2ª edicion del manuel bergey 2015

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Bacterias, levaduras y hongos importantes en microbiologia

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Volumen 1

SEGUNDA EDICIN DEL MANUAL BERGEY DE SISTEMTICA BACTERIOLGICA

Volumen 1. Secciones I-V: Archaea (Arqueobacterias: 25). Termfilas, Metangenas, Halobacterias, Termoplasmas Familia Halobacteriaceae: Es halfila y provoca los colores rojos de las salinas. Necesita vivir a 4,5 M de NaCl y se puede encontrar en los pescados salados. Tiene pseudopeptidoglicano y sintetiza un pigmento de color prpura llamado Bacteriorodopsina que funciona igual que la clorofila en la fotosntesis Gn. HalobacteriumSecciones VI-XVI: Cianobacterias, Prottrofos y Gneros muy ramificados. Bacterias auttrofas: Aquifex, Hidrogenobacter. Thermotogas, Geotogas, Deinococcus (12), Thermus (4). Bacterias fotosintticas. Cianobacterias (19) Gn. Thermus: bacteria termorresistente de la que se obtuvo la enzima Tac (T. acuaticus) PolimerasaBacterias fotosintticas oxignicas: Cianobacterias

Son algas verde-azuladas debido a la ficocianina

Pueden ser unicelulares o unirse formando filamentos

Su fotosntesis es oxignica ya que desprende O2 y la clorofila es de tipo a. Tienen cidos grasos poliinsaturados Tienen capas mucilaginosas que les sirven para reptar

Suelen tener vacuolas gaseosas para flotar y captar ms energa luminosa

En su ciclo vegetativo se pueden encontrar 3 formas:

Hormogonios: formacin de filamentos

Acinetos: clulas de resistencia

Heterocistos: estructuras que les sirven para fijar el N2 atmosfrico

Acumulan glucgeno

Han sido la mayor revolucin ecolgica de la Tierra ya que en el Precmbrico la atmsfera pas de tener bajas condiciones de O2 a las cantidades actuales (20%). Esto dio paso a una evolucin mucho ms rpida Fueron los primeros organismos fotosintticos. Una Cianobacteria primitiva fue secuestrada por las clulas vegetales para constituir los actuales cloroplastos

Solo necesitan: agua, luz y micronutrientes (sales del agua como N, Ca, Fe)

Estromatolitos: fsiles de las Cianobacterias del Precmbrico.

Gen. Oscillatoria:

Oscillatoria princep: es visible a simple vista

Volumen 2. Seccin XVII: Proteobacterias. Bacterias oligotrficas. Bacterias rojas no sulfreas (18). Acetobacter y Gluconobacter. Rickettsias (9, Orden I). Caulobacter, Hyphomicrobium (21). Rhizobiaceae (4). Nitrobacter (20)Bacterias fottrofas anoxignicas. Suelen vivir en lagos meromicticos (lagos donde hay poco O2). Son anoxignicas porque tienen una fotosntesis diferente a la normal de las plantas superiores ya que:

En estas bacterias nunca se forma Oxgeno molecular Es un proceso anaerobio ya que estas bacterias pueden vivir en ausencia de Oxgeno Solo tiene una fase luminosa La clorofila es diferente porque son pigmentos fotosintticos que tienen la misma funcin, pero tienen distinto espectro de absorcin El agua no es nunca el donador de electrones, sino que son compuestos como: H2, SH2, compuestos orgnicos (organismos fotoorgantrofos), tiosulfato S2O3=, compuestos inorgnicos (organismos fotoauttrofos o fotolittrofos)Esta seccin se divide en 3 grupos:

ABacterias rojas: Cromatobacterias (Seccin XIX)BBacterias rojas no sulfreasCBacterias verdes del azufre o clorobacterias

Clorofilaa, ba, bc, d

Donador e-S2O3=, SH2, H2H2O, SH2SH2

Condiciones anaerobiosisAnaerobias estrictasAnaerobias facultativasAnaerobias estrictas

La Columna de Winogradsky tiene unas condiciones muy parecidas a las de los lagos meromcticos y en ella se producen los tres tipos de bacterias

Las Rickettsias y Clamidias. Al principio, Rickettsias y Clamidias se confundieron con virus:RickettsiasClamidiasVirus

cido nucleicoADN y ARNADN y ARNADN o ARN

Ribosomas70S70SNo tienen

Sntesis ATPSi tienenNo tienenNo tienen

Sntesis macromolculasSi tienenNo tienenNo tienen (slo en husped)

