grupo de epigenética del cáncer. david guerrero-setas, navarra biomed
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Dr. David GuerreroResponsable del Grupo de Epigenética del Cáncer
GRUPO DE EPIGENÉTICA DEL CÁNCER:LÍNEA DE TRABAJO PRESENTE Y FUTURA
CENTRO DE INVESTIGACIÓN NAVARRABIOMED
Áreas de investigación: Cáncer, Patologías de Grandes Sistemas, Neurociencias, Salud Mental y Vigilancia Epidemiológica, Salud Pública y Servicios Sanitarios
www.navarrabiomed.es
2002-2013 2014-actual
Centro localizado junto al Pabellón de Radioterapia, en el Complejo Hospitalario de Navarra
Detección de nuevos biomarcadores epigenéticos y moléculas reguladoras de la
expresión génica (smallRNAs) con posible valor pronóstico y de predicción de
respuesta al tratamiento oncológico en pacientes con cáncer de mama esporádico, y
otros tipos de cáncer (cáncer ginecológico y tumores cerebrales).
Colaboraciones
Investigación multicéntrica
+Componentes: Personal básico (pre-doc, post-doc) de Navarrabiomed y clínico investigador de los Servicios de Anatomía Patológica, Cirugía General, Oncología Médica y Oncología Radioterápica del CHN.
OBJETIVO Y COMPONENTES DEL GRUPO DE EPIGENÉTICA DEL CÁNCER
PROYECTOS EN CÁNCER DE MAMA
Título: Análisis del Metiloma y Proteoma en los subtipos de expresión de cáncer de mama ductal infiltrante. Investigador principal (IP): Dr. David Guerrero Setas (Epigenética del Cáncer, Navarrabiomed-FMS) (2012-2015)
Title: Analysis of expression profiles of non-coding RNAs by ultra-sequencing. IP: Dr. David Guerrero Setas (Cancer Epigenetics, Navarrabiomed-FMS). REFBio Pyrenees Biomedical Network from European Union. (October 2013-February 2015).
Título: Análisis de genes alterados por metilación en relación con la respuesta al tratamiento oncológico en pacientes con cáncer de mama de mal pronóstico. IP: Dr. David Guerrero Setas (Navarrabiomed-FMS) (2015). Fundación Caja Navarra.
Título: Efectos de agentes anti-neoplásicos en la regulación funcional, epigenética y proteómica de las células mileoides supresoras en cáncer de mama. IP: Dr. Escors (Immunomodulación del Cancer, Navarrabiomed-FMS). Fundación Sandra Ibarra (2014-2016).
Título: Análisis de la expresión diferencial de miRNAs e hipermetilación de genes en relación con el pronóstico y respuesta al tratamiento en cáncer de mama. IP: Dra. Córdoba (Servicio AP, CHN, SNS). 2011-2013.
Nuevas convocatorias
Título: Análisis de variables clínicas, anatomopatológicas y moleculares en los subtipos de expresión de cáncer de mama. IP: Dr. Guerrero Setas (Centro de Investigación Biomédica, SNS. Departamento de Salud, Gobierno de Navarra (2009-2011).
Título: Análisis de la correlación entre el patrón molecular de los genes CDH-1 y SIAH-1 y las características clínicas y anatomopatológicas de pacientes navarras con carcinoma ductal de mama. IP: Dr. Vicente (Servicio de Cirugía General y Digestiva, CHN, SNS). Departamento de Salud, Gobierno de Navarra (2005-2007).
Título: Estudio de grado de apoptosis, adhesión celular y resistencia in vitro a quimioterápicos como marcadores de agresividad tumoral en pacientes con carcinoma ductal infiltrante de mama. IP: Dr. Vicente (Servicio de Cirugía General y Digestiva, CHN, SNS). Departamento de Salud, Gobierno de Navarra (2003-2005).
PUBLICACIONES DEL GRUPO
•Perez-Janices N, Torrea N, Blanco-Luquin I, y cols. Differential involvement of RASSF2 hypermethylation in breast cancer subtypes and their prognosis. Oncotarget 2015 (accepted). Factor de impacto 2013 (FI): 6.63
•Blanco-Luquin I, Guarch R, Ojer A, y cols. Differential role of gene hypermethylation in adenocarcinomas, squamous cell carcinomas and cervical intraepithelial lesions of the uterine cervix. Pathol Int 2015 (under review).
•Perez-Janices N, Blanco-Luquin I, Tuñón M, y cols. EPB41L3, TSP-1 and RASSF2 as new clinically relevant prognostic biomarkers in diffuse gliomas. Oncotarget 2015 Jan 1;6(1):368-80. FI: 6.63
•Guerrero-Setas D, Pérez-Janices N, Blanco-Fernandez L, y cols. RASSF2 hypermethylation is present and related to shorter survival in squamous cervical cancer. Mod Pathol 2013; 26(8):1111-22. PMID: 23542458. FI : 6.364
•Guerrero-Setas D, Pérez-Janices N, Blanco-Fernandez L, y cols. Differential gene hypermethylation in genital lichen sclerosus and cancer: a comparative study. Histopathology 2013; 63(5):659-69. PMID: 23998425. IF 2013: 3.301
•Arrazubi V, Suarez J, Guerrero D, y cols. Prognostic significance of thymidylate synthase polymorphism in rectal cancer patients treated with neoadjuvant chemoradiotherapy. Colorectal Dis 2013; 15(4):428-35. PMID: 22958523. FI: 2.081
• Guerrero D, Guarch R, Ojer A, y cols. Hypermethylation of the thrombospondin-1 gene is associated with poor prognosis in penile squamous cell carcinoma. BJU Int 2008; 102(6):747-55. PMID: 18336597. FI: 3.13
• Bertolo C, Guerrero D, Vicente F, y cols. Differences in molecular and immunohistochemical parameters in the subtypes of infiltrating ductal breast cancer. Am J Clin Pathol 2008; 130(3):414-24. PMID: 18701415. FI: 3.005
Nuevas publicaciones en cáncer de mama:
Tres nuevos artículos en preparación, de trabajos ya realizados:
-Estudio realizado en aprox. 700 pacientes acerca de los subtipos tumorales.
-Estudio molecular en ganglio centinela.
-Descripción de nuevos genes metilados en subtipos tumorales.
Nuevas publicaciones con los resultados de los proyectos en desarrollo.
• Guerrero D, Guarch R, Ojer A, y cols. Differential hypermethylation of genes in vulvar cancer and lichen sclerosus coexisting or not with vulvar cancer. Int J Cancer 2011; 128 (12): 2853-64. PMID: 20734389. FI: 6.198
PUBLICACIONES EN COLABORACIÓN CON OTROS GRUPOS
• Liechtenstein T, Perez-Janices N, Gato M, y cols. A highly efficient tumor-infiltrating MDSC differentiation system for discovery of anti-neoplastic targets, which circumvents the need for tumor establishment in mice. Oncotarget 2014;5(17):7843-57. FI: 6.63
• Kochan G, Escors D, Breckpot K, Guerrero-Setas D. Role of non-classical MHC class I molecules in cancer immunosuppression. Oncoimmunology 2013; 2(11):e26491. PMID: 24482746. FI: 6.28
• Escors D, Liechtenstein T, Perez-Janices N, y cols. Assessing T-cell responses in anticancer immunotherapy dendritic cells or myeloid-derived suppressor cells?. Oncoimmunology 2013; 2(10):e26148. PMID: 24244902. FI: 6.28
• Liechtenstein T, Perez-Janices N, Bricogne C, y cols. Immune modulation by genetic modification of dendritic cells with lentiviral vectors. Virus Res 2013; 176(1-2):1-15. PMID:23726846. FI: 2.812
• Lopez-Serra L, Ballestar E, Ropero S, y cols. Unmasking of epigenetically silenced candidate tumor suppressor genes by removal of methyl-CpG-binding domain proteins. Oncogene 2008; 27(25):3556-66. PMID: 18223687. IF 2013: 8.559
• Agrelo R, Cheng WH, Setien F, y cols. Epigenetic inactivation of the premature aging Werner syndrome gene in human cancer. Proc Natl Acad Sci USA 2006; 103(23):8822-7. PMID: 16723399. IF: 9.809
ENFOQUE DE ESTUDIOS: PASADO Y PRESENTE
Ahora: Múltiples genes al mismo tiempo
Selección de genes alterados
Antes: Gen a Gen
ESQUEMA GENERAL DE TRABAJO DE LABORATORIO
Selección de genes alterados
Estudio de la frecuencia de las alteraciones en tumores de distintos subtipos y análisis de su implicación clínica
Arrays de metilaciónSecuenciación de última Generación (NGS)Técnicas de Proteómica
Estudio funcional en líneas celulares mediante lentivirus
LÍNEA DE FUTURO
Selección de nuevos genes candidatos que pueden metilarse o expresarse de forma anómala, que ya han sido detectados mediante técnicas de última generación.
