absolute proteome analysis of colorectal

7/23/2019 Absolute Proteome Analysis of Colorectal

1/42

Subscriber access provided by FLORIDA ATLANTIC UNIV

Journal of Proteome Research is published by the American Chemical Society. 1155Sixteenth Street N.W., Washington, DC 20036Published by American Chemical Society. Copyright American Chemical Society.

However, no copyright claim is made to original U.S. Government works, or worksproduced by employees of any Commonwealth realm Crown government in the courseof their duties.

Article

Absolute proteome analysis of colorectal mucosa,

adenoma and cancer reveals drastic changes in fattyacid metabolism and plasma membrane transporters

Jacek R Wi#niewski, Kamila Dus-Szachniewicz, PawelOstasiewicz, Piotr Ziolkowski, Dariusz Rakus, and Matthias Mann

J. Proteome Res., Just Accepted Manuscript DOI: 10.1021/acs.jproteome.5b00523 Publication Date (Web): 06 Aug 2015

Downloaded from http://pubs.acs.org on August 11, 2015

Just Accepted

Just Accepted manuscripts have been peer-reviewed and accepted for publication. They are postedonline prior to technical editing, formatting for publication and author proofing. The American ChemicalSociety provides Just Accepted as a free service to the research community to expedite the

dissemination of scientific material as soon as possible after acceptance. Just Accepted manuscriptsappear in full in PDF format accompanied by an HTML abstract. Just Accepted manuscripts have been

fully peer reviewed, but should not be considered the official version of record. They are accessible to allreaders and citable by the Digital Object Identifier (DOI). Just Accepted is an optional service offeredto authors. Therefore, the Just Accepted Web site may not include all articles that will be published

in the journal. After a manuscript is technically edited and formatted, it will be removed from the JustAccepted Web site and published as an ASAP article. Note that technical editing may introduce minor

changes to the manuscript text and/or graphics which could affect content, and all legal disclaimersand ethical guidelines that apply to the journal pertain. ACS cannot be held responsible for errors

or consequences arising from the use of information contained in these Just Accepted manuscripts.


2/42

1

A ,

R : A

J . 1*

, K D1,2

, , 2,

D 3

1

1D P S T, MPI B, A

K 18, 82152 M, G

2D P, W M U, 50368 W, P

3D A M P, W U, 50205 W, P

*C

KED: C / A / E / M / FFPE

/ Q / FASP/ A / T

ge 1 of 41

ACS Paragon Plus Environment

Journal of Proteome Research


3/42

2

A:

C . I , ,

. ,

8,100

( . ID

22968445). H

(), (A) (C). A

10,000 . B

A 23% , 17.8% A C 21.6% C.

, , A

C .

, ,

,

, DA .

C , ,

.

Page 2




4/42

3

IDCI

H

E1. I 2012 446,800 214,700 40 E

.C

, ,

2. C

50 . T

, 10 20 , 5% ,

3. T ,

,

, 4.

T

PCR ,

. C RNA

37 31

5, RNA 248

, 96 152

. G ,

, . I , DNA 6,

RNA 7,

8

.

M 70

9,10

, S,

, , 53 DNA 1113

. I 2007 V

140

11 14

.

ge 3 of 41




5/42

4

A

,

, . T ,

( .15

), ,

(N), (A), (C). I 2012

8,100 ,

(FFPE) 16

. O

1,700

. V ,

,

7,526 90 17

, ,

. A

18

,

30 ,

N A (212 4,325 ),

.

I ,

, ()

. W 16

8

. W 10,900

8,500 . E 2,000

N A, C A, C N. W

,

, .

Page 4




6/42

5

AEIA AD EHD

F . A 2 3

D P W M U. A

(N. KB598/2011/).

.T L P C (LPC)

PALM I (Z, G, G) 0.1 M THC,

H 8.0, 0.1 M DTT, 0.5% (/) 20,000 4% SDS 99 C 1

19

20

.

