biokimia 11 (siklus asam sitrat).ppt
DESCRIPTION
fkubTRANSCRIPT
1
Kuliah ke Sebelas
Fakutras Kesehatan Masyarakat
Universitas Sumatera Utara
MEDAN
2
Pirurat Laktat atau etanol dan CO2
Respirasi
CO2 dan H2O
3
Fisiologis Biokimia
Pemasukkan O2 danPengeluaran CO2 dari paru
Konsumsi O2 danPembentukan CO2 dalam sel
4
Piruvat
Asamamino
Asamlemak
Asetil-KoACO2
NH3
CO2
2H
Oksalo asetat Sitrat
Malat
Fumarat
Suksinat Suksinil-KoA
Ketoglutarat
Isositrat
Cis-akonitat
CO2
CO2
GTP
2H
2H
2H
2HNADH
NADHdehidrogenase
Ubikuinon
Sitokrom b
Sitokrom c1
Sitokrom c
Sitokrom aa3
2H+ + 1/2 O2 H2O
ADP + Pi
ADP + Pi
ADP + Pi
ATP
ATP
ATP
Tahap 1
Tahap 2
Tahap 3
Gambar 26. Tahap Respirasi Sel
5
Siklus Asam Sitrat = Siklus Asam Trikarboksilat= Siklus Krebs
Lintas umum terakhir oksidasi gugusasetil, dari karbohidrat, asam lemak, dan asam amino selama katabolisme
Oksidari glukosa menjadi CO2 dan H2O membebaskanEnergi >>> Glikolisis
6
Mekanismenya adalah :
Piruvat Asetil – KoA dan CO2
Karbohidrat Asam lemak Asam amino
Reakai Piruvat Asetil – KoA
Piruvat + NAD+ + KoA – SH Asetil – KoA + NADH + CO2
7
dehi
drog
enas
i dekarboksilasi
Melibatkna 3 enzim yang berbeda, seperti• piruvat dehidrogenase ( E1 )• dihidrolipoil transasetilase ( E2 )• dihidrolipoil dehidrogenae ( E3 )Melibatkan 5 ko enzim,• TPP ( tiamin pirofosfat )• FAD ( flavin adenin dinukleotida )• KoA ( Ko enzim A ) • NAD+ ( nikotin adenin dinukleotida )• Asam lipoat
8
Empat Vitamin yang menyusun enzim (Ko enzim)• Tiamin ( pada TPP )• Riboflavin ( pada FAD )• Asam pantotenat ( pada KoA )• Nikotinamid ( NAD+ )
Selain itu diperlukan juga Asam lipoat (vitamin esensial)
9
Tahap
1. CH3 C COO -
O
+ H+ + TPPE1 E1 TPP CHOH CH3 + CO2
2. E1 TPP CHOH CH3 + E2
S S
E1 E1 TPP +
S HS
CH3 C
O
E2
3. S HS
O
E2
CH3 C
+ KoA-SH E2
HS SH
+ KoA S C CH3
O
4. E2
HS SH
+ E3 FAD E2
S S
+ FADH2
FADH2
E3
E35. + NAD+ E3 FAD + NADH + H+
Jumlah :
CH3 C COO -
O
+ KoA-SH + NAD+ CH3 C
O
S KoA + CO2
+ NADH
Gambar 27. Tahap-tahap dekarboksilasi piruvat Kunci : E1 = piruvat dehidrogenase TPP = tiamin pirofosfat TPP-CHOH - CH3 = -hidroksietiltiamin pirofosfat E2 = dihidrolipoil transasetilase E3 = dihidrolipoil dehidrogenase
10
Siklus Asam Sitrat merupakan bentuk lingkaran
Sis-Akonitat
Isositrat
Fumarat
Ketoglutarat
Suksinat
Penghambatan MalonatMalat
Oksalo asetat
Asam Sitrat
Piruvat
CO2
Gambar 28. Menutupnya lingkaran pada pencetusan teori awal siklus
11
Bagaimana munculnya pemikiran siklus asam sitrat ?
Sejarah Siklus Asam Sitrat.
1937 Hans Krebs
Lintas Oksidasi Piruvat dalam jaringan hewan
dikemukakan
12
Caranya adalah sebagai berikut: Jaringan hewan yang dipakai adalah cacahan otot dada burung merpati, yang diperlukan pada oksidasi piruvat sebagai asam organik.
Penelitian sebelumnya : Szent – Györgyi (Hongaria)
Menemukan asam organik dalam jaringan hewan
Suksinat Fumarat Malat Oksaloasetat
Merangsang konsumsi oksigen oleh otot
13
Krebs melengkapi hasil penemuan Szent-Györgyidengan oksidasi piruvat oleh otot dengan hasil asam trikarboksilat (C=6) seperti asam sitrat, sis akonitat, asam isositrat, dan asam α-ketoglutarat (C=5).
Adanya Malonat kompetitif inhibitor yang spesifik terhadap dehidrogenase suksinat, sehingga malonat dapat dinyatakan sebagai penghambat terhadap penggunaan piruvat secara aerobik dalam otot.