Sensibilidad a antibiticosSiSiNo

Familia Rickettsiaceae: se descubri en 1906 Gn. Rickettsia: producen la llamada Enfermedad de las Montaas Rocosas. Son pleomrficas, parsitos obligados y Gram negativas. Se transmiten por picaduras de artrpodos y se cultivan en embriones de pollo, igual que algunos virus. Se tien con la tincin especfica de Machiavelo y Giemsa Familia Rhizobiaceae:

Gn. Rhizobium: tambin fija el Nitrgeno y lo transforma en Nitratos o Nitritos, pero no est libre, sino asociado a las races de una leguminosa por simbiosis Rhizobium legominosarum Familia Acetobacteraceae: bacterias responsables del vinagre Gn. Glucobacter: produce vinagre a partir de las hexosas o del Etanol Gn. Acetobacter: tiene enzimas que pasan el vinagre a CO2 Gn. Brucella:

Brucella melitensis: produce la enfermedad de las fiebres de malta. Est asociada a las profesiones como la de veterinario. Se puede transmitir por el queso de oveja y de cabra.

Seccin XVIII: Proteobacterias. Neisseria (4). Bacterias aerobias quimiolittrofas (20): Bacterias incoloras del azufre. Thiobacillus Familia Neisseriaceae:

Gn. Neisseria: tiene forma de rin Neisseria gonorrhoeae: produce enfermedades de transmisin sexual. Es un gonococo Neisseria meningitidis o Meningococo: produce la enfermedad de la meningitis. Se transmite por el aire y forma parte de nuestra microbiota nasofarngea. En determinadas circunstancias puede pasar al torrente sanguneo y a la columna vertebral, llegando as a las meninges (capas que protegen al cerebro), donde la accesibilidad del antibitico es muy pequea y son poco eficientes. Los ms eficientes son las sulfamidas. Este es un proceso muy largo, que dura como mnimo una semanaSeccin XIX: Proteobacterias. Bacterias rojas: Chromatium (18). Pseudomonas y Legionella (4). Azotobacter (4). El grupo entrico y bacterias relacionadas (5). Familia Enterobacteriaceae: Escherichia coli. Pasteurellaceae y Vibrionaceae.

Familia Azotobacteraceae:

Gn. Azotobacter: est libre y fija el Nitrgeno atmosfrico (1900). Sirve como fertilizante del suelo y tiene sistemas de resistencia denominados cistos, resistentes al calor y a la desecacin.

Familia Pseudomonadaceae:

Gn. Pseudomonas: puede usar hasta ms de 100 fuentes de Carbono diferentes y tiene gran aplicacin en la degradacin de basura Pseudomonas fluorescens: produce pigmentos cercanos al ultravioleta Gn. Xanthomonas: es parsito de plantasBacilos Gram negativos anaerobios facultativos. Es el grupo ms numeroso y ms estudiado de las Gram negativas

Familia Enterobacteriaceae: incluye organismos comensales para el hombre y patgenos de animales y plantas. Fermentan Hidratos de Carbono con produccin de gas. Tiene entre el 40 y 50% de G+C, por lo que son muy similares y estn muy relacionadas. Presentan dos tipos de fermentaciones:

cido-mixta: son capaces de fermentar gran cantidad de Hidratos de Carbono. Puede tener intermediarios (cido Lctico, Actico) pero al final siempre se va a formar CO2 y H2 en la misma concentracin

Butanodilica: uno de los intermediarios es el Butanodiol, que se descompone en Etanol, CO2 y H2. La concentracin de CO2 es mayor que la de H2. Pruebas del INVIC: son 4: Indol: al transformar la Lysina a Triptfano se produce Indol. Los microorganismos que son positivos (se forma un anillo rojo) utilizan aminocidos como fuente de Carbono

Rojo Metilo: indica el pH. Si el pH final es mayor que 4,5 aparece un color amarillo, y si es menos aparece un color rojo

Vogas Proskauer: detecta la presencia de la Acetona

Simons Citrato: utiliza Citrato como fuente de Carbono. Este medio a pH cido es verde, y a pH alcalino es azul porque lleva como colorante el Azul de Bromotimol

Estas pruebas se usan para clasificar a las enterobacterias. Ejemplo:

IRMVPSC

Escherichia++--

Enterobacter--++

Gn. Escherichia:

Escherichia coli: es la bacteria ms conocida y sobre la que ms estudios se han vertido, por lo que se usa como modelo de procariotas para las tcnicas de ingeniera gentica. Vive en el intestino grueso, donde se aprovecha de los restos que an no han sido modificados. Produce vitamina K. La presencia de E.coli indica contaminacin fecal. Cuando pasa a las aguas hay que depurarlas. E.coli a veces produce toxinas que se traducen en diarreas (colicinas), que deshidratan el organismo Gn. Salmonella: habita en las aves y se transmite por sus huevos. El peligro en los humanos es que luchan con E.coli en el intestino, y stas producen las toxinas que provocan las diarreas