D .P

21

.

.D

MEDFASP

LC 22

30 (C N. MRCF0R030, M)23

.

P LC 4 2 SAX , .

C/ .P C18 (20 , 75

, RSP C18AQ 1.8 (D. M GH,

AE, G) 530% B (80%

ACN 0.5% ) 250 / 195 . T 10

30 60% B, 95% B

A. P Q E

50,000 / 200

( 256 ). U 10 2

1.6 T HCD24

25. T

ge 5 of 41




7/42


8/42

7

6.5 DNA 2

30

:

W NA A . T M E. T LCMS/MS

3133

. P LFQ P (://.

./).

E

I 10,900 ,

,

T (N), (A), (C)

, 8

N C 16 A (F 1A)(I 1). W

,

. F 250 ,

FFPEFASP LC 34

.

T 23.9 4.4 . T ,

LC 4 2

, . P LCMS/MS Q E

(F 1A). T 32 . I , 145,000

10,900 F D R

(FDR) 1% (I 2). P N, A, C

MQ (LFQ)27

. P

T P A16

P R 30

. I 9,70010,500 (F

ge 7 of 41




9/42

8

1B) 97.4% ( F 1C). R,

75 % . T

7 , 95%

10,000 (F 1D). P

(CEA),

(TP53, KRAS APC), .

A 8,237 75% , N, A,

C, . P

(PCA) , A C

2 PCA, (F 2A).

T . I

2300, 1780, 2161 (P


10/42

9

T 40% N, A,

C

. T ,

(N) (C)

(


11/42

10

T

. M 24 N A

A C (F 3C). A L A/C B.

T NUP107 A C

100,000 . T HL

36

. I,

A C.

T HMG ,

. U

37

. O

(F 3C). O HMGA2

38

100

, .

T

, ,

, , (SI T 5). B

.

E

I F 4 ,

. T

N, A C

.

S

39

. DNA ORC

Page 10




12/42

11

. T

ORC2, ORC3, ORC4 ORC5, ORC1 ORC6 (40

). W

ORC1, ORC2, ORC3 ORC5 N

C , , ORC5 ORC6

(F 4A).

I , ORC ,

DNA. O ,

. T DNA DNA

. P

1 DNA

DNA (PPAP),

,

. I ,

41

. O

DNA . W

.

T (MCM)

MCM2MCM7, (RFC1RCF5),

DNA A (RPA1RPA3). T

, , ,

. T

, DNA . I

,

PCNA RCF . C

.

I , 36 , 23

, 95 % 36

. T,

ge 11 of 41




13/42

12

.

C

I

. I

RNA. T RNA 1 45S

RNA, RNA P 2 RNA,

RNA 3 RNA, RNA 5S RNA. E

. O 50

(F 5). M

. O

(F 5AC) (F 5D).

T ,

. T II 4.69.210

4 0.61.210

5

. T 16

35

HL 42

. T 2

1 3. T

15,000, 65,000, 10,000

P I, II, III HL 43,44

.

I ,

2 3 (GTF2 GTF3) (F 5E). T GTF2

12 105 610

4 GTF3. T

(TAF) . T TATA

2N (TAF15) , 0.51105 ,

Page 12




14/42

13

TATA (TBP) 2,0008000

. T HL 42

.

A

A

45,46

. T , W 47

,

4850

.

I , C,

C N,

(PGK) (F 6A). M

NA AC , ,

.

P RNA A

N C51

. I ,

A C (F 6A). W

A N. I

, , (PFK),

A. E, A

NC

.

O N C

A HK, ,

52

. O

C , GLUT1 (SLC2A1),

C N (F 6A). T

GLUT1 53

.

ge 13 of 41




15/42

14

D ,

1,6 (FBP), ,

W 5459

. I

FBP C N (F 6A). H,

FBP A PFK,

FBP . T, FBP

.

