afghanistan polio eradication initiative

Afghanistan Polio Eradication Initiative

Surveillance Update Week 21

(Ending on Saturday 24 May 2008)

National Surveillance Office

May 27, 2008

AFP Case Classification Afghanistan 2008

Data up to 24 May 08

Year 2008

Reported AFP cases 508

Confirmed 7

Compatible 0

Discarded 415

Pending 86*

*68 Adequate AFP cases pending lab results

04 Inadequate AFP cases pending 60 days follow up and lab results

11 Inadequate AFP cases pending 60 days

3 Pending ERC

$

$

$

#

##

#

Recent NSL1 from, Maywand District of Kandahar Province, onset is 07 Mar, age 14m, 17 OPV doses

Recent NSL3 from, Shahwalikot District of Kandahar Province, onset is 25 Apr, age 12m, 0 OPV doses

NSL1=04NSL3=03Comp=0

2008

Confirmed polio cases & Compatibles Afghanistan 06-08

NSL1NSL3Compatible

$

$

#

#

#

#

##

#

#

#

#

#

##

#

#

#

#

#

# #

#

#

#

#

#

###

#

%% %

%

%

%

%

2006



2007


%

%

$$ $

$$ $

$

$ $$

$

##

#

## #

2007

NSL1=06

NSL3=11

$$

#

#

####

### ####

###

###

##

##

#

##

# ###

$

$

#

#

$$$$$

$$ $

$$ $

$$$$

$

$

$

####

#######

##

###

####

#

#

### #

######

#

#

##

#

######

##

2004

NSL1= 2

NSL3= 2

NSL1

NSL3

1999

NSL1= 45

NSL3= 18

P1 & P3 Poliovirus Isolates Afghanistan 1999, 04, 06-08

2006

NSL1=29

NSL3= 2

NSL1=04

NSL3=03


$

$

$

#

##

#

$

$$

$

$

$

$$

$$

$

##

##

##

Afghanistan & Pakistan P1 isolatesby genetic cluster Jul-07 to May 08

Cluster A-3A

Cluster B-4A

22 Dec Khayber

21 Dec Mardan

19 Dec Mardan

11 Nov Kilaabdullah

25 Dec Sangin

19 Dec Nahrisaraj


Cluster A-3D

11 Sep Kambar`

30 Sep Kambar

21 Nov Waziristan-S

07 Aug Thatta

23 Nov Lasbela

01 Jan 08 Nawabsha

25 Feb Shikarpoor

06 Apr Nferoz

09 Apr Jacobabad

10 Feb 08 Balab uluk

07 Mar-08 Maywand

12 Jan 08 Nadi Ali

20 Jan 08 Nadali

05 April 08Mir pur khas

25 Jan 08 Haidrabad

01 April -08Khinorth

23 Apr Dadu

Afghanistan & Pakistan P3 isolatesby genetic cluster July-07 to May 08 Cluster B-1C 2007

21 Jul Sangin

28 Jul Garmser

05 Sep Panjwai

16 Sep Washer

19 Dec Maywand

10 Jul Panjwai

01 Aug Kandahar

17 Sep Nadali

16 Sep DGKhan

29 Sep Kambar

26 Oct Loralai

07 Nov Naway-Barakzyi

26 Nov Pishin

24 Oct Nawzad

Cluster B-1C 2008


09 Feb Maywand

15 Apr Balabuluk

15 Apr Shah Wali Kot

27 Apr Nowshera

0

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10Ja

nF

ebM

arA

prM

ayJu

nJu

lA

ug Sep

Oct

Nov

Dec

Jan

Feb

Mar

Apr

May

Jun

Jul

Aug Sep

Oct

Nov

Dec

Jan

Feb

Mar

Apr

May

Jun

Jul

Aug Sep

Oct

Nov

Dec

Jan

Feb

Mar

Apr

May

Jun

Jul

Aug Sep

Oct

Nov

Dec

No

of c

ases

Polio Virus Isolates By Type & Month, Afghanistan 05-08

2005

tOPV mOPV1 mOPV3 sNID NID

2006 2007 2008

Short interval additional dose

NSL1

NSL3 Data up to 24 May 08

List Of Confirmed Polio Cases Afghanistan 2008

No Epid Donset Province District Prog Fever Asym Age Routine NIDsDlast Dstool Dstool

