användning av terminologi i patientjournaler¤ndning av terminologi i patientjournaler mia kvist...
TRANSCRIPT
![Page 1: Användning av terminologi i patientjournaler¤ndning av terminologi i patientjournaler Mia Kvist Inst. för data- och systemvetenskap (DSV), Stockholms universitet, och Centrum för](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022051206/5b3eef977f8b9a5e528b7f7a/html5/thumbnails/1.jpg)
Användning av terminologi i patientjournaler Mia Kvist Inst. för data- och systemvetenskap (DSV), Stockholms universitet,
och
Centrum för Hälsoinformatik,
Karolinska Institutet
![Page 2: Användning av terminologi i patientjournaler¤ndning av terminologi i patientjournaler Mia Kvist Inst. för data- och systemvetenskap (DSV), Stockholms universitet, och Centrum för](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022051206/5b3eef977f8b9a5e528b7f7a/html5/thumbnails/2.jpg)
Användning av termer i patientjournaler Mia Kvist Inst. för data- och systemvetenskap (DSV), Stockholms universitet,
och
Centrum för Hälsoinformatik,
Karolinska Institutet
![Page 3: Användning av terminologi i patientjournaler¤ndning av terminologi i patientjournaler Mia Kvist Inst. för data- och systemvetenskap (DSV), Stockholms universitet, och Centrum för](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022051206/5b3eef977f8b9a5e528b7f7a/html5/thumbnails/3.jpg)
Journalspråk
Terminologi - Termer
Jargong
Terminologireformen till svenska
![Page 4: Användning av terminologi i patientjournaler¤ndning av terminologi i patientjournaler Mia Kvist Inst. för data- och systemvetenskap (DSV), Stockholms universitet, och Centrum för](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022051206/5b3eef977f8b9a5e528b7f7a/html5/thumbnails/4.jpg)
Terminologi i patientjournaler
Fasta fält
• Strukturerat
• Färdiga formuleringar
• Är kopplat till koder.
• Kan användas för att skapa statistik.
Fri text
• Ostrukturerat
• Helt vilt språk
• Borde kopplas till koder?
4
![Page 5: Användning av terminologi i patientjournaler¤ndning av terminologi i patientjournaler Mia Kvist Inst. för data- och systemvetenskap (DSV), Stockholms universitet, och Centrum för](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022051206/5b3eef977f8b9a5e528b7f7a/html5/thumbnails/5.jpg)
Hypertoni o DM, brtsm och ST lyft anteriort, PCI mot ockluderad proximal LAD med 2 stent. Cirk stabil.
![Page 6: Användning av terminologi i patientjournaler¤ndning av terminologi i patientjournaler Mia Kvist Inst. för data- och systemvetenskap (DSV), Stockholms universitet, och Centrum för](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022051206/5b3eef977f8b9a5e528b7f7a/html5/thumbnails/6.jpg)
Hypertoni o DM, brtsm och ST lyft anteriort, PCI mot ockluderad proximal LAD med 2 stent. Cirk stabil.
![Page 7: Användning av terminologi i patientjournaler¤ndning av terminologi i patientjournaler Mia Kvist Inst. för data- och systemvetenskap (DSV), Stockholms universitet, och Centrum för](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022051206/5b3eef977f8b9a5e528b7f7a/html5/thumbnails/7.jpg)
Hypertoni o DM, brtsm och ST lyft anteriort, PCI mot ockluderad proximal LAD med 2 stent. Cirk stabil.
![Page 8: Användning av terminologi i patientjournaler¤ndning av terminologi i patientjournaler Mia Kvist Inst. för data- och systemvetenskap (DSV), Stockholms universitet, och Centrum för](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022051206/5b3eef977f8b9a5e528b7f7a/html5/thumbnails/8.jpg)
Hypertoni o DM, brtsm och ST lyft anteriort, PCI mot ockluderad proximal LAD med 2 stent. Cirk stabil.
![Page 9: Användning av terminologi i patientjournaler¤ndning av terminologi i patientjournaler Mia Kvist Inst. för data- och systemvetenskap (DSV), Stockholms universitet, och Centrum för](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022051206/5b3eef977f8b9a5e528b7f7a/html5/thumbnails/9.jpg)
Hypertoni o DM, brtsm och ST lyft anteriort, PCI mot ockluderad proximal LAD med 2 stent. Cirk stabil.
![Page 10: Användning av terminologi i patientjournaler¤ndning av terminologi i patientjournaler Mia Kvist Inst. för data- och systemvetenskap (DSV), Stockholms universitet, och Centrum för](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022051206/5b3eef977f8b9a5e528b7f7a/html5/thumbnails/10.jpg)
Terminologi i patientjournaler
Fasta fält
• Strukturerat
• Färdiga formuleringar
• Är/Kan kopplas till koder.
