1.pengenalan mikrobiologi

Upload: khaidirm2345

Post on 15-Oct-2015

50 views

Category:

Documents


2 download

TRANSCRIPT

  • 10/5/2010

    1

    Biologi & Mikrobiologi

    LingkunganEko Heryadi, S.Hut.,MP.,M.Sc

    [email protected]

    Biologi & Mikrobiologi Lingkungan

    Manfaat Mata Kuliah : Memberikan manfaat kepada mahasiswa tentang

    biologi dan mikrobiologi lingkungan, hubunganmikrobiologi dan pencemaran, serta industrimikrobiologi

    Tujuan Instruksional Umum

    Setelah mengikuti matakuliah ini diharapkanmahasiswa mengetahui :

    Pengertian dan perkembangbiakan Bakteri, Virus dan Jamur

    Mikrobia dan pencemaran

    Mikrobiologi limbah

    Mikrobiologi tanah dan udara

  • 10/5/2010

    2

    Tujuan Instruksional Khusus Mahasiswa mengetahui dan memahami asas-

    asas : Mikrobiologi dan Industri Mikrobiologi Bakteri , Virus, dan Jamur Mikroba dan Pencemaran Mikrobiologi Limbah Mikrobiologi Tanah Mikrobiologi Udara

    Referensi

    Waites et al, 2005, Industrial Microbiology: An Introduction, Blacwell Science

    Kimball, J.W, 1983, Biology, Penerbit Erlangga

    Stansfield et al, 2006, Biologi Molekuler dan Sel, Schaum Outlines

    Albert B et al, 1994, Biologi Molekuler Sel Mengenal Sel, Gramedia

    Yuwono, T, 2006, Bioteknologi Pertanian, Gajahmada University Press

    Ilmu Biologi

    Mempelajari Kehidupan (Learn of Life) Hakikat Hidup

    Mencari Kebenaran (Searching the Truth) tidak mutlak dantidak dapat dipercaya begitu saja

    Mempelajari hubungan makhluk hidup dengan lingkungannya

    Merupakan penyelidikan tentang kejadian/masalah yang perlu dimengerti dan dipecahkan, dapat menimbulkan

    masalah baru dan perasaaan ingin memecahkan masalah

    Mempelajari masa lalu, masa kini, dan masa yang akandatang

    Kelakuan kita (Habits), kesehatan (Health), teknologi dansebagainya untuk masa depan kita

    Habits, Health and Technologies for our Future

  • 10/5/2010

    3

    Cabang Cabang Ilmu Biologi

    Anatomi

    Morfologi

    Taksonomi

    Fisiologi

    Sitologi

    Ekologi

    Parasitologi

    Genetika

    Mikrobiologi

    Mempelajari struktur dalam organisme

    Mempelajari bentuk dan struktur luar organisme

    Mempelajari klasifikasi makhluk hidup

    Mempelajari kefaalan dalam tubuh organisme

    Mempelajari susunan dan fungsi Sel

    Mempelajari interaksi makhluk hidup denganlingkungannya

    Mempelajari parasit penyebab penyakit padamanusia

    Mempelajari sifat menurun pada makhluk hidup

    Mempelajari mikroorganisme

    Cabang Cabang Ilmu Biologi

    Anatomi

    Morfologi

    Taksonomi

    Fisiologi

    Sitologi

    Ekologi

    Parasitologi

    Genetika

    Mikrobiologi

    Mempelajari struktur dalam organisme

    Mempelajari bentuk dan struktur luar organisme

    Mempelajari klasifikasi makhluk hidup

    Mempelajari kefaalan dalam tubuh organisme

    Mempelajari susunan dan fungsi Sel

    Mempelajari interaksi makhluk hidup denganlingkungannya

    Mempelajari parasit penyebab penyakit padamanusia

    Mempelajari sifat menurun pada makhluk hidup

    Mempelajari mikroorganisme

    I. DEFINISI MIKROBIOLOGI

    Mikrobiologi: Telaah mengenai organisme hidup berukuran mikroskopis yang meliputi: virus,

    bakteri, archaea, protozoa, algae, dan fungi

    beberapa mikroba (algae dan fungi) yang berukuran cukup besar dan dapat dilihatdengan mata telanjang, tetapi masih dimasukan dalam kajian mikrobiologi, karena:

    teknik yang sama (isolasi, sterilisasi, penumbuhan pada mediaartifisial) digunakan untuk mempelajarinya

  • 10/5/2010

    4

    II. SEJARAH MIKROBIOLOGI

    POKOK BAHASAN

    A. PENEMUAN MIKROORGANISME

    B. KONFLIK GENERASI SPONTAN

    C. TEKNIK KULTUR MURNI

    D. PERANAN MIKROORGANISME

    I. SEJARAH MIKROBIOLOGI

    Antony van Leeuwenhoek (1632-1723)

    Ilmuwan pertama yang melihat dan mendeskripsikan mikroorganisme secara akurat

    pada tahun 1660.

