studentski.net · • stabilni brezcelični sistem e. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1...
TRANSCRIPT
![Page 1: studentski.net · • stabilni brezcelični sistem E. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK) •](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042102/5e7e9a41186bb42c6e45366b/html5/thumbnails/1.jpg)
Biosinteza proteinov
Voet 3: poglavje 32Stryer 5: poglavje 29
Krebs 3: poglavji 25 in 24
![Page 2: studentski.net · • stabilni brezcelični sistem E. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK) •](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042102/5e7e9a41186bb42c6e45366b/html5/thumbnails/2.jpg)
![Page 3: studentski.net · • stabilni brezcelični sistem E. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK) •](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042102/5e7e9a41186bb42c6e45366b/html5/thumbnails/3.jpg)
http://plato.stanford.edu/entries/information-biological/
![Page 4: studentski.net · • stabilni brezcelični sistem E. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK) •](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042102/5e7e9a41186bb42c6e45366b/html5/thumbnails/4.jpg)
standardni začetni kodon: AUG
nestandardni: GUG, UUG, …
E. coli: AUG – 83 % mRNA (Met)GUG – 14 % mRNA (Val)UUG – 3 % mRNA (Leu)AUUCUG
Tudi pri alternativnih start kodonih je najpogosteje 1. aminokislina Met !
![Page 5: studentski.net · • stabilni brezcelični sistem E. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK) •](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042102/5e7e9a41186bb42c6e45366b/html5/thumbnails/5.jpg)
Odstopanja od “standardnega” genetskega koda pri mitohondrijih.
• Click to edit Master text styles– Second level– Third level
• Fourth level– Fifth level
![Page 6: studentski.net · • stabilni brezcelični sistem E. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK) •](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042102/5e7e9a41186bb42c6e45366b/html5/thumbnails/6.jpg)
Adapterska hipoteza: genetski kod berejo molekule, ki prepoznajo posamezne kodone, hkrati pa nosijo ustrezne aminokisline.
• Click to edit Master text styles– Second level– Third level
• Fourth level– Fifth level
![Page 7: studentski.net · • stabilni brezcelični sistem E. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK) •](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042102/5e7e9a41186bb42c6e45366b/html5/thumbnails/7.jpg)
Nukleotidno zaporedje in oznake krakov na primeru kvasovkine tRNAAla, prikazane v strukturi deteljice.
• Click to edit Master text styles– Second level– Third level
• Fourth level– Fifth level
![Page 8: studentski.net · • stabilni brezcelični sistem E. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK) •](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042102/5e7e9a41186bb42c6e45366b/html5/thumbnails/8.jpg)
UH2=metilinozindihidrouridinmG=metilgvanozinm2G=dimetilgvanozinT=ribotimidinI=inozinmI=metilinozinψ=psevdouridin
![Page 9: studentski.net · • stabilni brezcelični sistem E. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK) •](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042102/5e7e9a41186bb42c6e45366b/html5/thumbnails/9.jpg)
![Page 10: studentski.net · • stabilni brezcelični sistem E. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK) •](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042102/5e7e9a41186bb42c6e45366b/html5/thumbnails/10.jpg)
![Page 11: studentski.net · • stabilni brezcelični sistem E. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK) •](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042102/5e7e9a41186bb42c6e45366b/html5/thumbnails/11.jpg)
![Page 12: studentski.net · • stabilni brezcelični sistem E. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK) •](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042102/5e7e9a41186bb42c6e45366b/html5/thumbnails/12.jpg)
![Page 13: studentski.net · • stabilni brezcelični sistem E. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK) •](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042102/5e7e9a41186bb42c6e45366b/html5/thumbnails/13.jpg)
![Page 14: studentski.net · • stabilni brezcelični sistem E. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK) •](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042102/5e7e9a41186bb42c6e45366b/html5/thumbnails/14.jpg)
![Page 15: studentski.net · • stabilni brezcelični sistem E. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK) •](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042102/5e7e9a41186bb42c6e45366b/html5/thumbnails/15.jpg)
![Page 16: studentski.net · • stabilni brezcelični sistem E. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK) •](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042102/5e7e9a41186bb42c6e45366b/html5/thumbnails/16.jpg)
p = (1 )nε
![Page 17: studentski.net · • stabilni brezcelični sistem E. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK) •](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042102/5e7e9a41186bb42c6e45366b/html5/thumbnails/17.jpg)
![Page 18: studentski.net · • stabilni brezcelični sistem E. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK) •](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042102/5e7e9a41186bb42c6e45366b/html5/thumbnails/18.jpg)
Nature Reviews Microbiology 8, 849-856 (Dec. 2010)
![Page 19: studentski.net · • stabilni brezcelični sistem E. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK) •](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042102/5e7e9a41186bb42c6e45366b/html5/thumbnails/19.jpg)
![Page 20: studentski.net · • stabilni brezcelični sistem E. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK) •](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042102/5e7e9a41186bb42c6e45366b/html5/thumbnails/20.jpg)
![Page 21: studentski.net · • stabilni brezcelični sistem E. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK) •](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042102/5e7e9a41186bb42c6e45366b/html5/thumbnails/21.jpg)
![Page 22: studentski.net · • stabilni brezcelični sistem E. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK) •](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042102/5e7e9a41186bb42c6e45366b/html5/thumbnails/22.jpg)
Nekatere bakterije, arheje, mitohondriji in kloroplasti nimajo GlnRS; pri njih se Glu-tRNA encimsko transamidira v Gln-tRNA.
