2 蛋白质的结构与功能

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2 蛋白质的结构与功能. 本章重点与难点 重点:掌握组成蛋白质的氨基酸的结构特点、分类、三个字母代号及重要理化性质;掌握蛋白质 1-4 级结构特点、作用力;了解蛋白质结构与功能的关系;了解蛋白质的重要理化性质 难点:氨基酸结构特点、酸碱性质、等电点;蛋白质各级结构的概念和特点、结构与功能的关系;蛋白质重要理化性质的应用。. 2.1 概 述. 1 、蛋白质的生物学意义和元素组成 意义:蛋白质生物学功能的多样性 蛋白质生物学功能的复杂性 元素组成: C 、 H 、 O 、 N 、 S 、 P 及微量元素. - PowerPoint PPT Presentation

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Page 1: 2  蛋白质的结构与功能

2 蛋白质的结构与功能

Page 2: 2  蛋白质的结构与功能

本章重点与难点

重点:掌握组成蛋白质的氨基酸的结构特点、分类、三个字母代号及重要理化性质;掌握蛋白质 1-4 级结构特点、作用力;了解蛋白质结构与功能的关系;了解蛋白质的重要理化性质难点:氨基酸结构特点、酸碱性质、等电点;蛋白质各级结构的概念和特点、结构与功能的关系;蛋白质重要理化性质的应用。

Page 3: 2  蛋白质的结构与功能

2.1 概 述

1 、蛋白质的生物学意义和元素组成 意义:蛋白质生物学功能的多样性 蛋白质生物学功能的复杂性 元素组成: C 、 H 、 O 、 N 、 S 、 P 及微

量元素凯氏定 氮 法:蛋白质含量 = 蛋白氮含量 ╳ 6.25

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2 、蛋白质的分类 功能:

催化蛋白调节蛋白结构蛋白运输蛋白贮藏蛋白运动蛋白防御蛋白

电子传递蛋白

组成与溶解性

(1) 单纯蛋白质清蛋白等

(2) 结合蛋白质核蛋白等

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3 、蛋白质在生产和生活中的应用

食品与饲料

医药

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2.2 蛋白质的基本组成单位

1 、氨基酸的结构2 、氨基酸的分类3 、氨基酸的性质 两性性质与等电点;光学性质;化学反应4 、氨基酸的分离、生产与应用

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1 、氨基酸的结构 (21 种 )

C +NH3

COO-

H

R

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2 、氨基酸的分类 (1) 编码氨基酸: 21 种 (2) 非编码氨基酸: 5- 羟赖氨酸; 4- 羟脯氨酸

等 (3) 非蛋白质氨基酸: 150 多种不参与蛋白质组成的氨基酸

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3 、氨基酸的性质 (1) 氨基酸的两性性质与等电点 : 等电点 (isoelectric point, pI) : 在某一 pH 的溶液中,氨基酸解 : 离成阳离子和阴离子的趋势及程度相等,成为兼性离子,呈电中性。此时溶液的 pH 值称为该氨基酸的等电点。

pH=pI

+OH-

pH>pI

+H+

+OH-

+H+

pH<pI

氨基酸的兼性离子 阳离子 阴离子

CH

NH2

COOHR CH

NH2

COOHR

CH

NH3+

COO-R CH

NH3+

COO-R CH

NH2

COO-R CH

NH2

COO-RCH COOHR

NH3+

CH COOHR

NH3+

Page 10: 2  蛋白质的结构与功能

(2) 氨基酸的光学活性与吸收光谱

1 、 L- 、 D- :以甘油醛为 CK 划分的(不对称 C 原子的存在)。 所有的 20 种蛋白质氨基酸为 L- a- 氨基酸。 2 、旋光性:用旋光仪测定的(不对称 C 原子的存在) 左旋: Ser 、 Leu 、 Pro 、 Trp 、 Phe 等。 右旋: Ala 、 Ile 、 Glu 、 Asp 、 Val 、 Lys 、 Arg 等。 Gly 由于不具有不对称 C 原子,所以没有旋光性。 3 、光吸收: 可见光( 390~770nm ):无光吸收。 紫外光( 220~300nm ): Phe ( 257nm ) Tyr ( 275nm ) Trp ( 280nm )

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(3) 氨基酸的化学反应 1 、茚三酮反应 CH2

CHCOO-

NH2+

CH2

CH2

CH2

CHCOO-

NH2+

CH2

CH2

脯氨酸

(亚氨基酸)

氨基酸与茚三酮水合物共热,可生成蓝紫色化合物,其最大吸收峰在 570nm 处。

Page 12: 2  蛋白质的结构与功能

2 、甲醛反应

Page 13: 2  蛋白质的结构与功能

3 、 2 、 4- 二硝基氟苯的反应

2N F

NO2

+ H2N CH C

R O

HN CH C

R O

O2N

NO2

H+

H2OO2N

NO2

HN CH C

R O

OH + 氨基酸

DNFB N- 端氨基酸 DNP 衍生物

DNP- 氨基酸

Page 14: 2  蛋白质的结构与功能

4 、荧光胺反应与丹磺酰氯反应 用 DNS( 二甲基萘磺酰氯 ) 测定 N 端氨基酸

原理 DNFB 法相同 但水解后的 DNS- 氨基酸不需分离,可直接用电

泳或层析法鉴定 由于 DNS 有强烈荧光,灵敏度比 DNFB 法高 10

0 倍,比 Edman 法高几到十几倍 可用于微量氨基酸的定量

Page 15: 2  蛋白质的结构与功能

5 、异硫氰酸苯酯的反应N C S NH CH C

O

R2

N CH C

O

R1

H

H

N

H

S:C

CH C

O

R1

HN NH CH C

O

R2

N

CO CH

NH

SC

R1

PITCPITC

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4 、氨基酸的分离、生产与应用 1 、氨基酸的分析分离 层析方法 2 、氨基酸的生产 3 、氨基酸的应用

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2.3 蛋白质的结构1 、蛋白质的一级结构 肽和肽键;天然活性肽;一级结构的测定2 、蛋白质的三维结构(1) 蛋白质构象的概念与稳定蛋白质构象的作用力(2) 蛋白质的二级结构(3) 蛋白质的超二级结构和结构域 (4) 蛋白质的三级结构(5) 蛋白质的四级结构

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1 、蛋白质的一级结构(1) 肽与肽键 :肽键 (peptide bond) 是由一个氨基酸的 - 羧基与另一个

氨基酸的 - 氨基脱水缩合而形成的化学键。

NH2-CH-C

H

O

OH甘氨酸

NH2-CH-C

H

O

OH甘氨酸

NH-CH-C

H OH

OO

H甘氨酸

+

-HOH

肽键

NH2-CH-C-N-CH-CO

OHHHH

ONH2-CH-C-N-CH-C

O

OHHHH

O

肽键产生的几个重要结果:

( 1 )肽键的部分双键性质

介于单双键之间

( 2 )键的旋转性

( 3 )主链酰胺平面

(4)Cα 的顺反构型

(5) 二面角

(6) 肽键的偶极性

Page 19: 2  蛋白质的结构与功能

(2) 天然活性肽 谷胱甘肽:

脑啡肽

短杆菌肽

肽类激素

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(3) 一级结构的测定步骤①测定蛋白质的分子质量和多肽链的数目②拆开蛋白质分子的多肽链③断开多肽链内的二硫键④分析每一条多肽链的氨基酸组成⑤鉴定多肽链的 N末端和 C末端残基⑥把多肽链裂解成两组以上大小不等的较小片段⑦测定各肽段的氨基酸序列⑧重叠各肽段,重建完整多肽链的一级结构顺序⑨确定半胱氨酸残基间形成的二硫键的位置

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2 、蛋白质的三维结构

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(1) 蛋白质构象的概念与 稳定蛋白质构象的作用力

构象:是指与碳原子相连的各原子或取代基团在单键旋转时形成的相对空间排布。

稳定蛋白质构象的作用力: ①氢键 ②范德华力 ③疏水力 ④离子键 ⑤ 二硫键

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(2) 蛋白质的二级结构 1 、概念:多肽链主链沿一定方向折叠盘绕,通过 氢键作用形成的空间构象。 2 、基本类型: a-螺旋 -折叠 - 转角 无规则卷曲

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a-螺旋

①3.6 个氨基酸残基上升一圈, 螺距 0.54nm ,每个 aa上升 0.15nm ,旋转 1000 。 ②氢键:螺旋 3.6(13) ③R- 基团分布于螺旋外侧 (基团大小、种类、形状均影响 a- 螺

旋) 同性电荷 aa 相斥 侧链较大 影响 Gly 二面角广泛 Pro形不成氢键 中断 ④ a-螺旋均为右手螺旋

Page 25: 2  蛋白质的结构与功能

-折叠 ①定义:两条或几条几乎完全伸展的多肽链侧向聚集在一起,相邻肽

链主链上的氨基和羰基之间形成有规则的氢键,维持这种片层结构的稳定。

②特点: 多肽链主链比较伸展,相邻 aa 的轴心距为 0.35nm ,侧链 R交 替分布在片层平面的上、下方。 有平行和反平行两面种 几乎所有的肽键都参与了链间氢键的形成

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- 转角

①定义:蛋白质分子的多肽链在形成空间构象时,经常会出现 1800 的回折,回折处的结构就称为 ~ 。

②特点: 一般由 4 个连续的 aa 组成。 Gly 和 Pro易出现在 - 转角。

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(3) 蛋白质的超二级结构和结构域 超二级结构定义:在蛋白质分子中,若相邻的二级结构单元组合在一起,相互作用,形成的有规则的在空间上可辩认的二级结构组合体,充当三级结构的构件。

形式: 、( )、

结构域的定义:在超二级结构的基础上,多肽链进一步 卷曲。折叠成几个空间上可以区分的相对独立的、近似球状的三维实体,其中每一个三维实体就称一个 ~ 。

形式: -折叠桶、 -螺旋构成的结构域

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(4) 蛋白质的三级结构 1 、定义:在二级结构、超二级结构和结构域的基础上,多肽链进一步盘绕、折叠形成更为复杂的球状分子结构,叫 ~ 。

2 、特点: 亲水基团位于分子表面 疏水基团位于分子内部,形成疏水核心 3 、例子: 肌红蛋白

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(5) 蛋白质的四级结构 1 、定义:由两个或两个以上具有三级结构的亚基

或亚单位通过非共价键彼此缔合在一起而形成的具有特定三维结构的聚集体,叫 ~ 。

2 、例子: 血红蛋白

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2.4 蛋白质结构与功能的关系1 、蛋白质一级结构与功能的关系 一级结构与同源蛋白质的物种差异和生物进化 一级结构变异与分子病 一级结构断裂与功能激活2 、蛋白质构象与功能的关系 变构调节活性; 变性丧失活性

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2.5 蛋白质的重要性质、分离纯化与鉴定

1 、蛋白质的重要性质 蛋白质的两性性质与等电点;蛋白质的胶体性质与沉淀;蛋白质的变性与复性;蛋白质的呈色反应

2 、蛋白质分离纯化的原则与方法 原则;基本步骤;基本原理与方法3 、蛋白质含 量测定与纯度鉴定 含量与活性测定;纯度鉴定

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1 、蛋白质的重要性质 (1) 蛋白质的两性性质与等电点 等电点( pI ):见 aa 等电点时的特性: ( 1 ) 净电荷为零 ( 2 )易沉淀析出,溶解度下降

失去双电层 ( 3 )导电能力下降 ( 4 ) 粘度最小

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(2) 蛋白质的胶体性质与沉淀 1 、溶质分子直径与溶液 真溶液 胶体颗粒 悬浊液 d<1nm 1nm<d<100nm d>100nm 2 、胶体稳定的原因: ( 1 )水化膜 ( 2 )双电层

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(3) 蛋白质的变性与复性1 、变性:( 1 )定义:在物理或化学因素作用下,天然蛋白质分子的次级键发生断裂 ,引起构

象改变,致使蛋白质的某些理化性质发生改变,生物活性丧失, 但一级结构未受破坏,这种现象叫 ~ 。

( 2 )变性后的特征: 溶解度降低,易沉淀析出 ①生物活性丧失 结晶能力丧失 ②理化性质改变 蛋白质分子形状改变,粘度增加。 某些基团暴露,光谱改变( 3 )变性因素:高温、高压、强酸、强碱、各种射线、某些化学试剂。

2 、复性:当变性因素除去之后,已变性的蛋白质又可重新回复到天然构象,

这一现象叫 ~ 。

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(4) 蛋白质的呈色反应 一般反应:指游离氨基酸也具备的反应 ,如米伦反应、酚试剂反应等。

特殊颜色反应:指蛋白质有而氨基酸不具备

的呈色反应。如蛋白质的双缩脲反应。

Page 36: 2  蛋白质的结构与功能

2 、蛋白质分离纯化的原则与方法

3 、蛋白质含量测定与纯度鉴定

见实验