U|uÄ|ÉzÜtÑ{ç  

 

 

 

Bibliography  

97

BIBLIOGRAPHY  

Alavi,  A.,  Axford,  J.  S.,  Hay,  F.  C.,  and  Jones,  M.  G.  (1998)  Tissue‐specific galactosyltransferase  abnormalities  in  an  experimental  model  of rheumatoid arthritis. Ann Med Interne (Paris) 149, 251‐260. 

Alavi, A. and Axford, J. S. (2008) Sweet and sour: the impact of sugars on disease. Rheumatology (Oxford) 47, 760‐770. 

Anderson,  L.  and  Seilhamer,  J.  (1997)  A  comparison  of  selected mRNA  and protein abundances in human liver. Electrophoresis 18, 533‐537. 

Anderson,  N.  L.  and  Anderson,  N.  G.  (2002)  The  human  plasma  proteome: history, character, and diagnostic prospects. Mol Cell Proteomics 1, 845‐867. 

Andersson, E. C., Hansen, B. E.,  Jacobsen, H., Madsen, L.  S., Andersen, C. B., Engberg, J., Rothbard, J. B., McDevitt, G. S., Malmstrom, V., Holmdahl, R., Svejgaard, A., and Fugger, L. (1998) Definition of MHC and T cell receptor contacts  in  the  HLA‐DR4restricted  immunodominant  epitope  in  type  II collagen and characterization of collagen‐induced arthritis in HLA‐DR4 and human CD4 transgenic mice. Proc Natl Acad Sci U S A 95, 7574‐7579. 

An,  H.  J.,  Miyamoto,  S.,  Lancaster,  K.  S.,  Kirmiz,  C.,  Li,  B.,  Lam,  K.  S., Leiserowitz, G. S., and Lebrilla, C. B. (2006) Profiling of glycans in serum for the discovery of potential biomarkers  for ovarian cancer.  J Proteome Res 5, 1626‐1635. 

Arnett, F. C., Edworthy, S. M., Bloch, D. A., McShane, D. J., Fries, J. F., Cooper, N. S., Healey, L. A., Kaplan, S. R., Liang, M. H., Luthra, H. S., et al (1988) The American  Rheumatism  Association  1987  revised  criteria  for  the classification of rheumatoid arthritis. Arthritis Rheum 31, 315‐324. 

Arii,  K.,  Kumon,  Y.,  Sugahara,  K.,  Nakatani,  K.,  Ikeda,  Y.,  Suehiro,  T.,  and Hashimoto, K. (2008) Edaravone inhibits collagen‐induced arthritis possibly through suppression of nuclear factor‐kappa B. Mol Immunol 45, 463‐469. 

Bibliography  

98

Barlas, A., Okamoto, H.,  and Greenbaum, L. M.  (1985) T‐kininogen‐‐the major plasma kininogen in rat adjuvant arthritis. Biochem Biophys Res Commun 129, 280‐286. 

Barrabes,  S.,  Pages‐Pons,  L.,  Radcliffe,  C. M.,  Tabares,  G.,  Fort,  E.,  Royle,  L., Harvey,  D.  J., Moenner, M.,  Dwek,  R.  A.,  Rudd,  P. M.,  De,  L.  R.,  and Peracaula, R. (2007) Glycosylation of serum ribonuclease 1 indicates a major endothelial origin and reveals an increase in core fucosylation in pancreatic cancer. Glycobiology 17, 388‐400. 

Belcher, C., Yaqub, R., Fawthrop, F., Bayliss, M., and Doherty, M. (1997) Synovial fluid chondroitin and keratan  sulphate epitopes, glycosaminoglycans, and hyaluronan in arthritic and normal knees. Ann Rheum Dis 56, 299‐307. 

Bergeron,  J.  J., Zapun, A., Ou, W.  J., Hemming, R., Parlati, F., Cameron, P. H., and Thomas, D. Y.  (1998) The  role  of  the  lectin  calnexin  in  conformation independent  binding  to N‐linked  glycoproteins  and  quality  control.  Adv Exp Med Biol 435, 105‐116. 

Bhattacharyya, S., Siegel, E. R., Achenbach, S. J., Khosla, S., and Suva, L. J. (2008) Serum biomarker profile associated with high bone  turnover and BMD  in postmenopausal women. J Bone Miner Res 23, 1106‐1117. 

Binkert,  C.,  Demetriou, M.,  Sukhu,  B.,  Szweras, M.,  Tenenbaum,  H.  C.,  and Dennis,  J. W.  (1999) Regulation of osteogenesis by  fetuin.  J Biol Chem 274, 28514‐28520. 

Biswas, S., Sahu, D., Saroha, A., and Das, H. R. (2009) Glycoproteomic analysis of collagen induced arthritis in rats. Trends Carbo Res 1, 12‐20. 

Blomme,  B.,  Van,  S.  C.,  Callewaert,  N.,  and  Van,  V.  H.  (2009)  Alteration  of protein glycosylation in liver diseases. J Hepatol 50, 592‐603. 

Boncela, J., Papiewska, I., Fijalkowska, I., Walkowiak, B., and Cierniewski, C. S. (2001) Acute phase protein alpha 1‐acid glycoprotein  interacts with plasmi‐ nogen  activator  inhibitor  type  1  and  stabilizes  its  inhibitory  activity.  J Biol Chem 276, 35305‐35311. 

Bibliography  

99

Bousette,  N.,  Gramolini,  A.  O.,  and  Kislinger,  T.  (2008)  Proteomics‐based investigations of animal models of disease. Proteomics Clin Appl 2, 638‐653. 

Boyd, M. R., Grygiel,  J.  J.,  and Minchin, R. F.  (1983) Metabolic  activation  as  a basis for organ‐selective toxicity. Clin Exp Pharmacol Physiol 10, 87‐99 

Bradford, M. M.  (1976) A  rapid  and  sensitive method  for  the  quantitation  of microgram  quantities  of  protein  utilizing  the  principle  of  protein‐dye binding. Anal Biochem 72, 248‐254. 

Burger,  D  and  Dayer  J.M.  (2002)  High‐density  lipoprotein‐associated apolipoprotein  A‐I:  the  missing  link  between  infection  and  chronic inflammation? Autoimmun Reviews 1, 111‐117 

Cai, T., Yu, P., Monga, S. P., Mishra, B., and Mishra, L.  (1998)  Identification of mouse  itih‐4 encoding a glycoprotein with  two EF‐hand motifs  from early embryonic liver. Biochim Biophys Acta 1398, 32‐37. 

Cantaert, T., De, R. L., Bongartz, T., Matteson, E. L., Tak, P. P., Nicholas, A. P., and  Baeten,  D.  (2006)  Citrullinated  proteins  in  rheumatoid  arthritis: crucial...but not sufficient! Arthritis Rheum 54, 3381‐3389. 

Carson,  D.  A.,  Chen,  P.  P.,  Fox,  R.  I.,  Kipps,  T.  J.,  Jirik,  F.,  Goldfien,  R.  D., Silverman,  G.,  Radoux,  V.,  and  Fong,  S.  (1987)  Rheumatoid  factor  and immune networks. Annu Rev Immunol 5, 109‐126. 

Chellingworth, M.  C.,  Salmon, M.,  Scott,  D.  L.,  and  Bacon,  P.  A.  (1984)  The significance of IgM antinuclear antinuclear antibody in rheumatoid arthritis and other connective tissue diseases. Rheumatol Int 4, 23‐25. 

Chen, Y., Akirav, E. M., Chen, W., Henegariu, O., Moser, B., Desai, D., Shen,  J. M., Webster,  J. C., Andrews, R. C., Mjalli, A. M., Rothlein, R., Schmidt, A. M.,  Clynes,  R.,  and  Herold,  K.  C.  (2008)  RAGE  ligation  affects  T  cell activation and controls T cell differentiation. J Immunol 181, 4272‐4278. 

Choi‐Miura,  N.  H.,  Takahashi,  K.,  Yoda,  M.,  Saito,  K.,  Hori,  M.,  Ozaki,  H., Mazda,  T.,  and  Tomita, M.  (2000)  The  novel  acute  phase  protein,  IHRP, 

Bibliography  

100

inhibits actin polymerization and phagocytosis of polymorphonuclear cells. Inflamm Res 49, 305‐310. 

Chou,  T.  Y.,  Hart,  G. W.,  and  Dang,  C.  V.  (1995)  c‐Myc  is  glycosylated  at threonine  58,  a known phosphorylation  site  and  a mutational hot  spot  in lymphomas. J Biol Chem 270, 18961‐18965. 

Chui, D., Sellakumar, G., Green, R., Sutton‐Smith, M., McQuistan, T., Marek, K., Morris, H., Dell, A.,  and Marth,  J.  (2001) Genetic  remodeling  of  protein glycosylation in vivo induces autoimmune disease. Proc Natl Acad Sci U S A 98, 1142‐1147. 

Cloonan, M. J., Bishop, G. A., Wilton‐Smith, P. D., Carter, I. W., Allan, R. M., and Wilcken, D. E.  (1979) An  enzyme‐immunoassay  for myoglobin  in  human serum and urine. Method development, normal values and application  to acute myocardial infarction. Pathology 11, 689‐699. 

Coelho, M. G., Reis, P. A., Gava, V. B., Marques, P. R., Gayer, C. R., Laranja, G. A.,  Felzenswalb,  I.,  and  Sabino,  K.  C.  (2004)  Anti‐arthritic  effect  and subacute  toxicological  evaluation  of  Baccharis  genistelloides  aqueous extract. Toxicol Lett 154, 69‐80. 

Comunale, M. A., Wang, M., Hafner, J., Krakover, J., Rodemich, L., Kopenhaver, B., Long, R. E., Junaidi, O., Bisceglie, A. M., Block, T. M., and Mehta, A. S. (2009)  Identification  and  development  of  fucosylated  glycoproteins  as biomarkers of primary hepatocellular carcinoma. J Proteome Res 8, 595‐602. 

Contag, P. R.  (2002) Whole‐animal cellular and molecular  imaging  to accelerate drug development. Drug Discov Today 7, 555‐562. 

Corthay,  A.,  Johansson,  A.,  Vestberg, M.,  and Holmdahl,  R.  (1999)  Collagen‐induced arthritis development  requires alpha beta T  cells but not gamma delta T cells: studies with T cell‐deficient  (TCR mutant) mice.  Int  Immunol 11, 1065‐1073. 

Courtenay, J. S., Dallman, M. J., Dayan, A. D., Martin, A., and Mosedale, B. (1980) Immunisation  against  heterologous  type  II  collagen  induces  arthritis  in mice. Nature 283, 666‐668. 

Bibliography  

101

Criswell, L. A., Saag, K. G., Mikuls, T. R., Cerhan, J. R., Merlino, L. A., Lum, R. F., Pfeiffer, K. A., Woehl, B., and Seldin, M. F.  (2006) Smoking  interacts with genetic risk factors in the development of rheumatoid arthritis among older Caucasian women. Ann Rheum Dis 65, 1163‐1167. 

Crocker, P. R., Paulson,  J. C., and Varki, A.  (2007) Siglecs and  their roles  in  the immune system. Nat Rev Immunol 7, 255‐266. 

Cromwell, M.  E., Hilario,  E.,  and  Jacobson,  F.  (2006)  Protein  aggregation  and bioprocessing. AAPS J 8, E572‐E579. 

Daniels, M. A., Hogquist, K. A.,  and  Jameson,  S. C.  (2002)  Sweet  ʹnʹ  sour:  the impact of differential glycosylation on T cell responses. Nat Immunol 3, 903‐910. 

Das, H. R., Gupta, B., Raghav, S. K., Goswami, k., Agarwal, C., and Das, R. H.  Methods  for  the  diagnosis  of  rheumatoid  arthritis.  CSIR.  12/271,149[US patent 7,763,436 B2]. 2010. New Delhi, India.  

Demetriou, M., Granovsky, M., Quaggin, S., and Dennis,  J. W.  (2001) Negative regulation of T‐cell activation and autoimmunity by Mgat5 N‐glycosylation. Nature 409, 733‐739. 

Devauchelle, V., Essabbani, A., De, P. G., Germain, S., Tourneur, L., Mistou, S., Margottin‐Goguet,  F.,  Anract,  P.,  Migaud,  H.,  Le,  N.  D.,  Lequerre,  T., Saraux,  A.,  Dougados, M.,  Breban, M.,  Fournier,  C.,  and  Chiocchia,  G. (2006) characterization and functional consequences of under expression of clusterin in rheumatoid arthritis. J Immunol 177, 6471‐6479. 

Doherty,  N.  S.,  Littman,  B.  H.,  Reilly,  K.,  Swindell,  A.  C.,  Buss,  J.  M.,  and Anderson, N. L. (1998) Analysis of changes in acute‐phase plasma proteins in an acute  inflammatory response and  in rheumatoid arthritis using  two‐dimensional gel electrophoresis. Electrophoresis 19, 355‐363. 

Drinda, S., Franke, S., Canet, C. C., Petrow, P., Brauer, R., Huttich, C., Stein, G., and Hein, G.  (2002)  Identification of  the advanced glycation end products N(epsilon)‐carboxymethyllysine  in  the  synovial  tissue  of  patients  with rheumatoid arthritis. Ann Rheum Dis 61, 488‐492. 

Bibliography  

102

Durand, G.  and  Seta, N.  (2000)  Protein  glycosylation  and  diseases:  blood  and urinary  oligosaccharides  as  markers  for  diagnosis  and  therapeutic monitoring. Clin Chem 46, 795‐805. 

Dzhambazov,  B., Holmdahl, M.,  Yamada, H.,  Lu,  S.,  Vestberg, M., Holm,  B., Johnell, O., Kihlberg, J., and Holmdahl, R. (2005) The major T cell epitope on type II collagen is glycosylated in normal cartilage but modified by arthritis in both rats and humans. Eur J Immunol 35, 357‐366. 

Edwards,  C.  J.  and  Cooper,  C.  (2006)  Early  environmental  factors  and rheumatoid arthritis. Clin Exp Immunol 143, 1‐5. 

Elliott, M. A., Elliott, H. G., Gallagher, K., McGuire, J., Field, M., and Smith, K. D. (1997)  Investigation  into  the  concanavalin  A  reactivity,  fucosylation  and oligosaccharide microheterogeneity of alpha 1‐acid glycoprotein expressed in  the sera of patients with rheumatoid arthritis.  J Chromatogr B Biomed Sci Appl 688, 229‐237. 

El‐Shehaby, A. M., Zakaria, A., El‐Khatib, M., and Mostafa, N. (2010) Association of  fetuin‐A  and  cardiac  calcification  and  inflammation  levels  in hemodialysis patients. Scand J Clin Lab Invest 70, 575‐582. 

Falgarone, G. and Chiocchia, G. (2009) Chapter 8: Clusterin: A multifacet protein at  the  crossroad  of  inflammation  and  autoimmunity. Adv Cancer Res  104, 139‐170. 

Fernandez‐Luna, J. L., Leyva‐Cobian, F., and Mendez, E. (1988) Measurement of protein  HC  (alpha  1  microglobulin)  and  protein  HC‐IgA  complex  in different body fluids. J Clin Pathol 41, 1176‐1179. 

Fiedler,  G. M.,  Leichtle,  A.  B.,  Kase,  J.,  Baumann,  S.,  Ceglarek,  U.,  Felix,  K., Conrad, T., Witzigmann, H., Weimann, A., Schutte, C., Hauss,  J., Buchler, M., and Thiery, J. (2009) Serum peptidome profiling revealed platelet factor 4  as  a potential discriminating Peptide  associated with pancreatic  cancer. Clin Cancer Res 15, 3812‐3819. 

Bibliography  

103

Findikli, N., Candan, N. Z., and Kahraman, S. (2006) Human embryonic stem cell culture:  current  limitations  and  novel  strategies. Reprod Biomed Online  13, 581‐590. 

Firestein, G. S. (2003) Evolving concepts of rheumatoid arthritis. Nature 423, 356‐361. 

Foell,  D., Wittkowski,  H.,  Hammerschmidt,  I., Wulffraat,  N.,  Schmeling,  H., Frosch, M., Horneff, G., Kuis, W., Sorg, C., and Roth,  J.  (2004) Monitoring neutrophil  activation  in  juvenile  rheumatoid  arthritis  by  S100A12  serum concentrations. Arthritis Rheum 50, 1286‐1295. 

Frosch, M.,  Strey,  A.,  Vogl,  T., Wulffraat, N. M.,  Kuis, W.,  Sunderkotter,  C., Harms, E., Sorg, C., and Roth,  J.  (2000) Myeloid‐related proteins 8 and 14 are  specifically  secreted  during  interaction  of  phagocytes  and  activated endothelium  and  are  useful  markers  for  monitoring  disease  activity  in pauciarticular‐onset  juvenile  rheumatoid arthritis. Arthritis Rheum 43, 628‐637. 

Fujimura, T., Shinohara, Y., Tissot, B., Pang, P. C., Kurogochi, M., Saito, S., Arai, Y., Sadilek, M., Murayama, K., Dell, A., Nishimura, S., and Hakomori, S. I. (2008) Glycosylation status of haptoglobin  in sera of patients with prostate cancer vs. benign prostate disease or normal subjects. Int J Cancer 122, 39‐49. 

Fu, Q., Bovenkamp, D. E.,  and Van Eyk,  J. E.  (2007) A  rapid,  economical,  and reproducible method  for human serum delipidation and albumin and  IgG removal for proteomic analysis. Methods Mol Biol 357, 365‐371. 

Gaudin, P., Razakaboay, M., Surla, A., Berthier, S., Fauconnier, J., Morel, F., and Phelip, X. (1997) A study of metalloproteinases in fifty joint fluid specimens. Rev Rhum Engl Ed 64, 375‐381. 

Ghosh, P. (1994) The role of hyaluronic acid (hyaluronan) in health and disease: interactions with cells, cartilage and components of synovial fluid. Clin Exp Rheumatol 12, 75‐82. 

Bibliography  

104

Giannelli, G., Erriquez, R., Iannone, F., Marinosci, F., Lapadula, G., and Antonaci, S.  (2004)  MMP‐2,  MMP‐9,  TIMP‐1  and  TIMP‐2  levels  in  patients  with rheumatoid arthritis and psoriatic arthritis. Clin Exp Rheumatol 22, 335‐338. 

Glasser, S. W. and Nogee, L. M.  (2006) Genetically engineered mice  in unders‐ tanding the basis of neonatal lung disease. Semin Perinatol 30, 341‐349. 

Goodarzi, M. T., Axford, J. S., Varanasi, S. S., Alavi, A., Cunnane, G., Fitzgerald, O.,  and  Turner,  G.  A.  (1998)  Sialyl  Lewis(x)  expression  on  IgG  in rheumatoid  arthritis  and  other  arthritic  conditions:  a  preliminary  study. Glycoconj J 15, 1149‐1154. 

Gornik, I., Maravic, G., Dumic, J., Flogel, M., and Lauc, G. (1999) Fucosylation of IgG heavy chains is increased in rheumatoid arthritis. Clin Biochem 32, 605‐608. 

Gornik, O., Royle, L., Harvey, D.  J., Radcliffe, C. M., Saldova, R., Dwek, R. A., Rudd, P., and Lauc, G. (2007) Changes of serum glycans during sepsis and acute pancreatitis. Glycobiology 17, 1321‐1332. 

Gravel, P., Walzer, C., Aubry, C., Balant, L. P., Yersin, B., Hochstrasser, D. F., and Guimon,  J.  (1996) New alterations of serum glycoproteins  in alcoholic and cirrhotic  patients  revealed  by  high  resolution  two‐dimensional  gel electrophoresis. Biochem Biophys Res Commun 220, 78‐85. 

Gregersen, P. K. (1999) Genetics of rheumatoid arthritis: confronting complexity. Arthritis Res 1, 37‐44. 

Gregersen,  P.  K.,  Silver,  J.,  and Winchester,  R.  J.  (1987)  The  shared  epitope hypothesis.  An  approach  to  understanding  the  molecular  genetics  of susceptibility to rheumatoid arthritis. Arthritis Rheum 30, 1205‐1213. 

Gupta, B., Raghav, S. K., Agrawal, C., Chaturvedi, V. P., Das, R. H., and Das, H. R.  (2006) Anti‐MBL  autoantibodies  in  patients with  rheumatoid  arthritis: prevalence and clinical significance. J Autoimmun 27, 125‐133. 

