BEAUCOUP de gènes et PEU d’épistasie

Modèle additif multi-locus

Les expériences de réponse à long terme à la sélection

« Illinois Long Term Selection Corn Experiment »Dudley & lambert, 1992.

Le polymorphisme permettant une réponse soutenue à la sélection est:

• Infini (modèle infinitésimal)

• Caché (linkage)

• Régénéré régulièrement (mutations)

+ dérive génétique

+ mutations

+ linkage

Yoo, 1980

(D’après les données de Yoo, 1980)

Générations

Rép

onse

à la

sél

ecti

onLes modèles de réponse à long terme à la sélection

Mod

èle in

finité

simal

popu

latio

ns in

finies

Fisher, 1930

Robertson, 1960

Hill, 1982Weber and Diggins, 1990

Lynch and Walsh, 200x

Bulmer, 1971Chevalet, 1988

Comment est structuré le polymorphisme sélectionné le long du génome ?

Réserve de polymorphisme dans des segments à forte densité de gènes ?• à court terme / dans une population ?• à long terme ?

Thèse Emmanuelle Della-Chiesa

Le polymorphisme est caché (linkage)

Effet Bulmer (1971)

P=X1+X2sélection

X2

X1

P=seuilX2

X1

Cov(X1,X2)<0

P= G + E = iXi + E

Var(G) = i Var(Xi) + ij Cov(Xi , Xj)

Var(G) = Vg + C (C<0)

La variance disponible pour la sélection est réduite

Déséquilibre de liaison entre paires de locus

« fortement »négatif entre locus proches

« moinsfortement »négatif entre locus éloignés

Effet Hill-Robertson (1966)

Dérive génétique+

Liaison+

Sélection des allèles favorables

Augmentation de la probabilité de fixation des allèles défavorables

La recombinaison restaure la variance « cachée »

recombinaison

mutation?

Hospital & Chevalet, Genetical Research, 1996.

SA

NS

M

UT

AT

ION

AV

EC

MU

TA

TIO

NDistances entre locus

• Répartition aléatoire du polymorphisme

• Répartition observée sous sélection

Indice d’agrégation au cours du temps

t=50

t=0

t=200

t=50

t=0

t=200

Structuration du polymorphisme sélectionné

• A court terme, agrégation transitoire du polymorphisme dans une population– Importance en sélection artificielle (SAM)

• Faible impact sur le maintien du polymorphisme avec mutation-sélection– Fixations successives de mutations +/- indépendantes

• Effets sur la divergence entre populations ?

Impact de l’histoire sélective des populations sur l’architecture apparente des caractères quantitatifs

population

Lignée H’

Lignée H

Lignée L

sélection

CroisementDétection QTL

CroisementDétection QTL

Divergence entre lignées HH’: