การจัดการตัวอย าง ส งตรวจ mers-cov ... ·...

18
การจัดการตัวอยาง สงตรวจ MERS-CoV ทางหองปฏิบัติการ กรมวิทยาศาสตรการแพทย

Upload: others

Post on 30-Jun-2020

0 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Page 1: การจัดการตัวอย าง ส งตรวจ MERS-CoV ... · 2015-06-25 · ตัวอย่างจากระบบทางเดินหายใจส่วนล่าง

การจดัการตวัอยาง สงตรวจ MERS-CoV ทางหองปฏบิตักิาร

กรมวทิยาศาสตรการแพทย

Page 2: การจัดการตัวอย าง ส งตรวจ MERS-CoV ... · 2015-06-25 · ตัวอย่างจากระบบทางเดินหายใจส่วนล่าง

การเกบ็ตวัอย่าง

ผูเก็บตวัอยาง

1. หนากาก N95 ขึ้นไป2. หมวกคลุมผม3. แวนครอบตา (Goggle) 4. ชุดกาวนผาแบบคลุมเต็มตัว5. สวมถุงมือยาง 2 ชั้น

Page 3: การจัดการตัวอย าง ส งตรวจ MERS-CoV ... · 2015-06-25 · ตัวอย่างจากระบบทางเดินหายใจส่วนล่าง

12/12/2012

การเก็บตัวอยาง

ระบบทางเดินหายใจ

Page 4: การจัดการตัวอย าง ส งตรวจ MERS-CoV ... · 2015-06-25 · ตัวอย่างจากระบบทางเดินหายใจส่วนล่าง

ชนิดตวัอยางจาก ผูปวยอาการ/ระบบ ชนิดสิ�งส่งตรวจ คาํแนะนําเพิ�มเตมิ

ท า ง เ ดิ น ห า ย ใ จ

สวนลาง

the must

bronchoalveolar lavage , tracheal aspirate

endotracheal aspirate, plurals fluid, sputum

ใหใสภาชนะปลอดเชื้อไมตองใส VTM ยกเวน

กรณีผูปวยใส tube ใหตัดสาย ET-tube จุมลงใน

หลอด VTM

ควรเก็บตัวอยางจากทางเดินหายใจสวนบนควบคูไปดวย( เพิ่มโอกาสการพบเชื้อ )

ทางเดนิหายใจสวนบน -nasopharyngeal aspirate, nasopharyngeal

wash ใหใสภาชนะปลอดเชื้อไมตองใส VTM

-เก็บnasopharyngeal swab และthroat swab

จุมลงในหลอด VTM(เพื่อเพิ่มปริมาณไวรัส)

ใช rayon หรือ draconswab ที่ไมเคลือบ calcium arginate(ยับยั้งปฏิกิริยา PCR)

Page 5: การจัดการตัวอย าง ส งตรวจ MERS-CoV ... · 2015-06-25 · ตัวอย่างจากระบบทางเดินหายใจส่วนล่าง

ที่มา: BD Diagnostics insert: 2-2452 February 2005

การเก็บตวัอย่าง nasopharyngeal swab

ตัวอย่างจากระบบทางเดนิหายใจส่วนบน

ที�มา: BD Diagnostics insert: 2-2452 February 2005

การเก็บตวัอย่าง nasopharyngeal aspirate

ที�มา: มาตรฐานการปฏิบตัิงาน ตรวจวิเคราะห์เชื �อไข้หวดัใหญ่สายพนัธุ์ใหมช่นิด A(H1N1) ทางห้องปฏิบตัิการชนัสตูรสาธารณสขุ

การเก็บตวัอย่าง throat swab

Page 6: การจัดการตัวอย าง ส งตรวจ MERS-CoV ... · 2015-06-25 · ตัวอย่างจากระบบทางเดินหายใจส่วนล่าง

ตัวอย่างจากระบบทางเดนิหายใจส่วนล่าง

ที่มา: Fremont Laboratory, Policy and Procedure 01/25/2010 version 2

การเก็บตวัอย่าง sputum lavage fluid

ที่มา: Strategies for the Diagnosis of Ventilator-Associated Pneumonia with expanded description of blind bronchoalveolar lavage (mini-BAL) methods

การเก็บตวัอยา่ง endotracheal tube แบบเข้าทางชอ่งปาก lavage fluid

ที�มา: Strategies for the Diagnosis of Ventilator-Associated Pneumonia with expanded

description of blind bronchoalveolar lavage (mini-BAL) methods

การเก็บตวัอย่าง Bronchoalveolar lavage fluid

Page 7: การจัดการตัวอย าง ส งตรวจ MERS-CoV ... · 2015-06-25 · ตัวอย่างจากระบบทางเดินหายใจส่วนล่าง