Bibliography  

105

Hansen, K. and Khanna, C.  (2004) Spontaneous and genetically engineered ani‐ mal models; use  in preclinical  cancer drug development. Eur  J Cancer  40, 858‐880. 

Harris,  R.  J.  and  Spellman,  M.  W.  (1993)  O‐linked  fucose  and  other  post‐translational modifications unique to EGF modules. Glycobiology 3, 219‐224. 

Haston,  J. L., FitzGerald, O., Kane, D., and Smith, K. D.  (2003) The  influence of alpha1‐acid  glycoprotein  on  collagenase‐3  activity  in  early  rheumatoid arthritis. Biomed Chromatogr 17, 361‐364 

Hayes, M. L. and Castellino, F. J. (1979) Carbohydrate of the human plasminogen variants. III. Structure of the O‐glycosidically linked oligosaccharide unit. J Biol Chem 254, 8777‐8780. 

Helenius, A.  and Aebi, M.  (2001)  Intracellular  functions  of N‐linked  glycans. Science 291, 2364‐2369. 

He, Q. Y.  and Chiu,  J.  F.  (2003)  Proteomics  in  biomarker  discovery  and  drug development. J Cell Biochem 89, 868‐886. 

Higai, K., Aoki, Y., Azuma, Y., and Matsumoto, K.  (2005) Glycosylation of site‐specific  glycans  of  alpha1‐acid  glycoprotein  and  alterations  in  acute  and chronic inflammation. Biochim Biophys Acta 1725, 128‐135. 

Hofmann,  M.  A.,  Drury,  S.,  Fu,  C.,  Qu, W.,  Taguchi,  A.,  Lu,  Y.,  Avila,  C., Kambham, N., Bierhaus, A., Nawroth, P., Neurath, M. F., Slattery, T., Beach, D., McClary,  J., Nagashima, M., Morser,  J., Stern, D.,  and Schmidt, A. M. (1999) RAGE mediates a novel proinflammatory axis: a central cell surface receptor for S100/calgranulin polypeptides. Cell 97, 889‐901. 

Hortin, G.  L.  (2006)  The MALDI‐TOF mass  spectrometric  view  of  the  plasma proteome and peptidome. Clin Chem 52, 1223‐1237. 

Hounsell, E. F. and Davies, M. J. (1993) Role of protein glycosylation in immune regulation. Ann Rheum Dis 52 Suppl 1, S22‐S29. 

Huang, C. M., Wang, C. C., Kawai, M., Barnes, S., and Elmets, C. A.  (2006)  In vivo protein sampling using capillary ultrafiltration semi‐permeable hollow 

Bibliography  

106

fiber and protein  identification via mass  spectrometry‐based proteomics.  J Chromatogr A 1109, 144‐151. 

Huang,  H.  L.,  Stasyk,  T.,  Morandell,  S.,  Dieplinger,  H.,  Falkensammer,  G., Griesmacher,  A.,  Mogg,  M.,  Schreiber,  M.,  Feuerstein,  I.,  Huck,  C.  W., Stecher, G., Bonn, G. K.,  and Huber, L. A.  (2006) Biomarker discovery  in breast  cancer  serum  using  2‐D  differential  gel  electrophoresis/  MALDI‐TOF/TOF and data validation by  routine  clinical assays. Electrophoresis 27, 1641‐1650. 

Isordia‐Salas, I., Sainz, I. M., Pixley, R. A., Martinez‐Murillo, C., and Colman, R. W.  (2005) High molecular weight kininogen  in  inflammation  and  angiog‐ enesis:  a  review  of  its  properties  and  therapeutic  applications. Rev  Invest Clin 57, 802‐813. 

Jafar‐Nejad, H., Leonardi,  J., and Fernandez‐Valdivia, R.  (2010) Role of glycans and glycosyltransferases  in  the  regulation of Notch  signaling. Glycobiology 20, 931‐949. 

Jersmann,  H.  P.,  Dransfield,  I.,  and  Hart,  S.  P.  (2003)  Fetuin/alpha2‐HS glycoprotein enhances phagocytosis of apoptotic cells and macropinocytosis by human macrophages. Clin Sci (Lond) 105, 273‐278. 

Jorgensen, H. G., Elliott, M. A., Priest, R., and Smith, K. D. (1998) Modulation of sialyl Lewis X dependent binding  to E‐selectin by glycoforms  of  alpha‐1‐acid glycoprotein expressed  in rheumatoid arthritis. Biomed Chromatogr 12, 343‐349. 

Kabir, S. (1998) Jacalin: a jackfruit (Artocarpus heterophyllus) seed‐derived lectin of versatile  applications  in  immunobiological  research.  J  Immunol Methods 212, 193‐211. 

Kamada,  H.,  Fugmann,  T.,  Neri,  D.,  and  Roesli,  C.  (2009)  Improved  protein sequence  coverage  by  on  resin deglycosylation  and  cysteine modification for biomarker discovery. Proteomics 9, 783‐787. 

Bibliography  

107

Kawamoto, S., Matsumoto, Y., Mizuno, K., Okubo, K., and Matsubara, K. (1996) Expression profiles of active genes  in human and mouse  livers. Gene 174, 151‐158. 

Kieliszewski, M. J., OʹNeill, M., Leykam, J., and Orlando, R. (1995) Tandem mass spectrometry  and  structural  elucidation  of  glycopeptides  from  a hydroxyproline‐rich  plant  cell wall  glycoprotein  indicate  that  contiguous hydroxyproline  residues  are  the  major  sites  of  hydroxyproline  O‐arabinosylation. J Biol Chem 270, 2541‐2549. 

Kim‐Howard, X. R.,  Staudt,  L.,  and  James,  J. A.  (2005) Update  in  rheumatoid arthritis therapy. J Okla State Med Assoc 98, 53‐62. 

Kirmiz, C., Li, B., An, H. J., Clowers, B. H., Chew, H. K., Lam, K. S., Ferrige, A., Alecio, R., Borowsky, A. D., Sulaimon, S., Lebrilla, C. B., and Miyamoto, S. (2007) A  serum glycomics approach  to breast  cancer biomarkers. Mol Cell Proteomics 6, 43‐55. 

Kremer,  J. M., Wilting,  J.,  and  Janssen,  L. H.  (1988) Drug  binding  to  human alpha‐1‐acid glycoprotein in health and disease. Pharmacol Rev 40, 1‐47. 

Kundranda, M. N., Ray, S., Saria, M., Friedman, D., Matrisian, L. M., Lukyanov, P., and Ochieng,  J.  (2004) Annexins expressed on  the  cell  surface  serve as receptors  for adhesion  to  immobilized  fetuin‐A. Biochim Biophys Acta 1693, 111‐123. 

Kyselova, Z., Mechref, Y., Al Bataineh, M. M., Dobrolecki, L. E., Hickey, R.  J., Vinson,  J.,  Sweeney,  C.  J.,  and Novotny, M.  V.  (2007) Alterations  in  the serum  glycome  due  to metastatic  prostate  cancer.  J  Proteome Res  6,  1822‐1832. 