Hcase LabR ClusterOPV 1 2

1 AFG/08/08/001 12-01-08 HILMAND NAD ALI Y Y N 28 0 3 28-10-07 15-01-08 16-01-08 YES NSL1 A3A

2 AFG/08/08/005 20-01-08 HILMAND NAD ALI Y Y N 11 0 1 20-09-07 25-01-08 26-01-08 No NSL1 A-3A

3 AFG/08/08/012 09-02-08 KANDAHAR MAYWAND Y Y Y 84 0 15 No date 14-02-08 15-02-08 No NSL3 B1C

4 AFG/03/08/012 10-02-08 FARAH BALABULUK Y Y N 26 0 02 22-04-07 20-02-08 21-02-08 No NSL1 A3A

5 AFG/08/08/027 07-03-08 KANDAHAR MAYWAND Y Y Y 14 5 12 09-03-08 13-03-08 14-03-08 YES NSL1 A3A

6 AFG/03/08/041 15-04-08 FARAH BALABULUK Y Y Y 16 0 12 13-04-08 18-04-08 19-04-08 YES NSL3

7 AFG/08/08/045 25-04-08 KANDAHARSHAHWALIKO

TY Y N 12 0 0 No date 30-04-08 Died No NSL3


Regional Reference Lab Update Afghanistan-2008


Month of onset CasesCases under process

Negative cases

NPEV positive

NPEV %Within 28

days

Positive cases

Culture ITD Wild Vaccine

Jan 97 0 0 79 10 10% 100% 2 7Feb 112 0 0 88 14 13% 100% 2 8Mar 115 0 0 74 14 12% 100% 1 26Apr

29 0 0 22 4 14% 100% 0 3Week 1

Apr33 1 0 21 7 21% 97% 0 7

Week 2Apr

27 0 0 16 8 30% 100% 1 2Week 3

Apr32 3 0 21 8 25% 91% 0 0

Week 4Apr total 121 4 0 80 27 22% 97% 1 12

May25 13 0 8 4 16% 48% 0 0

Week 1May

27 27 - - - - - - -Week 2May

8 8 - - - - - - -Week 3

May total 60 48 0 8 4 7% 20% 0 0

Total AFP cases

505 52 0 329 69 14% 90% 6 53 (10.49 %)

Contacts 275 39 0 168 44 16% 86% 3 21 (7.63 %)

AFP Cases Pending ERC, Afghanistan 2008


EPID DONSET District Province Sex Age DosesDstool2

(or 1)Asym Progress Fever

Lab result

60d follow up result

Provisional Diagnosis

AFG/01/08/034 12-02-08 ISHKAMISH TAKHAR F 18 11 28-02-08 YES YES YES NVI DIED Hemiplegia

AFG/03/08/018 02-03-08 KUSHK HIRAT F 38 14 18-03-08 YES YES YES EVRES

WEAKHemiplegia

AFG/01/08/056 20-02-08 KUNDUZ KUNDUZ M 52 10 02-04-08 NO YES . NVIRES

WEAK GBS

AFG/05/08/084 07-03-08 SHEKH ALI PARWAN M 22 11 17-04-08 NO YES YES NVIRES

WEAKMeningitis

AFP Cases Labeled As Hot & Pending in Lab, Afghanistan 2008

Hot by criteria=AFP cases have (Fever + rapid progress+ Asymmetric paralysis + Age <48 month)

* UP= Under Process in the Lab Data up to 24 May 08

EPID DONSET District Province Sex Age DosesDate of

last OPVDstool2 (or 1)