• Kan användas för att skapa statistik.
• Kan användas för att skapa ny text.
Fri text
• Ostrukturerat
• Helt vilt språk
• Borde kopplas till koder?
• Borde användas för att skapa strukturerad information och statistik?
10
![Page 11: Användning av terminologi i patientjournaler¤ndning av terminologi i patientjournaler Mia Kvist Inst. för data- och systemvetenskap (DSV), Stockholms universitet, och Centrum för](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022051206/5b3eef977f8b9a5e528b7f7a/html5/thumbnails/11.jpg)
11 Proc. 13th Conf. on Artificial Intelligence in Medicine, pp. 348–352.
![Page 12: Användning av terminologi i patientjournaler¤ndning av terminologi i patientjournaler Mia Kvist Inst. för data- och systemvetenskap (DSV), Stockholms universitet, och Centrum för](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022051206/5b3eef977f8b9a5e528b7f7a/html5/thumbnails/12.jpg)
Hypertoni o DM, brtsm och ST lyft anteriort, PCI mot ockluderad proximal LAD med 2 stent. Cirk stabil.
![Page 13: Användning av terminologi i patientjournaler¤ndning av terminologi i patientjournaler Mia Kvist Inst. för data- och systemvetenskap (DSV), Stockholms universitet, och Centrum för](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022051206/5b3eef977f8b9a5e528b7f7a/html5/thumbnails/13.jpg)
Rule-based Entity Recognition and Coverage
of SNOMED CT in Swedish Clinical Text
Maria Skeppstedt, Maria Kvist and Hercules Dalianis LREC2012
Visar hur bra terminologin avspeglar det naturliga språket i journaler.
• Förkortningar hittades inte med matchning mot terminologier
( 14% av diagnoserna stod i förkortad form)
• Uttryck längre än 2 ord kändes inte igen
Precision Recall
Kroppsdelar 0.74 0.80
Diagnoser 0.75 0.55
Symtom+fynd 0.57 0.30
13
![Page 14: Användning av terminologi i patientjournaler¤ndning av terminologi i patientjournaler Mia Kvist Inst. för data- och systemvetenskap (DSV), Stockholms universitet, och Centrum för](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022051206/5b3eef977f8b9a5e528b7f7a/html5/thumbnails/14.jpg)
Machine learning with CRF++
Precision Recall Disorder 0.84 0.72 Finding 0.70 0.59 Disorder/Finding as one group 0.78 0.68
![Page 15: Användning av terminologi i patientjournaler¤ndning av terminologi i patientjournaler Mia Kvist Inst. för data- och systemvetenskap (DSV), Stockholms universitet, och Centrum för](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022051206/5b3eef977f8b9a5e528b7f7a/html5/thumbnails/15.jpg)
Stockholm EPR Corpus
• Karolinska Universitetssjukhuset
• 600 000 patienter
• 2006-2010
• 900 vårdenheter
• 23 000 författare
![Page 16: Användning av terminologi i patientjournaler¤ndning av terminologi i patientjournaler Mia Kvist Inst. för data- och systemvetenskap (DSV), Stockholms universitet, och Centrum för](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022051206/5b3eef977f8b9a5e528b7f7a/html5/thumbnails/16.jpg)
Journalstruktur
• Semi-strukturerad text
Grammatik
• Ofullständiga meningar
• Saknar subjekt
• Verbformer
Medicinskt journalspråk
16
![Page 17: Användning av terminologi i patientjournaler¤ndning av terminologi i patientjournaler Mia Kvist Inst. för data- och systemvetenskap (DSV), Stockholms universitet, och Centrum för](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022051206/5b3eef977f8b9a5e528b7f7a/html5/thumbnails/17.jpg)
Journalstruktur
• Semi-strukturerad text
Grammatik
• Ofullständiga meningar
• Saknar subjekt
• Verbformer Passiva verb dubbelt så vanligt i röntgensvar som i vanlig svenska.