ตัวอยางอื่นๆ

อาการ/ระบบ ชนิดสิ�งส่งตรวจ คาํแนะนําเพิ�มเตมิ

ทอ้งร่วง เกบ็อุจจาระ10-20 มล. หรือประมาณ 5-10 กรัมใส่ในภาชนะปลอดเชื�อ

-

ไตวาย เกบ็ปัสสาวะ10-20 มล.ใส่ในภาชนะปลอดเชื�อ

-

Page 8: การจัดการตัวอย าง ส งตรวจ MERS-CoV ... · 2015-06-25 · ตัวอย่างจากระบบทางเดินหายใจส่วนล่าง

12/12/2012

ผู ้สั ม ผัส ใ ก ล้ ชิ ด(Asymtomaticcontact)

-nasopharyngeal aspirate, nasopharyngeal wash ให้ใส่ภาชนะปลอดเชื� อไม่ต้องใส่ VTM-เก็บnasopharyngeal swab และthroat swab จุ่มลงในหลอด VTM เดียวกัน(เพืEอ เพิEมปริมาณไวรัส)

ใช ้rayon หรือ dracon swab ทีEไม่เคลือบ calcium arginate (ยบัย ั�งปฏิกิริยา PCR)

การเก็บ ตัวอยาง จากผูสัมผัส

Page 9: การจัดการตัวอย าง ส งตรวจ MERS-CoV ... · 2015-06-25 · ตัวอย่างจากระบบทางเดินหายใจส่วนล่าง

12/12/2012

การนําส่งตวัอย่างการบรรจตุวัอยาง บรรจภุณัฑ 3 ชั้น (ตามวิธกีารสงใน

ประเทศ)

อุ ณ ห ภู มิ ข ณ ะ นํ า ส งตัวอยาง

แชเย็น โดยบรรจุกอนน้ําแข็งพลาสติก (Ice pack) ในกลองนําสง

ติดตอ ได 24 ชั่วโมง

Page 10: การจัดการตัวอย าง ส งตรวจ MERS-CoV ... · 2015-06-25 · ตัวอย่างจากระบบทางเดินหายใจส่วนล่าง

เครือข่ายห้องปฏบิตักิารกรมวิทยาศาสตร์การแพทย์

10

ห้องปฏิบตัิการ วิธีตรวจ

สวส. Isolation,PCR ,Sequencing

ศูนย์วิทยาศาสตร์การแพทย์ที( 1 (ตรัง)

PCR

ศูนย์วิทยาศาสตร์การแพทย์ที( 2 (อุดรธานี)

PCR

ศูนย์วิทยาศาสตร์การแพทย์ที( 3 (ชลบุรี) PCR

ศูนย์วิทยาศาสตร์การแพทย์ที( 4 (สมุทรสงคราม) PCR

ศูนย์วิทยาศาสตร์การแพทย์ที( 5 (นครราชสีมา) PCR

ศูนย์วิทยาศาสตร์การแพทย์ที( 6 (ขอนแก่น) PCR

ศูนย์วิทยาศาสตร์การแพทย์ที( 7 (อุบลราชธานี) PCR

ศูนย์วิทยาศาสตร์การแพทย์ที( 8 (นครสวรรค์)

PCR, Sequencing

ศูนย์วิทยาศาสตร์การแพทย์ที( 9 (พิษณุโลก) PCR

ศูนย์วิทยาศาสตร์การแพทย์ที( 10 (เชียงใหม่) PCR

ศูนย์วิทยาศาสตร์การแพทย์ที( 11(สุราษฎร์ธานี)

PCR

ศูนย์วิทยาศาสตร์การแพทย์ที( 12 (สงขลา)

PCR, Sequencing

ศูนย์วิทยาศาสตร์การแพทย์ที( 13 (เชียงราย) PCR

ศูนย์วิทยาศาสตร์การแพทย์ที( 14 (ภูเก็ต) PCR

ศูนย์วิทยาศาสตร์การแพทย์ 14 แห่ง

ห้องปฏิบัตกิารเคลื(อนที(

Page 11: การจัดการตัวอย าง ส งตรวจ MERS-CoV ... · 2015-06-25 · ตัวอย่างจากระบบทางเดินหายใจส่วนล่าง

สถานที�รับตัวอย่างส่วนกลาง : ศูนยประสานงานทางหองปฏิบัติการ (ศปส.) สถาบันวิจัยวิทยาศาสตร

สาธารณสุข กรมวิทยาศาสตรการแพทย จ.นนทบุรี

เวลาใหบริการ : วันทําการ เวลา 08.30-18.30 น. วันหยุดราชการ เวลา 08.30-16.30 น.

โทรศัพท 0-2951-0000 ตอ 99248, 99614 , 0-2591-2153โทรสาร 0-2591-5449, 0-2951-1485

กรณีเรงดวน (24 ชม) ศูนยประสานงานทางหองปฏิบัติการ (ศปส.) โทร. 089-318- 4596, 081-875-2792

Page 12: การจัดการตัวอย าง ส งตรวจ MERS-CoV ... · 2015-06-25 · ตัวอย่างจากระบบทางเดินหายใจส่วนล่าง

วธิีตรวจวเิคราะห์ทางห้องปฏบิตักิาร

12/12/2012

Page 13: การจัดการตัวอย าง ส งตรวจ MERS-CoV ... · 2015-06-25 · ตัวอย่างจากระบบทางเดินหายใจส่วนล่าง

สรุปแนวทางการตรวจวนิิจฉัยผู้ป่วยต้องสงสัยติดเชื&อไวรัสโคโรน่าสายพนัธุ์ใหม่ 2012 กรมวทิยาศาสตร์การแพทย์

ตรวจหา เชื&อ Novel corona 2012 และHouse keeping gene ( คุณภาพของตวัอย่าง)

ด้วยวธิี real time RT-PCR (screening for Upstream E- gene/orf 1a/orf 1b)

ผลการวิเคราะห 6-8 ชม

Neg 3 ยนี Pos 3 ยนีPos 1-2 ยนี

Negative PositiveInconclusiveส่งตรวจซํ� า 1-2 วนั

การตรวจอื่นๆ : การตรวจลําดับเบส : การเพาะแยกเชื้อ : การตรวจหาไวรัสชนิดอื่นๆ

Page 14: การจัดการตัวอย าง ส งตรวจ MERS-CoV ... · 2015-06-25 · ตัวอย่างจากระบบทางเดินหายใจส่วนล่าง

12/12/2012

ตัวอยางการรายงานผล

ผลการวเิคราะห การรายงานผล วิธีรายงานไมพบสารพันธุกรรมของ 3 ยีน

ไมพบสารพันธุกรรม ของไวรัสโรคทางเดินหายใจตะวนัออกกลาง (MERS-CoV)

รายงานปกติ

2. พบสารพันธุกรรม ของ1-2 ยีน(Inconclusive)

Up-E gene NegativeORF 1a gene PositiveORF 1b gene Negativeสรุปผล: ไมสามารถสรุปผลไดแนะนําใหเก็บตัวอยางสงตรวจซ้ํา 1 - 2 วัน

แจง ผอ. รพ / ผอ. สํานักระบาด

3. พบสารพันธุกรรมของ 3 ยีน

พบสารพันธุกรรมของไวรัสโรคทางเดินหายใจตะวนัออกกลาง (MERS-CoV)

แจง ผอ. รพ / ผอ. สํานักระบาด

Page 15: การจัดการตัวอย าง ส งตรวจ MERS-CoV ... · 2015-06-25 · ตัวอย่างจากระบบทางเดินหายใจส่วนล่าง

12/12/2012

การตรวจวเิคราะหตวัอยาสงสยั MERSในหองปฏบิตักิาร โรงพยาบาล

ผูปฏิบัติงาน

Page 16: การจัดการตัวอย าง ส งตรวจ MERS-CoV ... · 2015-06-25 · ตัวอย่างจากระบบทางเดินหายใจส่วนล่าง

12/12/2012

การตรวจวเิคราะหตวัอยาสงสยั MERSในหองปฏบิตักิารโรงพยาบาล

ชนิดตวัอยาง รายการทดสอบ ความปลอดภยัตัวอยางทางเดินหายใจ Flu rapid test

Bacterial culture เตรียมตัวอยาง/ทดสอบ ในหอง DRA (ถาไมมี ทําในหองทีม่ี BSC class II)

ตัวอยางอื่นๆ เชน เลือด ปสสาวะ อุจจาระ

CBC, Blood Chemistry, serology

ทําในหองปฏบิตัิการประจํา

Page 17: การจัดการตัวอย าง ส งตรวจ MERS-CoV ... · 2015-06-25 · ตัวอย่างจากระบบทางเดินหายใจส่วนล่าง

12/12/2012

การทาํลายเชือ้หลงัการวเิคราะห

1. นึ่งดวยความรอน ที่อุณหภูมิ 121°C นาน 20 นาที หรือ

2. น้ํายาฟอกขาว (Clorox®) 0.5% sodium hypochlorite นาน 30 นาที

เผา

ใชครั้งเดียวทิ้งนํากลับมาใชใหม

ทําความสะอาด ผึ่งแหง

Page 18: การจัดการตัวอย าง ส งตรวจ MERS-CoV ... · 2015-06-25 · ตัวอย่างจากระบบทางเดินหายใจส่วนล่าง

วธิีตรวจวนิิจฉัยโรคทางเดนิหายใจตะวนัออกกลาง ตามมาตรฐานองค์การอนามัยโลก

วธิีตรวจวนิิจฉัย MERS รายละเอยีดวธิีวเิคราะห์

วธิีตรวจคดักรอง (Screening) วธิี Real time PCR ต่อ upE, orf 1a assay

วธิีตรวจยนืยนั (Confirmation) 1.วธิี Real time PCR ต่อ ORF1_b gene หรือ2. หาลาํดบันิวคลีโอไทมต์่อ RdRp หรือ N sequencing