Hot by field

Hot by criteria

Lab result

AFG/12/08/014 29-04-08 SHAHRI BUZURG BADAKHSHAN F 24 6 15-04-08 07-05-08 YES YES UP

AFG/08/08/051 08-05-08 SHAMULZAYI ZABUL M 10 9 15-04-08 11-05-08 YES YES UP

AFG/07/08/035 05-05-08 SABARI KHOST M 10 8 14-04-08 15-05-08 YES YES UP

AFG/01/08/083 13-05-08 DUSHI BAGHLHAN M 18 16 14-04-08 14-05-08 YES YES UP

AFG/05/08/105 05-05-08 BAMYAN BAMYAN M 9 8 10-03-08 14-05-08 YES YES UP

AFG/05/08/106 11-05-08 PANJAB BAMYAN M 26 10 13-04-08 17-05-08 YES YES UP

AFG/07/08/036 08-05-08 DAND WA PATAN PAKTYA M 36 24 14-04-08 14-05-08 YES NO L20B

AFG/08/08/056 16-05-08 KANDAHAR KANDAHAR F 54 16 13-04-08 19-05-08 YES NO UP

Reported AFP Cases, Comparison By Month, Afghanistan 06-08

@ of 2/100,0000 <15 year

@ of 1/100,0000 <15 year

0102030405060708090

100110120

Jan

Feb

Mar

Ap

rM

ay Jun

Jul

Au

gS

ep Oct

Nov

Dec

Jan

Feb

Mar

Ap

rM

ay Jun

Jul

Au

gS

ep Oct

Nov

Dec

Jan

Feb

Mar

Ap

rM

ay Jun

Jul

Au

gS

ep Oct

Nov

Dec

Nu

mb

er o

f ca

ses

2006 2007 2008


AFP Cases By Week Of Onset Afghanistan 2008

Week (Sun-Sat)

Expected 2= Two cases/100,000 <15 yrs Good AFP= GBS or T. Myelitis, T. Neuritis


Region

AFP Cases 2008Week Number

10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21

Expect “2”

Reported

Good A

FP

08-Mar

15-Mar

23-Mar

30-Mar

05-Ap

r

12-Ap

r

19-Ap

r

29-Ap

r

03-May

10-May

17-May

18-May

Badakhshan 10 15 3 1 0 2 3 0 0 0 0 1 0 1 0

Central 62 110 41 10 4 4 7 4 7 7 2 6 5 5 0

Eastern 29 70 25 6 3 2 1 5 2 4 3 3 4 7 0

Kunduz 38 85 30 5 3 5 4 5 4 3 2 5 2 3 0

Northern 46 67 20 3 5 6 0 4 3 3 5 3 2 1 0

South East 34 37 11 0 0 3 5 1 4 2 1 4 2 1 0

Southern 57 56 16 3 2 1 1 6 3 3 3 0 5 3 0

Western 54 68 9 2 2 0 8 5 10 5 5 5 7 3 0

Afghanistan 329 508 155 30 19 23 29 30 33 27 21 27 27 24 0

Population Density Map Afghanistan 2008

#

#

#

#

#

##

#

#

#

#

#

##

## ##

##

#

#

###

##

##

##

##

##

#

#

##

##

#

##

##

#

##

###

#

#

###

#

#

## #

#

#

##

##

#

#

#

#

##

## #

#

###

# #

##

#

####

#

#

##

#

#### #

# # ###

#

##

#

#

#

#

##

###

###

#

# #

#

#

#

##

###

##

# #

## ##

###

#

#

#

##

#

##

#

#

## ##

#

##

#

#

## #

###

#

##

###

# ## ##

####

#

#

##

#

##

#

###

##

# ###

#

#

##

#

#

#

#

#

#

#

#

#

#

#

#

####

## ##

## ##

#

#

#

###

##

#

###

### ###

##

##

#

###

#

#

#

#

##

##

#

###

#

#

#

#

##

#

#

#

#

#

########

#

#

##

#

#

#

#

##

#

##

####

## #

# ### #

#

#

#

###

#

##

##

#

# #

## ##

##

#

##

##########

#

#####

#

##

#

###

#

###

# ####

## ##

#

####

#

#

#

#

##

#

#

#

##

##

##

#

##

##

#

#

#

#

##

#

#

###

#

#

#

#

#

##

###

#

#

#

###

#

####

#

###

## #### ##

#

#

####

####

##

###

# #### ##

## #

#

###

####

### ##

#

#

########

##

# ## #

#

##

####

##

############################

#####################

##############################################################################

###########################################################################################################################

