c. elegans : un espejo de 959 células

C. elegans: un espejo de 959 células

Prof. Dr. Juan Carlos Rodríguez Aguilera

Centro Andaluz de Biología del Desarrollo,Universidad Pablo de Olavide, Sevilla.

¿C. elegans?

Caenorhabditis elegans

www.news.wisc.edu

1 mm

Goldstein lab

¿C. elegans?

www.wormatlas.org

Caenorhabditis elegans

Seis cromosomas, dos sexos

www.wormatlas.org

959 células somáticas302 son neuronas95 son miocitos pared

99% de la población

1031células somáticas381 son neuronas

1% de la población

Paul Stenberg’s Lab

Reproducción (a)sexual

Asexual

• Obtención y propagación de cepas genéticamente homogéneas• Facilidad de obtención y mantenimiento de estirpes homocigóticas• Mutagénesis en condiciones controladas

Sexual• Mapeo genético por cruces• Estudios con heterocigotos• Retrocruzamiento con parentales• Estudios de segregación ligados al sexo

Desarrollo de C. elegans

www.wormatlas.org

(558 cells)

(959 cells)

Desarrollo de C. elegans

www.wormatlas.org

Goldstein lab

Linaje embrionario

www.wormatlas.org

Linaje post-embrionario

www.wormatlas.org

Estructura génica

(in humans 8.8 ± 1.2 exons/gene)

www.wormbook.org

Estructura génica

www.wormbook.org

27.000 genes humanos23.000 genes C. elegans

Genoma secuenciado

www.wormbook.org

ww

w.w

orm

bo

ok.

org

ww

w.w

orm

ba

se.o

rg

Termotactismo

Rosenzweig et al. , Gen. Dev 19: 419-424, 2005

Quimiotactismo

Hir

ots

u e

t al

. G

enes

to

Cel

ls (

2005

) 10

, 51

7-53

0.

Mutantes a la carta por ARNi

Silenciamiento por alimentación

Transformación por microinyección

• vectores purificados (miniprep), segmentos lineales de ADN (digestiones), productos de PCR

• Arrays extracromosómicos, poca estabilidad, herencia

www.wormbook.org

Sam Ward's lab

Transformación biolística

• Integración cromosómica, estable, mutaciones colaterales

www.bio-rad.com www.bio-rad.com

Algunos recursos

• Wormbase• Wormbook• Wormatlas• Wormimage• Wormserver• Wormclassroom• Textpresso• KO consortium• CGC Genetics Center

C. elegans como modelo: metabolismo bioenergético

www.wormbook.org

C. elegans como modelo: metabolismo bioenergético

www.wormbook.org

C. elegans como modelo: metabolismo bioenergético

Señalización y energía

www.wormbook.org

Interacción rutas metabólicas

www.wormbook.org

Efectos deletéreos en mutantes coq

N2 coq-1

coq-2 coq-8

Ga

vilá

n

et

al.,

Bio

fact

ors

, 2

00

5

Degeneración muscular faríngea

Ga

vilá

n

et

al.,

Bio

fact

ors

, 2

00

5

coq-1 coq-2 coq-8 / N2

Alteraciones bombeo faríngeo

N2 coq-1 coq-2

Ga

vilá

n

et

al.,

Bio

fact

ors

, 2

00

5

Fenotipos de mutantes coq

Gavilán et al., Biofactors, 2005

Eexpresión larvaria de coq-8

Ase

cio

et

al.,

Me

ch.

Ag

e.

De

v. 2

00

6

Expresión adulta de coq-8

Ase

cio

et

al.,

Me

ch.

Ag

e.

De

v. 2

00

6

Ase

cio

et

al.,

Me

ch.

Ag

e.

De

v. 2

00

6

Expresión embrionaria de coq-8

Ase

cio

et

al.,

Me

ch.

Ag

e.

De

v. 2

00

6

Fácil y asequible

www.nematodes.org

• Una lupa estereoscópica con transiluminación (4.000 €)• Una estufa con termostatización (1.500 €)• Un mechero de gas (50 €)• Reactivos varios (300 €)• Pipetas (400 €)

• Incubador de cultivos: un cajón (0 €)• Libros técnicos especializados (0 €)• Librería de mutantes (0 €)• Librería de vectores de expresión (0 €)• Librería de vectores de silenciamiento (0 €)• Suscripción a bases de datos genéticas (0 €)

• Aprendizaje y destreza (3 meses)

Entra en el “mundo elegans”…

by Adam Hartley and Carolyn Marks

Gracias por su atención

Prof. Dr. Juan Carlos Rodríguez AguileraCentro Andaluz de Biología del Desarrollo,

Universidad Pablo de Olavide, Sevilla.