T

(PCK),

. T PCK C N

A (F 6A). T PCK 49

. W PCK

, , ,

.

A

, 60,61

. I

CC2

62,63.O , ,

(A C) ( F 6B)

(F 6B). H, , (PYGB

PYGL), C. T

62,63

.

Page 14




16/42

15

G, ,

(PPP) ,

NADPH,

. PPP /

PPP 6 (G6PD), (TKT)

(TALDO)

64,65

. O C

. W

NADPH (G6PD)

(TKT TALDO) (F 6C).

T G6PD, PPP, C A (F

6C). I , PPP A C, ,

N.

T K

ACA

, , CA. A, K

NADH. O

(OXPHOS) K NADH

ATP ADP.

A K OXPHOS C ACA,

,

(F 6 D E). P C K

2 ACO66, SDH67

1 IDH68

. U HCT116 , ,

ATP ( V OXPHOS)69

. C ,

, ACO, IDH SDH (SDH

ge 15 of 41




17/42

16

SCA SUCL) (F 6E) V (F 6G),

OXPHOS C N (F

6G). T OXPHOS A, II (

) N (F 6G). T OXPHOS

N A . U,

K ,

(ACO, IDH, SDH ), A N (F 6E).

I K

ATP 70,71,72

.

I , , SLC7A5,

C N A (F 8). C,

, K ,

(F 6F). F ,

C.

F

I

(FA) / . I

, FA

, , 73

. O

FA NA

C (F 7).

C FA CA FA (FABP)

FABP. F FABP A C, 6

A C (F 7A). T

FABP

74

.

Page 16




18/42

17

A FA CA

. A FACA , (ACSL),

C, , ACSL4 (F 7B).

T ACSL4 A75

. I

, , 5

1 3 .

T FA . I

FA 16

FA . I 33

(

),

. I ,

(F 7D E). T

N A (F 7D). T

FACA FA

CA FA (F 7C).

T ,

, FA 3 (G3P) , . W

(F 7F) C (F 7G). T G3P

.

F, FA A C,

ATP (ACLY), CA (ACC), (FASN) , FACA, (ACSL) FA (SDC) (F 7B H). I ,

,

73

.

ge 17 of 41




19/42

18

I 100 ,

, , , ( 1). O , 27

N C, A C, N C (F 8).

I , (SLC2A1 SLC5A1)

(SLC3A2, SLC7A1, SCLC7A5),

. T

(W 47

).

E /

. T (SLC27A2 SLC27A4)

A, C N. T

( ).

T

N, A C (F 8). I , 1 (ABCB1)

1 (ABCC1) ,

ABCC3 ,

C.

A ,

(F 8). I ,

. T N (SLC5A6),

, . B

. P CA ,

. T

.

Page 18




20/42

19

DICI

I ,

. I

, 15

17

. A

16

76

.

I , 1,800

16

. T

2,100 N C. N, 1,148

, , F 2. I ,

16

4 (NHF4A), 4 (TOMM34)

SRC (SRC). T

3,899 , 90

17

.

I ,

, , . C

16 2,300

(A/C ) (A/N

). T ,

, . A ,

30 212

18

. N,

, . T

9

ge 19 of 41




21/42

20

. T

N A

. W U .18

,

(OFFGEL) 8 TRAQ ,

, ,

MED FASPSAX, . C,

.

W ,

. C

.F ,

, ,

. I

. N,

. W 1,780

429

. T

.

A ,

. I

,

,

.

S

,

Page 20




22/42

21

. F ,

( ALDOA, GAPDH, ENO1 PKM2) W

( 15

)

50

. O , ,

,

SLC2A1. T

PDH

ACA

ACA H2O CO2 (K OXPHOS).

I, K OXPHOS

,

, ,

.

I

I, ://../".

I (I) 1:S ,

. I 2: L

. I 3:S LFQ . I 4: T P

. I 5: P KEGG

P . T

PX C77 PRIDE

PXD002137.