################

#################################################

######################################

###################################################################

#############

#######################

#################################

#####################################################################################################

#############

###################################

####################################################################################################################

##

#

#

##

### #

##

#

##

##

#

# #

#

##

#

#

#

#

##

#

### #

#

#

#

#

###

##

## #

## ###

#

##

##

#

#

#

#

##

# #

#

#

##

#

#

##

##

# ####

#

#

##

## #

#

##

#

##

##

##

##

#

#

##

##

#

## ###

# ###

#

# ###

##

#

#

#

#

#

##

#

#

#

#

##

##

##

#

##

#

#

#

# #

### #

#

#

## #

##

#

#######

#

##

# #

##

# #

#

##

#

##

#

## ###

# ### #### ### ###

##

#

###

##

#### ##

###

#

##

#

# #

##

##

# ##

##

## #

##

##

#

#

## ### ##

##

##

####

# ##

#

# #

#

# #

#

#

#

##

#

##

#

#

#

#

##

#

#

##

# ##

##

#

#

#

#

##

#

##

#

##

# ##

#

##

# ###

#

# ###

# # ###

#

##

###

# #

#

#

##

#

##

#

##

###

#

#

#

#

#

#

##

##

##

#

#

#####

###

###

#

#

###

#

##

#

####

#

#

# #

##

##

##### ###

# ####

#

#

# ## ##

#

## #

#

#

#

#

#

##

#

##

##

#

####

##

##

#

#

#

#

####

###

#

#

#

##

# ##

#

###

#

##

## ##

#

### #

#

##

######

### ## ############

### #

########

#####

#

#

#

# ######

####

#####

####

## ####### ##

######

# ##

#### #### ##### ###### ## ## #### ####

#### ####

# ##########

# ########### ########

#######

#######

###############

########### # ##

#

##

#

#

### ##

#

#

# ###

#

#

#

## ## ####

###### ###

# ##########

# ####### ## #### #

########

# ## #### ## #### #

##

#

#

#

####

###

####

#

#

#### ##

#

##

# ##

#

###

#

#

#

#

#

###

#

#

##

## ######

##

##

##### ##

# ######### ###

#####

###

# ##### #####

##

####

####

###

##

######

##########

###

#######

#########

###

##

##

####

## ####

##

######

##

####

#######

###########

####

###

###

####

##

### #

##

# #

#

# ###

#

#

##

#

#

#

## #####

# ##### ##### ##

##

###

# ## #####

#

## ## #

##

#

##

##

###

####

## ### ##

###

####### ############ ##

###### ############### ##### ## ######### ###

##### ###### ######

######

#######

## ##### ###### ######### ###########

##### #

###

### #### ##

### ##

# ## ###

####

#

###

#

## #

#

####

## ##

##

# ##### #### #### ######## ##### #

###

#####

#

### #####

################################################################################### ####################

