Kayu. Pemanenan kayu dilakukan setelah pada kayu terbentuk senyawa metabolit sekunder secara maksimal.  Umur panen tanaman berbeda-beda tergantung jenis tanaman dan ke-cepatan pembentukan metabolit sekundernya. Caranya kayu diambil dari batang atau cabang, kelupas kuliltnya dan potong-potong kecil. Pencucian dan sortasi basah dimaksudkan untuk membersihkan simplisia dari benda-benda asing dari luar (tanah, batu dan sebagainya), dan memisahkan bagian tanaman yang tidak dikehendaki. Pencucian dilakukan bagi simplisia utamanya bagian tanaman yang berada di bawah tanah (akar, rimpang) untuk membersihkan simplisia dari sisa-sisa tanah yang melekat. Sortasi kering. Proses pemilahan dan pemotongan hingga menjadi bagian yang lebih kecil untuk mempermudah proses penghancuran.