生物統計学・第 12回

エクセルを使いこなすワークシート操作、ワークシート関数、マク

ロ、 VBA

2013 年 12 月 25 日生命環境科学域　応用生命科学

類尾形 善之

本日の予定

★ノートパソコン組

♦実習

★スクリーン組

♦実演

本日の内容★座学

♦チェックポイントがあります

★ノートパソコン組♦予め課題を見せるので、挑戦してください♦何かあれば TA に尋ねてください

★スクリーン組♦これまでの統計解析のうち、エクセルで実行

できるものを実演します♦最後に課題を出します

外れ値★グラブスの検定

♦目的• データセット中でひとつだけ離れた値を外す

• 纏めて省くとき

–クラスタリング、主成分分析

♦手順• 離れていると予想される値の値を計算

• グラブスの表で値を得る

グラブスの検定A B

1 35 31

2 26 27

3 41 8

平均 34 22

SD 6 10

長さ 60 42実験数 5% 1%

3 1.153 1.155

|26−34|6

=1.333

|8−22|10

=1.400

どちらも 1% の危険率で有意に外れる

チェックポイント・ I

1. データセットからひとつだけ外れた

データを外す手順は？

2. データセットからふたつ以上の外れ

たデータを外す方法は？

2 種類のエラーの話

9 75

声が大きい

声がかなり大きい

…

リー

ダー

シッ

プ

酒に呑まれる

…

眼鏡

四十代

教授 教員

アロハ犬嫌いかずさＤＮＡ研究所

ＳＮＳ嫌い

馬好き

コン

ピュータ

ウェッ

ト

バイオインフォマ

ティクス

ジブリ好き

トマ

ト

植物

微生物

生物統計学

…

若さ

視力

2

青木先生が王様だったら…

9 75

59+5

=514

偽陽性 False Positive

偽陰性 False Negative

正解！

57+5

=512

PrecisionRecall

私が王様だったら…

9 75

59+5

=514

偽陽性 False Positive

偽陰性 False Negative

正解！

57+5

=512

RecallPrecision

2 種類のエラー★Precision と Recall は対になって

いる★王様（理論値）がいる場合

♦Precision と Recall は意味がある

★王様（理論値）がいない場合♦Precision と Recall は向きによって異なる♦ふたつの指標を合わせると相関指標になる♦F-measure （ふたつの指標の調和平均）5

9+5=514

57+5

=512

𝐹=5+514+12

=1026

=513

生物統計学と 2 種類のエラー★ある病気の検査方法の信頼度は？

検査で陽性

検査で陰性

実際に陽性

True Positive

8False Negative

0 8

実際に陰性

False Positive

12True Negative

80 92

20 80

𝑃𝑟𝑒𝑐𝑖𝑠𝑖𝑜𝑛=820

=40% 𝑅𝑒𝑐𝑎𝑙𝑙=88=100%

生物統計学と 2 種類のエラー

偽陽性

検査で陽性

精密検査で陰性

ほっとひと息

偽陰性

検査で陰性

実は陽性

これは困る

情報学と 2 種類のエラー★あるブラウザの検出の信頼度は？

ブラウザでヒット

ブラウザでノーヒット

目的のページ 8 0 8

関係ないページ 992 999,000 999,992

1000 999,000

𝑃𝑟𝑒𝑐𝑖𝑠𝑖𝑜𝑛=81000

=0.8% 𝑅𝑒𝑐𝑎𝑙𝑙=88=100%

情報学と 2 種類のエラー★あるブラウザの検出の信頼度は？

ブラウザでヒット

ブラウザでノーヒット

目的のページ 3 5 8

関係ないページ 7 999,985 999,992

10 999,990

𝑃𝑟𝑒𝑐𝑖𝑠𝑖𝑜𝑛=310

=30% 𝑅𝑒𝑐𝑎𝑙𝑙=38=37.5%

2 種類のエラーの纏め★偽陽性 False Positive

♦検査で陽性だが実際は陰性• 「第一種の過誤（誤り）」「あわてんぼうのエ

ラー」

★偽陰性 False Negative♦検査で陰性だが実際は陽性• 「第二種の過誤（誤り）」「うっかりもののエ

ラー」

★意識しないとどちらかのエラーを忘れがち

チェックポイント・ II

3. 偽陽性とは？

4. 偽陰性とは？

今日の自習のポイント

★今日は特にありません！

アン ケート・ III

★次回からは解析環境の話です

5. いま学校や自宅でエクセルが使える

環境かどうか教 えてください。

6. この講義にノートパソコンを持って

こられるかどうか教 えてください。

本日の課題★下の検査結果について以下の問いに答えな

さい。♦Precision と Recall を計算し、この検査方法の信頼度に

ついて考察しなさい。検査で陽性 検査で陰性

実際に陽性

True Positive

7False Negative

1 8

実際に陰性

False Positive

3True Negative

89 92

10 90