république algérienne démocratique et populaire ministère de l’enseignement supérieur et de...
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République Algérienne Démocratique et Populaire
Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche Scientifique
Rencontres sur la Recherche en Informatique R²I 2011
12-14 juin 2011, Tizi-Ouzou, Algérie
CLASSIFICATION DES MICROCALCIFICATIONS: NOUVELLE
APPROCHE POUR L’EXTRACTION DES ATTRIBUTS
GHILAS Hamza(1), GAGAOUA Meriem(2), MOUSSAOUI Abdelouahab(3)
Département informatiqueUniversité Ferhat Abas, Sétif
Sétif, Algériehamzaghilas@yahoo.fr (1) , gagaouameriem@yahoo.fr (2), mousaoui.abdel@gmail.com (3)
Université Ferhat Abas, Sétif 2011
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Cancer du seinLe cancer du sein est une maladie dangereuse,
sa détection précoce reste le seul moyen de lutte→Des compagnies de dépistage gratuites.
Les radiologues sont censés d’analyser des dizaines de clichés / jours.
→Besoin d’outil d’aide au diagnostic.
Les calcifications: signe radiologique à un stade précoce.
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Cancer du sein
28.3 %
21.6 %
Les cancers les plus fréquents chez la femme en Algérie (OMS).
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Les microcalcifications
Les Mcs sont formées par des dépôts calciques fortement radio-opaques.
→ Détection.→ Classification: malignes/bénigne: La
vérification par biopsie est inévitable.Classification automatique: peut réduire le nombre d’interventions chirurgicale inutiles
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Classification automatique
Classifieur
Base d’apprentissageA1
A2
A3
An Classe prédite
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Etat de l’art
H.D. Cheng et al. Pattern Recognition. 2003:→ Analyse de la texture: indice de Haralick.→ Transformé en ondelette.→ Statistiques.→ …
Impliquer le radiologue dans la recherche des caractéristiques des microcalcifications
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Diagnostic des Mcs
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Attributs de classification
Attributs propres à une
Mc
L’aire Rayon maximale et rayon minimale Rectangularité Circularité interne et circularité externe Contraste de la microcalcification Contraste du contour L’écart type des niveaux de gris Angularité
Attributs d’un foyer de Mcs
Nombre de calcifications Densité des calcifications dans un foyer Nombre de foyers dans le sein L’écart type des tailles des microcalcifications Distance du foyer de Mcs de la peau L’écart type des distances inter-microcalcifications La bilatéralité L’écart type des intensités des microcalcifications
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Attributs de Mcs
• Rectangularité
Rectangularité = Rmin / Rmax
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Attributs de Mcs
• Circularité
Circularité interne = aire(Mc) / aire(Cint)
Circularité externe = aire(Cext) / aire(Mc)
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Attributs de Mcs
• Contraste du contour.
• L’écart type des niveaux de gris.
• Angularité.
Contraste(contour) = Im(contour) / Im(Mc)
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Attributs d’un foyer de Mcs
• Densité des calcifications dans un foyer
• L’écart type des tailles des microcalcifications.
• L’écart type des intensités des microcalcifications
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Classification
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Implémentation
• Weka, une API java complète pour le fouille de données.
• DDSM (Digital Database for Screening Mammography). Base d’image mammographiques très riche. Les cas de patiente sont vérifiés par biopsie.
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Résultats
Type d’attributs Apprentissage TesteTaux de
classification
Attributs propre à une Mc.
1/3 2/3 42%
2/3 1/3 60,20%
Attributs d’un foyer de Mcs.
1/3 2/3 35,12%
2/3 1/3 49,56%
Tout les attributs1/3 2/3 65,03%
2/3 1/3 82,21%
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Conclusion
• La liste d’attributs proposée dans cet article est issue d’une étude de recueil d’informations du point de vue médical. Ces attributs peuvent être utilisés comme vecteur d’entrée pour n’import quel type de classifieur (Support Vecteur Machine, K plus proche voisins, Réseau de neurones, Arbres de décision, Système immunitaire artificiels et etc).
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Merci pour votre attention
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