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Conferenza del Dipartimento DIITET 26 e 27 maggio 2014
Silvia Scaglione
Attività Progettuale Biotecnologie
CONSIGLIO NAZIONALE DELLE RICERCHE
26 e 27 Maggio, 2014Convegno del Dipartimento di Ingegneria, ICT e Tecnologie per l’Energia e i Trasporti
Conferenza del Dipartimento Roma, 26 e 27 maggio 2014
Silvia Scaglione
Introduzione alle biotecnologieLe biotecnologie sono intrinsecamente multidisciplinari, coinvolgendo input da:• Biochimica• Ingegneria• Biologia • Informatica• Genetica• Fisiologia• Matematica
Ricerca biomedica di base
High-dimensional “omics” data
Medicina traslazionale
Processi Biotecnologici Industriali
Strumenti di calcolo ed algoritmi ad alte prestazioni
Modelli matematici, ottimizzazione di processi, statistica per l’analisi di sistemi biologici complessi
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Silvia Scaglione
Il Programma di Ricerca H2020 e le Biotecnologie
Call: Biotech 1 Syntetic biology
Call: Biotech 2 e Health PHC32 Nuovi approcci bioinformatici a supporto di esigenze cliniche, mediche e biotecnologie
Call: Biotech 3,4 e LCE 15 Processi biotecnologici industriali
Call: Health PHC16 Tools e tecnologie per terapie avanzate
Call: ICT 26: Photonics KET Biofotonica
http://ec.europa.eu/research/horizon2020
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Silvia Scaglione
Synthetic biology
Design e costruzione di nuove parti biologiche e reti sintetiche
Contact point: Liliana Ironi IMATI
Hypothesis Construct Logic Build Math Model Numerical Simulation
Simulazione qualitativa •Full range della dinamica di una rete in una singola simulazione •Individuazione di reti che esibiscono il comportamento desiderato
Modulo Stocastico•Ottimizzazione della probabilità di ottenere il comportamento desiderato •Ranking delle strutture di rete plausibili
LEIT Biotech 1
IACICAR
ISSIA
IASI
IMATI
IIT
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Silvia Scaglione
Metodi per l’analisi e l’integrazione di dati omici
Metodi e strumenti computazionali per la System biology
Nuovi approcci bioinformatici a supporto di esigenze cliniche, mediche e biotecnologie
P. Bertolazzi IASI C. Angelini IAC
Applicazioni della bioinformatica a supporto della ricerca biomedica
Metodi e modelli matematici per l'analisi di dati biomedici
Sviluppo di tools open source per la bioinformatica
Biotech 2 - Health PHC32
ISTI
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Silvia Scaglione
Nuovi approcci bioinformatici a supporto di esigenze cliniche, mediche e biotecnologie
P. Bertolazzi IASI C. Angelini IAC
Biotech 2 - Health PHC32
Metodi per l’analisi e l’integrazione di dati omici
Metodi e strumenti computazionali per la System Biology(individuazione pathway biologici)
Esperimenti/raccolta dati
Conferenza del Dipartimento Roma, 26 e 27 maggio 2014
Silvia Scaglione
Nuovi approcci bioinformatici a supporto di esigenze cliniche, mediche e biotecnologie
P. Bertolazzi IASI C. Angelini IAC
Biotech 2 - Health PHC32
Applicazioni della bioinformatica a supporto della ricerca biomedica Identificazione marcatori, studio RNA regolatori, predizione di strutture proteiche e loro interazione
Metodi e modelli matematici per l'analisi di dati biomediciMetodi per il supporto della gestione di interventi e delle decisioni cliniche
Sviluppo di tools open source per la bioinformatica Database e piattaforme web per analisi dati. Algoritmi e HPC per big-data. Simulazione modelli biologici e patologie.
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Silvia Scaglione
Processi biotecnologici industriali
M. E. Russo IRC
Cattura biomimetica della CO2 da fumi di combustione
Sviluppo biocatalizzatori enzimatici per processi biomimetici CCS di post-combustione
Immobilizzazione di anidrasi carbonica ricombinante su solidi granulari
Progettazione e realizzazione di Unità di Assorbimento Biomimetico
Selezione di configurazioni reattoristiche per l’assorbimento promosso da biocatalizzatori enzimatici
LEIT Biotech 3,4
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Silvia Scaglione
Processi biotecnologici industriali
Silvia Scaglione IEIIT
LEIT Biotech 3,4
Prototipizzazione di sistemi hardware per l’ingegneria dei tessuti
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Silvia Scaglione
Tools e tecnologie per terapie avanzate
Silvia Scaglione IEIIT
bone
cartilage
Bioreattori per l’Ingegneria dei Tessuti
Health PHC16
Scaffolds biomimetici
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Silvia Scaglione
Tools e tecnologie per terapie avanzate
Giuseppe Pontrelli IAC
Tecniche innovative per la modellazione ed analisi di sistemi per il drug design & delivery
vessel
stent
Delivery of the therapeutic molecule to the vessel wall
vessel
stent
Delivery of the therapeutic molecule to the vessel wall
- Stent cardiovasculari a rilascio di farmaco (DES)
- Dinamica di rilascio/assorbimento di farmaci nella cornea
- Analisi e sviluppo di metodologie geometrico/topologiche per la modellizzazione di superfici molecolari
Health PHC16
- Drug delivery attraverso la pelle (cerotto medicato)
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Silvia Scaglione
Tools e tecnologie per terapie avanzate
Liliana Ironi IMATI
Fabbricazione di protesi personalizzateRichiesta del medico di
protesi personalizzate per l’analisi preopeatoria in vitro
Protesi personalizzate
Componenti patient-specific per l’analisi in vitro
Analisi di bioimmagini per la stima di informazioni patient-specific necessarie per costruire manufatti patient-specific
Metodologie per simulazioni
FEM e CFD stocastiche
Health PHC16
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Silvia Scaglione
Biofotonica: diagnostica
Francesco Baldini IFAC
• Progettazione, realizzazione e caratterizzazione di strutture ottiche risonanti (biosensori) per la rivelazione di biomarker di interesse clinico
• Tecniche di microscopia avanzata per diagnostica biomedicale (SHG)
ICT26: Photonics KET
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Silvia Scaglione
Biofotonica: terapia
Francesco Baldini IFAC
• Riparazione laser-indotta di tessuti biologici (oculistica, microvascolare, neuro);
• Emostasi indotta da blue-LED di alta potenza (dermatologia, vascolare)
• Dispositivi biopolimerici impiantabili per il rilascio di farmaci con attivazione laser
ICT26: Photonics KET
Conferenza del Dipartimento Roma, 26 e 27 maggio 2014
Silvia Scaglione Sinergie
Health care and Wellbeing
AP: Biotecnologie
Nanotecnologie e materiali avanzati
Matematica Applicata
DIITETDipartimento di Scienze Mediche
CNR
Università e Centri di ricerca
Industrie e PMI Grandi Infrastrutture ricerca
Dipartimento di Scienze Bio-agro alimentari
Low Carbon Technologies
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Silvia Scaglione
Acknowledgements and contacts
[email protected]@cnr.it
IMATI [email protected]
IEIIT [email protected]
IDASC [email protected]
IFAC [email protected]