###

#

#

#

#####

##

#

######

##

#####

#

##

##

##

#

##

### ##

####

######

###

###

#

########

####

#########################################################################

#

#

##

# #####

# ##

# ### ### ## ### ###

#

##

###### ## ####

#

# #

#

#

# #

##

## ##

###

## # #

# #

#

# ###

## ## ### #

## #

#

# ####

##

# ### #

#

##### #

### ### #

#########

##

#

##

###

####

###

##

#

####

#

#

##

##

#

##

#

### #

#

#

#

##

##

######### ###

#

########

###

####

###

##

### #

#

## #####

##

####### ############

##

######

#

########## ###########

#

#### ####

############# #####

#############

###

##########

##

###

#

###

# ##

#

############## ###

# #

#

########

#######

#

#####

####

######

#####

########

###

#######

#

########

## ######

### #

##########

#######

# ######

######

################

####

#

## #####

##

####

##

#

#########

##

## ### ##

##

##

# ##

#####

#

##

#

##### #

#######

## ## #################

#

####

#

#

########

###### ##

####

#

####

# ###

####

####

##

#

# ######## ######

#######

#############

##########

# ####### ## ##

##

###########

#

# ###

#

#

#

#######

###

#####

###

## ######

#### ##

#### ######

#

## #

######## #####

######

############

### ####

# ####### #######

### #####

#

###

#

#

######

####

## #####

## ######

###

# ### ## #

##

###

### #

##

# #

#####

#

#

##

#####

######################

#######

# ###

#

#

#

####### ####

########### ### ####

####

#

#

##

#######

#

###

##

#

####

######## #####

######

# ###

## ##

######### ##

##

### #####

# #

###### ###

# ######

#

## ### ########

#

###

#######

####### #

##########

#

####

####

######## ######################

# ## ##########

#

#####

######

###########

####

######

####

# ###

#

#

####

#######

# ###

### ######

##

## #

######

#######

###

### #####

#########

#

##

##

####

#

####

###

####

# #########

##

#

#

#

# ###

#

########

########

######

## ##

##################

####

###

##

###

##

#############

####

#

###

#

###

#

#

####

## #

###

######

###

#######

#####

####

#

# ## #####

##

# #

###

##

# ######## ##

###

##

#

# #

#

###########

###

# ######

#### #########

#######

# ############

### ############# #######

##

#####

######### ##### #

#########

## ############## #####

#######

################## ###

##

# ### #

###########

## ###############

#######

#####

####### #

# ###

# ### ###

############ #####

############## ### ###

###

### # ##

#### ### # ###

# ######

###

# ##

### #

##

# ##

#

#####

##

#

###########

# ###

###

####

##

### ###

###############

#

#

#

###

#

### #

##

#

#

### #

#

###

#

####

#

#

#

#

##

#

#

#

#

#

#

####

#########################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################################