    A. PENEMUAN MIKROORGANISME

    I. SEJARAH MIKROBIOLOGI

    POKOK BAHASAN

    A. PENEMUAN MIKROORGANISME

    B. KONFLIK GENERASI SPONTAN

    C. TEKNIK KULTUR MURNI

    D. PERANAN MIKROORGANISME

    I. SEJARAH MIKROBIOLOGI

  • 10/5/2010

    5

    spontaneous generation

    Organisme hidup berasal materi mati atau materi dekomposisi (Aristoteles

    1400)

    Francesco Redi (1626-1697)

    Menunjukkan bahwa belatung pada daging busuk berasal dari telur lalat

    bukan berasal dari daging itu sendiri

    B. KONFLIK GENERASI SPONTAN

    I. SEJARAH MIKROBIOLOGI

    John Needham (1713-1781)

    setelah daging dipanaskan dan dibiarkan mendingin

    akan muncul mikroorganisme

    Lazzaro Spallanzani (1729-1799)

    menunjukkan bahwa setelah daging dalam labu dipanaskan dan kemudian ditutup

    rapat-rapat tidak memunculkan mikroorganisme, karena udara yang membawa benih

    kultur tidak dapat masuk ke labu.

    I. SEJARAH MIKROBIOLOGI

    B. KONFLIK GENERASI SPONTAN

    Louis Pasteur (1822-1895)

    Kaldu daging dalam labu leher angsa dan dipanaskan dansetelah dingin udara dibiarkan masuk melalui leher angsa

    tabung

    Debu udara tidak dapat masuk

    Hasil: tidak ada pertumbuhan mikroorganisme

    I. SEJARAH MIKROBIOLOGI

    B. KONFLIK GENERASI SPONTAN

    John Tyndall (1820-1893)

    Menunjukkan bahwa debu membawa mikroorganisme

    Jika debu tidak ada maka kaldu nutrin tetap steril walaupunterdedah udara

  • 10/5/2010

    6

    POKOK BAHASAN

    A. PENEMUAN MIKROORGANISME

    B. KONFLIK GENERASI SPONTAN

    C. TEKNIK KULTUR MURNI

    D. PERANAN MIKROORGANISME

    I. SEJARAH MIKROBIOLOGI

    Kultur murni:kultur yang hanya mengandung spesies tunggal

    Teknik pengenceran (Pasteur dkk)

    Untuk memperoleh kultur tunggal dilakukan pengenceran

    Metode streak plate (Robert Koch, 1843-1910)

    Untuk memperoleh kultur tunggal dilakukan streak pada medium padat(agar)

    Agar: agen pemadat (gelling) yang digunakan sampai sekarang

    C. TEKNIK KULTUR MURNI

    I. SEJARAH MIKROBIOLOGI

    POKOK BAHASAN

    A. PENEMUAN MIKROORGANISME

    B. KONFLIK GENERASI SPONTAN

    C. TEKNIK KULTUR MURNI

    D. PERANAN MIKROORGANISME

    I. SEJARAH MIKROBIOLOGI

  • 10/5/2010

    7

    D. PERANAN MIKROORGANISME

    I. SEJARAH MIKROBIOLOGI

    1) Hubungan Mikroorganisme dan Penyakit

    2) Perkembangan Teknik untuk Mempelajari Patogen Mikroba

    3) Kajian Imunologis

    4) Mikrobiologi Industri dan Ekologi Mikroba

    D. PERANAN MIKROORGANISME

    I. SEJARAH MIKROBIOLOGI

    Agostino Bassi (1773-1856)

    penyakit ulat sutra (silkworm) disebabkan oleh jamur

    M. J. Berkeley ( 1845)

    penyakit pada kentang disebabkan oleh jamur

    Louis Pasteur

    Penyakit pada ulat sutra yang disebabkan protozoa

    Joseph Lister

    Secara tidak langsung membuktikan bahwa mikroba adalah agen penyebabpenyakit

    Mengembangkan sistem operasi (pembedahan) yang dirancang untukmencegah mikroba menginfeksi luka operasi

    Lebih sedikit pasien mengalami infeksi pascaoperasi

    1) Hubungan Mikroorganisme dan Penyakit

    I. SEJARAH MIKROBIOLOGI

    D. PERANAN MIKROORGANISME

    Robert Koch (1843-1910), Mengetahui hubungan antara Bacillus anthracis dan anthrax

    Kochs Postulates:

    1) Isolate bakteri dari cairan tubuh pasien diinokulasi (streak) pada nutrinagar dan mengamati bentuk sel di bawah mikroskop. In vitro.

    2) Propagate menumbuhkan koloni hasil isolasi pada media nutrin. In vitro.

    3) Inoculate menginokulasikan mikroba yang dicurigai sebagai patogen kehewan sehat dan menimbulkan gejala (symptoms) penyakit yang sama. In

    vivo.