Análisis in vitro de su papel funcional, incluyendo estudios de toxicidad frente a fármacos habituales en clínica.
Análisis del valor clínico de los genes candidatos en pacientes con cáncer de mama de distintos subtipos patológicos.
PACIENTES CON CÁNCER DE MAMA TRIPLE-NEGATIVO (ER, PR, HER2 -)
Tumor sólido Biomarcador Fármaco Centros Año de inicio
Tipo de técnica
Cáncer de colon Mutaciones de genes K-RAS, N-RAS
Cetuximab CHN, HRS 2009 (K-RAS) /2014 (N-
RAS)
Molecular
Cáncer de pulmónMutaciones del gen EGFR Erlotinib,
GefitinibCHN, HRS 2011 322
Cáncer de mama Amplificación del gen HER2 Trastuzumab CHN 2009 Citogenética (FISH)
Cáncer de mama Amplificación del gen HER2 Trastuzumab CHN 2009 Citogenética (FISH)
Tipo de cáncer Biomarcador Clínica Centros Año de inicio
Tipo de técnica
Cáncer de colon Mutaciones del gen BRAF Pronóstico CHN, HRS 2013 Molecular
Oligodendroglioma Codeleción 1p/19q Pronóstico CHN 2009 Citogenética (FISH)
LABORATORIO DE BIOLOGIA MOLECULAR
Biomarcadores predictivos de respuesta al tratamiento oncológico o con valor pronóstico
Cáncer de pulmón
Mutaciones del gen EGFR Erlotinib, Gefitinib
CHN, HRS Mar_2011 Molecular
Reordenamientos EML-ALK Crizotinib CHN, HRS Nov_2011 Citogenética (FISH)
HOSPITAL REINA
SOFIA,TUDELA
CONVENIO DE COLABORACIÓN CON LA ASOCIACIÓN SARAY: MAYO 2015-MAYO 2016.
Agradecimientos…
Anatomía PatológicaCirugía General y DigestivaOncología Médica y Oncología Radioterápica
SARAY
Departamento de Salud (Gobierno de Navarra)
Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas (CNIO, Madrid)Programa de Epigenética y Biología del Cáncer (IDIBELL, Barcelona)Laboratorio de Epigenética del Cáncer (IUOPA, Oviedo)
PACIENTES
BiobancoDocumentación GráficaUnidad de Gestión de ayudas y personal administrativoGrupo de investigación en Inmunomodulación Grupo de investigación Clínica en Oncología MédicaPersonal técnico (TEL y TEAP)Plataforma de ProteómicaUnidad de Metodología
Fundación Vasca de Investigación e Innovación Sanitarias (BIOEF)
Plataforma de Genómica, Centro de Investigación Biomédica de La Rioja (CIBIR)
¡Muchas Gracias!
www.navarrabiomed.es info.navarrabiomed@navarra.es
Dr. David GuerreroResponsable del Grupo de Epigenética del Cáncer
dguerres@navarra.es
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