#

#

#

#

##

# ## ##### ##

#################

###

####

# ##

####

########

#

###

###

##############

## #

# ###

#

# #########

################

##

#####

#

#

#

#

#

#

##

##

#

#

#

#

#

##

###

##

###

#

##

#

##

######

# ##

## #

## ### ##

####

######

##

##

# ####

####

#

######

###

###

##

##

##

#### ############

### ##### ######### ###### #

#####

#### #####

##

#

# ##

#

##

#

#

##

######

#

####

####

#

#

#

##

##

#

#

##

#

####

####

###

#

##

###

#

##

#####

#

# ## ##

#

#

###

##

##

#

##

#

##########

#

##########

#

#

##

# #

## #####

######

####

####

#### ##

##

### ###

### #####

### ## ###

##

#

#

#

##

#

#

##

##

## ##

##

####

#

#

#####

#######

#

##

#

###

##

####

#

## ##

#

##

##

#######

######

##

#

#### ##

###

#

# #

####

#

#

####

###

#

##

## ####

#

#

#

#

##

##

#######

# #

# ##

#

#

#####

#

#

####

#

#

###

########

## ##

#

###

#####

#

## ##

#

# ###

##

##

# #

#

#

#

#

##

#

##

##

#

###

###

##

#### #

#

##

#

##

#

#

#####

#

#

##

## ##

#

#

### #######

####

#

###

###

#

#

#

##

##

#

#

#

## #

#

#

#

#

##

#

#

##

#

#

#

####

#

###

###

#

### ###

#

#

#

#

#

#

# #

#### #####

#

#### #

##

#

##

# ###

#

### ######## #####

#####

##

# # ##

####### ##

##

##

###

#

#####

# ##

#

#####

#########

#

## # ##

#

##

##

####

##

##

#

#

#

###

#

###

##

##

##

####

##

##

#

##

#

###

##

####

#

#

## #

#

# ###############

#

# ##

###################

########## ###### ###########

#####

#

#

#

#

#

#

#

##

######

###

######

##

#

###

# #

###

###

####

# ######

#

##

##

#

####

#

#

#

##

#

#

## ### #

#

##

######

##

#

##

##

# ###########

#

#

##

###

#

#

##

###

#

#

#

#

##

#

#

#

#

#

#

#

#

#

##

##

#

#

#

#

#

##

####

###

#

###

###

###

#

##

#

#

#

##

#

#

##

###

#

##

###

# ## ## #

#

#

##

#

##

#

#

## ## # # ## ## #

###

##

#

##

# #

#

#

#

#

##

#

##

##

##

#

#

###

##

#

#

#

#

# #

##

##

###

##

##

##

##

##

## #

#

##

#

#

####

#

## #

#

#

#

#

#

# #

#

# #

####

# ## #

#

##

####

#

##

##

#

#

##

#

#

## #

#

#

#

#

#

##

## #

# ## #####

#

#

### #

#

#

#

###

#

## ##

#

#

##

#

##

##

####

#

#

##

#

#

###

#

#

## ##

#

### #

#

## ##

#

#

#

#

#

## ##

##

###

## ## ###

#

#

###

##

#

###

###

####

#

##

#

#

#

#

#

#

###

#

#

#

# ##

#

## #

##

#

#

#

##

#

##

#

##

##

##

#

#

####

#

###

#

# #

###

##

#

#

##

#

### #

###

## #

Hirat

Farah

Ghor

HilmandNimroz Kandahar

Badakhshan

Uruzgan Ghazni

Balkh

Zabul

Faryab

Paktika

Baghlan

Badghis

Sari Pul

Takhar

Bamyan

Jawzjan

Parwan

Wardak

Nuristan

Samangan

Kunduz

Paktya

KunarKabul

Nangarhar

Khost

Pakistan

Uzbakistan

Turkmanistan

Iran

Tajikistan

China

Dot=10 Persons/Sq Km

Non-Polio AFP Rate by Province, Afghanistan per 100,000 under 15 years

2008

2007

2006

0-0.991-23-45+


0

10

20

30

40

50

60

70

80

90

100

Badak

hshan

Centra

lEas

t

North

East

North

South

east

South

Wes

tAFG

Per

cen

tage

Y06 Y07 Y08

% of AFP cases reported within 7 days of paralysis onset by region Afghanistan 06-08


Proportion Of Adequate Stools By Region Afghanistan 06-08

0

10

20

30

40

50

60

70

80

90

100

Badak

hsha

n

Centr

alEas

t

North

East

North

South

east

South

ern

Wes

t

Nation

al

Per

cent

age

2006 2007 2008


0102030405060708090

100

Badak

hshan

Centr

al

Easte

rn

North

East

North

ern

South

easte

rn

South

ern

Wes

tern

Natio

nal

2006 2007 2008

AFP Cases with Stool Specimen Reaching The RRL Within 3 and 7 Days of 2nd Specimen Collection By Region, Afghanistan 06-08

Within 3 days

Within 7 days

0102030405060708090

100

Badak

hshan

Centr

al

Easte

rn

North

East

North

ern

South

easte

rn

South

ern

Wes

tern

Natio

nal

2006 2007 2008


0

2

4

6

8

10

12

14

16

18

Badak

hshan

Centra

l

Easte

rn

North

Easth

ern

North

ern

South

Easte

rn

South

ern

Wes

tern

Natio

nal

Pe

rce

nta

ge

Y06 Y07 Y08

Percentage of Entero -Virus and SL isolation Afghanistan 06-08

0

5

10

15

20

25

30

35

Badak

hshan

Centra

l

Easte

rn

North

Easth

ern

North

ern

South

Easte

rn

South

ern

Wes

tern

Natio

nal

Pe

rce

nta

ge

Y06 Y07 Y08

Entero Virus

SL

Per

cent

age

0

5

10

15

20

25

30

35

40

45

Jan Feb Mar Apr May Jun Jul Aug Sep Oct Nov Dec

Y06 Y07 Y08

EV % by month 06-08


afghanistan polio eradication initiative

Documents

region afghanistan

days data

inadequate afp cases

week of onset afghanistan

sl isolation afghanistan

nonpolio afp rate

hot pending

days of paralysis onset