国家科技基础条件平台科学数据共享工程医药卫生科学数据共享网

中医药数据中心子项目

工作汇报

子项目负责人：刘保延 崔蒙

子项目编号： （项目编号： 2005DKA32405 ）

子项目汇报内容提纲

（一）项目基本情况简介

（二） 2006 年度实施进展及成效

（三）典型服务案例

（四）主要经验与问题

（五）下一步工作计划

（一）项目基本情况简介

医药卫生科学数据共享网( 物理上合理分布 , 逻辑上高度统一 )

www.ncbi.cn

医药卫生科学数据共享网( 物理上合理分布 , 逻辑上高度统一 )

www.ncbi.cn

医药卫生科学标准规范建设

共享政策、机制、管理和运行 ( 办公室 )

医药卫生科学数据资源建设 医药卫生共享技术平台建设

基础医学数据中心 临床医学数据中心 中医药学数据中心公共卫生数据中心

药学主体数据库

共享服务节点 共享服务节点

服务目标 政府卫生决策 医学科技创新 卫生技术进步 公众健康服务 健康产业优化

1. 中医药学科学数据中心 -- 医药卫生科学数据共享网的组成部分

医药卫生科学数据共享网

中医药信息网格支撑平台

中医药科学数据共建共享运行机制

及管理模式

中医药科学数据服务体系

中医药科学数据共享平台

中医药科学数据主体数据库群

中医药科学数据规范标准平台

中医药科学数据共建平台

中医药科学数据汇交平台

中医药科学数据中心的基本构架

项目背景与意义

1.2001 年的调查显示，中医药领域相关数据库100 多种，但数据共享不足 20% ；

2.数据库建设缺乏统筹规划；数据库多类型、多结构、重复建设严重；

3.数据库缺乏统一的建库标准和通用的建库语言；标准术语 5000 条，不足 1/40 ；

4.绝大多数是课题在实施中所建立的数据库，没有维护和持续发展，形成信息孤岛；

5.缺乏专业化的科学数据建设的队伍和技术平台。

项目总体建设思路

（二） 2006 年度实施进展及成效

主要任务• 在医药卫生科学数据共享网

基础上，形成国内外中医药与传统医学领域中最大规模、性能优良的科学数据共享平台。

1 ．中医药科学数据中心技术平台进一步得到完善主要工作流程

建议整合数据

确立整合数据

平台组调研专家组审核

立项

数据服务平台

数据查询

信息动态

在线分析

系统集成

中医药科学数据中心

主题

主题

主题

主题

主题

主题

分中心 分中心 分中心…

科研监控

加工

审校

数据管理

软件维护

系统管理

设备管理

安全管理

标准建立

质量控制

人员培训

机制建立

组织管理

数据部 技术部

确定整合项目

进行项目主题分解

确立实施方案

组织参与单位

签订任务合同

发布专题技术方案

进行专题技术培训

设计网上共建平台

平台与方案测试

数据加工整合

数据三级审核

数据发布平台研制

数据发布

中医药科学数据中心工作模式

基于网格技术的中医药数据系统构架已经形成

OGSIWeb Service

/数据 知识

Semantic Web

虚拟医院 虚拟研究院 虚拟中医药企业

基础架构层

信息网格核心层

中医药应用层

TCM-InfoGri d Bui l d Out虚拟组织层

KB-Gri d DB-Gri d

资源服务层

协同服务层

系统工具层

Shared Upper-Level Ontol ogi es: Obj ects and Processes

模型检测

本体论知识服务

规则知识服务

推理服务

案例知识服务

相似度比较

Ontologies Rules Cases

应用工具层

临床研究和诊疗决策

新药开发

电子病历系统

中医药数据库网格

知识库元信息目录

虚拟知识库

语义浏览器 知识服务器

语义搜索引擎

VDHA

中医药KDD KDT与

功能服务层

语义浏览服务 语义查询服务

语义搜索服务

数据库元信息目录

虚拟数据库 智能数据仓库

Negotiation Transport

Transaction Authorization