    4) Reisolate langkah 1 diulang. In vitro

    1) Hubungan Mikroorganisme dan Penyakit

  • 10/5/2010

    8

    I. SEJARAH MIKROBIOLOGI

    D. PERANAN MIKROORGANISME

    2) Perkembangan Teknik untuk Mempelajari Patogen Mikroba

    Koch and his associates:

    Mengembangkan teknik, reagen, dan materi lain untuk mengkulturbakteri patogen pada media padat

    Teknik memungkinkan untuk mengisolasi kultur murni Charles Chamberland (1851-1908)

    Membuat filter bakterial untuk memisahkan bakteri dan mikroba yangberukuran lebih besar;

    Teknik ini mengarahkan penemuan virus sebagai agen penyebabpenyakit

    I. SEJARAH MIKROBIOLOGI

    D. PERANAN MIKROORGANISME

    3) Kajian Imunologis

    Edward Jenner ( 1798)

    Menggunakan prosedur vaksinasi untuk melindungi individu dari cacar (smallpox) Louis Pasteur (1880)

    Mengembangkan vaksin lain: kolera ayam, antrax, dan rabies Emil von Behring (1854-1917) and Shibasaburo Kitasato (1852-1931)

    menemukan antitoksin diphtheria Elie Metchnikoff (1845-1916)

    menemukan sel fagosit dalam darah yang berperan dalam imunitas (kekebalan)

    Louis Pasteur Fermentasi alkohol adalah hasil aktivitas mikroba

    Fermentasi dapat berlangsung aerob dan anaerob

    pasteurisasi untuk mengawetkan anggur selama penyimpanan

    Sergei Winogradsky (1856-1953) bakteri tanah dapat mengoksidasi besi, belerang, dan amonia untuk mendapatkan

    energi

    Fiksasi nitrogen anerob dan dekomposisi selulosa

    Martinus Beijerinck (1851-1931)

    Mengisolasi bakteri penambat nitrogen aerobik dan bakteri pereduksi sulfat

    I. SEJARAH MIKROBIOLOGI

    D. PERANAN MIKROORGANISME

    4) Mikrobiologi Industri dan Ekologi Mikroba

  • 10/5/2010

    9

    III. Anggota Dunia Mikroba

    Prokariot Morfologi relatif sederhana dan tidak memiliki

    nukleus Eukariot

    morfologi relatif kompleks dan mempunyainukleus

    Pada umumnya organisme dapatdiklasifikasikan dalam 5 kingdom: Monera (Prokariotae), Protista, Fungi, Hewan

    dan Tanaman; Mikrobiologi hanya mengkaji: monera,

    protista, dan fungi, dan juga virus

    Sel

    Prokariot

    Eukariot

  • 10/5/2010

    10

    IV. Cakupan Mikrobiologi

    Mikroorganisme adalah organisme hidup yang pertama kali di planet bumi, hidup di mana pun selama kehidupan memungkinkan, lebih banyakdibandingkan organisme lain, dan mungkinpenyusun terbesar komponen biomasa bumi

    Seluruh ekosistem tergantung pada aktivitasmikroorganisme, dan mikroorganismemempengaruhi masyarakat manusia

    Mikrobiologi mempunyai imbas terhadapbanyak bidang di antaranya kedokteran, pertanian, ilmu pangan, ekologi, genetika, biokimia, dan biologi molekuler

    Mikrobiologiwan dapat mendalami tipeorganisme spesifik:

    1. Virologiwan-viruses

    2. Bakteriologiwan-bacteria

    3. Phycologiwan atau Algologiwan-algae

    4. Mikologiwan-Jamur

    5. Protozoologiwan-protozoa

    Mikrobiologiwan mungkin tertarik pada berbagaikarakter dan aktivitas mikroorganisme:

    1. Morfologi Mikroba

    2. Sitologi Mikroba

    3. Fisiologi Mikroba

    4. Ekologi Mikroba

    5. Genetika dan Biologi Molekuler Mikroba

    6. Taksonomi Mikroba

  • 10/5/2010

    11

    Mikrobiologiwan dapat mengfokuskan padaaplikasi mikroorganisme:

    1. Mikrobiologi Kedokteran, termasuk imunologi

    2. Mikrobiologi Pangan

    3. Mikrobiologi Kesehatan Masyarakat

    4. Mikrobiologi Pertanian

    5. Mikrobiologi Industri

    The Future of Microbiology

    Mikrobiologi telah dan akan terus berpengaruh terhadapmasyarakat.

    Ahli mikrobiologi di masa depan akan:1. Mencoba untuk memahami secara lebih baik dan

    mengendalikan penyakit yang telah ada, yang muncul, dan muncul kembali.

    2. Mengkaji ketekaitan antara agen infeksi denganpenyakit kronis.

    3. Mempelajari lebih mendalam tentang pertahananinang dan interaksi inang-patogen

    4. Mengembangkan aplikasi baru mikroba dalambidang industri, pertanian, dan pengendalianlingkungan

    The Future of Microbiology

    5. Masih mengungkap banyak mikroba yang belumdapat diidentifikasi dan dikultivasi

    6. Mencoba memahami secara lebih baikbagaimana mikroba berinteraksi danberkomunikasi

    7. Menganalisis dan menafsirkan data yang terusmeningkat dari kajian genom Melanjutkanpenggunaan mikroba sebagai sistem model untukmenjawab pernyataan fundamental dalam bidangbiologi

    8. Memperkirakan dan mengkomunikasikandampak potensial penemuan dan teknologi baruterhadap masyarakat

  • 10/5/2010

    12

    Sekian