Corsi 2012

Corso Teorico-Pratico diProteomica/Elettroforesi 2D 2012

Genova

Corso Teorico-Pratico di Real-time PCRMilano

Corso Teorico-Pratico di Real-time PCRAriano Irpino (AV)

qPCR Assay Design and Sample Preparation

Marnes-la-Coquette, France

qPCR and Statistical analysis of Gene Expression

Marnes-la-Coquette, France

Corso Teorico di Real-time PCRRoma

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Italy

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Droplet Digital™ PCR: Molecular Biology in High Resolution

Droplet Digital PCR è la terza generazione della tecnologia PCR. Il sistema QX100™ Droplet Digital PCR di Bio-Rad Laboratories consente di ottenere una misurazione assoluta del numero di copie di DNA con un’accuratezza, precisione e sensibilità mai viste prima d’ora, al prezzo incredibilie di circa 3 € a campione.

Droplet Digital PCR offre ai ricercatori un nuovo strumento per misurazioni precise di copy number variation, identificazione di sequenze poco rappresentate, di mutazioni rare, inclusa l’identificazione di sequenze rare in campioni tumorali, e per l’analisi di gene expression.

QX100™ Droplet Digital™ PCR System

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Organizzato da Bio-Rad Laboratories, con il patrocinio della Scuola Internazionale di Scienze Pediatriche dell’Istituto

G. Gaslini, in collaborazione con il RenalChild Foundation

Corso Teorico-Pratico di Proteomica/Elettroforesi 2D 2012

L’organizzazione e le date del corso saranno definite in funzione delle richieste e delle disponibilità. Per informazioni:

Lsg_training_it@bio-rad.com

Il Corso si terrà presso l’Istituto Giannina Gaslini di Genova

Largo Gerolamo Gaslini, 5

Relatori:Dr. G. Candiano; Dr. M. Bruschi;Istituto Giannina Gaslini, Genova

Primo Giorno09.00 Presentazione del Corso09.30 Preparazione del campione e reidratazione delle IPG.10.30 Parte teorica12.30 Pausa pranzo Caricamento del campione per la prima dimensione e partenza della focalizzazione. Preparazione dei gel per la seconda dimensione in SDS-PAGE e soluzioni di equilibrazione delle IPG focalizzate.15.30 Parte teorica

Secondo Giorno09.00 Equilibrazione delle IPG

Allestimento dei gel per seconda dimensione e inizio corsa. Preparazione delle soluzioni di colorazione: Coomassie blue, Coomassie colloidale e Sypro Ruby

12.30 Pausa pranzo14.30 Termine della seconda dimensione e inizio colorazione.

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15.30 Parte teorica: Introduzione alla tecnologia Stain Free e visualizzazione di una mappa 2D mediante Criterion Stain Free Imager.

Terzo Giorno09.00 Termine fase colorazione

Acquisizione delle mappe bidimensionali con densitometro in luce bianca per gel colorati e con scanner laser per gel in fluorescenza.

11.00 Elaborazione delle immagini con software PDQuest.12.30 Pausa pranzo14.00 Termine elaborazione con software PDQuest.15.00 Taglio spot e relativo trattamento per l’analisi in

spettometria di massa.16.30 Discussione finale.

La quota di 800 Euro (IVA esclusa) comprende: iscrizione, materiale didattico e pranzi di lavoro.Il Corso prevede un numero massimo di 5

partecipanti

Per le modalità di iscrizione si veda pag. 14

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Organizzato da Bio-Rad Laboratories

Corso Teorico-Pratico di Real-time PCR

Il corso si terrà pressoBio-Rad Laboratories S.r.l. Via B. Cellini 18/A

Segrate - MI

04-07 Giugno 2012 - 22-25 Ottobre 2012

Relatori del corso:Dr. M.G. Bianchi; Dr. L. Boveri Dr.ssa E. Cardillo

Bio-Rad Laboratories S.r.l.Dr. A. Beghini Dip. di Biologia e Genetica per le Scienze

Mediche – Università di Milano Dr. A. Gori Dip. di Biotecnologie Agrarie – Università di Firenze Dr. G. Spinsanti Dip. di Biologia Evolutiva – Università di Siena

Primo giorno14.10 Introduzione al corso e presentazione del programma.14.30 Principi generali della tecnologia Real -Time.15.20 Chimiche fluorogeniche in Real -Time PCR.16.15 Coffee Break16.30 Principi della quantificazione relativa ed assoluta e significato degli standard.16.30 Principi della quantificazione relativa.

