数据来源： ddbj 统计截止日期： 2000 年 10 月 23 日
DESCRIPTION
说明. 数据来源： DDBJ 统计截止日期： 2000 年 10 月 23 日. 香港没有全部统计在内； 如果提交者没有写 “ CHINA ” ，则无法统计，但这种估计这种情况极少，只发现一条记录写了 “ PROC ” 。. 概况 ( 非 EST 部分 ). 序列总数： 6522 序列总长度： 37492880 平均序列长度： 5748 最长： 266941( 台湾 ) 209216( 上海 ). 序列数 --- 地区分布. 台湾. 云南. 18%. 8%. 广东. 5%. 其他. 上海. 16%. 25%. - PowerPoint PPT PresentationTRANSCRIPT
数据来源： DDBJ统计截止日期： 2000 年 10 月 23 日
说明
•香港没有全部统计在内；•如果提交者没有写“ CHINA”，则无法统计，但这种估计这种情况极少，只发现一条记录写了“ PROC”。
序列总数： 6522序列总长度： 37492880
平均序列长度： 5748最长： 266941( 台湾 ) 209216( 上海 )
概况 (非 EST 部分 )
北京28%
台湾18%
云南8%广东5%
其他16%
上海25%
地区 序列数 ％北京 1815 27.83%上海 1601 24.55%台湾 1193 18.29%云南 536 8.22%广东 340 5.21%其他 1037 15.90%
总计 6522 100%
地区 序列数 ％江苏 250 24.11%湖北 247 23.82%陕西 122 11.76%湖南 76 7.33%浙江 68 6.56%青海 58 5.59%山东 56 5.40%福建 45 4.34%四川 37 3.57%甘肃 21 2.03%吉林 11 1.06%黑龙江 10 0.96%安徽 8 0.77%辽宁 6 0.58%河北 5 0.48%河南 5 0.48%重庆 3 0.29%江西 2 0.19%海南 2 0.19%天津 2 0.19%广西 2 0.19%香港 1 0.10%
总计 1037 100%
序列数 --- 地区分布
北京15%
上海35%
台湾45%
云南1%
广东1%
其他3%
地区 序列长度 %北京 5778285 15.41%上海 13030948 34.76%台湾 16952737 45.22%云南 336185 0.90%广东 291668 0.78%其他 1103057 2.94%
总计 37492880 100%
地区 序列长度 ％江苏 152784 13.85%
湖北 285134 25.85%
陕西 79368 7.20%
湖南 117362 10.64%
浙江 99621 9.03%
青海 68137 6.18%
山东 30613 2.78%
福建 42430 3.85%
四川 52786 4.79%
甘肃 16765 1.52%
吉林 3356 0.30%
黑龙江 16630 1.51%
安徽 90217 8.18%
辽宁 9001 0.82%
河北 5981 0.54%
河南 3579 0.32%
重庆 2798 0.25%
江西 7823 0.71%
海南 2156 0.20%
天津 1777 0.16%
广西 897 0.08%
香港 13842 1.25%
总计 1103057 100%
序列长度 --- 地区分布
最长的序列
AF165124 195909 bp human.Homo sapiens chromosome 5q31.1-q33.1 clone BAC djn082c10 containing GABRG2 gene, complete sequence.Jiang,S., Yu,J., He,L. and Yang,H.Submitted (02-JUL-1999) Human Genome Center, Institute of Genetics, Chinese Academy of Sciences, Datun Road, Beijing 100101, People's Republic of China
AF190464 209216 bp human.Homo sapiens hepatocytic transcription factor (B1F) gene, alternatively spliced products, complete cds, complete sequence.Lin,W., Fu,G., Dong,H. and Huang,G.M.Submitted (26-SEP-1999) Chinese Human Genome Center at Shanghai, 351 Guoshoujing Road, Zhangjiang Hi-Tech Park, Shanghai 201203, People's Republic of ChinaWang,Y., Zhang,C. and Cai,Y.Submitted (26-SEP-1999) Research Group of Hepatitis Viruses, Shanghai Institute of Biochemistry, Chinese Academy of Science, 320 Yueyang Road, Shanghai 200031, People's Republic of China
AF213884S2 266941 bp human. Homo sapiens mannosidase, beta A, lysosomal (MANBA) gene, and ubiquitin-conjugating enzyme E2D 3 (UBE2D3) genes, complete cds.Chang,H.-M. and Tsai,S.-F.Submitted (09-DEC-1999) Institute of Genetics, National Yang-Ming University, 155 Li-Rong St. Section 2, Peitou, Taipei, Taiwan 11221, Republic of China
最长的序列
0
2000
4000
6000
8000
10000
12000
14000
16000
台湾
香港
安徽
上海
江西
北京
黑龙江
湖南
辽宁
浙江
四川
河北
青海湖北
海南
福建
重庆
天津
广东
甘肃
河南
陕西
