cisplatin aml hücrelerinde urg4/urgcp dna tamir ... · cisplatin aml hücrelerinde urg4/urgcp...
TRANSCRIPT
Cisplatin AML Hücrelerinde URG4/URGCP Üzerinden DNA Tamir Mekanizmasını
Düzenler Mi?
Doç. Dr. Yavuz Dodurga
Yavuz Dodurga1, Mücahit Seçme1, Levent Elmas1, Nazlı Şirin1, Yasemin Işık Balcı2
1Pamukkale Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Tıbbi Biyoloji ve Genetik AD., Denizli, Türkiye2Pamukkale Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Pediatrik Hematoloji BD., Denizli, Türkiye
Lökomogenez; Tüm kanserlerde olduğu gibi lösemilerde tek bir
mutant hücreden köken alan kemik iliği öncül hücrelerinin klonal bir
bozukluğu olarak tanımlanır.Lösemiye Eğilim Yaratan Durumlar
Çevresel Faktörler Hastalıklar Genetik İyonize Radyasyon Kimyasal etmenler (pestisid, herbisid, petrol ürünleri, benzen, hidrokinon...) Hamilelikte alkol kullanımı Hamilelikte sigara, mariuana kullanımı Beslenme Enfeksiyonlar (Onkogenik retrovirüsler)
Primer Trombositopeni Klonal Sitopeniler Aplastik Anemi MDS/Refrakter sitopeni Akkiz AA
Bloom Sendromu Ataksi‐pansitopeni Down Sendromu Kostmann Sendromu Diskeratozis konjenita Fankomi anemisi Naksoz Sendromu Nörofibromatöz Noonan Sendromu Poland Sendromu Rothmund‐Thomson Sendromu Seckel Sendromu Shwachman Sendromu Werner Sendromu
Akut myeloblastik lösemi (AML), hematopoetik malignitelerin heterojen bir grubu olup anormal lösemikblastların ve normal kan hücrelerinin bozulmuş üretimi ile karakterizedir.
Cisplatin, kemoterapide kanseri tedavi etmek için kullanılan
bir ilaçtır (solid tümörlerde).
Cisplatin, genomik DNA'ya bağlanarak yapısını bozan böylece
DNA'da hasar oluşturarak DNA replikasyonunu veya transkripsiyonu
engelleyerek kanser hücresinin ölümüne neden olan, sitotoksik
süreçleri tetikleyen bir bileşiktir.
Up-regulated Gene 4 (URG4)/Upregulator of cell proliferation
(URGCP)• Şatıroğlu-Tufan ve arkadaşları tarafından,
– Hepatit B Virus aracılı Hepatosellüler kanser gelişiminde rol alan bir gen olarak tanımlanmış,
– “Up-Regulated-Gene-4 (URG4)” olarak isimlendirilmiş
– Amerika’daki National Center for Biotechnology Information-Gen Bankasına (NCBI-GenBank, Entrez GeneID: 55665 ve Entrez Nükleotid ID NM_017920) kayıt edilmiştir.
ATP / GTP bağlanma bölgesi(690 ‐ 697 aa)
~3600 bç8 ekzon922 aa104 kD
7. kromozomun kısa kolunda lokalizedir (7p13)ve daha önce tanımlanan genler ile herhangi bir homoloji Ø.
Özgün ‐ Yeni bir gen
URG4/URGCP
• Feitelson ve arkadaşları, URG4’ün hepatoselüler karsinoma olgularının ön taramasında kullanılabilecek güçlü bir preneoplastik marker olabileceğini göstermiştir.
• Ekibimiz ve diğer araştırmacılar tarafından,
– Lösemi,– Mide kanseri,– Osteosarkom,– Prostat kanseri,– Nöroblastom,– Akciğer kanseri, – Gliom,– Medullar tiroid kanseri…
• Bu yeni çalışmalar ışığında URG4’ün lökomogenezde rol alabileceğini ve aynı zamanda kanser tedavisinde de umut verici bir terapötik hedef olabileceğini düşündürmüştür.
Amaç• Bu çalışmamızda amaç, cisplatinin Kasumi‐1 (AML hücre
hattı) hücre hatlarında,– hücre proliferasyonuna etkisi,– DNA tamiri ve hücre döngüsü ile ilişki genlerin ve özgün bir
onkogen olan URG4/URGCP geninin ekspresyon değişimlerineetkisini
– DNA hasarı oluşumuna etkisini belirlemektir.
• Leukemogenesis as a new approach to investigate the correlation between up regulated gene4/upregulator of cell proliferation (URG4/URGCP) and signal transduction genes in leukemia. DodurgaY, Oymak Y, Gündüz C, Satıroglu‐Tufan NL, Vergin C, Cetingül N, Biray Avci C, Topçuoğlu N. Mol BiolRep. 2013 Apr;40(4):3043‐8. doi: 10.1007/s11033‐012‐2378‐1. Epub 2012 Dec 25.
• Higher expression of the novel gene upregulated gene 4 in two acute lymphoblastic leukemiapatients with poor prednisolone response. Oymak Y, Dodurga Y, Turedi A, Yaman Y, Ozek G,Carti O, Gunes BT, Erbudak E, Berber E, Avci CB, Vergin C. Acta Haematol. 2012;128(2):73‐6. doi:10.1159/000338220. Epub 2012 Jun 6.