Secondo giorno09.00 Pre-PCR – RNA; analisi, estrazione e valutazione della qualità del campione.10.15 Pre-PCR – L’ottimizzazione della reazione di retrotrascrizione e l’influenza di diversi approcci sull’accuratezza del dato di espressione genica.11.15 Coffee Break11.30 Prova pratica – Elettroforesi microfluidica dell’RNA e Retrotrascrizione.12.15 Pausa Pranzo13.45 Prova pratica – Risultato della corsa di elettroforesi microfluidica.14.30 HRM: Utilizzo di HRM per una rapida e accurata determinazione di differenti pathovar di Pseudomonas savastanoi.15.45 Coffee Break

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16.00 Linee guida per il disegno di sistemi SybrGreen, TaqMan e nuovi sviluppi per l’analisi epigenetica. 16.45 HRM: lo screening per la ricerca di mutazioni ed altre applicazioni per una tecnologia in continuo sviluppo.

Terzo giorno08.45 Sistemi di analisi – Software e parametri di analisi in PCR Real-Time.09.45 Prova Pratica - Preparazione di un test Real-Time con SybrGreen per l’analisi quantitativa dell’espressione genica.10.45 Coffee Break11.00 Troubleshooting – Conoscere la chimica, l’hardware ed il software utilizzati per comprendere il significato di plot di amplificazione strani o aberranti.12.15 Pausa pranzo13.30 Risultato della prova pratica di PCR Real-Time con SybrGreen.14.45 Selezione di geni controllo in biopsie cutanee di Stenella coeruleoalba (Cetacea, Odontoceti).15.45 Coffee Break16.00 Real-time PCR e statistica di base. Considerazioni su un appropriato disegno sperimentale per esperimenti di gene expression.16.45 Prova pratica – preparazione test multiplex e preparazio- ne di un test di High Resolution Melting per la ricerca di mutazioni.

Quarto giorno08.45 Progettazione PCR - Stem-loop RT-PCR, un sistema ingegnoso ed efficace per la rilevazione e la quantifica- zione dei micro-RNA.09.45 Risultato del test TaqMan in multiplex e risultato del test High Resolution Melting per la ricerca di mutazioni.11.00 Coffee Break11.20 La terza generazione della PCR quantitativa – droplet digital PCR. La soluzione per quantificazioni assolute e applicazioni complesse quali; detection di sequenze rare, analisi di Copy Number Variation e quantificazioni che richiedono un’accuratezza superiore.

La quota di 800 Euro (IVA esclusa) comprende: iscrizione, materiale didattico e pranzi di lavoro.Il Corso prevede un numero massimo di 12

partecipanti

Per le modalità di iscrizione si veda pag. 14

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Organizzato da Bio-Rad Laboratories S.r.l.in collaborazione con l’istituto di ricerche genetiche “Gaetano Salvatore” di Ariano Irpino (Biogem Scarl)

Corso Teorico-Pratico di Real-time PCR

Il Corso si terrà presso Biogem s.c.a.r.l. Via Camporeale Area P.I.P. - Ariano Irpino (AV)

24 - 27 Settembre 2012

Relatori del Corso:Dr.ssa L. Ciccone, Dr.ssa E. Cardillo, Dr. L. Boveri

Bio-Rad Laboratories S.r.l.

Primo Giorno14.10 Introduzione al corso e presentazione del programma14.30 Principi generali della tecnologia Real-Time15.20 Chimiche fluorogeniche in Real-Time PCR.16.15 Coffee Break16.30 Principi della quantificazione assoluta e significato degli standards.17.15 Principi della quantificazione relativa.

Secondo Giorno08.45 Pre-PCR – Modulazione dell’espressione, profilatura, isolamento dell’RNA, valutazione della qualità e della resa del campione. Quale influenza attribuire a ciascuno step sulle fasi successive dell’analisi.10.00 Prova pratica – Elettroforesi microfluidica dell’RNA11.00 Coffee Break11.15 Pre-PCR – L’ottimizzazione della reazione di retro-trascrizione e l’influenza di diversi approcci sull’accuratezza del dato di espressione genica12.00 Risultato della corsa di elettroforesi microfluidica Software e parametri di analisi.13.00 Pausa Pranzo14.30 Prova pratica – Reazione di retro-trascrizione con l’iScript cDNA Synthesis kit.15.00 La Real Time PCR per lo studio dello stato di metilazione delle sequenze promotrici o per la ricerca di mutazioni o polimorfismi.

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15.45 Coffee Break16.00 Prova pratica – Preparazione di un test di Real Time in Sybr Green.16.30 Progettazione PCR – Linee guida per il disegno di sistemi SybrGreen, TaqMan e nuovi sviluppi per l’analisi epigenetica.

