「データベース構築・維持・管理 の現場から」bmb2010フォーラム...
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2010年12月9日のBMB2010のフォーラム 「私たちの論文以外の活動はどう評価されている? ~既存の評価軸に乗りづらい研究者の活動をどう評価するか~」の坊農秀雅(情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS))の話題提供のスライド。 詳細は、http://togetter.com/li/77086 を。TRANSCRIPT
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© ライフサイエンス統合データベースセンター/大学共同利用機関法人 情報・システム研究機構
データベース構築・維持・管理の現場から
大学共同利用機関法人 情報・システム研究機構(ROIS)ライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS)
坊農 秀雅
私たちの論文以外の活動はどう評価されている?~既存の評価軸に乗りづらい研究者の活動をどう評価するか~
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坊農秀雅(ぼうのうひでまさ)ライフサイエンス統合データベースセンター特任准教授埼玉医科大学ゲノム医学研究センター助教授(03/4-07/6)その前の3年間、理化学研究所ゲノム科学総合研究センター 基礎科学特別研究員(00/4-03/3)マウスの遺伝子機能アノテーション(FANTOM)京都大学化学研究所@宇治で大学隠棲院生時代(-00/3)代謝経路のデータベース(KEGG)を使ったゲノム解析
95 00
H.influenzae Synechocystis S.cerevisiae C.elegans A.thalianaD.melanogaster H.sapiens
draft M.musculus P.troglodytes
大学院 理研 埼玉医大
1003
H.sapiens
07DBCLS
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データベースセンターの役割•浄水処理場•(例えば)出された配列データを‒データベースとして貯える(Bank)‒使いやすく加工して流通させる(Circulate)
3
DB
SRR001356.1 2023DAAXX:5:1:123:563 length=33TGTCGGTCCAGCTCGGCCTTGGGCTCCGTTTTC+SRR001356.1 2023DAAXX:5:1:123:563 [email protected] 2023DAAXX:5:1:123:476 length=33TCTGAACCCGACTCCCTTTCGATCGGCCGCGGG+SRR001356.2 2023DAAXX:5:1:123:476 [email protected] 2023DAAXX:5:1:121:746 length=33GTGGCAGCGTTTTTGGGCCCGCCGCTTGCCGTT+SRR001356.3 2023DAAXX:5:1:121:746 length=33IIIII&IIIIIIIIIIIIIIIIHI1IIIIIIII
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本年度で終了
文部科学省統合データベースプロジェクト•2006-2010年度の時限プロジェクト–http://lifesciencedb.mext.go.jp/•DBCLSはその中核機関としてのちに設立‒公開サービスは「統合ホームページ」から
• http://lifesciencedb.jp/
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ブース番号:3-39, 3-40
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DBCLS: Database Center for Life Science•ライフサイエンス統合データベースセンター ‒特務機関:ライフサイエンス分野のデータベース統合化の拠点‒@東京大学本郷キャンパス内(理1号館別館⇒工12号館)•が、東大の機関ではありません
‒2011年度以降も継続して存続
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http://dbcls.rois.ac.jp/
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DBCLS構成員(2010/12現在)•長・教授: 2人•直接雇用(特任)‒研究員(PhD): 15人‒技術専門員: 5人‒技術補佐員: 1人
•外来研究員: 10人•SE: 2人•事務: 3人
•常勤合計: 38人•RA(アルバイト): 20人
→ 総計: 58人
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研究員でもなく事務員でもなく•役職は「特任研究員」ですが…•論文になることをするのが仕事でない‒データベースやツールを使いやすくするのが仕事
•論文を書くこともありますが‒開発したデータベースやツールを「広く報じる」のが目的であって、手段でない
•大学共同利用機関として公正に‒特定のグループに肩入れすべきでない⇒論文に名を連ねることは原則なし 7
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論文以外の活動:ぼうのうの場合•外部発表‒学会発表‒講演‒統合DB講習会
•コンテンツ作成‒統合TV作成‒翻訳、監訳‒ブログ
•システム維持‒ウェブサイト維持‒後進の指導•「研究員」の後輩•RA(アルバイト)
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結論評価のための研究でなく、科学の発展にどれだけ貢献したか
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