interpretação brasileira de genotipagem – algoritmo brasileiro
Post on 01-Jan-2016
29 Views
Preview:
DESCRIPTION
TRANSCRIPT
Interpretação brasileira Interpretação brasileira de genotipagem – de genotipagem – Algoritmo BrasileiroAlgoritmo Brasileiro
Anderson Alvarenga Pereira
Ministério da SaúdeDepartamento de DST/Aids e
Hepatites Virais
IntroduçãoIntroduçãoContexto
◦Criação da Rede Nacional de Genotipagem – RENAGENO (2001).
23 Laboratórios.
◦Necessidade de criar um algoritmo próprio – (2003).
◦Oferecer recursos para os laboratórios da RENAGENO.
2
MotivaçãoMotivaçãoAumento da demanda por
exames de genotipagem.Demora na utilização dos
algoritmos públicos e privados.Necessidade de adequação a
realidade brasileira.◦Interpretação em português;◦Características locais da circulação
do HIV.
3
ObjetivosObjetivosValidar a qualidade das
sequências produzidas;Subtipar as sequências com
simplicidade e eficiência;Desenvolver o algoritmo baseado
nas regras do comitê da RENAGENO.ContaminaçãoContaminação SubtipoSubtipo
AlgoritmoAlgoritmoBrasileiroBrasileiro
4
DesafiosDesafiosConhecimentos avançados
envolvidos.◦Biológicos;◦Computacionais;◦Modelos matemáticos e estatísticos;◦Modelagem do conhecimento em
formação;◦Simplificação para o uso de não
especialistas;
5
Algoritmos de resistência à Algoritmos de resistência à drogasdrogas Baseado em Regras:
◦ Analisam a presença ou ausência de mutações específicas;
◦ Atribuem níveis de resistência a cada droga. Baseado em penalidades/score:
◦ Atribuem penalidades presença ou ausência de mutações específicas.
Público – Acesso livre via internet, mantido por universidades ou órgãos governamentais.◦ HIVdb – Universidade de Stanfort;◦ ANRS – Agence Nationale de Recherches Sur le
Sida;◦ Rega – Rega Institute;◦ Algoritmo Brasileiro.
Privados◦ Mantidos por empresas.
6
Diferença entre Diferença entre AlgoritmosAlgoritmosBaseado em Regras ou PenalidadesNíveis de resistência conferidos
◦ ANRS e REGA Sensível; Intermediário; Resistente.
◦ HIVdb Sensível; Potencial baixo nível de resistência; Baixo Nível de Resistência; Resistência intermédiária; Alto nível de resistência.
◦ Algoritmo Brasileiro Sensível; Intermediário; Resistente; NA (Não se aplica).
7
Diferença entre Diferença entre AlgoritmosAlgoritmosDrogas avaliadas pelo algoritmo;
◦Brasileiro = 22 drogas◦HIVdb e REGA = 13 drogas◦ANRS = 10 drogas
10 drogas estão nos 4 algoritmos;◦3TC, ABC, ATV/r, D4T, DDI, DRV,
EFV, NFV, SQV/r, TDFInterpretação da relação entre
mutações e resistência à droga.Resultados divergentes.
8
Algoritmo BrasileiroAlgoritmo Brasileiro Abrange as
características específicas do HIV no Brasil;
Baseado nas regras de resistência a drogas criadas pelo comitê da RENAGENO;
Maior quantidade de drogas avaliadas;
Entre 10.000 a 15.000 exames ano.
Validado pelo banco da RENAGENO com mais de 20.000 sequências.
Mais de 400 médicos de referência em genotipagem treinados para interpretar os laudos;
Página de acesso e resultado do Algoritmo Brasileiro de Genotipagemhttp://aids.gov.br/genotipagem
9
Algoritmo BrasileiroAlgoritmo Brasileiro
Revisão periódica;Atualização sempre que
necessário;Processo de atualização:
◦Definição da regra pelo comitê;◦Desenvolvimento da nova versão;◦Teste da nova versão pelo comitê;◦Comparação do Impacto das versões;◦Treinamento dos médicos (MRG’s);◦Liberação da nova versão.
10
Version 11
N=18935N=18935Version 12
top related