Laemmli, U. K. (1970) Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4. Nature 227, 680‐685. 

Leffler, H., Carlsson, S., Hedlund, M., Qian, Y., and Poirier, F. (2004) Introduction to galectins. Glycoconj J 19, 433‐440. 

Bibliography  

108

Lettesjo, H., Nordstrom, E., Strom, H., Nilsson, B., Glinghammar, B., Dahlstedt, L.,  and  Moller,  E.  (1998)  Synovial  fluid  cytokines  in  patients  with rheumatoid arthritis or other arthritic lesions. Scand J Immunol 48, 286‐292. 

Ligier,  S.,  Fortin,  P.  R.,  and  Newkirk,  M.  M.  (1998)  A  new  antibody  in rheumatoid  arthritis  targeting  glycated  IgG:  IgM  anti‐IgG‐AGE.  Br  J Rheumatol 37, 1307‐1314. 

Liljeblad, M., Lundblad, A., and Pahlsson, P.  (2000) Analysis of agalacto‐IgG  in rheumatoid arthritis using  surface plasmon  resonance. Glycoconj  J 17, 323‐329. 

Lin, H.  S., Hu, C. Y., Chan, H. Y., Liew, Y. Y., Huang, H. P., Lepescheux, L., Bastianelli, E., Baron, R., Rawadi, G., and Clement‐Lacroix, P.  (2007) Anti‐rheumatic  activities  of  histone  deacetylase  (HDAC)  inhibitors  in  vivo  in collagen‐induced arthritis in rodents. Br J Pharmacol 150, 862‐872. 

Li, W., Zhu, S., Li, J., Huang, Y., Rongrong, Z., Fan, X., Yang, H., Gong, X., Eissa, N. T., Jahnen‐Dechent, W., Wang, P., Tracey, K. J., Sama, A. E., and Wang, H. (2011) A Hepatic Protein, Fetuin‐A, Occupies a Protective Role in Lethal Systemic Inflammation. PLoS ONE 6, e16945. 

Lorenz,  P.,  Bantscheff, M.,  Ibrahim,  S. M.,  Thiesen, H.  J.,  and Glocker, M. O. (2003)  Proteome  analysis  of  diseased  joints  from  mice  suffering  from collagen‐induced arthritis. Clin Chem Lab Med 41, 1622‐1632. 

Lowe, J. B. (2001) Glycosylation, immunity, and autoimmunity. Cell 104, 809‐812. 

Mackiewicz, A.  (1992) Cytokine, cytokine receptors and glucocorticoid network controlling N‐glycosylation of acute phase proteins in vitro. Folia Histochem Cytobiol 30, 165‐166. 

Malhotra, R., Wormald, M. R., Rudd, P. M., Fischer, P. B., Dwek, R. A., and Sim, R.  B.  (1995)  Glycosylation  changes  of  IgG  associated  with  rheumatoid arthritis can activate complement via the mannose‐binding protein. Nat Med 1, 237‐243. 

Mann, A. C., Record, C. O., Self, C. H., and Turner, G. A. (1994) Monosaccharide composition  of  haptoglobin  in  liver  diseases  and  alcohol  abuse:  large 

Bibliography  

109

changes  in glycosylation associated with alcoholic  liver disease. Clin Chim Acta 227, 69‐78. 

Manicourt, D. H., Poilvache, P., Van, E. A., Devogelaer,  J. P., Lenz, M. E., and Thonar, E. J. (2000) Synovial fluid levels of tumor necrosis factor alpha and oncostatin  M  correlate  with  levels  of  markers  of  the  degradation  of crosslinked collagen and cartilage aggrecan in rheumatoid arthritis but not in osteoarthritis. Arthritis Rheum 43, 281‐288. 

Mansson,  B.,  Geborek,  P.,  and  Saxne,  T.  (1997)  Cartilage  and  bone macromolecules in knee joint synovial fluid in rheumatoid arthritis: relation to development of knee or hip joint destruction. Ann Rheum Dis 56, 91‐96. 

Maresca, B., Cigliano, L., Corsaro, M. M., Pieretti, G., Natale, M., Bucci, E. M., Dal,  P.  F.,  Balato,  N.,  Nino,  M.,  Ayala,  F.,  and  Abrescia,  P.  (2010) Quantitative determination of haptoglobin glycoform variants  in psoriasis. Biol Chem 391, 1429‐1439. 

Marinkovic, S., Jahreis, G. P., Wong, G. G., and Baumann, H. (1989) IL‐6 modul‐ ates the synthesis of a specific set of acute phase plasma proteins in vivo. J Immunol 142, 808‐812. 

Marti, T., Schaller, J., Rickli, E. E., Schmid, K., Kamerling, J. P., Gerwig, G. J., van, H. H.,  and  Vliegenthart,  J.  F.  (1988)  The N‐  and  O‐linked  carbohydrate chains  of  human,  bovine  and  porcine  plasminogen.  Species  specificity  in relation to sialylation and fucosylation patterns. Eur J Biochem 173, 57‐63. 

Mathews,  S.  T.,  Deutsch,  D.  D.,  Iyer,  G.,  Hora,  N.,  Pati,  B.,  Marsh,  J.,  and Grunberger,  G.  (2002)  Plasma  alpha2‐HS  glycoprotein  concentrations  in patients with acute myocardial  infarction quantified by a modified ELISA. Clin Chim Acta 319, 27‐34. 

Memoli, B., De, B. L., Favia, P., Morelli, S., Lopez, L. C., Procino, A., Barbieri, G., Curcio,  E.,  Giorno,  L.,  Esposito,  P.,  Cozzolino,  M.,  Brancaccio,  D., Andreucci,  V.  E.,  dʹAgostino,  R.,  and  Drioli,  E.  (2007)  Fetuin‐A  gene expression, synthesis and release in primary human hepatocytes cultured in a galactosylated membrane bioreactor. Biomaterials 28, 4836‐4844. 

Bibliography  

110

Michaelsson,  E.,  Malmstrom,  V.,  Reis,  S.,  Engstrom,  A.,  Burkhardt,  H.,  and Holmdahl, R. (1994) T cell recognition of carbohydrates on type II collagen. J Exp Med 180, 745‐749. 

Mills, K., Mills, P. B., Clayton, P. T., Mian, N., Johnson, A. W., and Winchester, B. G.  (2003)  The  underglycosylation  of  plasma  alpha  1‐antitrypsin  in congenital disorders of glycosylation type I  is not random. Glycobiology 13, 73‐85. 

Mohamed, E., bdul‐Rahman, P. S., Doustjalali, S. R., Chen, Y., Lim, B. K., Omar, S. Z., Bustam, A. Z., Singh, V. A., Mohd‐Taib, N. A., Yip, C. H., and Hashim, O. H. (2008) Lectin‐based electrophoretic analysis of the expression of the 35 kDa  inter‐alpha‐trypsin  inhibitor  heavy  chain  H4  fragment  in  sera  of patients with five different malignancies. Electrophoresis 29, 2645‐2650. 

