analiza danych z technik sekwencjonowania … danych z technik sekwencjonowania nowej generacji...
TRANSCRIPT
![Page 1: Analiza danych z technik sekwencjonowania … danych z technik sekwencjonowania nowej generacji Krzysztof Chojnowski Opiekun naukowy: prof. dr hab. inż. Krzysztof Zaremba DNA Kwas](https://reader030.vdocuments.mx/reader030/viewer/2022041200/5d3dfbba88c9938d248d73ff/html5/thumbnails/1.jpg)
Analiza danych z technik sekwencjonowania
nowej generacji
Krzysztof Chojnowski
Opiekun naukowy: prof. dr hab. inż. Krzysztof Zaremba
![Page 2: Analiza danych z technik sekwencjonowania … danych z technik sekwencjonowania nowej generacji Krzysztof Chojnowski Opiekun naukowy: prof. dr hab. inż. Krzysztof Zaremba DNA Kwas](https://reader030.vdocuments.mx/reader030/viewer/2022041200/5d3dfbba88c9938d248d73ff/html5/thumbnails/2.jpg)
DNA
● Kwas deoksyrybonukleinowy
● Biopolimer złożony z nukleotydów
![Page 3: Analiza danych z technik sekwencjonowania … danych z technik sekwencjonowania nowej generacji Krzysztof Chojnowski Opiekun naukowy: prof. dr hab. inż. Krzysztof Zaremba DNA Kwas](https://reader030.vdocuments.mx/reader030/viewer/2022041200/5d3dfbba88c9938d248d73ff/html5/thumbnails/3.jpg)
DNA
● Kwas deoksyrybonukleinowy
● Biopolimer złożony z nukleotydów
![Page 4: Analiza danych z technik sekwencjonowania … danych z technik sekwencjonowania nowej generacji Krzysztof Chojnowski Opiekun naukowy: prof. dr hab. inż. Krzysztof Zaremba DNA Kwas](https://reader030.vdocuments.mx/reader030/viewer/2022041200/5d3dfbba88c9938d248d73ff/html5/thumbnails/4.jpg)
DNA
![Page 5: Analiza danych z technik sekwencjonowania … danych z technik sekwencjonowania nowej generacji Krzysztof Chojnowski Opiekun naukowy: prof. dr hab. inż. Krzysztof Zaremba DNA Kwas](https://reader030.vdocuments.mx/reader030/viewer/2022041200/5d3dfbba88c9938d248d73ff/html5/thumbnails/5.jpg)
Chromatyna
![Page 6: Analiza danych z technik sekwencjonowania … danych z technik sekwencjonowania nowej generacji Krzysztof Chojnowski Opiekun naukowy: prof. dr hab. inż. Krzysztof Zaremba DNA Kwas](https://reader030.vdocuments.mx/reader030/viewer/2022041200/5d3dfbba88c9938d248d73ff/html5/thumbnails/6.jpg)
ChIP-Seq
![Page 7: Analiza danych z technik sekwencjonowania … danych z technik sekwencjonowania nowej generacji Krzysztof Chojnowski Opiekun naukowy: prof. dr hab. inż. Krzysztof Zaremba DNA Kwas](https://reader030.vdocuments.mx/reader030/viewer/2022041200/5d3dfbba88c9938d248d73ff/html5/thumbnails/7.jpg)
ChIP-Seq
● Sekwencjonowanie nowej generacji
![Page 8: Analiza danych z technik sekwencjonowania … danych z technik sekwencjonowania nowej generacji Krzysztof Chojnowski Opiekun naukowy: prof. dr hab. inż. Krzysztof Zaremba DNA Kwas](https://reader030.vdocuments.mx/reader030/viewer/2022041200/5d3dfbba88c9938d248d73ff/html5/thumbnails/8.jpg)
ChIP-Seq
● Mapowanie do genomu referencyjnego
![Page 9: Analiza danych z technik sekwencjonowania … danych z technik sekwencjonowania nowej generacji Krzysztof Chojnowski Opiekun naukowy: prof. dr hab. inż. Krzysztof Zaremba DNA Kwas](https://reader030.vdocuments.mx/reader030/viewer/2022041200/5d3dfbba88c9938d248d73ff/html5/thumbnails/9.jpg)
ChIP-Seq
● Mapowanie do genomu referencyjnego
![Page 10: Analiza danych z technik sekwencjonowania … danych z technik sekwencjonowania nowej generacji Krzysztof Chojnowski Opiekun naukowy: prof. dr hab. inż. Krzysztof Zaremba DNA Kwas](https://reader030.vdocuments.mx/reader030/viewer/2022041200/5d3dfbba88c9938d248d73ff/html5/thumbnails/10.jpg)
ChIP-Seq
● Wykrywanie pików
WTD
Window Tag Density
MSP
Matching Strand Peaks
Mirror Tag Correlation
MTC
![Page 11: Analiza danych z technik sekwencjonowania … danych z technik sekwencjonowania nowej generacji Krzysztof Chojnowski Opiekun naukowy: prof. dr hab. inż. Krzysztof Zaremba DNA Kwas](https://reader030.vdocuments.mx/reader030/viewer/2022041200/5d3dfbba88c9938d248d73ff/html5/thumbnails/11.jpg)
ChIP-Seq
● Tworzenie profilu wiązania
![Page 12: Analiza danych z technik sekwencjonowania … danych z technik sekwencjonowania nowej generacji Krzysztof Chojnowski Opiekun naukowy: prof. dr hab. inż. Krzysztof Zaremba DNA Kwas](https://reader030.vdocuments.mx/reader030/viewer/2022041200/5d3dfbba88c9938d248d73ff/html5/thumbnails/12.jpg)
jChIP
![Page 13: Analiza danych z technik sekwencjonowania … danych z technik sekwencjonowania nowej generacji Krzysztof Chojnowski Opiekun naukowy: prof. dr hab. inż. Krzysztof Zaremba DNA Kwas](https://reader030.vdocuments.mx/reader030/viewer/2022041200/5d3dfbba88c9938d248d73ff/html5/thumbnails/13.jpg)
jChIP
![Page 14: Analiza danych z technik sekwencjonowania … danych z technik sekwencjonowania nowej generacji Krzysztof Chojnowski Opiekun naukowy: prof. dr hab. inż. Krzysztof Zaremba DNA Kwas](https://reader030.vdocuments.mx/reader030/viewer/2022041200/5d3dfbba88c9938d248d73ff/html5/thumbnails/14.jpg)
jChIP
![Page 15: Analiza danych z technik sekwencjonowania … danych z technik sekwencjonowania nowej generacji Krzysztof Chojnowski Opiekun naukowy: prof. dr hab. inż. Krzysztof Zaremba DNA Kwas](https://reader030.vdocuments.mx/reader030/viewer/2022041200/5d3dfbba88c9938d248d73ff/html5/thumbnails/15.jpg)
jChIP
![Page 16: Analiza danych z technik sekwencjonowania … danych z technik sekwencjonowania nowej generacji Krzysztof Chojnowski Opiekun naukowy: prof. dr hab. inż. Krzysztof Zaremba DNA Kwas](https://reader030.vdocuments.mx/reader030/viewer/2022041200/5d3dfbba88c9938d248d73ff/html5/thumbnails/16.jpg)
Dziękuję za uwagę!