![Page 23: studentski.net · • stabilni brezcelični sistem E. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK) •](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042102/5e7e9a41186bb42c6e45366b/html5/thumbnails/23.jpg)
![Page 24: studentski.net · • stabilni brezcelični sistem E. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK) •](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042102/5e7e9a41186bb42c6e45366b/html5/thumbnails/24.jpg)
![Page 25: studentski.net · • stabilni brezcelični sistem E. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK) •](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042102/5e7e9a41186bb42c6e45366b/html5/thumbnails/25.jpg)
![Page 26: studentski.net · • stabilni brezcelični sistem E. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK) •](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042102/5e7e9a41186bb42c6e45366b/html5/thumbnails/26.jpg)
poli-Lys se ne obarja s TCA!!! (Ochoa, Watson)
![Page 27: studentski.net · • stabilni brezcelični sistem E. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK) •](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042102/5e7e9a41186bb42c6e45366b/html5/thumbnails/27.jpg)
• stabilni brezcelični sistem E. coli• mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene
aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK)
• dodatek (m)RNA• inkubiranje• obarjanje proteinov & spiranje precipitata• merjenje radioaktivnosti v oborini
• pri poli-U so izmerili radioaktivnost le v paralelki z označenim Phe
![Page 28: studentski.net · • stabilni brezcelični sistem E. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK) •](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042102/5e7e9a41186bb42c6e45366b/html5/thumbnails/28.jpg)
5' anticodon base 3' codon base
A U
C G
G C or U
U A or G
I A or C or U
• degeneriranost genetskega koda• ohlapne baze
![Page 29: studentski.net · • stabilni brezcelični sistem E. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK) •](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042102/5e7e9a41186bb42c6e45366b/html5/thumbnails/29.jpg)
http://themedicalbiochemistrypage.org/scid.html
Adenozin-deaminaza (ADA): katabolizem purinovSCID (huda kombinirana imunska pomanjkljivost: posledica dedne okvare ADA
![Page 30: studentski.net · • stabilni brezcelični sistem E. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK) •](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042102/5e7e9a41186bb42c6e45366b/html5/thumbnails/30.jpg)
![Page 31: studentski.net · • stabilni brezcelični sistem E. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK) •](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042102/5e7e9a41186bb42c6e45366b/html5/thumbnails/31.jpg)
Ribosome Small subunit Large subunit
70S, 2520 kDa 30S, 930 kDa 50S, 1590kDa
RNA: 1664 kDa 16S, 1542 nt, 560 kDa1104 kDa
23S, 2904 nt5S, 120 nt
Proteins: 857 kDa 370 kDa, 21 kinds 487 kDa, 31 kinds
![Page 32: studentski.net · • stabilni brezcelični sistem E. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK) •](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042102/5e7e9a41186bb42c6e45366b/html5/thumbnails/32.jpg)
Zorenje evkariontske rRNA
Lodish 4
![Page 33: studentski.net · • stabilni brezcelični sistem E. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK) •](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042102/5e7e9a41186bb42c6e45366b/html5/thumbnails/33.jpg)
snoRNP:mali nukleolarni ribonukleoproteinski delec
![Page 34: studentski.net · • stabilni brezcelični sistem E. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK) •](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042102/5e7e9a41186bb42c6e45366b/html5/thumbnails/34.jpg)
rRNA 16 S1542 nt
![Page 35: studentski.net · • stabilni brezcelični sistem E. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK) •](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042102/5e7e9a41186bb42c6e45366b/html5/thumbnails/35.jpg)
Nekateri proteini, ki sestavljajo ribosomsko podenoto 50 S.
![Page 36: studentski.net · • stabilni brezcelični sistem E. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK) •](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042102/5e7e9a41186bb42c6e45366b/html5/thumbnails/36.jpg)
![Page 37: studentski.net · • stabilni brezcelični sistem E. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK) •](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042102/5e7e9a41186bb42c6e45366b/html5/thumbnails/37.jpg)
![Page 38: studentski.net · • stabilni brezcelični sistem E. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK) •](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042102/5e7e9a41186bb42c6e45366b/html5/thumbnails/38.jpg)
![Page 39: studentski.net · • stabilni brezcelični sistem E. coli • mešanica 19 neradioaktivnih + 1 radioaktivno označene aminokisline ( 20 paralelk z vsakič drugo označeno AK) •](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042102/5e7e9a41186bb42c6e45366b/html5/thumbnails/39.jpg)
Trije možni bralni okviri na mRNA. Vsak bralni okvir pomeni drugačen polipeptid, ki lahko nastane na osnovi istega zaporedja nukleotidov.
• Click to edit Master text styles– Second level– Third level
• Fourth level– Fifth level