Mondal, G., Chatterjee, U., Chawla, Y. K., and Chatterjee, B. P. (2011) Alterations of  glycan  branching  and  differential  expression  of  sialic  acid  on  alpha fetoprotein among hepatitis patients. Glycoconj J 28, 1‐9. 

Mondal, G.,  Chatterjee, U., Das, H.  R.,  and  Chatterjee,  B.  P.  (2009)  Enhanced expression  of  alpha1‐acid  glycoprotein  and  fucosylation  in  hepatitis  B patients provides an insight into pathogenesis. Glycoconj J 26, 1225‐1234. 

Monnet, E. and Chachques,  J. C.  (2005) Animal models of heart  failure: what  is new? Ann Thorac Surg 79, 1445‐1453. 

Nakagawa,  H.,  Hato,  M.,  Takegawa,  Y.,  Deguchi,  K.,  Ito,  H.,  Takahata,  M., Iwasaki, N., Minami, A., and Nishimura, S.  (2007) Detection of altered N‐glycan  profiles  in  whole  serum  from  rheumatoid  arthritis  patients.  J Chromatogr B Analyt Technol Biomed Life Sci 853, 133‐137. 

Newkirk, M. M., LePage, K., Niwa, T., and Rubin, L. (1998) Advanced glycation endproducts  (AGE)  on  IgG,  a  target  for  circulating  antibodies  in  North American  Indians with  rheumatoid arthritis  (RA). Cell Mol Biol  (Noisy  ‐le‐grand) 44, 1129‐1138. 

Nielen, M. M., van, S. D., Reesink, H. W., Twisk, J. W., van de Stadt, R. J., van der Horst‐Bruinsma  IE, de, G. T., Habibuw, M. R., Vandenbroucke,  J. P.,  and 

Bibliography  

111

Dijkmans, B. A. (2004) Increased levels of C‐reactive protein in serum from blood donors before  the onset of  rheumatoid arthritis. Arthritis Rheum 50, 2423‐2427. 

Noda,  Y.,  Fujiwara,  K.,  Yamamoto,  K.,  Fukuno,  T.,  and  Segawa,  S.  (1994) Specificity  of  trypsin  digestion  and  conformational  flexibility  at  different sites of unfolded lysozyme. Biopolymers 34, 217‐226. 

Norberg, B., Bjelle, A., and Eriksson, S. (1983) Joint fluid leukocytosis of patients with rheumatoid arthritis evidence for neutrophil and monocyte chemotaxis in vivo. Clin Rheumatol 2, 237‐242. 

Ohtsubo,  K.  and Marth,  J.  D.  (2006)  Glycosylation  in  cellular mechanisms  of health and disease. Cell 126, 855‐867. 

Oortwijn, B. D., Roos, A., Royle, L., van Gijlswijk‐Janssen, D. J., Faber‐Krol, M. C., Eijgenraam,  J. W., Dwek, R. A., Daha, M. R., Rudd, P. M., and van, K. C. (2006)  Differential  glycosylation  of  polymeric  and  monomeric  IgA:  a possible  role  in  glomerular  inflammation  in  IgA  nephropathy.  J  Am  Soc Nephrol 17, 3529‐3539. 

Orchard,  S.  (2007)  Proteomics:  from  technology  development  to  biomarker applications. Expert Rev Proteomics 4, 709‐710. 

Parkkinen,  J.  (1989)  Aberrant  lectin‐binding  activity  of  immunoglobulin  G  in serum from rheumatoid arthritis patients. Clin Chem 35, 1638‐1643. 

Park, Y. B., Lee, S. K., Lee, W. K., Suh, C. H., Lee, C. W., Lee, C. H., Song, C. H., and  Lee,  J.  (1999)  Lipid  profiles  in  untreated  patients  with  rheumatoid arthritis. J Rheumatol 26, 1701‐1704. 

Patel, M. and Goldstein, H. (2004) Animal models of cancer and HIV. Curr Opin Oncol 16, 463‐467. 

Petricoin,  E.  F.,  Belluco,  C., Araujo,  R.  P.,  and  Liotta,  L. A.  (2006)  The  blood peptidome: a higher dimension of information content for cancer biomarker discovery. Nat Rev Cancer 6, 961‐967. 

Bibliography  

112

Pineiro, M., Andres, M.,  Iturralde, M.,  Carmona,  S., Hirvonen,  J.,  Pyorala,  S., Heegaard, P. M., Tjornehoj, K., Lampreave, F., Pineiro, A., and Alava, M. A. (2004)  ITIH4  (inter‐alpha‐trypsin  inhibitor heavy  chain  4)  is  a new  acute‐phase  protein  isolated  from  cattle  during  experimental  infection.  Infect Immun 72, 3777‐3782. 

Piva, M., Moreno, J. I., and Sharpe‐Timms, K. L. (2002) Glycosylation and over‐expression  of  endometriosis‐associated peritoneal haptoglobin. Glycoconj  J 19, 33‐41. 

Prevoo, M. L., van ʹt Hof, M. A., Kuper, H. H., van Leeuwen, M. A., van de Putte, L. B., and van Riel, P. L. (1995) Modified disease activity scores that include twenty‐eight‐joint  counts.  Development  and  validation  in  a  prospective longitudinal study of patients with rheumatoid arthritis. Arthritis Rheum 38, 44‐48. 

Przybysz,  M.,  Maszczak,  D.,  Borysewicz,  K.,  Szechinski,  J.,  and  Katnik‐Prastowska,  I.  (2007) Relative  sialylation and  fucosylation of  synovial and plasma  fibronectins  in  relation  to  the  progression  and  activity  of rheumatoid arthritis. Glycoconj J 24, 543‐550. 

Putnam,  F. W.  (1984)  The  Plasma  Proteins  Structure,  Function,  and  Genetic Control. Academic press: New York. 

Rabinovich,  G.  A.,  Toscano,  M.  A.,  Jackson,  S.  S.,  and  Vasta,  G.  R.  (2007) Functions of cell surface galectin‐glycoprotein lattices. Curr Opin Struct Biol 17, 513‐520. 

Raghav, S. K., Gupta, B., Agrawal, C., Saroha, A., Das, R. H., Chaturvedi, V. P., and  Das,  H.  R.  (2006)  Altered  expression  and  glycosylation  of  plasma proteins in rheumatoid arthritis. Glycoconj J 23, 167‐173. 

Ribbens, C., Bonnet, V., Kaiser, M. J., Andre, B., Kaye, O., Franchimont, N., de, G. D., Beguin, Y., and Malaise, M. G. (2000) Increased synovial fluid  levels of soluble CD23 are associated with an erosive status  in rheumatoid arthritis (RA). Clin Exp Immunol 120, 194‐199. 