Terzo Giorno08.45 Troubleshooting – Conoscere la chimica, l’hardware ed il software utilizzati per comprendere il significato di plot di amplificazione strani o aberranti. Validità ed accettabilità dei dati sperimentali.10.45 Coffee Break11.00 Prova pratica – Preparazione di un test TaqMan in multiplex.12.00 Sistemi di analisi – Software e parametri di analisi in PCR Real-Time – risultato della prova pratica di PCR Real Time con SybrGreen.13.00 Pausa Pranzo14.30 Esempio di disegno con BD.15.30 Risultato del test TaqMan in multiplex.16.30 Coffee Break16.45 Prova pratica – Preparazione di un test di High Resolution Melting.

Quarto Giorno08.45 Risultato del test di High Resolution Melting.09.45 Nozioni basilari di statistica utili alla comprensione dei dati di Real-Time PCR. Considerazioni sulla corretta impostazione di uno studio di espressione genica.10.45 Commenti a chiusura del corso11.00 La terza generazione di PCR quantitativa - droplet digital PCR. La soluzione per quantificazioni assolute e applicazioni quali: detection di sequenze rare, analisi di Copy Number Variation e quantificazioni che richiedono un’accuratezza superiore.12.00 Commenti a chiusura del corso

La quota di 600 Euro (IVA esclusa) comprende: iscrizione e materiale didattico, i coffee break, due

pranzi e la cena socialeIl Corso prevede un numero massimo di

16 partecipantiPer le modalità di iscrizione si veda pag. 14

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La Bio-Rad Laboratories,al fine di promuovere un’informazione costante e qualificata sulle

più moderne tecnologie di laboratorio,è lieta di invitarLa al

Corso Teorico di Real-time PCR

Il corso si terrà pressoUniversità “La Sapienza”

Dipartimento di Biologia AmbientaleAula ‘’Valerio Giacomini’’

P.le A.Moro, 5 - 00185 Roma

25-27 Giugno 2011

Relatori del corso:

Dr.ssa L. Ciccone, Dr. M.G. Bianchi Bio-rad Laboratories S.r.l.

Dr. A. Gori Dip. di Biotecnologie Agrarie - Università degli Studi di Firenze

Dr. M. Pilotti C.R.A. - Consiglio per la Ricerca e la Sperimentazione

in Agricoltura - Roma

Primo giorno14.10 Introduzione al corso e presentazione del programma.14.30 Principi generali della tecnologia Real-Time.15.20 Chimiche fluorogeniche in Real-Time PCR16.15 Coffee Break16.30 Principi della quantificazione relativa ed assoluta.

Secondo giorno08.45 Modulazione dell’espressione, profilatura, isola mento dell’RNA, valutazione della qualità e della resa del campione. Quale influenza attribuire a ciascuno step sulle fasi successive dell’analisi.10.00 L’ottimizzazione della reazione di retro-trascrizione e l’influenza di diversi approcci sull’accuratezza del dato di espressione genica.10.30 Coffee Break10.45 Preparazione degli standard e loro significato nei diversi approcci quantitativi.

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11.30 La Real Time PCR per lo studio dello stato di metilazione delle sequenze promotrici o per la ricerca di mutazioni e polimorfismi.12.15 Pausa Pranzo13.45 HRM: Utilizzo di HRM per una rapida e accurate determinazione di differenti pathovar di Pseudomonas savastanoi.15.00 Sistemi di analisi – Software e parametri di analisi in PCR Real Time.16.00 Coffee Break16.20 Progettazione PCR – Linee guida per il disegno di sistemi SybrGreen, TaqMan e nuovi sviluppi per l’analisi epigenetica; studio dello stato epigenetico mediante EpiQ.

Terzo Giorno08.45 Messa a punto di una metodica di PCR Real Time per il rilevamento di Ceratocystis platani (agente del cancro colorato) in legno di platano.09.45 Troubleshooting – Conoscere la chimica, l’hardware ed il software utilizzati per comprendere il significato di plot di amplificazione strani o aberranti. Validità ed accettabilità dei dati sperimentali.10.45 Coffee Break11.00 Nozioni basilari di statistica utili alla comprensione dei dati di Real Time PCR. La corretta impostazione di uno studio di espressione genica dal punto di vista statistico.