Jadi suksinat dan suksinat dehidrogenase merupakankomponen yang esensial dalam oksidasi piruvat.
Kesimpulan Krebs bahwa siklus asam sitrat ini sebagai lintas utama bagi oksidasi karbohidrat dalam otot, penemuan selanjutnya menyatakan bahwa fungsi siklus asam sitrat tidak hanya di otot, ttp dalam semua jarigan hewan dan tumbuhan tingkat tinggi.
14
COO -
CH2
HO C COO -
CH2
COO -
Sitrat
COO -
CH2
C COO -
CH
COO -
COO -
CH2
H C COO -
HO C H
COO -
COO -
CH2
CH2
C
COO -
sis-akonitat
O
Isositrat
Ketoglutarat
COO -
CH2
CH2
COO -
Ketoglutarat
Suksinat
Penghambatan Malonat
COO -
CH
HC
COO -
Fumarat
COO -
CH2
COO -
COO -
C O
CH2
COO -
HO C H L-Malat
Oksaloasetat
Gambar 29. Asam dikarboksialt dan tri karboksilat yang berperan pada oksidari piruvat .
15
Diawali dari Asetil-KoA
CO2 Atom H (diikat dalam bentuk ko enzim tereduksi NADH dan FADH2)
.
16
O
C S KoA
CH3
Asetil-KoA
+
O
C COO -
CH2
COO -
Oksaloasetat
C COO -
CH2
COO -
HO
COO -
CH2
Sitrat
+ H2O - H2O
C COO -
CH
COO -
COO -
CH2sis-Akonitatterikat oleh enzim
C COO -
COO -
COO -
CH2
- H2O + H2O
H
C HHO
IsositratIsositrat dehidrogenase Mg2+
CO2NAD+
NADP+NADHNADPH
CH2
COO -
COO -
CH2
C O
Ketoglutarat
Gambar 30. Keempat reaksi pertama pada siklus asam sitrat
17
COO -
CH2
CH2
CH2
CH2
CH2
CH2
CH2
CH2
C O
COO -
Ketoglutarat
KoA-SH
NAD+
NADH
CO2
Kompleks Ketoglu-tarat dehidrogenase Mg2+
COO -
COO -
COO - COO -
COO -
COO -
COO -
C
O
S KoA
Suksinil-KoA
GDP + Pi
GTP
KoA-SH
Suksinil-KoAsintetase Mg2+
Suksinat
E FAD
E FADH2
Suksinatdehidrogenase
CH
HC
Fumarat
+ H2O
- H2OFumarase
- OOC- OOC C
OH
H NAD+ NADH + H+
L-Malatdehidrogenase
C
O
L-Malat Oksaloasetat
Gambar 31. Reaksi selanjutnya dari siklus asam sitrat
18
Sitrat dibentuk oleh kondensasi Asetil-KoA dengan Oksaloasetat, dikatalisis oleh Sitrat sintase
Asetil-S-KoA + Oksaloasetat + H2O
Sitrat + KoA – SH + H+
Sitrat sintase
Sitrat diubat menjadi isositrat melalui sis-akonitat,Yang berperan adalah enzim akonitase
Sitrat– H2O
+ H2O [ Sis – Akonitat ]
+ H2O
– H2O Isositrat
Akonitase(mengandung Fe2+, S)
Pusat besi bersulfur
19
Isositrat mengalami dehidrogenase menghasilkan α-ketoglutarat dan CO2 oleh isositrat dehidrogenase
Isositrat + NAD+ (NADP+) α-ketoglutarat + CO2 + NADH (NADPH) + H+
Isositrat dehidrogenase enzim penerima elektron
NAD+ NADP+ (dalam mitokondria) (dalam mitokondria dan sitosol)
Memerlukan Mg2+ dan Mn2+ tidak aktif tanpa ADP sebagai modulator positifnya
20
α-ketoglutarat dioksidasi menjadi suksinat dan CO2 oleh kerja kompleks α-ketoglutarat dehidrogenase.
α-ketoglutarat +NAD+ + KoA suksinil–KoA + CO2 + NADH
Reaksi ini sama dengan piruvat dehidrogenase,mengandung 3 enzim, salah satunya adalah timin pirofosfat yang terikat dengan enzim, Mg2+, Koenzim A, FAD, dan Asam lipoat.
21
Pengubahan suksinil – KoA menjadi suksinat suksinil – KoA senyawa berenergi tinggi
Suksinil–S–KoA + H2O Suksinat + KoA–SH + H+ Suksinil–KoA
sintetase
Reaksi ini menghasilkan suksinil bebas dan menyebabkan pembentukan gugus fosfat terminal Berenergi tinggi (GTP GDP + Pi)
Reaksi ini disebut Fosforilasi tingkat substrat (karenareaksi dihasilkan dari dehidrogenasi molekul substrat)fosfat berenergi tinggi dari GTP diberikan pada ADP membentuk ATP melalui nukleosida difosfokinase
22
Dehidrogenasi suksinat menjadi fumarat oleh flavo–protein suksinat dehidrogenase yang mengandung FAD
Suksinat + E–FAD fumarat + E–FADH2
Reaksi di atas dihambat oleh Malonat,penghambatan ini pegang peranan dalam penentuan jalur siklus asam sitrat.
