Баранова А. Облачные биомаркеры патологических...

24
Полнопрофильные композитные биомаркеры патологических состояний тканей человека Анча Баранова Медико-Генетический Научный Центр РАМН, Москва, Россия George Mason University, Fairfax VA, USA

Upload: bigdatabm

Post on 16-Jul-2015

78 views

Category:

Health & Medicine


5 download

TRANSCRIPT

Page 1: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов

Полнопрофильные композитные биомаркеры

патологических состояний тканей человека

Анча БарановаМедико-Генетический Научный Центр РАМН, Москва, Россия

George Mason University, Fairfax VA, USA

Page 2: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов

На решение какой практически-значимой проблемы направлено Ваше исследование?

Как ее решение позволит улучшить этот мир?

НОВЫЙ ТИП БИОМАРКЕРОВ ДЛЯ МОНИТОРИНГА СОСТОЯНИЙ,

в том числе здоровья

Page 3: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов

Биомаркеры заболеваний – в принципе, хорошая идея.

Page 4: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов

Однако, все годные биомаркеры уже были найдены.

Зачем эволюции нужно отбирать на биомаркеры????

НИЗАЧЕМ !!!!

Page 5: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов

Объективные показатели общего состояния для здорового человека

Самый лучший биомаркер здоровья

– это состояние гомеостаза

которое для каждого человека индивидуально

Page 6: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов

Чтобы определить гомеостаз

Давайте откажемся от минимизации числа

измеряемых параметров

Для каждого состояния мы определяем

«дистаницию» до усредненного

состояния

Page 7: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов

Может быть описано как Броуновское движение с исходной точкой в центре гомеостаза

Если «случайно» отошли слишком далеко от точки гомеостаза, вернуться “в молодость / “в здоровье”все сложнее

Только точка тут – не один параметр,

а тысячи – сколлапсированные

в дистанцию

Page 8: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов

Пространство ,занимаемоеБОЛЕЗНЕННЫМИ СОСТОЯНИЯМИ

Центр пространства НОРМАЛЬНОГО

(молодого) организма

DNormal

Индивидуальное Пространство Состояния здорового человека(норма реакции)

Page 9: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов

ДИСТАНЦИЯ – ЭТО ЛИНЕЙНАЯ МЕТРИКА

DN – Avg dist from normal sample spaceDNglobal DNspecific

(Tone et al. 2008)

(Wurmbach et al. 2007)

DNglobal DNspecific

Page 10: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов

Тоже самое можно делать и с помощью NextGen Seq

Вполне возможно что потребуется достаточно небольшой уровень перекрытия (удешевление)

Page 11: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов

Чего Вам удалось и чего еще не удалось добиться

в своей работе?

1) Концепция доказана для опухолей

2) Разработаны общие методические подходы ( но не оптимизированы) 3) Сделаны первые прикидки для хронических заболеваний

и для СТАРЕНИЯ

Page 12: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов

ПЕРСПЕКТИВНЫЕ ВОПРОСЫ КОТОРЫЕ МОЖНО ПОЗАДАВАТЬ :

DNglobal DNspecific

ЕСТЬ ЛИ РАЗНИЦА В ПРОГНОЗЕ МЕЖДУ ЭТИМИ ДВУМЯ ОПУХОЛЯМИ

Page 13: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов
Page 14: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов

Distance to normal center

Page 15: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов

Correlation to actual survival

Significant!!!

Page 16: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов

Насколько плоха моя опухоль?

Ответ: дистанция от идеальной нормы

Ваша опухоль

Page 17: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов

Нормальные эпит клетки

предзлокач

Поле, где катаются злокач клетки

Нормальные МЕЗЕНХИМ клетки

Метастаз.Клетки после транзиции

АТТРАКТОРЫ !!!

Page 18: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов

George Mason University, Fairfax, VA, USA

A.Baranova, M.Sikaroodi, G,Manyam, P. Gillevet

Page 19: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов
Page 20: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов
Page 21: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов

Нужны ли Вам студенты, какими они должны обладать компетенциями,

и какие для них есть задачи?

Уметь считать Уметь писать

Page 22: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов
Page 23: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов
Page 24: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов