2. laboratorijas darbs. spektrofotometrija

39
10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un bio tehnoloģijas katedra ML 1 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija. Spektrofotometrija. Māris Lazdiņš [email protected] LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra diju kurss Bioloģija (biologiem) Bloks Šūnas bioloģija, bioķīmija, ģenētika

Upload: olive

Post on 22-Jan-2016

362 views

Category:

Documents


2 download

DESCRIPTION

Studiju kurss Bioloģija (biologiem). Bloks Šūnas bioloģija, bioķīmija, ģenētika. 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija. Māris Lazdiņš [email protected] LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra. Kas ir gaisma?. - Kvantu plūsma. - Noteikta diapazona elektromagnetiskais starojums. - PowerPoint PPT Presentation

TRANSCRIPT

Page 1: 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija

10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

1

2. laboratorijas darbs.

Spektrofotometrija.Spektrofotometrija.

Māris Lazdiņš [email protected]

LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra

Studiju kurss Bioloģija (biologiem)

Bloks Šūnas bioloģija, bioķīmija, ģenētika

Page 2: 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija

10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

2

- Kvantu plūsma.

- Noteikta diapazona elektromagnetiskais starojums.

Kas ir gaisma?Kas ir gaisma?

Page 3: 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija

10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

3

Kas ir gaisma?Kas ir gaisma?

Elektromagnetiskā starojuma viļņu garums - (nm).

C = 300 000 km/s

- attālums, kuru starojums veicis vienas svārstības laikā.

Page 4: 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija

10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

4

Kas ir gaisma?Kas ir gaisma?

Elektromagnetisko starojumu pēc tā- īpašībām un- mijiedarbības ar dzīvās un nedzīvās dabas objektiem

iedala vairākos diapazonos:

diapazons

10 km – 1 mm - radiodiapazons1 mm – 800 nm - infrasarkanais starojums800 nm – 350 nm - redzamā gaisma350 nm – 1 nm - ultravioletais starojums1 nm – 10 pm - rentgena starojums10 pm – 100 fm - starojums

Page 5: 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija

10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

5

Redzamā gaismaRedzamā gaisma

krāsa

760 nm – tumši sarkans660 nm – sarkans590 nm – oranžs560 nm – dzeltens500 nm – zaļš480 nm – gaiši zils450 nm – zils380 nm – violets

Page 6: 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija

10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

6

Kā mēra gaismas un vielas mijiedarbību?Kā mēra gaismas un vielas mijiedarbību?

Transmisija – (T = I2/I1)

Transmisijas % – T% = (I2/I1) 100

Transmisijas% parāda cik % starojuma izkļuvuši cauri videi.

I1 I2

Page 7: 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija

10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

7

Kā mēra gaismas un vielas mijiedarbību? Kā mēra gaismas un vielas mijiedarbību?

Turpinot pētījumus noskaidrojās, ka T ir atkarīga no:

- starojuma ceļa garuma;- vielas koncentrācijas šķīdumā;- izmantotā starojuma ;- konkrētai vielai raksturīga starojuma absorbcijas koeficienta pie noteikta starojuma .

Page 8: 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija

10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

8

Kā mēra gaismas un vielas mijiedarbību? Kā mēra gaismas un vielas mijiedarbību?

Sakarību apraksta Bera likums:

T=10-kcl

k – konkrētai vielai raksturīgs starojuma absorbcijas koeficients pie noteikta starojuma ;

c – vielas koncentrācija šķīdumā;l – starojuma ceļš cauri šķīdumam.

Page 9: 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija

10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

9

Kā mēra gaismas un vielas mijiedarbību? Kā mēra gaismas un vielas mijiedarbību?

Praksē bieži izmanto Lamberta – Bera likumu un mērvienības:

Absorbcija (A)Ekstinkcija (E)Optiskais blīvums (D; OD)

A = - lg(T) = kcl

Page 10: 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija

10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

10

Kādas iekārtas izmanto spektrofotometrijā?Kādas iekārtas izmanto spektrofotometrijā?

Spektrofotometrs (SF)

Starojuma avots

Kondensors Dispersijas sistēma

Optiskā sprauga

Kivete ar paraugu

Starojuma intensitātes mērītājs

Page 11: 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija

10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

11

Kādas iekārtas izmanto spektrofotometrijā?Kādas iekārtas izmanto spektrofotometrijā?

Fotoelektrokolorimetrs (FEK)

Starojuma avots

KondensorsOptiskie filtri

Kivete ar paraugu

Starojuma intensitātes mērītājs

Page 12: 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija

10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

12

Absorbcijas spektrsAbsorbcijas spektrs

Grafiks - absorbcijas (optiskā blīvuma) atkarība no viļņu garuma

(nm)

OD(o.v.)

400 450 500 550 600 650 700

Page 13: 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija

10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

13

Cilvēka acs jūtībaCilvēka acs jūtība

(nm)

%100

80

60

40

20

0

400 450 500 550 600 650 700

Page 14: 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija

10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

14

Absorbcijas spektrsAbsorbcijas spektrs

Grafiks - absorbcijas (optiskā blīvuma) atkarība no viļņu garuma

400 450 500 550 600 650 700 (nm)

OD(o.v.)

Page 15: 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija

10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

15

Absorbcijas spektrsAbsorbcijas spektrs

Grafiks - absorbcijas (optiskā blīvuma) atkarība no viļņu garuma

400 450 500 550 600 650 700

OD

Page 16: 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija

10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

16

Absorbcijas spektrsAbsorbcijas spektrs

Grafiks - absorbcijas (optiskā blīvuma) atkarība no viļņu garuma

400 450 500 550 600 650 700

OD

Page 17: 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija

10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

17

Absorbcijas spektrsAbsorbcijas spektrs

400 450 500 550 600 650 700

Page 18: 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija

10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

18

Pie darba ?Pie darba ?

Page 19: 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija

10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

19

Absorbcijas spektra noteikšanaAbsorbcijas spektra noteikšana

(nm) OD1 (o.v.) OD2 (o.v.)

400420440460480500520540

1. tabula

(nm) OD1 (o.v.) OD2 (o.v.)

560580600620640660680700

Page 20: 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija

10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

20

Absorbcijas spektra noteikšanaAbsorbcijas spektra noteikšana

400 450 500 550 600 650 700

OD

Page 21: 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija

10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

21

Page 22: 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija

10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

22

Page 23: 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija

10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

23

Ūdens un sausnas satura noteikšanaŪdens un sausnas satura noteikšana

2.1.

Page 24: 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija

10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

24

Proteīnu kvantitatīva noteikšanaProteīnu kvantitatīva noteikšana

2.2. Pamatā - krāsu reakcija

Bradfordas + proteīni => zils krāsojums reaģents (mērījumiem izdevīgs (brūns) = 590 nm - oranža gaisma)

Page 25: 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija

10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

25

Proteīnu kvantitatīva noteikšanaProteīnu kvantitatīva noteikšana

http://www.histosoft.com/services/background/ba/baback.html#ref

http://en.wikipedia.org/wiki/Bradford_protein_assay

Page 26: 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija

10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

26

Proteīnu kvantitatīva noteikšanaProteīnu kvantitatīva noteikšana

2.3. - reakcijas “kalibrēšana”

Reakciju veic ar zināmas koncentrācijas proteīnu (BSA)šķīdumiem, -

lai iegūtu OD sakarību ar proteīnu koncentrāciju.

0,1 mg/ml,0,3 mg/ml,0,5 mg/ml, 0,8 mg/ml.

Ar katras koncentrācijas šķīdumu veic 3 atkārtotas reakcijas / mērījumus.

Page 27: 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija

10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

27

Proteīnu kvantitatīva noteikšanaProteīnu kvantitatīva noteikšana

2.4. Reakcijas un mērījumu gaita:

1. Kivetē iepilda 2 ml Bradfordas reaktīva (2 reizes pa 1000 l).

Kivetes ņemt aiz rievotajām/matētajām malām!

Sekojiet, lai kivetes rievotās/matētās malas neievietotu gaismas ceļā!

Pārbaudiet vai FEK uzstādīts oraņžais filtrs.

Page 28: 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija

10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

28

Proteīnu kvantitatīva noteikšanaProteīnu kvantitatīva noteikšana

2.4. Reakcijas un mērījumu gaita:

2. Nospiežot pogu „R“, aparātu iestāda uz D = 0 (T% = 100).

Ieslēgt / izslēgt

Page 29: 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija

10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

29

Proteīnu kvantitatīva noteikšanaProteīnu kvantitatīva noteikšana

2.4. Reakcijas un mērījumu gaita:

3. Izņem kiveti un pievieno 20 l proteīnu šķīdumu.

4. Ar 1000 µl automātiskās pipetes palīdzību (iesūcot un izpūšot) samaisiet šķīdumus un ielieciet kiveti FEK.

Page 30: 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija

10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

30

Proteīnu kvantitatīva noteikšanaProteīnu kvantitatīva noteikšana

2.4. Reakcijas un mērījumu gaita:

5. Pēc 1 minūtes izdara mērījumu, nospiežot taustiņu „T“.

6. Rezultātu pierakstiet 3. tabulā.

T

Page 31: 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija

10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

31

Proteīnu kvantitatīva noteikšanaProteīnu kvantitatīva noteikšana

2.4. Reakcijas un mērījumu gaita:

Katrai reakcijai jālieto jauna kivete!

Katrai kivetei ar reaģentu individuāli jāiestāda OD = 0,00 (nospiežot kontroles (references) taustiņu “R”).

Page 32: 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija

10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

32

Proteīnu kvantitatīva noteikšanaProteīnu kvantitatīva noteikšana

2.3. - reakcijas “kalibrēšana”

3. tabulā jāieraksta reakcijā izmantoto proteīnu (BSA) masa.

0,1 mg/ml,0,3 mg/ml,0,5 mg/ml, 0,8 mg/ml.

Page 33: 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija

10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

33

Proteīnu kvantitatīva noteikšanaProteīnu kvantitatīva noteikšana

2.5. Reakcijas “kalibrēšanas” grafiks

Pēc iegūtajiem rezultātiem uz milimetru papīra konstruē graduācijas grafiku.

- uz X ass atliek proteīnu masu (g), kura ar 20 l BSA šķīduma tika ienesta reakcijā.

- uz Y ass atliek vidējo nomērīto optisko blīvumu (o.v.).

Vienības uz asīm izvēlieties tā, lai racionāli tiktu izmantots viss milimetru papīra laukums!

Page 34: 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija

10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

34

Proteīnu kvantitatīva noteikšanaProteīnu kvantitatīva noteikšana

2.5. Reakcijas “kalibrēšanas” grafiks

D(o.v.)

g BSA / 20 l šķīduma

.

..

. Grafikam jāsanāk lineāram!

Page 35: 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija

10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

35

Proteīnu kvantitatīva noteikšanaProteīnu kvantitatīva noteikšana

2.6. Proteīnu kvantitēšanas reakcijas analizējamo pārtikas produktu lizātiem.

Veic reakcijas un mērījumus ar pārtikas produkta lizātu.(2 atkārtojumus)

Rezultātus ieraksta 4. tabulā un aprēķina vidējo vērtību.

Page 36: 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija

10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

36

Proteīnu kvantitatīva noteikšanaProteīnu kvantitatīva noteikšana

2.6. Proteīnu kvantitēšanas reakcijas analizējamo pārtikas produktu lizātiem.

D(o.v.)

g BSA / 20 l šķīduma

.

..

.

Page 37: 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija

10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

37

Proteīnu kvantitatīva noteikšanaProteīnu kvantitatīva noteikšana

3.2. Proteīnu satura aprēķini produktos.

No grafika nolasītos rezultātus ieraksta arī 5. tabulā.

Tabulā apkopo arī grupas biedru rezultātus (proteīnu g / 20 l šķīduma, nevis OD !!! ).

Veic aprēķinus un izsaka:- proteīnu daudzumu (g) 100 g svaiga produkta;- % no sausnas masas.

Page 38: 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija

10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

38

Veiksmi darbāVeiksmi darbā

Page 39: 2. laboratorijas darbs. Spektrofotometrija

10.09.2012 LU Mikrobioloģijas un biotehnoloģijas katedra ML

39

Uz nākošo nodarbību Uz nākošo nodarbību (mājas darbs)(mājas darbs)

Rezultātu apstrāde un secinājumi:

3.1. 3.2.

!