit 75 % ; TP 25 %

SOL4BO02SSL4BO02

Ecologie des peuplements

Durée�i1 36 h

Cours à 16 hTD à 4 hTP à 16 h

Semestre 4Objectifs+ Familiariser

l’étudiant avecl’organisation et ladynamique despeuplements, undomaine essentielpour lacompréhension dufonctionnement dela biosphère.

Langue(s)

Français

Option Biologie-Biochimie

Responsable Aurélien Sallé å [email protected]

Pré-requis Notions d’écologie générale et d’écologie des populations.

ContenuCaractères fondamentaux de l’organisation des peuplements ; équilibre dynamique et colo-nisation des îles ; les facteurs de l’organisation et de la dynamique des peuplements (rôlesde la compétition, de la prédation, du parasitisme, des ressources, de la variabilité spa-tiale et temporelle) ; dynamique des peuplements et évolution, coévolution ; organisationdes biocénoses (structure spatiale et temporelle, successions écologiques, biodiversité) ;structure de quelques communautés de la zone tempérée : forêts, prairies, cultures, lacs,étangs, rivières,.... comparaison et caractères généraux ; études théoriques et pratiques.Évaluation

4Coefficient 4ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CT(CM+TD) 1h30 / CC(TP)à Session de rattrapage : RNE et RSE : CT(CM+TD+TP) 2h

Calcul de la note finale :à Première session : Ecrit 67 % ; TP 33 %à Session de rattrapage : Ecrit 67 % ; TP 33 %

26

Page 27: Deuxième année · - lui permettre ainsi d'acquérir des connaissances fondamentales et pratiques de niveau Bac+3 ... en biochimie structurale, en génétique, ... Travaux pratiques

SOL4BO03SSL4BO03

Communication cellulaire et pharmacologie

Durée�i1 36 h

Cours à 24 hTD à 7 hTP à 9 h

Semestre 4Objectifs+ L’initiation à la

connaissance dumédicamentpermettrad’aborder lesfondements dufonctionnementdes récepteurscellulaires d’unepart et des ciblesd’agentspharmacologiquesd’autre part. Enemployantquelques exemplesprécis, fairecomprendre àl’étudiant lesinterrelationscellulaires quisoustendent lasituation normaleou pathologique.

Langue(s)

Français

Option Biologie-Biochimie

Responsable William Même å [email protected]

ContenuCommunications intercellulaires et transfert d’informations via les systèmes récepteurs.Les grandes familles de récepteurs. Première approche des notions de transduction dusignal. Interaction ligand-récepteur. Pharmacologie fondamentale et appliquée. L’impli-cation du biologiste dans l’élaboration et/ou la production d’un nouveau médicament.Origine des molécules pharmacologiquement actives, étude de la découverte d’un médica-ment, le devenir du médicament dans l’organisme (adsorption, distribution, métabolisme,excrétion). La communication cellulaire dans le système immunitaire : signaux molécu-laires membranaires et solubles. Rôle des cytokines, chimiokines et de leur récepteurs.Application à deux cas concrets : réponse des cellules aux infections et aux signaux dudanger.Évaluation

4Coefficient 4ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit/exposé

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CT (E+TP) 2h / CC(TP) / exposé oralà Session de rattrapage : RNE et RSE : CT 2h

Calcul de la note finale :à Première session : CT : Ecrit 1/3, TP : 1/3 ; oral 1/3à Session de rattrapage : Ecrit 50% + TP 50%

27

Page 28: Deuxième année · - lui permettre ainsi d'acquérir des connaissances fondamentales et pratiques de niveau Bac+3 ... en biochimie structurale, en génétique, ... Travaux pratiques

SOL4BO04SSL4BO04

Relations hydriques et nutrition minérale chez les plantes

Durée�i1 36 h

Cours à 14 hTD à 8 hTP à 14 h

Semestre 4Objectifs+ Acquisition des

basesfondamentales dephysiologie etbiochimievégétales.

Langue(s)

Français

Option Biologie-Biochimie et SVT

Responsable Régis Fichot å [email protected]

ContenuL’eau et la plante, nutrition minérale hors azote, le transport des assimilats. Phytoreme-diation, engrais, rôle des mycorhizes dans l’absorption de l’eau et du phosphate.Évaluation

4Coefficient 4ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit/Oral

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : Ecrit CT 1h30 /TP CC(2-3)à Session de rattrapage : RNE et RSE : Ecrit CT 1h30 / TP Oral

Calcul de la note finale :à Première session : Ecrit 67% + TP 33%à Session de rattrapage : Ecrit 67% + TP 33%

SOL4BO05SSL4BO05

Génétique fonctionnelle

Durée�i1 24 h

Cours à 10 hTD à 8 hTP à 6 h

Semestre 4Objectifs+ Montrer comment

l’analyse formellechez un organismemodèle peutpermettred’aborder desproblèmes desanté humaine.