Management

Table / Data Schema

statement

虚拟数据库建模工具

虚拟数据库查询分配器

语义索引服务

知识共享服务 知识管理服务基于本体论的联合查询服务

基于本体论的联合建模服务

中医药专家系统

HPC Cluster OS HPC Cluster File System

• 2006.12-2007.4 原始数据采集• 2007.4-2007.6 加工程序研制与测试• 2007.7-2007.12 完成数据总任务量 30

万条。数据总量 50G• 2007.7-2007.12 25 个数据库发布

• 2006.12-2007.4 完成• 2007.4-2007.6 完成• 2007.7-2008.1 完成 30 多万条数据

；数据量 57G2007.7-2008.2 25 个数据库已经发布

中医药科学数据的整合与增量完成了既定任务

2006 年度计划 2006 年度完成情况

1 ．中医药科学数据中心数据整合与增量1 中医防治呼吸系统疾病数据库

2 中医防治哮喘病数据库

3 中医中风病防治数据库

4 中医防治病毒性肝炎数据库

5 中医防治艾滋病数据库

6 中医糖尿病防治数据库

7 中医防治肾病数据库

8 中医防治老年性痴呆数据库

9 中医防治高血压病数据库

10 中医防治冠心病数据库

11 中医防治消化系统疾病数据库

12 中医防治心血管系统疾病数据库

13 中医防治泌尿系统疾病数据库14 中医防治儿科病症数据库15 中医防治神经系统疾病数据库16 中医防治免疫系统疾病数据库17 中医防治肿瘤数据库18 中医疾病诊疗数据库19 中医诊法与疗法数据库20 针灸方法数据库21 中医古籍养生数据库22 腧穴数据库23 针灸古籍资源数据库24 针灸医疗器械数据库25 古代医家数据库

1 ．中医药科学数据中心数据整合与增量

共享网肿瘤主体数据库的中医部分

数据库发布平台

基础医学 临床医学 公共卫生 中医药学

地方节点 药学

目前已建成包含有用户服务、工作区、论坛区等功能技术平台，并能够提供基于元数据的目录服务和基于 SOA 的数据应用服务；

中医药科学数据的整合与增量成为医学共享网的重要组成部分

2 ．中医药科学数据平台的开放服务与共享（ 1 ）采取了多种、多层次共享服务的形式

（ 2 ）主要服务对象与需求

（ 3 ）服务数量及服务成效

2007 年度服务数量及服务成效 网络服务— 7X24 小时的免费检索服务

– 网络注册单用户 362 家单位与个人；比 2006 年新增 24 家– 网络 IP 注册 :25段 ,比 2006 年新增 8 段 , 开放 IP 地址约 1 万

个 离线服务：

– 光盘：数据库的数据总量 6G ；用户 133 户；新增 30个 ; 涉及数据库 30余个。

课题服务– 为国家支撑计划提供数据 49664 条。– 为 973 课题中医临床疗效评价 提供数据查询与服务 ; 提供总数据量 3G

IP 统计 用户名统计

用户访问日志

3 ．建立与落实标准与规范（１）应用共享网的标准

科技部通用标准学习宣贯应用培训科技部通用标准学习宣贯应用培训领域专用标准的研究与制订领域专用标准的研究与制订

指导标准指导标准 通用标准通用标准

物理中心建设

共享资源建设

技术平台建设

数据类

服务类

建设类

数据发现类数据访问类数据表示类数据操作类

元数据类数据元类数据模式类分类与编码类

网络建设类设备建设类机房建设类安全建设类

1. 领域专用数据类标准的研究与制订；

2. 领域国内外术语、代码、卫生信息模型标准资料汇编；

3. 领域主题数据集概念模型研究与设计；

4. 标准实施工具软件的设计与开发；

5. 标准的培训、审核与动态维护。

（２）网上发布的标准 （３）标准加工平台

4 ．人才队伍的培养

• 35 个分中心 :参与本工作人员 300个 , 实名工作人员 178

名 ;硕士研究生以上学历占三分之一 ;• 2007 年度培养 :硕士生 13

人 ,博士生 2人 ;博士后入站 3

人 ;

