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ANTIBIORÉSISTANCE ET PISCICULTURE
Baron Sandrine1, Le Bouquin Sophie2, Tocqueville Aurélien3, Jouy Eric1, Levadoux Marine4, Gaumé Matthieu3, Larvor Emeline1,3, Sanders Pascal5, David Julie6, Chauvin Claire6, Kempf Isabelle1
ANSES, Ploufragan - 1Unité Mycoplasmologie Bactériologie ; 2 Unité Épidémiologie et bien-être en aviculture et cuniculture; 6Unité Épidémiologie et bien-être porcin 3 ITAVI, Service Technique Aquaculture 4 CIPA, Paris 5 ANSES, Fougères - Laboratoire
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600 PISCICULTURES ≈ 37 000 T/an
3 grandes régions productrices Aquitaine Bretagne
Nord/Picardie
Une production majoritaire
Truite arc-en-ciel
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ANTIBIOTIQUE & PISCICULTURE UN ARSENAL THÉRAPEUTIQUE RESTREINT
• 5 molécules avec AMM : – Oxytétracycline, – Florfénicol, – Association triméthoprime/sulfamide, – Fluméquine, Acide oxolinique
Recours à la cascade
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ANTIBIOTIQUE & PISCICULTURE UNE FILIÈRE PARTICULIÈRE
Elevage en lien direct avec l’environnement Dépendant de la qualité de l’eau en amont Contrainte de débit
Dissémination de l’antibiorésistance en milieu aquatique plus rapide
qu’en milieu terrestre
Peu de données disponibles au niveau national sur la présence de bactéries résistantes
Bactéries résistantes absentes Des paramètres de qualité des eaux, Pas de plan de surveillance systématique.
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ANTIBIORÉSISTANCE ET PISCICULTURE : PROJETS EN COURS ET FUTURS
Suivi des pratiques et usage des antibiotiques ANPI (2013-2015)
Dissémination de l’antibiorésistance en milieu aquatique AQUARES (2013-2015)
Présence de bactéries résistantes dans la flore commensale & pathogène du poisson (2015-2017) Effort & Flor-Co Antibio-Fish
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ANPI : ETUDE QUANTITATIVE ET QUALITATIVE DE L’UTILISATION DES ANTIBIOTIQUES EN PISCICULTURE
Service Technique Aquaculture
FINANCEMENT
PARTENAIRES GDS
Axe 4 : Conforter le dispositif de suivi de la consommation des antibiotiques et de l’antibiorésistance
Mesure 35 : Mettre en place des enquêtes régulières sur des échantillons représentatifs de vétérinaires et d’éleveurs et étendre les enquêtes de pharmaco-épidémiologie à toutes les filières
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ETAT DES LIEUX DES USAGES EN PISCICULTURE
• Travaux sur l’usage dans les autres filières (porcine, avicole, cunicole, vitellière…) • En pisciculture : quelques données au niveau national, des estimations par l’ANMV
• Données ANMV (suivi des ventes) • Recensement en salmoniculture 1997 & 2007
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SUIVI DES VENTES DE MEDICAMENTS (ANMV)
Répartition des ventes 2012 entre les différentes espèces en tonnage de matière active et en quantité de matière active par kilogramme animal
Répartition des ventes 2012 entre les différentes espèces en tonnage de poids vif traité (ACDkg) et en indicateur du niveau d’exposition ALEA et en quantité de matière active par kilogramme animal
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RECENSEMENT 2007 VS 1997 EN SALMONICULTURE
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• Une filière peu exposée • Une filière peu consommatrice d’ATB critiques pour la
santé humaine : – C3G & C4G : non utilisées – Fluoroquinolones & macrolides : peu utilisés
Mais peu de données disponibles et pas d’éléments sur la variabilité et les facteurs associés
étude ponctuelle réalisée en élevage
ETAT DES LIEUX DES USAGES EN PISCICULTURE
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• Estimer les quantités utilisées • Par famille, molécule • Par voie d’administration • Variabilité des quantités entre élevages
• Analyse des usages • Motifs d’utilisation • Facteurs associés
Analyse de la variabilité des usages en relation avec les pratiques d’élevage et le niveau sanitaire
OBJECTIFS ANPI
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SCHÉMA D’ÉTUDE
• Population cible : salmoniculture continentale (75% des piscicultures)
