ДНХ секвенсинг технологи өнөө ба ирээдүй /minion

Илтгэгч: Х. ЭнхжаргалТ. Нандин – Эрдэнэ

Удирдагч багш: Д. Дөлгөөн

ДНХ секвенсинг технологи өнөө ба ирээдүй

/MinION/

ШУТИС – ҮТС

2

АГУУЛГА

Нуклейн хүчилДНХ секвенсинг Минайон /MinION/ нанопоре секвенатор Технологийн ашиглалтын ойрын болон ирээдүйн чиг хандлагаТүгээмэл тохиолддог бэрхшээлүүд, тэдгээрийг шийдвэрлэх арга замДүгнэлт

2

3

НУКЛЕЙН ХҮЧИЛ

Нуклейн хүчлийн молекул нь хоорондоо тодорхой дарааллаар холбогдсон 4 төрлийн нуклеотидаас тогтох полимер нэгдэл үүсгэдэг.

3

ДНХ СЕКВЕНСИНГ

ДНХ-ийн нуклеотидуудын дарааллыг тогтоох арга.Максам-ГилбертСангерПиросеквенсингШинэ үеийн буюу геномийн секвенатор

ÞIllumina solexaÞRoche 454ÞABI – SOLID ÞIon Torrent 4

МАКСАМ ГИЛБЕРТИЙН БУЮУ ГИНЖ ТАСЛАХ ХИМИЙН АРГА

5

САНГЕРИЙН БУЮУ ГИНЖ ЗОГСООХ ЭНЗИМИЙН АРГА

Энэ аргын үндэс – Полимераз энзимийн ажиллагааг ддНТФ буюу дидезоксирибонуклеозид ашиглан зогсоох

6

LIFE TECHNOLOGY-GENETIC ANALYZER

Сангерийн шинэчлэгдсэн хувилбар Капилляр секвенсинг

7

ШИНЭ ҮЕИЙН БУЮУ геномын секвенаторууд

Illumina solexa

Roche 454

Ion torrentaABI–SOLID

8

МИНАЙОН нанопоре секвенатор

Оксфорд Нанопоре Технологи зохион бүтээж, 2015 оны хавар худалдаанд оруулсан. 9

МИНАЙОН МКI аппарат

Урсгал хэсгийн байрлуулсан зөөврийн Минайон аппаратыг USB порт ашиглан зөөврийн болон ширээний компютертэй холбон ажиллуулна.1

0

МИНАЙОН давуу тал

АвсаарханТээвэрлэх боломжтойХямдШинжилгээнд нэгхэн ширхэг гинжин молекул хангалттайДНХ төдийгүй РНХ, уургийн молекулуудын секвенсийг тодорхойлдог. Үр дүнг бодит хугацаанд хянаж чаддаг.1

1

МИНАЙОН ажиллах зарчим

Нано сувгаар зөвхөн цахилгаан гүйдэл урсах бөгөөд ямар нэгэн молекул сувгаар дамжин өнгөрөх үед гүйдлийн хүчинд өөрчлөлт үүсгэнэ.

12

НАНОПОРИЙН МЭДРЭМТГИЙ ЧАНАР

Энэ өөрчлөлтийн хэмжээ ямар молекул сувагт орсоноос шууд хамааралтай. 1

3

МИНАЙОН секвенаторын бүтэц

Урсгал нэгж (Flow

cell)

Бичил таваг (array of

microscaffolds)

Полимер мембран ( polymer

membrane)

Нано нүх (nanopore)

14

МИНАЙОН аппаратын дэвшилт

ДНХ-ийн метилжилтийг илрүүлэх чадвар100кс хүртэл амжилттай ажилладаг. Оксфорд нанопоре секвенсинг мэдээллийн сан нээлттэй, үнэ төлбөргүй.Өөрийн мэдээллийг үүлэн системд хадгалж,Хадгалагдсан мэдээллүүдтэй бодит хугацааны турш харьцуулах боломжтой.

15

МИНАЙОН секвенаторын хэрэглээ

Эбола вирусын генотипийг газар дээр нь тодорхойлсон.Ургийн гажгийн нэг хувилбар болон хромосомын мутацийг илрүүлсэн.Хүнсээр дамждаг өвчин үүсгэгчийн төрөл зүйлийг газар дээр нь тодорхойлсон.Хөрсний микробийн найрлагыг тогтоох гэх мэтээр ашиглаж чадсан. 1

6

ХЭРЭГЛЭЭНИЙ ДАВУУ ТАЛ

Ноцтой өвчин үүсгэгчийг нэг улсаас нөгөө улсруу тээвэрлэхгүй байх боломжтой.Мөн судалгааны материал тээвэрлэлтийн орчноос хамаарч өөрчлөлтөнд орохгүй.Газар дээр шинжлэх нь хугацаа алдахгүй гэх мэт. 1

7

ОКСФОРД НАНОПОРЕ байгууллага

PromethION

GridION

18

БЭРХШЭЭЛ БОЛОН ШИЙДВЭРЛЭХ АРГА ЗАМ

Хэдэн зуун нано сувгаар урт гинжин молекулууд зэрэг дамжин өнгөрдөг болохоор алдаа гарах магадлалтай. Гэхдээ алдааг засах, багасгах тал дээр нанопоре хамтын нийгэмлэгийн гишүүд, судлаач нар цаг тухайд нь нягт хамтын ажиллагаа явуулдаг.

19

ДҮГНЭЛТ

Анхаарал хандуулсанд баярлалаа! 20