5 ．项目组织管理 中医药科学数据中心的五个课题分解为 35 个子课题；每

个课题均签订任务书；由课题组、子项目单位、项目单位签字盖章；

1. 任务管理 :•月汇报制度：向共享网提交当月信息与活动情况•月考核制度 : 子课题与专题项目进度月总结•中期检查制度 : 项目中期进行总结；进度、质量；•年终总结与表彰：年终总结，表彰先进

2. 人员管理：•培训：网络培训、集中培训；

建立工作考核管理制度

工作平台

月检查

标准与规范

6. 中医药科学数据共享公认度极大提高

“中医药科学数据系统”成为被“推荐品牌

• 2007年 7 月 19日 在北京国际会议中心召开第二届中国数字出版博览会上，中国中医药科学数据系统与中国知网、万方数据资源系统等九家单位一起被第二届中国数字出版博览会评为“推荐品牌”与“万方”“同方”齐名，获得“推荐品牌”奖。

•

“中医药科学数据系统”成为被“推荐品牌”与“万方”“同方”齐名

•到 2007 年共获中华医学会、北京市科委、中国中医科学院科技进步奖共七项。

国外影响1 ）中医药科学数据共享平台应用的网络技术在 2005 年的 Globus World

国际会议上 , 得到了网络之父 Ian Foster认可 , 并引起了来自美国、德国、英国、意大利、俄罗斯、日本等国家的关注。

（ 2 ）美国加州大学伯克利分校公共卫生学院学者Michael McCulloch 等在权威主流医学期刊——《美国公共卫生杂志》发表了有关中草药与干扰素治疗乙型肝炎随机对照试验的 Meta 分析。 McCulloch 及其同事认为，中国中医药数据库在其研究中起到了非常重要的作用。就此，他们专门致信表示感谢。

（ 3） 2005年 3月由世界卫生组织西太区资助在中国北京召开了传统医学信息标准化研讨会，成立了三个小组从三个方面入手研制传统医学信息标准化。

（ 4） 2008 年得到美国科学基金委与我国国家自然基金委的资助，组织召开了“中美传染性疾病信息学和生物检测研讨会”有包括美国 CDC、哈佛大学、霍普金斯大学、麻省理工等 15名美国专家参加交流，对中医药科学数据研究表示了极大兴趣。

（三）、典型服务案例

中医药信息学中医药科学数据

紧密相关互相促进

1. 数据标准术语2. 科研项目数据服务3. 数据分析4.知识发现

促进中医药现代化发展

中医药科学数据已经成为中医药现代化的重要支撑

1. 科研项目数据服务

门诊系统

1.1. 门诊病历空白模版 门诊病历空白模版

2.2. 门诊病历专科模版门诊病历专科模版 3.3. 名老中医个体化模版名老中医个体化模版

个体诊疗临床数据采集系统研究

临床标准术语成为个体诊疗临床数据采集系统的重要基础

临床信息采集系统使用培训 临床信息采集系统采集病例及诊次临床信息采集系统采集病例及诊次

为中风等疾病研究提供数据统计与分析数据分析

知识发现

研究同一疾病，不同证候的用药组分药理作用规律：

1

2

3

40

20

4060

80100

2

4

Prescription:1--Prescription12--Prescription23--Prescription34--Prescription4

Pharmacological action:1--Myocardial protection drug2--Antiviral drug3--Anti myocardial ischemia drug4--Antiarrhythmic drug5--Immunoregulatory drug

