genetický drift
Post on 09-Jan-2016
61 Views
Preview:
DESCRIPTION
TRANSCRIPT
Genetický driftZdeňka Svobodová
Populační genetika
PŘENOS GENETICKÉ INFORMACE NA
ÚROVNI POPULACE
GENETICKÁ PODSTATA VARIABILITY
DYNAMIKA GENETICKÝCH ZMĚN
Příčiny genetické variability
Mutace: hlavní zdroj genetické variability
Migrace: geneticky účinná migrace jedinců
Inbreeding: stoupá počet homozygotů (změna frekvencí alel)
Genetický drift (posun): náhodné změny v alelových frekvencích
Selekce: fenotypové vlastnosti
Genetický drift
působí na všechny alely ve všech Po (nezáleží na projevu znaku)
evoluce: jen pokud budou vyvolané fenotypové změny udrženy v následující generaci (-ích)
chyby výběru
ne tendence k návratu
o mutacích alel s fenotypovým projevem rozhoduje selekce x o mutacích alel, které nejsou podrobeny selekci, rozhoduje drift
1. rozrůznění alelových četností
2. fixace či eliminace alely
3. diferenciace subpopulací
4. pokles genetické variability uvnitř Po → genotypově uniformní
5. inbreeding → zvýšení frekvence homozygotů a ztráta alel, projev škodlivých recesivní alel, snížení fertility a viability
Pravděpodobnot fixace či ztráty
Binomická pravděpodobnost
fixace alely (p = 1), monomorfní lokus
eliminace alely (p = 0)
Po s nefixovanými alelami: segregující
[(2N)! / i! (2N-i)! ] pi q2N-i
p…četnost alely Aq…četnost alely ai…počet alel AN…počet jedinců Po
Velikost GD
spq2 = pq /2N
největší GD : p = q = 0,5 a
malá Po
počáteční frekvence, velikosti počáteční populace
stejná pravděpodobnost snížení (až eliminace) i
zvýšení (až fixace) četnosti alely
neurčíme, která alela
s…variance alelových frekvencí
GD a evoluceI. Bottleneck
Disturbance, Nedosahují genetické variability původní populace
gepard - extrémní inbreeding (nemoci) - bottleneck (12 tis. let) a recentní fragmentace
rypouš severní
- lovení → 1890: 30 jedinců
- ochrana → desíky tisíc jedinců
- malá variabilita DNA (x rypouš sloní)
GD a evoluce
I. Bottleneck
odchylka od správného poměru pohlaví (lovná
zvěř)
II. Founder effect
migraci a založení nové Po
stále více odlišná od té původní speciace druhů
GD a evoluce
Indiáni: nemají krevní skupinu B Dunkeři, Amishové: jiná četnost krevních skupin
cichlidy
III. Kontinuální drift
malé Po: mnoho generací, jediná Po druhu snižování viability a fitness
GD a evoluce
ohrožené druhy až extinkce - znalost biologie, genetické výbavy a ekologie → odhad velikosti Po s dostatečným genovým poolem pro zachování daného druhu.
• http://darwin.eeb.uconn.edu/simulations/simulations.html• http://old.mendelu.cz/~agro/af/genetika/vsg3/souhrn.html• http://kgn.umbr.cas.cz/prednasky/Genetika%20I/Lekce9_GI.pdf• http://cs.wikipedia.org/wiki/Genetick%C3%BD_drift• http://www.huntington.cz/predtest.htm• http://www.brooklyn.cuny.edu/bc/ahp/LAD/C21/C21_Bottleneck.html• http://home.comcast.net/~milazinkova/Fogshadow.html• http://commons.wikimedia.org/wiki/Image:Acinonyx_jubatus_Sabi_Sands.jpg• http://www.animalsholding.cz/zvirata/papilochromis.jpg• http://www.macenauer.cz/cs/hradec042.htm• http://www.lukysipy.cz/• http://www.loc.gov/rr/european/imde/germchro.html• http://www.fotopriestor.sk/foto/cichlida• Relichová J. (1997) Genetika populací. Masarykova Univerzita, Vydavatelství MU, Brno,
103-130.
KONEC
top related