Salmonella typhi: produce las fiebres tifoideas Gn. Klebsiella:

Klebsiella pneumoniae: produce la neumona Gen. Serratia:

Serratia marcencens: produce un pigmento rojo denominado Prodigiosina Familia Vibrionaceae:

Gn. Vibrio: es de agua dulce, por lo que si aparece en el mar (costas) es un agua no apta para el bao Vibrio cholerae: produce la enfermedad del clera ya que produce una neuraminidasa que altera la permeabilidad de los tejidos intestinales (paso al torrente sanguneo) Gn Photobacterium:

Photobacterium lucibacterium: produce un pigmento verde-azulado que produce una protena dependiente del O2 llamada Luciferina.

Familia Pasteurellaceae:

Gn. Haemophilus:

Haemophilus influenzae: patgeno, que produce el enzima de restriccin Hinf. Acompaa a la gripe porque aprovecha la bajada de defensas. Necesita el grupo Hemo (Hemoglobina)Seccin XX: Proteobacterias. Reduccin desasimilatoria de sulfatos y sulfuros (7): Desulfovibrio. Mixobacterias formadoras de cuerpos fructferos. Bdellovibrio Seccin XXI: Proteobacterias: Campylobacter (2). Helicobacter. Gn. Bdellovibrio:

Bdellovibrio bacteriovorans: microorganismo ms velozHelicobacter pilori: produce lcera estomacalVolumen 3. Seccin XXII: Bacterias Gram positivas de bajo contenido en G+C I. Clostridia y afines. Desulfomaculatum y Clostridium (13)Bacilos y cocos Gram positivos formadores de endosporas. Son termorresistentes, se aslan a temperaturas elevadas (80C). Son quimiohetertrofos Gn. Bacillus: es catalasa positivo ya que tienen cadena respiratoria; y es oxidasa positivo ya que transforma el H2O2 para dar H2O y O2. Se suelen clasificar segn la formacin de las esporas: lateral, central, etc.

Bacillus subtilis: produce un antibitico llamado Bacitracina Bacillus anthracis: supone el nacimiento de la Bacteriologa. Se encuentra en el suelo y es arrastrada por la lana de las ovejas. En Espaa se denomina Carbunco porque la enfermedad se manifiesta con manchas semejantes al carbn. Adems de a la piel afecta al intestino y al aparato respiratorio, siendo mortal en este ltimo caso. Existe una vacuna contra esta bacteria pero solo para animales (dosis de recuerdo) Bacillus thuringiensis: produce un insecticida que puede servir para el control de plagas como: La procesionaria del pino La mariposa de la remolacha Gn. Clostridium: se denomina tambin Bacterias del cido Butrico. Son anaerobios estrictos, oxidasa y catalasa negativo, por lo que realizan la fosforilacin a nivel de sustrato. Utilizan la Reaccin de Stickland, que consiste en la utilizacin de los aminocidos (Alanina y Glicocola) como fuente de Carbono y Nitrgeno. Son cepas muy patgenas porque liberan gran cantidad de exotoxinas, que afectan a los msculos y al sistema nervioso central.

Clostridium tetani: produce la enfermedad del Ttano ya que produce un potente neurotxico (Ttanos Plasmina) que provoca rigidez muscular Clostridium perfrigens: produce la enfermedad de la Gangrena Clostridium botulinum: produce la neurotoxina denominada Botulina que ataca al sistema nervioso central. Un microgramo de ella es 200 mil veces la dosis letal para matar a un ratn. Puede aparecer en las latas de conserva. Se utiliza en cosmtica un derivado: botox Clostridium pectinovorans: est implicado en el proceso del enriado del lino y del camo porque descompone las fibras de celulosa que se mantienen unidas mediante las pectinas.

Secciones XXIII (Mollicutes) y XXIV (Bacilli y Lactobacilli): Bacterias Gram positivas de bajo contenido en G+C II. Clase Mollicutes (10). Staphylococcus (12). Streptococcus (12). Bacillus (13). Lactobacillus (14)Los Micoplasmas (Mollicutes). No tienen peptidoglicano, por lo que son insensibles a la mayora de los antibiticos. Son patgenos de animales de sangre caliente Gn. Mycoplasma:

Mycoplasma pneumonie: fue el primero que se aisl y tambin se llam PPO. Produce la neumona (inflamacin de los pulmones). Fue al que se le ech la culpa del aceite de Colza en un principio.

Cocos Gram positivos. La mayora son aerobios, y pueden ser estrictos o facultativos.

Gn. Staphylococcus:

Staphylococcus aureus: constituye la microbiota autctona de la formacin de granos en la piel y acn. Cuando se dividen se van quedando unidos unos a otros dando lugar a una estructura en forma de racimo.