“中风”的数据统计与在线分析

（四）主要经验与问题

（五）下一步工作计划

1 ．今年工作目标（ 1 ）整合 17个中、大型数据库；总数据量为 15-20万条，约达到 40G

。（ 2 ）完善中医药科学数据中心数据共建与共享服务平台功能，实现为国内

外用户提供不同级别的 7*24小时不间断共享服务。（ 3 ）深入研究科研项目与成果数据汇交方法；建立 6-7家试点单位。（ 4 ）发布中医药科学数据中心管理、激励机制与共享条例。（ 5 ）修订与完善中医药资源分类目录与中医药元数据标准，建设中医药语

言系统应用工程。（ 6 ）稳定一支不少于 300人的中医药科学数据建设队伍，进行年度培训（ 7 ）扩大用户范围，提高共享程度与数据利用能力，实名用户与注册用户

提升 10-20%。

2 ． 2008 年以后总目标• 在人口与健康科学数据共享网的统一部署下，与医药卫生、人口健康

项目协同实现进行数据的重组、融合和增值。

• 继续整合数据库，形成国内外传统医学领域中高性能的数据共享平台。与医药卫生、人口健康项目协同实现进行数据的重组、融合和增值。

• 利用已搭建双驱动模式的整合技术平台，完成多源、多项目的科学数据汇交。

• 继续研究中国医药学语言系统，扩 充与集成西医学与古籍术语系统。

• 有计划稳定与发展整合队伍与培养人才（ 37 家单位 300 人）、同时精选与落实 10-15 家中医药科学数据汇交 委托中心与分中心；

1 ）整合与新增数据库•到 2011 年，形成具有世界竞争力的、能够显示国家实力的中医药学整体信息资源体系。根据中医药学的研究 需求，三年内 :

– 整合与增量 30 个数据库，约 30 万条数据， 30GB 。

– 打造 1 个主体数据库 ( 中药 ),60GB;– 3 个主题数据库 ;– 6 个精品数据库，从 50 个数据库中筛选 ;

2 ）开展中医药科学数据汇交

• 有计划落实 10-15 家中医药课题科学数据汇交委托中心与分中心 , 完成 40-60% 的多源、多项目的科学数据汇交。

• 建立科研课题与临床研究二套数据汇交模式。

完成 20 年内 10-15 家科学数据汇交 ,与10 家医院临床科研数据汇交

3 ）建立中国医药学语言系统

• 中医药语言系统的建 立，为中医药科学数据共享平台 起到了一定的作用，但是由于缺少医学术语与古代术语，以及一部 份厘语、口语等非规范术语；

• 此次扩充与开发主要内容 : 扩充与集成西医学与古籍术语系统

4 ）落实标准与数据管理规范

5 ）提供一个整合与发布平台

小 结

…………

数据共享服务平台

数据共享服务平台

中医药在线

中医药在线

中药药理实验库

中药药理实验库

中药化学实验库

中药化学实验库

中药基础数据库

中药基础数据库

中医药文献数据库

中医药文献数据库

古代本草文献数据库

古代本草文献数据库

…………

项目管理 质量管理 权限管理 ……

中医药学语言系统

中国中医药学主题词表

中医药学术语标准表 ……

数据平台

标准规范平台

管理平台

2 3 4 5 6 7 8

12

11

9

1

30

29

27

28

26

25

24 23 22 21 20 19 18 17

14

13

16

15

10

Internet

虚拟专业网络……

构建了中医药科学数据整合加工、共建平台与技术体系

整合构建成国内外最大的中医药精品科学数据库群

提供了多种类、多层次数据服务年代

数据整合量 标准 技术支撑 设备 参加单位人员

服务

1984-1998

4G 文献

1 终端 小型机VaX4500

1 单位14 人

15-20 家检索

1999-2002

16G 文献、事实

3 局域网与互联网

Sun250Sun 3500

12 单位70 人

40 家检索

2003-2005

60G 文献、结构关联型

29 共建平台 集群式分布 19 单位150 人

1180 家检索、关联查询、统计

2006-现在

180G （完成 50% ）多类型、多结构

35 共建管理平台

集群式分布与高性能计算机

35 家单位300 人实名 178 人

1236 家深度应用

数据年增长量 20万条记录、数据量每年预计以 20%速度递增

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