Langue(s)

Français

Option Biologie-Biochimie

Responsable Catherine Mura å [email protected]

Pré-requis Génétique de première année.

ContenuGénétique bactérienne : modes de transferts horizontaux d’information génétique, recom-binaison, plasticité génétique. Génétique des organismes haploïdes : analyse au niveauhaploïde et diploïde, études des mutations et des voies métaboliques, modèle levure,interactome. Génétique extranucléaire. TP : test de complémentation chez la levure.Évaluation

3Coefficient 3ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CT 2h + TP CC(2-3)à Session de rattrapage : RNE et RSE : Ecrit 2h / TP Ecrit 1h

Calcul de la note finale :à Première session : Ecrit 75 % ; TP 25 %à Session de rattrapage : Ecrit 75 % ; TP 25 %

28

Page 29: Deuxième année · - lui permettre ainsi d'acquérir des connaissances fondamentales et pratiques de niveau Bac+3 ... en biochimie structurale, en génétique, ... Travaux pratiques

SOL4CH05SSL4CH05

Chimie organique expérimentale

Durée�i1 24 h

TP à 24 hSemestre 4

Objectifs+ Maîtrise des

techniques depurifications etd’analyse, maîtrisedes méthodes etpratiquesd’expérimentationdans unlaboratoire dechimie organique.

Langue(s)

Français

Option Biologie-Biochimie

Responsable Arnaud Tatibouet å [email protected]

Pré-requis Chimie organique I.

ContenuMéthodes de synthèse et Bonnes Pratiques en laboratoire de chimie organique. Expéri-mentations des réactions et techniques essentielles au laboratoire de chimie organique.Évaluation

3Coefficient 3ECTS

Méthode d’évaluation :Travaux pratiques

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CC(6)à Session de rattrapage : RNE et RSE : CT Oral 1h

Calcul de la note finale :à Première session : CR TP 100 %à Session de rattrapage : Oral 100 %

SOL4CH25SSL4CH25

Chimie pour les biosciences

Durée�i1 24 h

Cours à 8 hTD à 4 hTP à 12 h

Semestre 4Objectifs+ Utilisation des

notions de chimiede base, acquisesen 1ère année delicence pourcomprendrequelquesphénomènesquotidiens :maladies du sangliées à ladérégulation deson acidité,extraction etdistillation dupétrole,introduction auxpolymères

Langue(s)

Français

Option Biologie-Biochimie

Responsable Christophe Guimbault å [email protected]

Pré-requis Chimie des solutions 2

ContenuApplication des notions de chimie générale à différents domaines de la vie courante età différents problèmes en biologie : chimie des solutions, extraction et distillation dupétrole, introduction aux polymères. Application pratique de la chimie générale au dosagedes produits courants (produits alimentaires, médicaments, produits ménagers, composésd’intérêt biologique).Évaluation

3Coefficient 3ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CC(4)/CT (E+TP) 2hà Session de rattrapage : RNE et RSE : CT(E+TP) 2h

Calcul de la note finale :à Première session : Ecrit 50 % ; TP 50 %à Session de rattrapage : Ecrit 50 % ; TP 50 %

29

Page 30: Deuxième année · - lui permettre ainsi d'acquérir des connaissances fondamentales et pratiques de niveau Bac+3 ... en biochimie structurale, en génétique, ... Travaux pratiques

SOL4BO06SSL4BO06

Initiation à la valorisation des ressources végétales

Durée�i1 12 h

TD à 8 hTP à 4 h

Semestre 4Langue(s)

Français

Option Biologie-Biochimie

Responsables Daniel Hagège å [email protected] lainé å [email protected]

ContenuDes exemples de valorisations de produits végétaux dans les domaines pharmaceutiquees,énergétiques, alimentaires, agromatériaux et cosmétiques seront fournis, ainsi que les pro-blématiques actuelles de valorisation des végétaux. Les étudiants seront amenés à traiteren petits groupes des sujets en lien avec ces valorisations, traditionnelles ou innovantes,et à en évaluer par eux même les avantages et inconvénients, les atouts et les contraintesen se basant sur les informations biologiques, techniques, économiques et éthiques qu’ilsauront recueillies et analysées. L’évaluation reposera sur un exposé.Évaluation

