効率的に構造検索!...
TRANSCRIPT
効率的に構造検索!作図ツールを使いこなそう
本⽇の内容
• SciFinder のポリマーの収録
• ポリマーの検索⽅法
• 検索例
• ⽂献中のポリマーの登録確認⽅法
1
1. 基本の作図ツール
2. 検索条件を広げるためのツール
3. 検索条件を限定するためのツール
4. 他の情報を使った作図
本⽇の内容
• SciFinder のポリマーの収録
• ポリマーの検索⽅法
• 検索例
• ⽂献中のポリマーの登録確認⽅法
2
1. 基本の作図ツール
2. 検索条件を広げるためのツール
3. 検索条件を限定するためのツール
4. 他の情報を使った作図
Non-Java を選択3
Java プラグインを利⽤しない構造作図ツール
1. 基本の作図ツール4
・ペンシルツール・消しゴムツール・原⼦メニューツール・ショートカット
メニューツール
・キーボードショートカットの表⽰
アイコン 内容ペンシルツール
・ ノードや結合を描く
消しゴムツール・ ノードや結合を削除する (⼀操作やり直す時 )
原⼦メニューツール・ 周期表から原⼦を選択して作図する
ショートカットメニューツール・ ショートカットを作図する
キーボードのショートカットの表⽰・ キーボードのキーを使って作図する
まずはこれらのツールから5
リセットボタン
本⽇の内容
• SciFinder のポリマーの収録
• ポリマーの検索⽅法
• 検索例
• ⽂献中のポリマーの登録確認⽅法
8
1. 基本の作図ツール
2. 検索条件を広げるためのツール
3. 検索条件を限定するためのツール
4. 他の情報を使った作図
2. 検索条件を広げるためのツール9
・X メニューツール・R グループツール・繰り返しグループツール・可変置換位置ツール
・結合パレットの不定結合
アイコン 内容X メニューツール
・ 可変原⼦を作図する
R グループツール・ 原⼦,ショートカット,可変原⼦から 2-20 種類を組み
合わせて定義した R グループを作図する時に使⽤する
便利な作図ツール10
X : ハロゲンM : ⾦属A: H 以外の元素Q : C,H 以外の元素Ak : 炭素鎖Cy : 環系Cb : 炭素環系Hy : ヘテロ環系
アイコン 内容繰り返しグループツール
・ 繰り返し単位を含む構造を作図する
可変置換位置ツール・ 環または環系における置換基の可変な位置を指定する
不定結合・ 不定結合を指定する
便利な作図ツール11
• スライド 10-11 のツールのうち 「不定結合」 以外の作図ツールは,完全⼀致検索で利⽤できない.
デモンストレーション
• 下記構造の検索条件を広げて作図する
12
注⽬ポイント13
ハロゲンを含む(X メニューツール)
ハロゲン
この部分が繰り返す(繰り返しグループツール)
どこかに OH 基が置換(可変置換位置ツール)
本⽇の内容
• SciFinder のポリマーの収録
• ポリマーの検索⽅法
• 検索例
• ⽂献中のポリマーの登録確認⽅法
14
1. 基本の作図ツール
2. 検索条件を広げるためのツール
3. 検索条件を限定するためのツール
4. 他の情報を使った作図
15
3. 検索条件を限定するためのツール
・Lock Rings ツール・Lock Atom ツール
アイコン 内容Lock Rings ツール
・ 環の縮合を禁⽌し,孤⽴させる
・ 鎖が環の⼀部となることを禁⽌する
Lock Atom ツール・ 特定のノードに対する置換基の追加を禁⽌する
便利な作図ツール16
○ ×
○ ×
デモンストレーション
• 下記の構造を検索し,検索条件をRefine で限定する
17
注⽬ポイント18
環の縮環を禁⽌(Lock Ring ツール)
鎖が環の⼀部になることを禁⽌(Lock Ring ツール)
特定ノードへの置換基の追加を禁⽌(Lock Atom ツール)
本⽇の内容
• SciFinder のポリマーの収録
• ポリマーの検索⽅法
• 検索例
• ⽂献中のポリマーの登録確認⽅法
19
1. 基本の作図ツール
2. 検索条件を広げるためのツール
3. 検索条件を限定するためのツール
4. 他の情報を使った作図
4. 他の情報を使った作図20
・CAS 登録番号,SMILES,InChI から構造を呼び出すツール
他のツールで作図した構造を利⽤
• ChemDraw や Accelrys Draw で作図した構造を SciFinder で利⽤する
21
SMILES あるいは InChI を利⽤する
ChemDraw SciFinder
• ChemDraw の場合22
1. 構造全体を選択
4. コピー
2. Edit
3. Copy As
• Accelrys Draw の場合23
1. 構造全体を選択
2. Chemistry
4. コピー
3. GenerateText from Structure