Bibliography  

113

Ricardo,  J.  and  Sola,  K.  G.  (2008)  Effects  of  Glycosylation  on  the  Stability  of Protein Pharmaceuticals. J pharm Sci 1‐23. 

Rooney, M., Condell, D., Quinlan, W., Daly, L., Whelan, A.,  Feighery, C.,  and Bresnihan,  B.  (1988)  Analysis  of  the  histologic  variation  of  synovitis  in rheumatoid arthritis. Arthritis Rheum 31, 956‐963. 

Ropes,  M.  W.,  Perlmann,  G.  E.,  Kaufman,  D.,  and  Bauer,  W.  (1954)  The electrophoretic distribution of proteins  in plasma  in rheumatoid arthritis. J Clin Invest 33, 311‐318. 

Rottger,  S., White,  J., Wandall,  H.  H.,  Olivo,  J.  C.,  Stark,  A.,  Bennett,  E.  P., Whitehouse,  C.,  Berger,  E.  G.,  Clausen,  H.,  and  Nilsson,  T.  (1998) Localization of three human polypeptide GalNAc‐transferases in HeLa cells suggests  initiation  of  O‐linked  glycosylation  throughout  the  Golgi apparatus. J Cell Sci 111 ( Pt 1), 45‐60. 

Ryden,  I.,  Pahlsson,  P.,  Lundblad,  A.,  and  Skogh,  T.  (2002)  Fucosylation  of alpha1‐acid  glycoprotein  (orosomucoid)  compared  with  traditional biochemical markers of  inflammation  in  recent onset  rheumatoid arthritis. Clin Chim Acta 317, 221‐229. 

Sahu, D., Saroha, A., Roy, S., Das, S., Srivastava, P. S., and Das, H. R. Suramin ameliorates collagen induced arthritis. (manuscript under revision). 

Sambrook, J., Fritsch, E. F., and Maniatis, T. (1989) Molecular cloning: A Laboratory Manual. Cold Spring Harbor Laboratory press. 

Saroha,  A.,  Biswas,  S.,  Chatterjee,  B.  P.,  and  Das,  H.  R.  (2011)  Altered glycosylation  and  expression  of  plasma  alpha‐1‐acid  glycoprotein  and haptoglobin  in  rheumatoid  arthritis.  J Chromatogr B Analyt Technol Biomed Life Sci 879, 1839‐1843. 

Saroha, A. and Das, H. R. (2011) Altered glycosylation in autoimmune diseases. Trends Carbo Res 3, 1‐12. 

Sasisekharan,  R.  and Myette,  J.  R.  (2003)  The  Sweet  Science  of Glycobiology. American Scientist 91, 432‐441. 

Bibliography  

114

Saso, L., Silvestrini, B., Zwain, I., Guglielmotti, A., Luparini, M. R., Cioli, V., and Cheng, C. Y. (1992) Abnormal glycosylation of hemopexin in arthritic rats can be blocked by bindarit. J Rheumatol 19, 1859‐1867. 

Sato, M., Schneeweiss, S., Scranton, R., Katz,  J. N., Weinblatt, M. E., Avorn,  J., Ting,  G.,  Shadick,  N.  A.,  and  Solomon,  D.  H.  (2006)  The  validity  of  a rheumatoid  arthritis  medical  records‐based  index  of  severity  compared with the DAS28. Arthritis Res Ther 8, R57. 

Sautner, J. and Leeb, B. F. (2003) Biologicals in treatment of rheumatoid arthritis and other inflammatory arthropathies. Wien Med Wochenschr 153, 304‐308. 

Sawada, M., Moriya, S., Saito, S., Shineha, R., Satomi, S., Yamori, T., Tsuruo, T., Kannagi, R.,  and Miyagi, T.  (2002) Reduced  sialidase  expression  in highly metastatic  variants  of mouse  colon  adenocarcinoma  26  and  retardation  of their metastatic ability by sialidase overexpression. Int J Cancer 97, 180‐185. 

Scott, D. L., Grindulis, K. A., Struthers, G. R., Coulton, B. L., Popert, A.  J., and Bacon,  P.  A.  (1984)  Progression  of  radiological  changes  in  rheumatoid arthritis. Ann Rheum Dis 43, 8‐17. 

Schafer, C., Heiss, A., Schwarz, A., Westenfeld, R., Ketteler, M., Floege, J., Muller‐Esterl, W., Schinke, T.,  and  Jahnen‐Dechent, W.  (2003) The  serum protein alpha  2‐Heremans‐Schmid  glycoprotein/fetuin‐A  is  a  systemically  acting inhibitor of ectopic calcification. J Clin Invest 112, 357‐366. 

Schauer  R  (1982)  Sialic  Acids,  Chemistry,  Metabolism,  and  Function.  Springer‐Verlag: New York. 

Shevchenko, A., Wilm, M., Vorm, O., and Mann, M.  (1996) Mass spectrometric sequencing  of  proteins  silver‐stained  polyacrylamide  gels. Anal  Chem  68, 850‐858 

Shiyan  SD  and  Bovin  NV  (1997)  Carbohydrate  composition  and immunomodulatory  activity  of  different  glycoforms  of  alpha1‐acid glycoprotein. Glycoconj J 14, 631‐638. 

Bibliography  

115

Shiyan SD, Nasonov VV, Bovin NV, Novikova LI, Aleshkin VA, and Lutov AG (1993)  Studies  of N‐linked  oligosaccharide  chains  of  a1‐acid  glycoprotein from  ascitic  fluid  of  stomach  cancer  patients  and  normal  serum.  Experim Oncol 15, 53‐61. 

Skogh, T., Gustafsson, D., Kjellberg, M.,  and Husberg, M.  (2003) Twenty  eight joint count disease activity score in recent onset rheumatoid arthritis using C reactive protein instead of erythrocyte sedimentation rate. Ann Rheum Dis 62, 681‐682. 

Smeets,  M.  B.,  Sluijter,  J.  P.,  Donners,  M.  M.,  Velema,  E.,  Heeneman,  S., Pasterkamp, G., and de Kleijn, D. P. (2003) Increased arterial expression of a glycosylated haptoglobin  isoform after balloon dilation. Cardiovasc Res 58, 689‐695. 

Smiley, J. D., Sachs, C., and Ziff, M. (1968) In vitro synthesis of immunoglobulin by rheumatoid synovial membrane. J Clin Invest 47, 624‐632. 

Song, J., Patel, M., Rosenzweig, C. N., Chan‐Li, Y., Sokoll, L. J., Fung, E. T., Choi‐Miura,  N.  H.,  Goggins,  M.,  Chan,  D.  W.,  and  Zhang,  Z.  (2006) Quantification  of  fragments  of human  serum  inter‐alpha‐trypsin  inhibitor heavy  chain  4  by  a  surface‐enhanced  laser  desorption/ionization‐based immunoassay. Clin Chem 52, 1045‐1053. 