• Un échantillon représentatif d’élevages
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• 100 élevages tirés au sort dans la base de données nationale • effectif proportionnel au nb d’élevages/région
•Production > 2T/an
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LA PROCÉDURE D’ENQUÊTE
Tirage au sort des élevages
Prise de contact ( courrier d’info + téléphone)
Enquête en élevage : questionnaire complété par
interrogation de l’éleveur, consultation de documents et
relevés d’informations (inspiré d’Aquares)
Recueil d’éléments complémentaires auprès des structures (si
accord de l’éleveur et des structures) année 2013
Un traitement anonyme des données
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AQUARES : Etude pilote sur la présence de bactéries résistantes en amont et en aval des piscicultures
dans l’hydro-écorégion Normandie/Bretagne
Service Technique Aquaculture
Axe 4 : Conforter le dispositif de suivi de la consommation des antibiotiques et de l’antibiorésistance
Mesure 37 : Examiner l’impact de l’utilisation des antibiotiques dans l’environnement des élevages
FINANCEMENT
PARTENAIRES GDS
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OBJECTIFS 1. Obtenir une sélection pertinente
d’indicateurs de la dissémination de l’antibiorésistance,
2. Définir une méthodologie analytique et d’échantillonnage,
3. Mettre au point des outils épidémio (questionnaire en élevage, modalités de collecte des données d’usage… )
ANPI
BOITE À OUTILS
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CHOIX DE 20 PISCICULTURES de TRUITES ARC EN CIEL
Volontariat
Localisation : Bretagne et Normandie
Type de production,
Position sur le bassin-versant,
Présence d’autres activités en amont (Station d’Epuration, Elevages terrestres…)
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ECHANTILLONNAGE
2 visites par élevage
hiver : février/mars & Eté : juin/juillet 2014
Questionnaires + Prélèvements
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EAU / SEDIMENT BIOFILM EAU/SEDIMENT
AMONT PISCICULTURE AVAL
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RECUEIL DE DONNEES / ANALYSES
Questionnaires épidémiologiques (Anpi)
Paramètres de terrain :
pH, Température, Salinité, Débit, Oxygène dissous
Caractérisation du Bassin Versant
Analyses microbiologiques % de bactéries résistantes Détection et origine de la contamination fécale Détection/quantification des gènes de résistances Caractérisation de la sensibilité aux ATB des isolats collectés
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CHOIX DES « ESPECES » BACTERIENNES & DES ATB
Aeromonas Enterococcus B H E. coli Cyclines Tétracycline Tétracycline Tétracycline
Macrolides Erythromycine Quinolones
Acide
Oxolinique
Acide Oxolinique
Phénicolés
Florfénicol Florfénicol
Β-lactamines
Céfotaxime Amoxicilline Céfotaxime
Aminosides Gentamicine
Glycopeptides Vancomycine
Triméthoprime Sulfamides
Triméthoprime Sulfaméthoxazole
(SXT)
SXT
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Ensemencement de milieux sans ATB et avec ATB
Conservation d’isolats bactériens Constitution d’un souchier
GSP : Aeromonas spp ECB E. coli
Slanetz Enterococcus spp
TSA Bact. Hétérotrophes
DETERMINATION DU % de BACTERIES RESISTANTES
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Gènes de résistance : Détection Quantification Contamination fécale : présence/absence origine : humaine, élevage terrestre (porc…)
METHODES MOLECULAIRES
svt-biologie-premiere.bacdefrancais.net
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ETAT D’AVANCEMENT Les deux campagnes de prélèvements sont achevées (collecte des paramètres de terrain)
Questionnaires épidémiologiques complétés
Constitution d’une collection d’isolats Aeromonas (1500 isolats) Enterococcus (1200 isolats) E. coli (250 isolats)
Ratio R/S en amont/aval pour l’ensemble des
piscicultures échantillonnées
Caractérisation des isolats en cours
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MERCI DE VOTRE ATTENTION
Remerciements aux Eleveurs qui ont accepté de participer à ces études
Vétérinaires aquacoles & ssssssss GDS aquacoles