云南
江苏
山东
广西
吉林
地区 平均长度 嘴长 最短台湾 14210 266941 92
香港 13842 13842 13842
安徽 11277 80009 458
上海 8139 209216 50
江西 3912 7388 435
北京 3184 195909 60
黑龙江 1663 3188 467
湖南 1544 13615 96
辽宁 1500 2470 983
浙江 1465 6395 198
四川 1427 9832 321
河北 1196 1422 305
青海 1175 1383 611
湖北 1154 12310 94
海南 1078 1385 771
福建 943 4306 51
重庆 933 1763 218
天津 889 1561 216
广东 858 9435 46
甘肃 798 1162 378
河南 716 1449 440
陕西 651 5829 105
云南 627 1563 93
江苏 611 4539 123
山东 547 1890 288
广西 449 456 441
吉林 305 510 94
地区 平均长度 嘴长 最短台湾 14210 266941 92
香港 13842 13842 13842
安徽 11277 80009 458
上海 8139 209216 50
江西 3912 7388 435
北京 3184 195909 60
黑龙江 1663 3188 467
湖南 1544 13615 96
辽宁 1500 2470 983
浙江 1465 6395 198
四川 1427 9832 321
河北 1196 1422 305
青海 1175 1383 611
湖北 1154 12310 94
海南 1078 1385 771
福建 943 4306 51
重庆 933 1763 218
天津 889 1561 216
广东 858 9435 46
甘肃 798 1162 378
河南 716 1449 440
陕西 651 5829 105
云南 627 1563 93
江苏 611 4539 123
山东 547 1890 288
广西 449 456 441
吉林 305 510 94
序列平均长度 --- 地区分布
0
100
200
300
400
500
600
700
0 | 100 | 200 | 300 | 400 | 500 | 600 | 700 | 800 | 900 | 1K
序列长度 --- 正态分布
0
20
40
60
80
100
120
10K | 50K | 100K | 150K | 200K | 250K | 300K
0
500
1000
1500
2000
2500
1K | 2K | 3K | 4K | 5K | 10K
0－ 1K
10－ 300K
1K－ 10K
序列数 --- 年代分布
0
500
1000
1500
2000
2500
3000
3500
90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 00
序列长度 --- 年代分布
0
5,000,000
10,000,000
15,000,000
20,000,000
25,000,000
30,000,000
35,000,000
40,000,000
90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 00
最早提交者
KPNIFJG 720 bp DNA BCT 11-MAY-1992K.pneumoniae nifJ gene promoter and partial sequence of nifJ gene.Submitted (28-AUG-1989) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. S.C. Shen, Y. Wu, G. Yu and J. Zhu, SHANGHAI INSTITUTE OF PLANT PHYSIOLOGY, ACCADEMICA SINICA, 300 FONGLIN ROAD, SHANGHAI 200032, P.R. CHINA
KPNIFJG 720 bp DNA BCT 11-MAY-1992K.pneumoniae nifJ gene promoter and partial sequence of nifJ gene.Submitted (28-AUG-1989) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. S.C. Shen, Y. Wu, G. Yu and J. Zhu, SHANGHAI INSTITUTE OF PLANT PHYSIOLOGY, ACCADEMICA SINICA, 300 FONGLIN ROAD, SHANGHAI 200032, P.R. CHINA
ZMACCR11 4150 bp DNA PLN 02-OCT-1990Maize DNA for cryptic Ac-11 sequence.Submitted (22-FEB-1990) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. Chen J., Institute of Molecular Biology, Academia Sinica Taiwan, Republic of China
ZMACCR11 4150 bp DNA PLN 02-OCT-1990Maize DNA for cryptic Ac-11 sequence.Submitted (22-FEB-1990) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. Chen J., Institute of Molecular Biology, Academia Sinica Taiwan, Republic of China
BSPGIB 1866 bp DNA BCT 20-APR-1995Bacillus stearothermophilus pgiB gene for phosphoglucose isomerase isoenzyme B (EC 5.3.1.9).Submitted (25-SEP-1989) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. Tao W., Institute of Genetics , Fu