2Coefficient 2ECTS

Méthode d’évaluation :Oral

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CC 15minà Session de rattrapage : RNE et RSE : CT 15min

Calcul de la note finale :à Première session : Oral 100 %à Session de rattrapage : Oral 100 %

SOL4MT14 Maths prépa-concours 2Durée�i1 24 h

TD à 20 hSemestre 4

Objectifs+ Permettre à des

étudiantsd’acquérir desconnaissancesutiles pour passerles concoursd’accès aux écolesnationalesvétérinaires(concours ENV-voie B), lesconcoursd’ingénieurs agro(concours ENSAvoie B) maiségalement certainsconcoursadministratifs.

Langue(s)

Français

Option Biologie-Biochimie (sur Orléans uniquement)

Responsable Athanassios Batakis å [email protected]

Pré-requis Maths niveau bac. Forte motivation.

ContenuAlgèbre linéaire : applications linéaires, matrices, diagonalisation, probabilités.Évaluation

3Coefficient 3ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : 2h CTà Session de rattrapage : 2h CT

Calcul de la note finale :à Première session : 100% CTà Session de rattrapage : 100% CT

30

Page 31: Deuxième année · - lui permettre ainsi d'acquérir des connaissances fondamentales et pratiques de niveau Bac+3 ... en biochimie structurale, en génétique, ... Travaux pratiques

SSL4BO08 Histoire des Sciences NaturellesDurée�i1 20 h

TD à 20 hSemestre 3

Objectifs+ Donner une idée

de la démarchescientifique etprésenter, parquelques exemplesbiologiques,l’évolution desconnaissancesscientifiques aucours du temps.

Langue(s)

Français

Option Biologie-Biochimie (sur Chartres uniquement)

Responsable Géraldine Roux å [email protected]

ContenuA quoi sert l’histoire des sciences. Du savoir à la science. Histoire des classifications oucomment ordonner la nature. Débat création-évolution. Histoire des neurosciences : com-ment l’Homme essaie de comprendre le fonctionnement de son cerveau : de la préhistoireà nos jours. Histoire de la microbiologie.Évaluation

3Coefficient 3ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CT 2hà Session de rattrapage : RNE et RSE : CT 2h

Calcul de la note finale :à Première session : Ecrit 100%à Session de rattrapage : Ecrit 100%

SOL4ST04SSL4ST04

Stage

Semestre 3Langue(s)

Français

Option Biologie-Biochimie

Responsable Lucile Mollet å [email protected]

ContenuStage de 70h minimum avec convention de stage.Évaluation

3Coefficient 3ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit/Oral

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CT (Rapport) + Soutenanceà Session de rattrapage : Pas de session de rattrapage pour les stages

Calcul de la note finale :à Première session : Rapport 33% + Soutenance 67%

31

Page 32: Deuxième année · - lui permettre ainsi d'acquérir des connaissances fondamentales et pratiques de niveau Bac+3 ... en biochimie structurale, en génétique, ... Travaux pratiques

SOL4BO10 Les algues et les champignonsDurée�i1 24 h

Cours à 10 hTD à 4 hTP à 10 h

Semestre 4Objectifs+ Intérêts

économiques etbiologie des algueset deschampignons.

Langue(s)

Français

Option SVT

Responsable Sabine Carpin å [email protected]

ContenuBiologie et reproduction des algues et des champignons, initiation à la reconnaissance deschampignons. Intérêts économiques, pharmaceutiques et biotechnologiques des algues etdes champignons.Évaluation

2Coefficient 2ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CT 1hà Session de rattrapage : RNE et RSE : CT 1h

Calcul de la note finale :à Première session : Ecrit 100 %à Session de rattrapage : Ecrit 100 %

SOL4GO01 Bassins et stratigraphie séquentielleDurée�i1 24 h

Cours à 10 hTD à 2 hTP à 12 h

Semestre 4Objectifs+ Connaissance

approfondie desfacteurs contrôlantla sédimentation.Maîtrise desprincipaux outilsd’investigationstratigraphique.Capacitéd’interpréter descoupes sismiquesréflexion àdifférentesrésolutions, ainsique les facièssédimentaires.Connaissance del’architecture 3Dde bassinssédimentairestypes.

Langue(s)

Français

Option SVT

Responsable Anaelle Simonneau å [email protected]

Pré-requis Paléoenvironnements, stratigraphie et paléontologie ; Sédimentologie etpétrologie sédimentaire.