AH IFAI

ge 21 of 41




23/42

22

*A: B P G, D P S T,

MPI B, A K 18, D82152 M, G. T.:

+49 89 8578 2205. E: @...

T .

ACKEDGEE

W K M K Z

. T MP S A

S P N C S (DEC2011/01/N/NZ5/04253).

Page 22




24/42

23

A: A, A; ABCB1, M 1; ABCC1, M

1; ABCC3, ABCC3 ; ACC, ACA ; AC, ATP

; AC63, A 2; AC, F CA ; AC, F CA ;

ADA, F A; , ; AC,

A ; BA, B ; C, C; CEA,

C ; CC, C C; , ; D,

D; E1, A; FAB, F ; FA, F ;

FA, F ; FB, F1,6; FD, F D R; FFE

, F F P E ; G3, G3; G6D,

G6 ; GADH, G3 ;

G1 (C2A1),G 1; GF2, G

2; GF3, G 3; HCD, H C D;

HG , H ; HGA2,,H HMGIC;

IDH65, I 1; , ; C , L C

; C/, L CT M S; F, L

Q; C, L P C; C, M M; C2,

M 2; C7, M

2; EDFA, M DF A S P;/, T M S; , N ; ADH, N

( ); ADH, N

; HF4A, H 4; 107, N N107;

C1C6, O , 16; H, O P;

53; CA, P C A; CK,

P ; CA, P ; C,

P C R; FK, P; GK, P ; K2,P ; D1, DNA ; E, DNA

A; , P P P; GB, G ,

; G, G , ; FC1CF5, H

; A1A3, S DNA A;

ge 23 of 41




25/42

24

A, S A E; DC, F ; DH64, S ;

C27A2, V CA ; C27A4, L

4; C2A1, S 2; C3A2, 4F2 ; C5A1, S

5 (/ ), 1; C5A6, N

; C7A1, H 1; C7A5, L

1; C7A5, L

1; C, SRC ; C SCA ; AF15, TATA

2N; AF, T ; AD,

T; K, T; 34, O 4;

A,T P A; 53, C 53.

(1) F, J.; SF, E.; LT, J.; R, S.; C, J. W.; C, H.; F,

D.; B, F. C E: 40 2012.

2013, 49, 13741403.

(2) F, E. R.; V, B. A . 1990, 61, 759767.

(3) C, E.; L, E.; B, F.; Z, F.; B, M. A.; M, M.; B, Z.; H, R.;

H, B.; SB, J.; T, A.; J, J.; M, G. P

( . ). 2011, 3, 334347.

(4) L, A.; C, F. A.; P, N. R.; S, R. J. T .

2002, 89, 845860.

(5) C, B.; SH, A. H.; P, C.; M, S.; T S D, J.; O, A.;

W, M.; C, W.; Y, B.; F, R. J.; M, G. A. C

,

, . 2012, 35, 5363.

(6) B, A. D.; J, A.; EB, M.; A, M.; H, S. V.; T, I. P. W

. 2013, 229,

697704.

(7) C, J.; W, S.; H, D.; D, W.; X, C.; G, H. MRNA455

RAF / . :

2014.

(8) C, Y. C.; C, Y. F. S

. 2003, 50, 19101913.

(9) N, I. R

. 2005, 33, 694697.

Page 24




26/42

25

(10) P, C. B.; S, S.; S, T.; K, W.; D, A. S. O KRAS

, , .

2005, 65, 12441250.

(11) B, W. F.; B, C. J.; B, J.; B, H. J.; E, A.; G, P.; L, F. C.; M, V.

A.; R, S. H.; S, P.; . L

5. 1987, 328, 614616.

(12) V, B.; F, E. R.; H, S. R.; K, S. E.; P, A. C.; L, M.; N, Y.;

W, R.; S, A. M.; B, J. L. G .

1988, 319, 525532.

(13) B, S. J.; F, E. R.; N, J. M.; H, S. R.; P, A. C.; J, J. M.; T, P.;

L, D. H.; B, D. F.; N, Y.; W, R.; V, B. C 17 53

. 1989, 244, 217221.

(14) W, L. D.; P, D. W.; J, S.; L, J.; S, T.; L, R. J.; S, D.; B, S. M.; B,

T.; P, J.; S, N.; S, S.; D, Z.; U, V.; N, T.; N, Y.; K, R.;

W, P. A.; K, J. S.; Z, Z.; C, R.; W, J.; D, D.; S, M.; W, J. K.;

S, S.; P, K.; P, B. H.; P, C. L.; P, P. V.; B, D. G.; S, A. B.; H,

J.; S, D. R.; S, E.; P, N.; B, P.; M, S. D.; P, G.; K, K. W.;

V, V. E.; V, B. T . 2007, 318, 11081113.

(15) J, C. R.; K, J. C.; M, G. A.; F, R. J. P :

CRC . 2010, 73, 18731895.

(16) W, J. R.; O, P.; D, K.; Z, D. F.; G, F.; M, M. E

.

2012, 8, 611.

(17) Z, B.; W, J.; W, X.; Z, J.; L, Q.; S, Z.; C, M. C.; Z, L. J.; S, K.

F.; K, S.; D, S. R.; W, S.; W, P.; K, C. R.; R, R. C.; R, H.; T, R. R.;

E, M. J.; C, S. A.; T, D. L.; C, R. J.; S, R. J.; L, D. C.; N, C. P

. 2014, 513, 382387.(18) U, A.; N, P.; S, T.; G, J.; BO, S.; S, J. W.; T, A.;

B, F.; L, E.; M, G. S

:

. & : 2014, 13, 11981218.

(19) W, J. R.; O, P.; M, M. H FASP

.

2011, 10, 30403049.

(20) W, J. R. P .

: 2013.

(21) W, J. R.; G, F. Z. F P

. 2015, 87, 41104116.

(22) W, J. R.; M, M. C

. 2012, 84, 26312637.

(23) W, J. R.; Z, D. F.; M, M. C N

. 2011,

410, 307309.

(24) O, J. V.; M, B.; L, O.; M, A.; H, S.; M, M. H C

. 2007, 4, 709712.

ge 25 of 41




27/42

26

(25) C, J.; M, M. MQ , ...

. 2008, 26, 13671372.

(26) C, J.; N, N.; M, A.; S, R. A.; O, J. V.; M, M. A: A P

S E I MQ E. 2011.

(27) C, J.; H, M. Y.; L, C. A.; P, I.; N, N.; M, M. A

, MLFQ.

& : 2014, 13, 25132526.

(28) B, Y., H, Y. C F D : A P P A

M T. 1995, 57, 289300.

(29) W, J. R.; R, D. M FASP 'T P A'

E . 2014, 109, 322331.

(30) W, J. R.; H, M. Y.; C, J.; M, M. A ' '

. & : 2014.

(31) W, J. R.; G, A.; R, D. I P E K R T

S T G G P. 2015.

(32) R, D.; G, A.; D, A.; W, J. R. A

. 2015, 14, 14001411.

(33) W, J. R.; K, H.; G, A.; R, D. A . 2015, 15, 13161325.

(34) W, J. R.; D, K.; M, M. P

10 000 . P. C 2013,

7, 225233.

(35) D, M.; M, L.; T, D. W .

2009, 54, 753762.

(36) O, A.; B, N.; I, M.; AP, A.; E, C.; K B, H.; S, L.; SM,

V.; R, O.; B, P.; L, E. A.; B, M. C :

. 2013, 9, 648.

(37) W, J. R.; S, R. H I/Y:

(). 2000, 6, 409419.

(38) S, R.; R, A.; T, M. A.; D B, J.; A, S.; F, A.; M, G.;

G, V. N HMGA .

2004, 574, 18.

(39) H, D.; W, R. A. H : . 2011, 144, 646674.

(40) V, S.; S, P.; C, M. D.; K, T. J. A

. 2001, 276, 2666626673.

(41) H, E.; T, I. R DNA .

& 2014, 24, 107113.

(42) K, H.; T, Y.; R, R. G.; C, P. R. Q RNA II

HL :

. 1999, 19, 53835392.

(43) J, D. A.; I, F. J.; M, E. M.; C, P. R. N RNA

, , HL .

1998, 9, 15231536.

(44) P, A.; J, D. A.; H, M.; W, Z.; R, R. G.; C, P. R. R

: RNA III.

1999, 18, 22412253.

Page 26




28/42

27

(45) G, R. A.; G, R. J. W ? .

2004, 4, 891899.

(46) V H, M. G.; C, L. C.; T, C. B. U W :

. 2009, 324, 10291033.

(47) W, O. O . 1956, 124, 269270.

(48) A, B.; G, K. O. G 24 .

2004, 84, 10141020.

(49) B, X.; L, Q.; F, T. W.; J, S.; Y, T.; S, H. M.; O, C. N.; C, P. Y.; E, K. W.; H, C. L.

P :

. & : 2006, 5, 11191130.

(50) R, U.; R, H.; H, J.; E, K.; S, T.; M, S.; B, S. E.; P, G.;

C, A. P.; P, C.; H, F. G. D

.

2010, 10, 194202.

(51) L, B.; X, J.; L, M.; Z, H.; C, J. A .

2006, 6, 40.

(52) P, K. C.; W, Q.; B, P. T.; M, L.; W, Z.; W, W.; C, N.; L, M.;

M, W. J.; A, E. L.; J, A. K.; S, G. A.; C, M. F.; R, R. B.; H, N. H 2

. 2013, 24, 213228.

(53) H, R. S.; R, A.; W, K. R.; P, A.; I, S. H.; B, C.; S, G.; W, A.;

B, D. E. GLUT1 :

. 1998, 83, 3440.

(54) L, X.; W, X.; Z, J.; L, E. K.; S, V. Y.; C, A. S.; Y, J.; C, F. K.; S, J. J.; J, H. C.

W : .

2010, 29, 442450.

(55) D, C.; Y, T.; W, Y.; W, Y.; F, T. W.; M, S.; L, Y.; Y, J.; S, J.; K, T.;

L, P.; S C, D.; H, M. C.; E, B. M.; Z, B. P. L FBP1 S

. 2013, 23, 316331.(56) C, M.; Z, J.; L, N.; Q, Z.; Z, M.; L, Q.; Z, J.; W, X.; S, G. P

FBP1

. 2011, 6, 25564.

(57) L, H.; W, J.; X, H.; X, R.; P, Y.; L, W.; C, J.; Z, H.; L, Y. D 1,6

2 .

2013, 12, 110.

(58) L, B.; Q, B.; L, D. S.; W, Z. E.; O, J. D.; M, L. K.; M, A.; G, T. P.; K,

B.; N, I.; S, M. C. F1,6 .

2014, 513, 251255.

(59) A, G. K. T: FBP1 . . 2014,

14, 575.

(60) P, C.; W, J.; B, J.; H, B.; V, S. P

: . 2001, 920,

7483.

(61) M, P.; D, M.; R, W. S

. 1990, 261, 195203.

(62) R, M.; Z, A.; F, J. P 58

. P

. 1981, 41, 11651170.

ge 27 of 41




29/42

28

(63) R, M.; C, G.; R, J. P.; D, E.; Z, A. P

.

1979, 39, 531534.

(64) F, W. M.; V, P.; B, K. S.; VS, H.; B, J.; C, M. E

()

. 2008, 89, 232240.

(65) L, S.; Z, M.; Z H, A.; S, W.; RB, K.; L, N.; P, J.;

T, M. P.; S, A.; W, C.; G, R.; W, F.; A, P.; S, G.; S, P.; C, J. F.