dan University , Shanghai, People's Republic of China
BSPGIB 1866 bp DNA BCT 20-APR-1995Bacillus stearothermophilus pgiB gene for phosphoglucose isomerase isoenzyme B (EC 5.3.1.9).Submitted (25-SEP-1989) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. Tao W., Institute of Genetics , Fu
dan University , Shanghai, People's Republic of China
POVVHA 1458 bp DNA VRL 26-MAY-1995Vaccinia virus gene for viral hemagglutinin.Submitted (30-JUN-1989) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. D.Y.Jin, Institute of Virology, Chinese Academy of Preventive Medicine, 100 Yingxin Street, Beijing 1000 52, Peoples Republic of China
POVVHA 1458 bp DNA VRL 26-MAY-1995Vaccinia virus gene for viral hemagglutinin.Submitted (30-JUN-1989) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. D.Y.Jin, Institute of Virology, Chinese Academy of Preventive Medicine, 100 Yingxin Street, Beijing 1000 52, Peoples Republic of China
DMLAMB2 4482 bp RNA INV 29-APR-1991Drosophila mRNA for laminin B2 chain.Submitted (03-JUN-1988) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. Chi H.C., Institute of Molecular
Biology, Academia Sinica, Nankang, Taipei 11529, Republic of China
DMLAMB2 4482 bp RNA INV 29-APR-1991Drosophila mRNA for laminin B2 chain.Submitted (03-JUN-1988) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases. Chi H.C., Institute of Molecular
Biology, Academia Sinica, Nankang, Taipei 11529, Republic of China
序列数 --- 分类
30%
22%14%
8%
6%
5%4%4%3%
3%
HUM PLN VRL VRT BCT INV MAM PRI HTG
ROD SYN STS GSS UNA PHG
分类 序列数HUM 1894PLN 1452VRL 923VRT 501BCT 374INV 347MAM 282PRI 276HTG 207ROD 169SYN 35STS 31GSS 15UNA 14PHG 2
分类 序列数HUM 1894PLN 1452VRL 923VRT 501BCT 374INV 347MAM 282PRI 276HTG 207ROD 169SYN 35STS 31GSS 15UNA 14PHG 2
序列长度 --- 分类
16%
6%3%1%2%1%1%
70%
HUM PLN VRL VRT BCT
INV MAM PRI HTG ROD
SYN STS GSS UNA PHG
分类 序列长度 平均长度HUM 5797511 3061PLN 2359111 1625VRL 1195657 1295VRT 552411 1103BCT 597527 1598INV 384550 1108MAM 251173 891PRI 132028 478HTG 25995943 125584ROD 173112 1024SYN 32919 941STS 5861 189GSS 8251 550UNA 2911 208PHG 3915 1958
分类 序列长度 平均长度HUM 5797511 3061PLN 2359111 1625VRL 1195657 1295VRT 552411 1103BCT 597527 1598INV 384550 1108MAM 251173 891PRI 132028 478HTG 25995943 125584ROD 173112 1024SYN 32919 941STS 5861 189GSS 8251 550UNA 2911 208PHG 3915 1958
概况 (EST 部分 )
总数 ： 103026总长度： 53363155
其中：南方中心于 2000 年 9月提交 EST 序列 100218 条，总长度： 52358070 bp 分别占 97.27% 和 98.12% 。 其平均长度为 522 bp
除南方中心的 103026 条 EST 外：
地区 序列数 ％ 序列总长度 ％北京 1724 61.40% 541011 53.83%
上海 907 32.30% 392639 39.07%
陕西 78 2.78% 34654 3.45%
湖南 37 1.32% 7927 0.79%
广东 27 0.96% 13047 1.30%
浙江 13 0.46% 6619 0.66%
重庆 7 0.25% 4271 0.42%
天津 6 0.21% 2316 0.23%
海南 4 0.14% 1378 0.14%
黑龙江 3 0.11% 780 0.08%
吉林 2 0.07% 443 0.04%
平均长度： 358 bp