Medicinskt journalspråk
17
![Page 18: Användning av terminologi i patientjournaler¤ndning av terminologi i patientjournaler Mia Kvist Inst. för data- och systemvetenskap (DSV), Stockholms universitet, och Centrum för](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022051206/5b3eef977f8b9a5e528b7f7a/html5/thumbnails/18.jpg)
Vanlig svenska
Medicinsk terminologi
Medicinsk jargong
Medicinskt journalspråk
18
![Page 19: Användning av terminologi i patientjournaler¤ndning av terminologi i patientjournaler Mia Kvist Inst. för data- och systemvetenskap (DSV), Stockholms universitet, och Centrum för](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022051206/5b3eef977f8b9a5e528b7f7a/html5/thumbnails/19.jpg)
Vanlig svenska
• Sammansatta ord
Medicinskt journalspråk
strålbehandlingsplaneringsdatortomografi
19
![Page 20: Användning av terminologi i patientjournaler¤ndning av terminologi i patientjournaler Mia Kvist Inst. för data- och systemvetenskap (DSV), Stockholms universitet, och Centrum för](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022051206/5b3eef977f8b9a5e528b7f7a/html5/thumbnails/20.jpg)
Vanlig svenska
• Sammansatta ord
• Negationer
Medicinskt journalspråk
Inga säkra kliniska hållpunkter för…
Lungemboli kan inte uteslutas.
20
![Page 21: Användning av terminologi i patientjournaler¤ndning av terminologi i patientjournaler Mia Kvist Inst. för data- och systemvetenskap (DSV), Stockholms universitet, och Centrum för](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022051206/5b3eef977f8b9a5e528b7f7a/html5/thumbnails/21.jpg)
Vanlig svenska
• Sammansatta ord
• Negationer
Medicinskt journalspråk
Pat har en fraktur i proximala humerus. Ingen skelettskada påvisas.
Använder olika termer vid
affirmerad eller negerad diagnos.
![Page 22: Användning av terminologi i patientjournaler¤ndning av terminologi i patientjournaler Mia Kvist Inst. för data- och systemvetenskap (DSV), Stockholms universitet, och Centrum för](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022051206/5b3eef977f8b9a5e528b7f7a/html5/thumbnails/22.jpg)
0
10
20
30
40
50 ischemia
heart attack
angina pectoris
An
no
tati
on
s
Certainly
Pos
Probably
Pos
Possibly
Pos
Certainly
Neg
Probably
Neg
Possibly
Neg
![Page 23: Användning av terminologi i patientjournaler¤ndning av terminologi i patientjournaler Mia Kvist Inst. för data- och systemvetenskap (DSV), Stockholms universitet, och Centrum för](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022051206/5b3eef977f8b9a5e528b7f7a/html5/thumbnails/23.jpg)
Vanlig svenska
• Sammansatta ord
• Negationer
• Läsa mellan raderna
Medicinskt journalspråk
Står på insulin sedan 5 år. =
Patienten har diabetes mellitus.
![Page 24: Användning av terminologi i patientjournaler¤ndning av terminologi i patientjournaler Mia Kvist Inst. för data- och systemvetenskap (DSV), Stockholms universitet, och Centrum för](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022051206/5b3eef977f8b9a5e528b7f7a/html5/thumbnails/24.jpg)
Vanlig svenska
Medicinsk terminologi
• latin, grekiska, engelska
• förkortningar
Medicinsk jargong
Medicinskt journalspråk
24
![Page 25: Användning av terminologi i patientjournaler¤ndning av terminologi i patientjournaler Mia Kvist Inst. för data- och systemvetenskap (DSV), Stockholms universitet, och Centrum för](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022051206/5b3eef977f8b9a5e528b7f7a/html5/thumbnails/25.jpg)
Autentisk journal: Pat med bruten hö arm. Rtgjour tar över. EKG för säkerhets skull. I övrigt u a.
Förkortningar akutjournal
25
![Page 26: Användning av terminologi i patientjournaler¤ndning av terminologi i patientjournaler Mia Kvist Inst. för data- och systemvetenskap (DSV), Stockholms universitet, och Centrum för](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022051206/5b3eef977f8b9a5e528b7f7a/html5/thumbnails/26.jpg)
Abbreviations X-ray
18 of the top 100 words were abbreviated • 7 common abbreviations (tel = telephone, cm =centimeter), • 10 domain specific (iv = intravenous) • 1 ambiguous (ca = cancer or circa).