Gn. Streptococcus: es catalasa negativo ya que no tienen cadena respiratoria, es decir, carece de citocromo C. Por eso el poder reductor no se transforma en ATP y las nicas molculas de ATP que consiguen es mediante la fosforilacin a nivel de sustrato (2 ATP). Se asla fcilmente con Acida Sdica (N3Na, ya que inhibe la cadena respiratoria) Streptococcus hemoliticus: produce la enfermedad de la escarlatina Streptococcus lacticus: implicado en la produccin de los yogures. Necesita una temperatura baja para su conservacin (10C) Gn. Sarcina: ahora se llama Micrococcus:

Micrococcus luteus: bacteria amarilla con la que se hacen muchas pruebas (por ejemplo mutaciones por la prdida de su color)Bacilos regulares Gram positivos no formadores de endosporas.

Gn. Lactobacillus: se encuentra en preparaciones de verduras y vegetales o en alimento con una acidez no adecuada. Ej. mantequilla. Tambin forma parte del tracto nasofarngeo. Obtiene ATP fermentando carbohidratos y produciendo cido Lctico. Se divide en dos grupos:

Homofermentadores: su producto final es siempre el cido Lctico Heterofermentadores: su producto final es 1 mol de cido Lctico, 1 mol de Etanol y 1 mol de CO2Son siempre de color blanquecino ya que no tienen pigmentos.

Lactobacillus bulgaris: Participa en la produccin de yoguresVolumen 4. Seccin XXV Bacterias Gram positivas de alto contenido en G+C (Actinomycetos y organismos relacionados). Bacterias corineformes: Corynebacterium, Brevibacterium y Propionibacterium (15). Mycobacterias (16). Nocardioformes (17). Actinomycetos nocardiformes: Nocardia (26). Frankia (27). Streptomyces: ciclo de desarrollo e importancia ecolgica e industrial.Bacilos irregulares Gram positivos no formadores de endosporas. Morfolgicamente son semejantes a los hongos porque son alargados y con forma de hifa; pero son procariotas Gn. Corynebacterium: anaerobios facultativos y con forma de palillo de tambor. Puede ser patgeno de animales y del hombre Corynebacterium diphtheriae: no se dividen por completo, sino que quedan unidos de manera regular a la madre. Se llama tambin Bacilo de Kleb-Loffler y produce la enfermedad de la Difteria Corynebacterium glutamicum: produce el aminocido cido Glutmico, adems de la Lisina y la Metionina. El cido Glutmico se usa en las salsas como espesante, y la Lisina se aade como correctivo a los terneros en la dieta Gn. Propionibacterium: se usa para la elaboracin del queso Enmental, ya que le proporciona cido Propinico y le aporta un olor caracterstico Gn. Bifidobacterium: es tpico de la microbiota de los nios recin nacidos antes de que se instale E.coliLas Micobacterias. Presentan cidos Miclicos, lo que hace que resistan a la tincin cido-alcohol-resistente. Son muy resistentes a los antibiticos Gn. Mycobacterium:

Mycobacterium leprae: Produce la enfermedad de la Lepra Mycobacterium tuberculosis: tambin se denomina Bacilo de Robert Koch. Produce la enfermedad de la Tuberculosis, que se transmite al hombre mediante la leche de las vacas. La prueba de la Tuberculina se usa para saber si una vaca presenta esta enfermedad. Es un microorganismo termosensible, por lo que muere a unos 65C.Estreptomicetos y gneros relacionados.

Gn. Streptomyces: de forma alargada (no confundir con hongos filamentosos). Producen antibiticos como la estreptomicina. Es el grupo ms numeroso en el suelo y da el olor caracterstico cuando llueve (geosminas, isoborneol).

Volumen 5. Secciones XXVI-XXXIII: Planctomicetos, Espiroquetas, Fibrobacter, Bacteroides y Fusobacterias. Clamidias (9, Orden II). Las espiroquetas (1). Flavobacterium (4), Bacteroides y Fusobacterium (6), Cytophaga y Flexibacter (23, Orden I). Familia Chlamydiaceae: son las Bedsonias: parsitos obligados Gram negativos que se transmiten husped a husped. No producen ATP. Producen infecciones en los ojos y en el sistema respiratorio.

Las espiroquetas: axostilo (cuerpos de insercin) Gn. Treponema:

Treponema denticola: en la boca Treponema orale: en la boca Treponema palidum: causa la enfermedad e la sfilis Familia Bacteroidaceae:

Gn. Bacteroides: es pleomrfico (con varias formas) y vive en el tracto gastrointestinal y en la boca Gn. Fusobacterium: es el responsable del sarro de la boca12