Suzuki,  A.,  Yamada,  R.,  Chang,  X.,  Tokuhiro,  S.,  Sawada,  T.,  Suzuki,  M., Nagasaki, M., Nakayama‐Hamada, M., Kawaida, R., Ono, M., Ohtsuki, M., Furukawa,  H.,  Yoshino,  S.,  Yukioka,  M.,  Tohma,  S.,  Matsubara,  T., Wakitani, S., Teshima, R., Nishioka, Y., Sekine, A.,  Iida, A., Takahashi, A., Tsunoda, T., Nakamura, Y., and Yamamoto, K. (2003) Functional haplotypes of PADI4, encoding citrullinating enzyme peptidylarginine deiminase 4, are associated with rheumatoid arthritis. Nat Genet 34, 395‐402. 

Sutton, B., Corper, A., Bonagura, V., and Taussig, M.  (2000) The  structure and origin of rheumatoid factors. Immunol Today 21, 177‐183. 

Swallow, C. J., Partridge, E. A., Macmillan, J. C., Tajirian, T., DiGuglielmo, G. M., Hay,  K.,  Szweras,  M.,  Jahnen‐Dechent,  W.,  Wrana,  J.  L.,  Redston,  M., Gallinger, S., and Dennis, J. W. (2004) alpha2HS‐glycoprotein, an antagonist 

Bibliography  

116

of  transforming  growth  factor  beta  in  vivo,  inhibits  intestinal  tumor progression. Cancer Res 64, 6402‐6409. 

Taneja, S., Ahmad,  I., Sen, S., Kumar, S., Arora, R., Gupta, V. K., Aggarwal, R., Narayanasamy, K., Reddy, V. S., and  Jameel, S.  (2011) Plasma peptidome profiling of acute hepatitis E patients by MALDI‐TOF/TOF. Proteome Sci 9, 5. 

Taylor, P. C., Chu, C. Q., Plater‐Zyberk, C., and Maini, R. N.  (1996) Transfer of type  II  collagen‐induced  arthritis  from  DBA/1  to  severe  combined immunodeficiency  mice  can  be  prevented  by  blockade  of  Mac‐1. Immunology 88, 315‐321. 

Tedder, T. F., Steeber, D. A., Chen, A., and Engel, P. (1995) The selectins: vascular adhesion molecules. FASEB J 9, 866‐873. 

Terato, K., Hasty, K. A., Reife, R. A., Cremer, M. A., Kang, A. H., and Stuart, J. M. (1992)  Induction  of  arthritis  with  monoclonal  antibodies  to  collagen.  J Immunol 148, 2103‐2108. 

Thompson, S., Kelly, C. A., Griffiths, I. D., and Turner, G. A. (1989) Abnormally‐fucosylated serum haptoglobins in patients with inflammatory joint disease. Clin Chim Acta 184, 251‐258. 

Tilleman,  K.  and  Deforce,  D.  (2008)  Proteomics  in  rheumatology.  Expert  Rev Proteomics 5, 755‐759. 

Tolleshaug, H.  (1984)  Intracellular  segregation  of  asialo‐transferrin  and  asialo‐fetuin  following  uptake  by  the  same  receptor  system  in  suspended hepatocytes. Biochim Biophys Acta 803, 182‐190. 

Towbin,  H.,  Staehelin,  T.,  and  Gordon,  J.  (1992)  Electrophoretic  transfer  of proteins  from  polyacrylamide  gels  to  nitrocellulose  sheets:  procedure  and some applications. 1979. Biotechnology 24, 145‐149. 

Trentham, D. E., Townes, A. S., and Kang, A. H. (1977) Autoimmunity to type II collagen an experimental model of arthritis. J Exp Med 146, 857‐868. 

Bibliography  

117

Van Boekel, M. A., Vossenaar, E. R., van den Hoogen, F. H., and van Venrooij, W. J.  (2002)  Autoantibody  systems  in  rheumatoid  arthritis:  specificity, sensitivity and diagnostic value. Arthritis Res 4, 87‐93. 

Van, D. W., Koeleman, C., Van het, H. B., Poland, D.,  Jakobs, C., and  Jaeken,  J. (2001)  Increased  alpha3‐fucosylation  of  alpha(1)‐acid  glycoprotein  in patients with congenital disorder of glycosylation  type  IA  (CDG‐Ia). FEBS Lett 494, 232‐235. 

Varki, A., Cummings, R. D., Esko, J. D., Freeze, H. H., Stanley, P., Bertozzi, C. R., Hart, G. W., and Etzler, M. E.  (2009) Essentials of Glycobiology. Cold Spring Harbor Laboratory Press Publications. 

Wang,  B.  and  Brand‐Miller,  J.  (2003)  The  role  and  potential  of  sialic  acid  in human nutrition. Eur J Clin Nutr 57, 1351‐1369. 

Wang, W. (2005) Protein aggregation and its inhibition in biopharmaceutics. Int J Pharm 289, 1‐30. 

Weaver, A. L.  (2004) Efficacy  and  safety  of  the  anti‐TNF  biologic  agents. Mod Rheumatol 14, 101‐112. 

Weis, W. I., Taylor, M. E., and Drickamer, K. (1998) The C‐type lectin superfamily in the immune system. Immunol Rev 163, 19‐34. 

Weyand, C. M. and Goronzy,  J.  J.  (2000) Association of MHC and  rheumatoid arthritis.  HLA  polymorphisms  in  phenotypic  variants  of  rheumatoid arthritis. Arthritis Res 2, 212‐216. 

Wooley, P. H., Luthra, H. S., Stuart, J. M., and David, C. S. (1981) Type II Collage‐ n ‐induced arthritis in mice. I. Major histocompatibility complex (I region) linkage and antibody correlates. J Exp Med 154, 688‐700. 

Xu, L. X. and Zhao, M. H. (2005) Aberrantly glycosylated serum IgA1 are closely associated with pathologic phenotypes of  IgA nephropathy. Kidney  Int 68, 167‐172. 

Yang, H. T., Jirholt, J., Svensson, L., Sundvall, M., Jansson, L., Pettersson, U., and Holmdahl,  R.  (1999)  Identification  of  genes  controlling  collagen‐induced 

Bibliography  

118

arthritis  in  mice:  striking  homology  with  susceptibility  loci  previously identified in the rat. J Immunol 163, 2916‐2921. 

Zhao, J., Simeone, D. M., Heidt, D., Anderson, M. A., and Lubman, D. M. (2006) Comparative  serum  glycoproteomics  using  lectin  selected  sialic  acid glycoproteins with mass  spectrometric  analysis:  application  to  pancreatic cancer serum. J Proteome Res 5, 1792‐1802. 

Zheng,  X., Wu,  S.  L., Hincapie, M.,  and Hancock, W.  S.  (2009)  Study  of  the human plasma proteome of rheumatoid arthritis. J Chromatogr A 1216, 3538‐3545. 

Zhuo,  L.  and  Kimata,  K.  (2008)  Structure  and  function  of  inter‐alpha‐trypsin inhibitor heavy chains. Connect Tissue Res 49, 311‐320.