Materyal-Metod• Kasumi‐1 hücre hattı çoğaltılması
• Sitotoksisite testleri
• Total RNA eldesi ve cDNA sentesi
• Real Time PCR ile analiz
• Komet assay yöntemi
• İstatistiksel analiz
Materyal-Metod• Kasumi‐1 hücre hattı RPMI1640 besi ortamında üretildi. (% 10 fötal sığır serumu
100IU/ml penisilin ve 100mg/ml streptomisin 25 mM L‐glutamin) (370C’de, %95nemli ortamda % 5 CO2 ‘li etüvde inkübasyon)
Cisplatinin 2,5 – 160 µM
aralığındaki dozları Kasumi‐1 lösemi
hücre hattına uygulanmış ve hücre
canlılığına olan etkisi, doz ve
zamana bağlı olarak, canlı
hücrelerden ATP ölçümüne dayalı
hassas bir lüminometrik bir yöntem
olan Celltiter‐ Glo yöntemi ile
belirlenmiş (24, 48, 72 saat).
Sitotoksisite Testleri
Total RNA İzolasyonu/cDNA Sentezi
Genlerin ekspresyon düzeylerinin
tespiti için kontrol ve doz olmak
üzere her bir hücre gurubu
süspansiyonundan total RNA
izolasyonu Trizol ile
gerçekleştirilmiştir.
cDNA sentezi için revers
transkripsiyon prosedürü,
Transcriptor First Strand cDNA
Synthesis Kit kullanılarak
gerçekleştirilmiştir.
p53, ATM, ATR, CHECK1, CHECK2, CDC25A, CDC25C, ERCC1,
GADD45A, GADD45G, CCND1, CDK6, BAX, BCL‐2 ve
URG4/URGCP genlerinin mRNA düzeyindeki ekspresyon
değişimleri RT‐PCR yöntemiyle belirlenmiştir.
Real‐Time PCR ile mRNA Ekspresyon Değişimlerinin Belirlenmesi
Komet Assay Analizi ile DNA Hasarının Belirlenmesi
Cisplatinin Kasumi‐1 hücrelerinde DNA hasarına olan etkisi
belirlenmiştir.
Verilerin analizi ∆∆CT metodu kullanılarak bilgisayar programı ile kantitasyonu
yapıldı. Web tabanlı “RT² Profiler™ PCR Array Data Analysis“ programında bulunan,
Volcano Plot analizleri kullanıldı.
Metodun amacı, iki ekspresyon sonucunun ±3SD karşılaştırılması esasına
dayanmaktadır. Böylelikle, gen ekspresyonunun karşılaştırılması yapılan durumlarda
kontrol ve doz grubu ilgili genlerin ekspresyon değerleri rölatif olarak belirlendi.
Grupların karşılaştırılması “RT² Profiler™ PCR Array Data Analysis” programında
bulunan “Student t‐testi” analizi ile istatistiksel olarak değerlendirildi.
İstatiksel Analiz
Bulgular/SonuçlarSitotoksisite Testleri
Cisplatinin IC50 dozu; Kasumi‐1 lösemi hücre hattı için 48. saatte 160 µM
olarak hesaplanmıştır.
Kontrol grubu ile karşılaştırıldığında,
cisplatin uygulanan Kasumi‐1 hücrelerinde
ATM, CHECK 1, CDC25C, GADD45A,
GADD45G, CCND1, CDK 6, BCL‐2 ve
URG4/URGCP genlerinin ekspresyonları
istatistiksel olarak anlamlı şekilde
azalmışken, p53 geninin ekspresyonunda
ise istatistiksel olarak anlamlı şekilde artış
gözlenmiştir (p<0,05).
Bulgular/SonuçlarRT‐PCR
Kontrol grubuna göre KASUMİ-1 hücrelerindeki ekspresyon değişimleri
Bulgular/SonuçlarKomet Assay
Kuyruk uzunluğu ve kuyruktaki DNA yüzdesi doz grubunda anlamlı olarak
arttığı analiz edildi (p<0,05)
Sonuç olarak; Yeni tanı AML hastaları (farklı kurumlarla işbirliği ile) ve farklı gen
profilleri değerlendirmek böylelikle ALL/AML olguların ayırıcı
tanısında ya da olguların tanı alabilmesinde kullanılabilecek aday
moleküler genetik belirteç olabileceğini düşünmekteyiz
Yeni onkogen olan URG4’ ün lökomogenez’deki olası etki
mekanizmasını aydınlatması ile yeni gen profil modelleri ile
tedavinin takibi ve yeni tedavi protokollerinin etkinliğinin erken
dönemlerde anlaşılabilmesine katkıda bulunulabilecektir ve
kesin tanı almamış olgularda da tanıya moleküler genetik bir
yaklaşım getirilebilecektir
Çocukluk çağı lösemilerde hücre sinyal ileti yolaklarında
görülen gen etkileşimlerindeki bozuklukların tanımlanması
için yapılan genetik çalışmalar;
Lökomogeneze ışık tutabilmesi ve prognoza yönelik yeni
hedef sağaltım modellerinin geliştirilmesi için
gerekmektedir.