23
Fumarat terhidrasi membentuk Malat
Fumarat + H2O L –Malat fumarat hidratase
fumarat hidratase = fumarase
Malat mengalami dehidrogenasi membentukoksaloasetat
L-malat + NAD+ Oksaloasetat + NADH + H+
oksaloasetat dehidrogenase
Sebenarnya reaksi berjalan ke kiri, tetapi oksaloasetatyang terbentuk dengan cepat ditarik oleh sitrat sintase sehingga reaksi berjalan ke kanan
24
Piruvat menjadi asetatil–KoA merupakan prosesyang diatur.
GLIKOLISIS
Dikontrol pada 2 tingkatan
enzim heksokinase enzim fosforilase glikogen
(fosforilasi glukosa gukosa-6-fosfat) (pembentukan glukosa-6-fosfat dari glikogen)
Laju siklus asam sitrat tergantung pada asetil-KoAYang dihasilkan dari oksidasi piruvat dan asam lemak
25
Ganbar 32. menunjukan bagaimana pembentukan asetil-KoA oleh kompleks dehidrogenase piruvat.
Piruvatdehidrogenase
berfosfat(tidak aktif)
Piruvat dehidrogenase
tanpa fosfat(aktif)
ATP
ADP
piruvatdehidrogenase
kinaseNADH
H2O
Pi
Ca2+
Mg2+piruvat dehidrogenase
fosfat fosfatase
Gambar 32. Pengaturan piruvat dehidrogenase
26
Siklus asam sitrat juga diaturPiruvat
Ca2+
CO2
Asetil-KoA
ATPNADHAsetil-KoA
Sitrat
Suksinil-KoANADHAsil lemak-KoA
KoA
Oksaloasetat
Konsentrasi oksaloasetatmerupakan faktor yang paling kritis di dalam kecepatan pembentukan sitrat
Malat
Fumarat
Suksinat Suksinil-KoA
Ketoglutarat
CO2
Isositrat
CO2ADP
Gambar 33. Pengaturan siklus asam sitrat
27
Senyawa antara siklus asam sitrat sering digunakanpada tujuan metabolik lain dan ini dapat digantikan kembali
Siklus asam sitrat adalah lintas amfibolik (bukankatabolisme oksidatif karbohidrat, asam lemak,dan asam amino, tetapi juga sebagai reaksi tahappertama dalam lintas biosintetik)
Senyawa antara : - α-ketoglutarat - suksinat - oksaloasetat
Sebagai pemula Asam amino
Akibat penarikan senyawa antara , maka laju siklusAsam sitrat menurun.
28
Senyawa antara tersebut dapat dikembalikan Lagi dengan reaksi ANAPLEROTIK, yaitu reaksi enzimatik piruvat oleh CO2 membentuk oksaloasetat melalui kerja piruvat karboksilase
Piruvat + CO2 + ATP + H2O oksaloasetat + ADP + Pi + H+
29
Siklus GlioksilatReaksi total siklus glioksilat :
2 asetil-S-KoA + NAD+ + H2O suksinat + 2 KoA-SH + NADH + H+
Asetil-KoAKoA-SH
Oksaloasetat
MalatNAD+
H+ + NADH
malat dehidrogenase
Glioksilat
Sitrat
Isositrat
akonitase
Suksinat
isositratliase
Asetil-KoA + H2O
H+ + KoA-SH
Gambar 34. Siklus Glioksilat
30
LINTAS SEKUNDER GLUKOSAD-Glukosa 1-fosfat
UTP
PPi
Mg2+
OCH2OH
HH
H
OHOH
H
H
OH
O P O P
O-O-
OO
Uridin
OCOO -
HH
H
OHOH
H
H
OH
O P O P
O-O-
OO
Uridin
H2O + 2NAD+
3H+ + 2NADH
UDP-glukosa dehidrogenase
OCOO -
HH
H
OHOH
H
O
OH
H
Fenol
UDP lintas detoksifikasi
UDP-glukosa
UDP-D-glukuronat
H2O
UDP
lintas menuju L-askorbat
HC O
HCOH
HCOH
HCOH
HOCH
COO -
NADPH
NADP+
glukoronat reduktase
D-Glukoronat
COO-
HOCH
HCOH
HOCH
HOCH
CH2OH
L-Gulonat
C
HOCH
HC
HOCH
HOCH
CH2OH
L-Gulonat
H2OAldonolaktonase
O
O L-Gulonolakton
C
HOC
HC
HOC
HOCH
CH2OH
O
O
2Hgulonolakton oksidase
L-Asam askorbat
Fenol glukosiduronida(bentuk ekskresi genol)
Gambar 35. Lintas sekunder glukosa
31
Lintas sekunder glukosa(pada hewan)
D–Glukuronat L–asam askorbat
Catatan : manusia, marmot, monyet, beberapa jenis burung, kelelawar buah, dan beberapa jenis ikan tidak dapat mensintesis L-askorbat, karena secara genetik tidak terdapat enzim gulonolakton oksidase.