Загрузка данных в системе r
DESCRIPTION
Приведен пример загрузки данных в рабочую среду системы статистических вычислений R.TRANSCRIPT
3.1. Использование Excel для подготовки данных
Microsoft Excel – одна из наиболее
распространенных программ для подготовки
данных для R
Перед загрузкой в R, Excel-файл обычно сохраняют как текстовый файл.txt or .csv
Имеется возможность работать и с др.
форматами (SPSS, SAS, Access, SQL, и др.) – см. пакет foreign
Author: Sergey Mastitsky
Никаких пустых ячеек – отсутствующие значения обозначаются как NA
Присвойте имя каждой
переменной:
Никаких пробелов в именах
Имена не должны начинаться с точек или
чисел
Файл стоит поместить в текущую рабочую
папку
Author: Sergey Mastitsky
Эксперимент по влиянию pH на рост
Dreissena polymorpha* 4 pH-группы: Control (вода из оз.
Онтарио), A (7.3), B (7.1), and C (6.9)
Три повтора на группу: Control1-
Control3, A1-A3, B1-B3, и C1-C3
Wikipedia Author: Sergey Mastitsky
* Claudi R, Graves A, Taraborelli AC, Prescott RJ, Mastitsky SE (2012)
Impact of pH on survival and settlement of dreissenid mussels. Aquatic
Invasions 7(1): 21-28
3.2. Загрузка данных
Подробнее см.:
http://r-analytics.blogspot.de/2011/11/r_08.html
Из командной строки: > setwd("~/Introductory R
Course/R_Course_Datasets")
Или в RStudio:
Session -> Set Working Directory -> Choose
Directory -> …
Author: Sergey Mastitsky
Откройте файл pH_down_experiment.xls
Ознакомьтесь с данными
Сохраните как файл с разделителем в виде
табуляции
Откройте файл
в текстовом редакторе
и посмотрите, как
он выглядит
Author: Sergey Mastitsky
"Рабочая лошадка" для загрузки данных
Основные аргументы: - file = "имя.txt": имя файла (или
URL-ссылка) - header = TRUE: есть ли в файле
заголовки столбцов - sep = "\t" или sep = "," :
разделитель значений в файле
Author: Sergey Mastitsky
> LWdata <- read.table(
file = "pH_down_experiment.txt",
header = TRUE,
sep = "\t")
> names(LWdata)
> head(LWdata)
> LWdata
Author: Sergey Mastitsky
Author: Sergey Mastitsky
Author: Sergey Mastitsky
> save.image(file =
"pH_experiment.rda")
Или в RStudio:
Environment -> Save Workspace As… pH_experiment.rda
Author: Sergey Mastitsky