La quota di 550 Euro (IVA esclusa) comprende: iscrizione e materiale didattico, i coffee break, due

pranzi e la cena socialeIl Corso prevede un numero massimo di

30 partecipantiPer le modalità di iscrizione si veda pag. 14

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Corso Avanzato Teorico-Pratico

qPCR Assay Design and Sample Preparation

in collaborazione con TATAA Biocenter

Il Corso si terrà pressoBio-Rad European Training Centre

Marnes-La-Coquette, France

3-4 Luglio 2012 e 4-5 Dicembre 2012

L’obiettivo di questo corso è fornire l’opportunità di effettua-re prove pratiche di laboratorio sotto la supervisione di istruttori. Saranno suggerite le migliori strategie per un’ottima-le preparzione dei campioni, per condurre un’efficiente re-tro-trascrizione, per generare dati di PCR di buona qua-lità e per impostare un adeguato disegno sperimentale.

Gli argomenti trattati includono:

• Introduzione alle tecniche e ai principi per la preparazione dei campioni

• Prova pratica su differenti metodologie per la preparazione dei campioni

• Estrazione da matrici difficoltose e da campioni di piccole dimensioni

• Controllo della qualità del DNA e dell’RNA • Elettroforesi automatizzata • Disegno di saggi In silico “Disegna il tuo saggio personalizzato” • Introduzione alla PCR e alla qPCR • Disegno di primer e sonde • Trascrizione inversa: linee guida e dimostrazione pratica

per la sintesi del cDNA • PCR quantitativa Real time: linee guida sperimentali ed

esperimenti pratici in laboratorio

Istruttori: Specialisti Tattaa Biocenter e Bio-Rad

* Il corso sarà tenuto in lingua inglese

Per l’iscrizione al corso visita il nostro sitowww.bio-rad.com/qPCRtraining

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Corso Avanzato

qPCR and Statistical Analysis of Gene Expression

Il corso si terrà pressoBio-Rad European Training Centre

Marnes-La-Coquette, France

5-6 Luglio 2012 e 6-7 Dicembre 2012

L’obiettivo di questo corso è fornire gli strumenti necessari per la comprensione delle procedure di elaborazione e analisi stati-stica dei dati ottenuti per mezzo di Real-Time PCR. Le esercita-zioni pratiche basate su dati reali e su dati forniti dai partecipanti saranno un fattore chiave di questo corso. Verranno presentati i di-segni sperimentali più diffusi; i dati derivanti da studi di questo ge-nere saranno quindi analizzati dai partecipanti sotto la supervisone dei nostri istruttori. Grazie a questo corso i partecipanti acquisiran-no familiarità con i più comuni casi sperimentali e creeranno modelli basati su Excel per l’analisi dei dati; tali modelli rimarranno a dispo-sizione dei partecipanti e sarà possibile per loro usufruirne in se-guito. Durante il corso verrà inoltre fornita una panoramica dei dif-ferenti strumenti software correlati a metodiche di Real-Time PCR.

Gli argomenti trattati includono:

• Introduzione alla statistica• Processo di amplificazione• Livello di threshold e valore Cq• Calcolo del numero di copie• Calcolo del valore di espressione• Metodiche di normalizzazione• Selezione e normalizzazione con geni Reference• Test statistici per l’analisi di dati Real Time PCR (Verrà fornita una versione demo dei software)• Qbase Plus, etc…• MIQE guidelines

Istruttori: Specialisti Tattaa Biocenter e Bio-Rad

* Il corso sarà tenuto in lingua inglese

Per l’iscrizione al corso visita il nostro sitowww.bio-rad.com/qPCRtraining

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Modalità di iscrizione

Per l’iscrizione ai corsi che si terranno c/o Bio-Rad European Training Centre Marnes-La-Coquette

è necessario compilare il modulo online che troverete alla pagina internet

www.bio- rad.com/qPCR

Per richiedere l’iscrizione ai Corsiè necessario compilare il modulo online che troverete alla

pagina internet discover.bio-rad.it (sezione Eventi)

Per l’ammissione ai Corsi

Teorico - Pratico di Real Time PCR del04-07 Giugno 2012 / 22-25 Ottobre 2012

Teorico - Pratico di Real Time PCR del24 - 27 Settembre 2012

saranno considerati requisiti preferenziali il possessodi un apparecchio Bio-Rad per PCR Real-Time

e un’esperienza, seppur minima, in questa tecnologia

Segreteria OrganizzativaBio-Rad Laboratories Srl

Rossella FumagalliVia Cellini 18/A

20090 Segrate (Milano)tel 02 21609436 fax 02 21609399

e-mail: Lsg_training_it@bio-rad.com

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Bio-Rad è impegnata a dare un supporto costante sulle tecnologie più avanzate, con informazioni dettagliate sui

prodotti e sulle applicazioni specifiche.

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nostri protocolli di laboratorio:

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