E TKTL1 : W

. 2006, 94, 578585.

(66) L, P.; H, T.; M, J. P.; J, H.; K, A.; L, V.; A, L. A. M

LOH ACO2 : .

2003, 40, 73.

(67) F, D. B.; H, S.; K, J. W.; M, N. B.; L, S. E.; C, R. J.; C, R. M.

P

. 2004, 4, 793811.

(68) B, D. R.; T, K. K.; F, K. C.; L, H. U.; F, V. R.; S, K. S.; S, D. P.;

H, A. F.; A, M.; L, H. M.; K, E. L.; C, J. W.; R, D. P.; D, V.; DS, D.; E, L. W.; Z, A. X.; I, A. J. F

(IDH)1 IDH2 .

2012, 17, 7279.

(69) SA, M.; C, M.; C, J. M. S

. 2010, 31, 567576.

(70) D, R. J.; M, A.; D, E.; N, I.; Y, M.; W, S.; T, C. B.

B :

.

2007, 104, 1934519350.

(71) D, R. J.; S, N.; D, D.; T, C. B. B :

. & 2008, 18, 5461.(72) F, J.; K, J. J.; M, R.; C, M. K.; W, E.; S, T.; R, J. D.

G ATP

. 2013, 9, 712.

(73) C, E.; S, A.; Z, R.; W, T. C.; F, R. V., J. C

. 2013, 18, 153161.

(74) G, J. F. L : A . , ,

2014.

(75) C, Y.; P, A. T.; Z, G. A.; MI, T. M.; P, S. M. I

.

2000, 97, 1128011285.

(76) N, N.; W, J. R.; G, T.; C, J.; K, M.; K, J.; P, S.; M, M. D

. 2011, 7,

548.

(77) V, J. A.; D, E. W.; W, R.; C, A.; R, F.; R, D.; D, J. A.; S, Z.;

F, T.; B, N.; B, P. A.; X, I.; E, M.; M, G.; G, L.; C, A.;

C, R. J.; K, H. J.; A, J. P.; MB, S.; A, R.; O, G. S.; M, L.;

J, A. R.; H, H. PX

. 2014, 32, 223226.

Page 28




30/42

29

ge 29 of 41




31/42

30

F

F 1. FFE , ,

.

(A)

P

, .

(B)N .

(C)P .

(D)D ( )

: CEA , TP53, KRAS, APC. C P

30.

F 2. .

(A)P .

(B)C

16

.

(C)

(J) C

N, A, C G O . >

< , , . T

.

F 3. G , .

(A)A .

(B)

P

(C)T ,

.

F 4. .

Page 30




32/42

31

S N/C, N/A C/A

.

F 5. A , ,

.S N/C, N/A C/A

.

(A)RNA P I

(B)RNA P II

(C)RNA III

(D)S RNA

(E)

G (F) T

F 6.

. S N/C, N/A C/A

. S N/C, N/A

C/A .

(A)

G G.

(B)

P P P.

(C)G

(D)P

(E) K

(F) G .

(G)O . T

. T

.

F 7. F . S N/C, N/A C/A

. I F G

ge 31 of 41




33/42

32

. DG3C, 3; TG

; G3P, 3, MAG3P, 3.

(A)C

(B)

CA

(C)C

(D)M

(E) P

(F)

T

(G)T

(H)F

F 8. C

. S N/C, N/A C/A

. T .

Page 32




34/42

33

F 1

ge 33 of 41




35/42

34

F 2

Page 34




36/42

35

F 3

ge 35 of 41




37/42

36

F 4

Page 36




38/42

37

F 5

ge 37 of 41




39/42

38

F 6

Page 38




40/42

39

F 7

ge 39 of 41




41/42

40

F 8

Page 40




42/42

C G

ge 41 of 41 Journal of Proteome Research

absolute proteome analysis of colorectal

Documents