All words sentences bigram trigram
18 12 38 29
26
![Page 27: Användning av terminologi i patientjournaler¤ndning av terminologi i patientjournaler Mia Kvist Inst. för data- och systemvetenskap (DSV), Stockholms universitet, och Centrum för](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022051206/5b3eef977f8b9a5e528b7f7a/html5/thumbnails/27.jpg)
27
VAD FÖRKORTNINGARNA HANDLADE OM
Med Akuten (12%) RTG (7%) Vanliga svenska förkortningar 10 13 Diagnoser 5 1 medicinering 12 0 provtagning 12 0 storlek 1 15 metod/procedur 9 22 kroppsdelar/position 2 10 administration 13 12 titlar/yrken 6 4
"pat" 23 0,5
Förkortningar olika termer förkortas i olika specialiteter
![Page 28: Användning av terminologi i patientjournaler¤ndning av terminologi i patientjournaler Mia Kvist Inst. för data- och systemvetenskap (DSV), Stockholms universitet, och Centrum för](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022051206/5b3eef977f8b9a5e528b7f7a/html5/thumbnails/28.jpg)
Vanlig svenska
Medicinsk terminologi
Medicinsk jargong
• ekonomiskt språk
• udda verbformer
Medicinskt journalspråk
28
![Page 29: Användning av terminologi i patientjournaler¤ndning av terminologi i patientjournaler Mia Kvist Inst. för data- och systemvetenskap (DSV), Stockholms universitet, och Centrum för](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022051206/5b3eef977f8b9a5e528b7f7a/html5/thumbnails/29.jpg)
Medicinsk jargong
Jargong: Pat infarcerar på akuten, t. HIA med mellanjouren. Vanlig svenska: Patienten utvecklar en hjärtinfarkt under tiden på akutvårdsmottagningen, varför han skyndsamt förflyttas till Hjärtintensiven av den jourhavande specialistläkaren.
29
![Page 30: Användning av terminologi i patientjournaler¤ndning av terminologi i patientjournaler Mia Kvist Inst. för data- och systemvetenskap (DSV), Stockholms universitet, och Centrum för](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022051206/5b3eef977f8b9a5e528b7f7a/html5/thumbnails/30.jpg)
Medicinskt journalspråk
Septisk pat, oklart fokus, rundodlas före Zinacef. Patienten har sepsis med oklart ursprung, bakterieodling tas från samtliga möjliga infektionsfokus, inklusive blododling, innan behandling med Zinacef inleds.
![Page 31: Användning av terminologi i patientjournaler¤ndning av terminologi i patientjournaler Mia Kvist Inst. för data- och systemvetenskap (DSV), Stockholms universitet, och Centrum för](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022051206/5b3eef977f8b9a5e528b7f7a/html5/thumbnails/31.jpg)
•Produktionsvillkor. Ingen tid att fundera på syftningsregler. Semantisk ekonomi.
•Vem man ser som mottagare av texten. Skriver för kollegor införstådda med syftet med texten samt produktionsvillkoren.
•Identitet. Insocialiseringsprocess
Varför jargong?
![Page 32: Användning av terminologi i patientjournaler¤ndning av terminologi i patientjournaler Mia Kvist Inst. för data- och systemvetenskap (DSV), Stockholms universitet, och Centrum för](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022051206/5b3eef977f8b9a5e528b7f7a/html5/thumbnails/32.jpg)
Medicinskt journalspråk
Funktion:
ekonomiskt,
effektivt och
exakt arbetsredskap.
32
![Page 33: Användning av terminologi i patientjournaler¤ndning av terminologi i patientjournaler Mia Kvist Inst. för data- och systemvetenskap (DSV), Stockholms universitet, och Centrum för](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022051206/5b3eef977f8b9a5e528b7f7a/html5/thumbnails/33.jpg)
33
Stava med c eller k? Cholecystitis -> kolecystit
DAY RTG
kolecystit 48 84
colecystit 1 8
cholecystit 88 1613
DAY – 0,1 milj daganteckningar, 4 milj ord RTG – 0,43 milj röntgensvar, 20 milj ord
![Page 34: Användning av terminologi i patientjournaler¤ndning av terminologi i patientjournaler Mia Kvist Inst. för data- och systemvetenskap (DSV), Stockholms universitet, och Centrum för](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022051206/5b3eef977f8b9a5e528b7f7a/html5/thumbnails/34.jpg)
34
DAY RTG DAY RTG
kolit 55 89 colit 57 273
koloncancer 23 3 coloncancer 39 76
kardiell 150 26 cardiell 15 28
kardiellt 94 56 cardiellt 12 6
supraklavikulär 1 7 supraclavikulär 0 5
supraklavikulärt 11 283 supraclavikulärt 4 302
Stava med c eller k?
![Page 35: Användning av terminologi i patientjournaler¤ndning av terminologi i patientjournaler Mia Kvist Inst. för data- och systemvetenskap (DSV), Stockholms universitet, och Centrum för](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022051206/5b3eef977f8b9a5e528b7f7a/html5/thumbnails/35.jpg)
35
DAY RTG
esofagus 176 1339
oesofagus 4 35 oesophagus 7 77 esophagus 21 243
torax 13 230
thorax 1377 13784
pharynx 0 10 farynx 4 46
![Page 36: Användning av terminologi i patientjournaler¤ndning av terminologi i patientjournaler Mia Kvist Inst. för data- och systemvetenskap (DSV), Stockholms universitet, och Centrum för](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022051206/5b3eef977f8b9a5e528b7f7a/html5/thumbnails/36.jpg)
FRÅGOR?
36