ContenuCours : Présentation des principaux outils de cartographie et de prélèvements du remplis-sage sédimentaire au sein de bassins actuels. Lecture et analyse des paramètres contrôlantl’enregistrement sédimentaire : stratigraphies génétique et sismique (applications). Fluxsédimentaire, accommodation et subsidence, cartes isobathes, isopaques, architecture 3Ddes corps sédimentaires et des bassins. TD/TP : Principe et interprétation de la sismiqueréflexion (différentes échelles), application aux corps sédimentaires (affleurements, carot-tages), architecture 3D des corps sédimentaires : marqueurs du climat et de la tectonique.Évaluation

3Coefficient 3ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CT 4hà Session de rattrapage : RNE et RSE : CT 4h

Calcul de la note finale :à Première session : Ecrit/TP 100 %à Session de rattrapage : Ecrit/TP 100 %

32

Page 33: Deuxième année · - lui permettre ainsi d'acquérir des connaissances fondamentales et pratiques de niveau Bac+3 ... en biochimie structurale, en génétique, ... Travaux pratiques

SOL4GO02 Pétrologie endogène 1Durée�i1 48 h

Cours à 18 hTD à 6 hTP à 24 h

Semestre 4Objectifs+ Identifier les

minérauxcardinaux desrochesmagmatiques ma-croscopiquementet microscopique-ment. Décrire etinterpréter destextures courantesdes rochesplutoniques etvolcaniquesConnaître lesgrands processusmagmatiques.

Langue(s)

Français

Option SVT

Responsable Jean-Louis Bourdier å [email protected]

Pré-requis Bases de minéralogie.

ContenuPétrologie magmatique Cours : Définitions ; nomenclature et classifications des rochesmagmatiques ; processus de genèse et de différenciation des magmas TD : diagrammesde phases ; calcul de norme CIPW TP : description macroscopique et microscopique desgrands types de roches magmatiques. Pétrologie métamorphique Cours : Présentationpréliminaire des roches métamorphiques et du métamorphisme – Les facteurs du méta-morphisme – La nomenclature des roches métamorphiques fondée sur leur minéralogie,leur texture et leur structure - Approche statique du métamorphisme : degré de métamor-phisme et faciès métamorphiques – Le métamorphisme de contact TP : Déterminationmacroscopique et microscopique des minéraux, des textures et des structures des rochesmétamorphiques – Détermination des noms des roches métamorphiquesÉvaluation

5Coefficient 5ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CC (Ecrit 2x2h + TP 2x1h30)à Session de rattrapage : RNE et RSE : CT (Ecrit 2h + TP 3h)

Calcul de la note finale :à Première session : Ecrit 67 % + TP 33%à Session de rattrapage : Ecrit 67 % + TP 33%

33

Page 34: Deuxième année · - lui permettre ainsi d'acquérir des connaissances fondamentales et pratiques de niveau Bac+3 ... en biochimie structurale, en génétique, ... Travaux pratiques

SOL4BO09 Ecologie des peuplementsDurée�i1 36 h

Cours à 16 hTD à 4 hTP à 16 h

Semestre 4Objectifs+ Familiariser

l’étudiant avecl’organisation et ladynamique despeuplements, undomaine essentielpour lacompréhension dufonctionnement dela biosphère.

Langue(s)

Français

Option SVT

Responsable Steeve Thany å [email protected]

Pré-requis Notions d’écologie générale et d’écologie des populations.

ContenuCaractères fondamentaux de l’organisation des peuplements ; équilibre dynamique et colo-nisation des îles ; les facteurs de l’organisation et de la dynamique des peuplements (rôlesde la compétition, de la prédation, du parasitisme, des ressources, de la variabilité spa-tiale et temporelle) ; dynamique des peuplements et évolution, coévolution ; organisationdes biocénoses (structure spatiale et temporelle, successions écologiques, biodiversité) ;structure de quelques communautés de la zone tempérée : forêts, prairies, cultures, lacs,étangs, rivières,.... comparaison et caractères généraux ; études théoriques et pratiques.Évaluation

3Coefficient 3ECTS

Méthode d’évaluation :Ecrit

Modalités de contrôle des connaissances :à Première session : RNE et RSE : CT(CM+TD) 1h30 / CC(TP)à Session de rattrapage : RNE et RSE : CT(CM+TD+TP) 2h

Calcul de la note finale :à Première session : Ecrit 67 % ; TP 33 %à Session de rattrapage : Ecrit 67 % ; TP 33 %

34